# TARGET T0423 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0423.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 910.806 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.093 0.020 0.063 0.020 0.040 0.110 0.010 0.645 2 S 0.057 0.019 0.039 0.015 0.031 0.168 0.009 0.662 3 D 0.045 0.017 0.017 0.007 0.013 0.075 0.005 0.820 4 V 0.077 0.035 0.016 0.007 0.014 0.269 0.006 0.576 5 I 0.081 0.113 0.022 0.011 0.024 0.348 0.008 0.394 6 E 0.047 0.391 0.020 0.012 0.032 0.104 0.006 0.388 7 G 0.029 0.473 0.009 0.007 0.014 0.089 0.006 0.374 8 R 0.086 0.618 0.007 0.006 0.008 0.059 0.012 0.204 9 L 0.040 0.862 0.006 0.005 0.010 0.009 0.006 0.062 10 K 0.052 0.753 0.010 0.010 0.021 0.026 0.022 0.106 11 E 0.092 0.718 0.022 0.011 0.011 0.021 0.023 0.103 12 L 0.171 0.620 0.039 0.022 0.019 0.015 0.037 0.079 13 G 0.233 0.242 0.078 0.038 0.031 0.024 0.069 0.285 14 F 0.053 0.065 0.625 0.057 0.047 0.019 0.023 0.111 15 T 0.040 0.049 0.192 0.063 0.094 0.086 0.021 0.454 16 L 0.046 0.022 0.183 0.050 0.092 0.045 0.008 0.555 17 P 0.001 0.001 0.006 0.002 0.003 0.008 0.001 0.980 18 V 0.015 0.004 0.030 0.017 0.031 0.118 0.006 0.779 19 A 0.217 0.018 0.054 0.023 0.046 0.091 0.012 0.538 20 A 0.070 0.023 0.025 0.017 0.039 0.083 0.014 0.728 21 A 0.234 0.023 0.041 0.034 0.053 0.135 0.010 0.469 22 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 23 A 0.083 0.017 0.036 0.033 0.068 0.123 0.017 0.623 24 A 0.336 0.034 0.080 0.038 0.031 0.080 0.024 0.377 25 N 0.100 0.033 0.051 0.039 0.058 0.065 0.019 0.636 26 Y 0.114 0.029 0.147 0.045 0.089 0.099 0.016 0.461 27 V 0.060 0.013 0.049 0.036 0.054 0.189 0.005 0.593 28 P 0.002 0.003 0.008 0.013 0.013 0.018 0.001 0.943 29 F 0.037 0.028 0.050 0.104 0.214 0.099 0.005 0.463 30 T 0.051 0.059 0.137 0.287 0.209 0.040 0.012 0.206 31 I 0.040 0.056 0.069 0.261 0.293 0.048 0.011 0.223 32 S 0.023 0.037 0.117 0.199 0.322 0.045 0.011 0.245 33 G 0.036 0.022 0.081 0.174 0.177 0.080 0.049 0.381 34 N 0.179 0.006 0.073 0.069 0.075 0.195 0.036 0.367 35 L 0.093 0.003 0.138 0.178 0.209 0.146 0.010 0.224 36 L 0.028 0.002 0.081 0.317 0.455 0.048 0.002 0.066 37 Y 0.003 0.001 0.142 0.362 0.392 0.016 0.002 0.082 38 V 0.002 0.002 0.121 0.362 0.424 0.016 0.001 0.072 39 S 0.003 0.002 0.091 0.253 0.473 0.026 0.002 0.151 40 G 0.010 0.002 0.068 0.240 0.453 0.048 0.009 0.170 41 Q 0.102 0.001 0.057 0.083 0.257 0.175 0.010 0.315 42 L 0.017 0.001 0.044 0.231 0.181 0.067 0.003 0.456 43 P 0.001 0.001 0.002 0.013 0.018 0.006 0.001 0.961 44 M 0.009 0.001 0.028 0.145 0.347 0.057 0.002 0.410 45 E 0.049 0.005 0.021 0.089 0.174 0.139 0.005 0.519 46 S 0.029 0.006 0.009 0.032 0.059 0.067 0.005 0.793 47 G 0.090 0.014 0.018 0.034 0.040 0.155 0.019 0.629 48 K 0.402 0.008 0.024 0.027 0.033 0.197 0.023 0.286 49 I 0.069 0.017 0.070 0.095 0.095 0.104 0.008 0.541 50 A 0.021 0.018 0.073 0.160 0.299 0.077 0.005 0.349 51 V 0.025 0.021 0.089 0.157 0.279 0.095 0.005 0.327 52 T 0.017 0.027 0.083 