This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA F A 3 3 NATAA E A 4 4 NATAA S A 5 5 NATAA A A 6 6 NATAA E A 7 7 NATAA V A 8 8 NATAA G A 9 9 NATAA H A 10 10 NATAA S A 11 11 NATAA I A 12 12 NATAA D A 13 13 NATAA K A 14 14 NATAA D A 15 15 NATAA T A 16 16 NATAA Y A 17 17 NATAA E A 18 18 NATAA K A 19 19 NATAA A A 20 20 NATAA V A 21 21 NATAA I A 22 22 NATAA E A 23 23 NATAA L A 24 24 NATAA R A 25 25 NATAA E A 26 26 NATAA A A 27 27 NATAA L A 28 28 NATAA L A 29 29 NATAA E A 30 30 NATAA A A 31 31 NATAA Q A 32 32 NATAA F A 33 33 NATAA E A 34 34 NATAA L A 35 35 NATAA K A 36 36 NATAA Q A 37 37 NATAA Q A 38 38 NATAA A A 39 39 NATAA R A 40 40 NATAA F A 41 41 NATRO P A 42 42 NATAA V A 43 43 NATAA I A 44 44 NATAA I A 45 45 NATAA L A 46 46 NATAA I A 47 47 NATAA N A 48 48 NATAA G A 49 49 NATAA I A 50 50 NATAA E A 51 51 NATAA G A 52 52 NATAA A A 53 53 NATAA G A 54 54 NATAA K A 55 55 NATAA G A 56 56 NATAA E A 57 57 NATAA T A 58 58 NATAA V A 59 59 NATAA K A 60 60 NATAA L A 61 61 NATAA L A 62 62 NATAA N A 63 63 NATAA E A 64 64 NATAA W A 65 65 NATAA M A 66 66 NATAA D A 67 67 NATRO P A 68 68 NATAA R A 69 69 NATAA L A 70 70 NATAA I A 71 71 NATAA E A 72 72 NATAA V A 73 73 NATAA Q A 74 74 NATAA S A 75 75 NATAA F A 76 76 NATAA L A 77 77 NATAA R A 78 78 NATRO P A 79 79 NATAA S A 80 80 NATAA D A 81 81 NATAA E A 82 82 NATAA E A 83 83 NATAA L A 84 84 NATAA E A 85 85 NATAA R A 86 86 NATRO P A 87 87 NATRO P A 88 88 NATAA Q A 89 89 NATAA W A 90 90 NATAA R A 91 91 NATAA F A 92 92 NATAA W A 93 93 NATAA R A 94 94 NATAA R A 95 95 NATAA L A 96 96 NATRO P A 97 97 NATRO P A 98 98 NATAA K A 99 99 NATAA G A 100 100 NATAA R A 101 101 NATAA T A 102 102 NATAA G A 103 103 NATAA I A 104 104 NATAA F A 105 105 NATAA F A 106 106 NATAA G A 107 107 NATAA N A 108 108 NATAA W A 109 109 NATAA Y A 110 110 NATAA S A 111 111 NATAA Q A 112 112 NATAA M A 113 113 NATAA L A 114 114 NATAA Y A 115 115 NATAA A A 116 116 NATAA R A 117 117 NATAA V A 118 118 NATAA E A 119 119 NATAA G A 120 120 NATAA H A 121 121 NATAA I A 122 122 NATAA K A 123 123 NATAA E A 124 124 NATAA A A 125 125 NATAA K A 126 126 NATAA L A 127 127 NATAA D A 128 128 NATAA Q A 129 129 NATAA A A 130 130 NATAA I A 131 131 NATAA D A 132 132 NATAA A A 133 133 NATAA A A 134 134 NATAA E A 135 135 NATAA R A 136 136 NATAA F A 137 137 NATAA E A 138 138 NATAA R A 139 139 NATAA M A 140 140 NATAA L A 141 141 NATRO C A 142 142 NATAA D A 143 143 NATAA E A 144 144 NATAA G A 145 145 NATAA A A 146 146 NATAA L A 147 147 NATAA L A 148 148 NATAA F A 149 149 NATAA K A 150 150 NATAA F A 151 151 NATAA W A 152 152 NATAA F A 153 153 NATAA H A 154 154 NATAA L A 155 155 NATAA S A 156 156 NATAA K A 157 157 NATAA K A 158 158 NATAA Q A 159 159 NATAA L A 160 160 NATAA K A 161 161 NATAA E A 162 162 NATAA R A 163 163 NATAA L A 164 164 NATAA K A 165 165 NATAA A A 166 166 NATAA L A 167 167 NATAA E A 168 168 NATAA K A 169 169 NATAA D A 170 170 NATRO P A 171 171 NATAA Q A 172 172 NATAA H A 173 173 NATAA S A 174 174 NATAA W A 175 175 NATAA K A 176 176 NATAA L A 177 177 NATAA S A 178 178 NATRO P A 179 179 NATAA L A 180 180 NATAA D A 181 181 NATAA W A 182 182 NATAA K A 183 183 NATAA Q A 184 184 NATAA S A 185 185 NATAA E A 186 186 NATAA V A 187 187 NATAA Y A 188 188 NATAA D A 189 189 NATAA R A 190 190 NATAA F A 191 191 NATAA V A 192 192 NATAA H A 193 193 NATAA Y A 194 194 NATAA G A 195 195 NATAA E A 196 196 NATAA R A 197 197 NATAA V A 198 198 NATAA L A 199 199 NATAA R A 200 200 NATAA R A 201 201 NATAA T A 202 202 NATAA S A 203 203 NATAA R A 204 204 NATAA D A 205 205 NATAA Y A 206 206 NATAA A A 207 207 NATRO P A 208 208 NATAA W A 209 209 NATAA Y A 210 210 NATAA V A 211 211 NATAA V A 212 212 NATAA E A 213 213 NATAA G A 214 214 NATAA A A 215 215 NATAA D A 216 216 NATAA E A 217 217 NATAA R A 218 218 NATAA Y A 219 219 NATAA R A 220 220 NATAA A A 221 221 NATAA L A 222 222 NATAA T A 223 223 NATAA V A 224 224 NATAA G A 225 225 NATAA R A 226 226 NATAA I A 227 227 NATAA L A 228 228 NATAA L A 229 229 NATAA E A 230 230 NATAA G A 231 231 NATAA L A 232 232 NATAA Q A 233 233 NATAA A A 234 234 NATAA A A 235 235 NATAA L A 236 236 NATAA A A 237 237 NATAA T A 238 238 NATAA K A 239 239 NATAA E A 240 240 NATAA R A 241 241 NATAA A A 242 242 NATAA K A 243 243 NATAA R