This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA S A 3 3 NATAA D A 4 4 NATAA V A 5 5 NATAA I A 6 6 NATAA E A 7 7 NATAA G A 8 8 NATAA R A 9 9 NATAA L A 10 10 NATAA K A 11 11 NATAA E A 12 12 NATAA L A 13 13 NATAA G A 14 14 NATAA F A 15 15 NATAA T A 16 16 NATAA L A 17 17 NATRO P A 18 18 NATAA V A 19 19 NATAA A A 20 20 NATAA A A 21 21 NATAA A A 22 22 NATRO P A 23 23 NATAA A A 24 24 NATAA A A 25 25 NATAA N A 26 26 NATAA Y A 27 27 NATAA V A 28 28 NATRO P A 29 29 NATAA F A 30 30 NATAA T A 31 31 NATAA I A 32 32 NATAA S A 33 33 NATAA G A 34 34 NATAA N A 35 35 NATAA L A 36 36 NATAA L A 37 37 NATAA Y A 38 38 NATAA V A 39 39 NATAA S A 40 40 NATAA G A 41 41 NATAA Q A 42 42 NATAA L A 43 43 NATRO P A 44 44 NATAA M A 45 45 NATAA E A 46 46 NATAA S A 47 47 NATAA G A 48 48 NATAA K A 49 49 NATAA I A 50 50 NATAA A A 51 51 NATAA V A 52 52 NATAA T A 53 53 NATAA G A 54 54 NATAA L A 55 55 NATAA V A 56 56 NATAA G A 57 57 NATAA R A 58 58 NATAA D A 59 59 NATAA V A 60 60 NATAA D A 61 61 NATAA V A 62 62 NATAA A A 63 63 NATAA S A 64 64 NATAA A A 65 65 NATAA Q A 66 66 NATAA R A 67 67 NATAA A A 68 68 NATAA A A 69 69 NATAA E A 70 70 NATAA L A 71 71 NATRO C A 72 72 NATAA A A 73 73 NATAA V A 74 74 NATAA N A 75 75 NATAA I A 76 76 NATAA L A 77 77 NATAA A A 78 78 NATAA Q A 79 79 NATAA V A 80 80 NATAA K A 81 81 NATAA A A 82 82 NATAA A A 83 83 NATAA L A 84 84 NATAA N A 85 85 NATAA G A 86 86 NATAA D A 87 87 NATAA L A 88 88 NATAA S A 89 89 NATAA K A 90 90 NATAA I A 91 91 NATAA R A 92 92 NATAA R A 93 93 NATAA V A 94 94 NATAA I A 95 95 NATAA K A 96 96 NATAA L A 97 97 NATAA N A 98 98 NATAA G A 99 99 NATAA F A 100 100 NATAA V A 101 101 NATAA A A 102 102 NATAA S A 103 103 NATAA V A 104 104 NATRO P A 105 105 NATAA E A 106 106 NATAA F A 107 107 NATAA V A 108 108 NATAA E A 109 109 NATAA Q A 110 110 NATAA H A 111 111 NATAA L A 112 112 NATAA V A 113 113 NATAA I A 114 114 NATAA N A 115 115 NATAA G A 116 116 NATAA A A 117 117 NATAA S A 118 118 NATAA N A 119 119 NATAA L A 120 120 NATAA I A 121 121 NATAA A A 122 122 NATAA T A 123 123 NATAA V A 124 124 NATAA L A 125 125 NATAA G A 126 126 NATAA E A 127 127 NATRO P A 128 128 NATAA G A 129 129 NATAA R A 130 130 NATAA H A 131 131 NATAA A A 132 132 NATAA R A 133 133 NATAA A A 134 134 NATAA A A 135 135 NATAA V A 136 136 NATAA G A 137 137 NATAA M A 138 138 NATAA A A 139 139 NATAA S A 140 140 NATAA L A 141 141 NATRO P A 142 142 NATAA F A 143 143 NATAA N A 144 144 NATAA A A 145 145 NATAA S A 146 146 NATAA V A 147 147 NATAA E A 148 148 NATAA I A 149 149 NATAA D A 150 150 NATAA A A 151 151 NATAA I A 152 152 NATAA V A 153 153 NATAA E A 154 154 NATAA I A 155 155 NATAA D A 156 156 NATAA V