0.140 0.224 0.065 0.006 0.436 53 G 0.053 0.039 0.107 0.184 0.218 0.062 0.022 0.315 54 L 0.141 0.015 0.124 0.093 0.123 0.133 0.018 0.353 55 V 0.022 0.010 0.084 0.066 0.093 0.075 0.007 0.644 56 G 0.043 0.020 0.094 0.104 0.242 0.099 0.006 0.392 57 R 0.026 0.014 0.094 0.050 0.078 0.131 0.009 0.598 58 D 0.061 0.013 0.042 0.019 0.035 0.085 0.011 0.734 59 V 0.229 0.014 0.089 0.020 0.028 0.120 0.009 0.492 60 D 0.031 0.021 0.035 0.016 0.025 0.402 0.006 0.464 61 V 0.048 0.053 0.044 0.013 0.054 0.055 0.006 0.726 62 A 0.011 0.011 0.005 0.001 0.004 0.757 0.002 0.208 63 S 0.021 0.004 0.001 0.001 0.001 0.930 0.001 0.043 64 A 0.025 0.894 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.067 65 Q 0.002 0.768 0.001 0.001 0.002 0.037 0.001 0.188 66 R 0.015 0.669 0.001 0.001 0.001 0.112 0.003 0.199 67 A 0.004 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 68 A 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 69 E 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 70 L 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 71 C 0.002 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 72 A 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 73 V 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 74 N 0.003 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 75 I 0.007 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 76 L 0.002 0.982 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 77 A 0.002 0.977 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.016 78 Q 0.003 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 79 V 0.003 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 80 K 0.001 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 81 A 0.017 0.965 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.009 82 A 0.079 0.870 0.006 0.001 0.001 0.001 0.024 0.018 83 L 0.060 0.822 0.028 0.004 0.004 0.005 0.025 0.051 84 N 0.077 0.580 0.069 0.006 0.005 0.017 0.048 0.198 85 G 0.353 0.202 0.077 0.006 0.004 0.020 0.095 0.243 86 D 0.322 0.048 0.082 0.004 0.003 0.091 0.049 0.402 87 L 0.020 0.033 0.119 0.006 0.012 0.055 0.005 0.751 88 S 0.020 0.027 0.021 0.013 0.020 0.587 0.007 0.305 89 K 0.100 0.016 0.006 0.004 0.008 0.700 0.009 0.159 90 I 0.357 0.241 0.019 0.012 0.030 0.095 0.005 0.241 91 R 0.026 0.311 0.035 0.053 0.045 0.211 0.012 0.307 92 R 0.180 0.177 0.026 0.075 0.075 0.109 0.050 0.309 93 V 0.275 0.131 0.070 0.111 0.208 0.046 0.026 0.131 94 I 0.018 0.046 0.145 0.386 0.334 0.020 0.006 0.045 95 K 0.006 0.018 0.174 0.237 0.301 0.032 0.006 0.226 96 L 0.003 0.007 0.340 0.280 0.294 0.013 0.003 0.061 97 N 0.002 0.004 0.368 0.290 0.275 0.011 0.003 0.047 98 G 0.004 0.002 0.461 0.161 0.227 0.017 0.003 0.126 99 F 0.003 0.001 0.561 0.176 0.186 0.016 0.001 0.055 100 V 0.010 0.003 0.234 0.179 0.382 0.044 0.002 0.145 101 A 0.007 0.003 0.363 0.158 0.271 0.031 0.004 0.162 102 S 0.022 0.005 0.083 0.094 0.145 0.107 0.012 0.533 103 V 0.054 0.003 0.080 0.039 