# TARGET T0418 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0418.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2182 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.995 2 K 0.115 0.026 0.002 0.005 0.006 0.013 0.834 3 Y 0.317 0.009 0.002 0.002 0.046 0.006 0.620 4 T 0.750 0.002 0.001 0.001 0.151 0.002 0.093 5 V 0.978 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 6 Y 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 7 L 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.007 8 F 0.945 0.003 0.001 0.001 0.006 0.001 0.045 9 D 0.417 0.004 0.002 0.001 0.039 0.007 0.529 10 F 0.111 0.011 0.030 0.006 0.265 0.283 0.293 11 D 0.050 0.015 0.037 0.009 0.306 0.425 0.158 12 Y 0.155 0.010 0.051 0.025 0.271 0.199 0.289 13 T 0.304 0.030 0.037 0.042 0.213 0.079 0.294 14 L 0.461 0.048 0.034 0.042 0.108 0.061 0.247 15 A 0.398 0.051 0.030 0.044 0.102 0.051 0.324 16 D 0.127 0.038 0.011 0.031 0.226 0.049 0.519 17 S 0.031 0.009 0.007 0.085 0.186 0.048 0.634 18 S 0.001 0.001 0.018 0.894 0.030 0.034 0.024 19 R 0.001 0.001 0.009 0.971 0.006 0.012 0.002 20 G 0.001 0.001 0.006 0.984 0.002 0.006 0.002 21 I 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 22 V 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 23 T 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 24 C 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 25 F 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 26 R 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 27 S 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 28 V 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.002 29 L 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.006 0.002 30 E 0.001 0.001 0.003 0.963 0.002 0.029 0.002 31 R 0.001 0.001 0.004 0.851 0.006 0.134 0.004 32 H 0.001 0.001 0.005 0.337 0.034 0.600 0.024 33 G 0.001 0.002 0.004 0.020 0.089 0.697 0.187 34 Y 0.005 0.011 0.006 0.006 0.122 0.019 0.831 35 T 0.028 0.032 0.013 0.012 0.118 0.021 0.776 36 G 0.024 0.018 0.046 0.063 0.159 0.047 0.643 37 I 0.019 0.013 0.029 0.103 0.109 0.048 0.679 38 T 0.012 0.005 0.051 0.510 0.078 0.075 0.269 39 D 0.004 0.001 0.032 0.868 0.021 0.032 0.043 40 D 0.006 0.001 0.026 0.896 0.015 0.025 0.032 41 M 0.011 0.002 0.017 0.905 0.014 0.021 0.029 42 I 0.018 0.003 0.013 0.906 0.015 0.022 0.025 43 K 0.018 0.002 0.015 0.898 0.012 0.038 0.018 44 R 0.018 0.003 0.020 0.845 0.015 0.077 0.022 45 T 0.019 0.006 0.029 0.729 0.034 0.138 0.045 46 I 0.019 0.006 0.027 0.537 0.075 0.247 0.090 47 G 0.016 0.005 0.025 0.323 0.169 0.219 0.243 48 K 0.013 0.006 0.031 0.315 0.209 0.149 0.277 49 T 0.014 0.007 0.038 0.450 0.119 0.126 0.245 50 L 0.006 0.003 0.040 0.779 0.040 0.050 0.084 51 E 0.007 0.002 0.030 0.868 0.018 0.039 0.037 52 E 0.009 0.002 0.022 0.893 0.015 0.029 0.030 53 S 0.013 0.002 0.018 0.896 0.015 0.026 0.029 54 F 0.017 0.002 0.017 0.894 0.016 0.029 0.026 55 S 0.023 0.002 0.025 0.856 0.017 0.044 0.032 56 I 0.014 0.003 0.030 0.812 0.024 0.075 0.042 57 L 0.013 0.006 0.036 0.701 0.040 0.125 0.080 58 T 0.008 0.005 0.058 0.517 0.071 0.185 0.156 59 G 0.005 0.003 0.066 0.433 0.097 0.235 0.162 60 I 0.004 0.004 0.073 0.340 0.120 0.235 0.225 61 T 0.003 0.005 0.073 0.264 0.153 0.171 0.331 62 D 0.003 0.005 0.067 0.295 0.122 0.138 0.371 63 A 0.002 0.003 0.082 0.537 0.096 0.148 0.134 64 D 0.002 0.002 0.069 0.620 0.064 0.145 0.097 65 Q 0.002 0.003 0.049 0.679 0.049 0.089 0.130 66 L 0.002 0.002 0.018 0.801 0.038 0.037 0.102 67 E 0.002 0.001 0.008 0.899 0.018 0.029 0.043 68 S 0.001 0.001 0.005 0.934 0.011 0.024 0.024 69 F 0.001 0.001 0.002 0.952 0.008 0.018 0.019 