0.130 0.061 0.007 0.626 104 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.994 105 E 0.017 0.005 0.004 0.006 0.017 0.364 0.005 0.581 106 F 0.412 0.056 0.008 0.005 0.011 0.065 0.010 0.433 107 V 0.083 0.245 0.022 0.014 0.028 0.077 0.008 0.523 108 E 0.104 0.274 0.012 0.010 0.017 0.098 0.014 0.471 109 Q 0.157 0.488 0.035 0.010 0.020 0.040 0.018 0.232 110 H 0.090 0.616 0.018 0.022 0.018 0.030 0.021 0.185 111 L 0.120 0.372 0.118 0.027 0.030 0.047 0.032 0.255 112 V 0.117 0.365 0.139 0.037 0.049 0.064 0.021 0.208 113 I 0.032 0.524 0.180 0.043 0.045 0.031 0.008 0.136 114 N 0.023 0.388 0.103 0.031 0.044 0.058 0.014 0.340 115 G 0.093 0.265 0.077 0.020 0.024 0.074 0.025 0.422 116 A 0.157 0.225 0.074 0.011 0.019 0.212 0.017 0.285 117 S 0.062 0.184 0.026 0.007 0.015 0.278 0.018 0.410 118 N 0.069 0.483 0.012 0.005 0.009 0.084 0.008 0.329 119 L 0.037 0.586 0.008 0.003 0.005 0.141 0.007 0.212 120 I 0.063 0.719 0.005 0.003 0.011 0.085 0.009 0.106 121 A 0.013 0.953 0.002 0.002 0.003 0.004 0.002 0.022 122 T 0.035 0.913 0.003 0.003 0.003 0.005 0.011 0.028 123 V 0.158 0.732 0.014 0.006 0.005 0.005 0.036 0.043 124 L 0.114 0.702 0.030 0.017 0.022 0.006 0.025 0.083 125 G 0.087 0.262 0.082 0.026 0.050 0.032 0.080 0.381 126 E 0.141 0.095 0.049 0.017 0.020 0.062 0.028 0.588 127 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.994 128 G 0.064 0.017 0.030 0.022 0.023 0.147 0.031 0.667 129 R 0.335 0.015 0.119 0.026 0.019 0.103 0.019 0.364 130 H 0.006 0.004 0.012 0.011 0.012 0.029 0.001 0.925 131 A 0.048 0.013 0.073 0.062 0.190 0.162 0.004 0.450 132 R 0.072 0.045 0.100 0.123 0.136 0.225 0.010 0.289 133 A 0.100 0.049 0.187 0.168 0.198 0.124 0.017 0.157 134 A 0.034 0.066 0.200 0.198 0.196 0.029 0.005 0.271 135 V 0.010 0.025 0.224 0.290 0.314 0.019 0.004 0.111 136 G 0.011 0.022 0.157 0.188 0.299 0.035 0.006 0.281 137 M 0.027 0.027 0.153 0.145 0.421 0.040 0.007 0.180 138 A 0.028 0.032 0.093 0.178 0.232 0.062 0.011 0.363 139 S 0.071 0.015 0.027 0.039 0.083 0.049 0.041 0.674 140 L 0.328 0.009 0.063 0.070 0.080 0.063 0.030 0.357 141 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 142 F 0.001 0.001 0.004 0.012 0.030 0.030 0.002 0.920 143 N 0.221 0.003 0.014 0.025 0.024 0.097 0.031 0.585 144 A 0.705 0.001 0.025 0.023 0.033 0.079 0.008 0.127 145 S 0.123 0.002 0.107 0.246 0.189 0.105 0.004 0.224 146 V 0.014 0.001 0.083 0.356 0.362 0.030 0.002 0.151 147 E 0.006 0.001 0.101 0.327 0.495 0.020 0.001 0.048 148 I 0.001 0.001 0.049 0.485 0.435 0.009 0.001 0.020 149 D 0.001 0.001 0.057 0.349 0.519 0.010 0.001 0.064 150 A 0.001 0.001 0.059 0.304 0.613 0.010 0.001 0.013 151 I 0.004 0.001 0.062 0.304 0.595 0.013 0.001 0.020 152 V 0.002 0.001 0.067 0.432 0.476 0.008 0.001 0.012 153 E 0.007 0.002 0.051 0.231 0.610 0.019 0.001 0.079 154 I 0.005 0.002 0.080 0.359 0.490 0.013 0.002 0.048 155 D 0.003 0.003 0.022 0.141 0.176 0.026 0.003 0.626 156 V 0.011 0.003 0.035 0.083 0.280 0.048 0.005 0.535