70 R 0.001 0.001 0.001 0.969 0.007 0.012 0.010 71 Q 0.001 0.001 0.001 0.977 0.004 0.012 0.006 72 E 0.001 0.001 0.001 0.978 0.004 0.011 0.007 73 Y 0.001 0.001 0.001 0.979 0.003 0.010 0.007 74 S 0.001 0.001 0.001 0.980 0.004 0.011 0.004 75 K 0.001 0.001 0.001 0.978 0.003 0.013 0.004 76 E 0.001 0.001 0.001 0.974 0.004 0.013 0.008 77 A 0.001 0.001 0.001 0.965 0.006 0.016 0.010 78 D 0.001 0.001 0.004 0.940 0.008 0.034 0.011 79 I 0.002 0.001 0.009 0.888 0.013 0.071 0.017 80 Y 0.002 0.001 0.015 0.783 0.024 0.140 0.034 81 M 0.005 0.004 0.033 0.562 0.065 0.237 0.094 82 N 0.011 0.007 0.088 0.314 0.119 0.263 0.199 83 A 0.011 0.004 0.112 0.193 0.134 0.387 0.160 84 N 0.019 0.008 0.098 0.118 0.182 0.349 0.226 85 T 0.046 0.014 0.043 0.066 0.241 0.069 0.521 86 I 0.086 0.035 0.037 0.037 0.156 0.063 0.585 87 L 0.088 0.054 0.026 0.048 0.109 0.036 0.639 88 F 0.025 0.005 0.014 0.015 0.060 0.025 0.856 89 P 0.005 0.003 0.107 0.109 0.125 0.582 0.068 90 D 0.009 0.019 0.075 0.160 0.161 0.394 0.183 91 T 0.002 0.002 0.041 0.863 0.034 0.013 0.045 92 L 0.001 0.001 0.005 0.981 0.003 0.003 0.007 93 P 0.001 0.001 0.004 0.986 0.001 0.006 0.002 94 T 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 95 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 96 T 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 97 H 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 98 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.001 99 K 0.001 0.001 0.003 0.986 0.001 0.009 0.001 100 K 0.001 0.001 0.007 0.933 0.003 0.055 0.002 101 Q 0.001 0.001 0.005 0.211 0.013 0.768 0.002 102 G 0.001 0.001 0.001 0.002 0.017 0.955 0.023 103 I 0.021 0.001 0.001 0.001 0.040 0.002 0.936 104 R 0.475 0.001 0.001 0.001 0.207 0.001 0.315 105 I 0.990 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.006 106 G 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 107 I 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 108 I 0.947 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.047 109 S 0.267 0.002 0.001 0.001 0.184 0.017 0.528 110 T 0.025 0.002 0.009 0.010 0.656 0.087 0.211 111 K 0.009 0.016 0.030 0.033 0.524 0.105 0.282 112 Y 0.014 0.019 0.072 0.271 0.185 0.093 0.346 113 R 0.003 0.002 0.079 0.783 0.034 0.046 0.052 114 F 0.002 0.001 0.037 0.888 0.012 0.046 0.014 115 R 0.002 0.001 0.020 0.935 0.005 0.028 0.009 116 I 0.001 0.001 0.004 0.982 0.003 0.006 0.004 117 L 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.002 0.002 118 S 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.001 119 F 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 120 L 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.001 121 R 0.001 0.001 0.009 0.960 0.001 0.028 0.001 122 N 0.001 0.001 0.021 0.822 0.005 0.150 0.003 123 H 0.001 0.001 0.031 0.286 0.039 0.625 0.018 124 M 0.001 0.007 0.012 0.027 0.073 0.691 0.190 125 P 0.004 0.020 0.097 0.031 0.069 0.056 0.722 126 D 0.012 0.009 0.473 0.034 0.061 0.072 0.338 127 D 0.027 0.006 0.527 0.050 0.081 0.189 0.120 128 W 0.107 0.036 0.278 0.083 0.090 0.175 0.231 129 F 0.182 0.004 0.004 0.012 0.107 0.011 0.680 130 D 0.355 0.001 0.001 0.006 0.532 0.010 0.096 131 I 0.974 0.006 0.001 0.008 0.003 0.002 0.007 132 I 0.984 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.006 133 I 0.973 0.001 0.001 0.005 0.003 0.002 0.015 134 G 0.663 0.003 0.001 0.009 0.033 0.012 0.279 135 G 0.082 0.003 0.061 0.062 0.267 0.133 0.392 136 E 0.031 0.006 0.186 0.129 0.289 0.210 0.150 137 D 0.025 0.025 0.347 0.180 0.128 0.159 0.135 138 V 0.043 0.031 0.196 0.231 0.145 0.150 0.204 139 T 0.029 0.009 0.096 0.153 0.128 0.375 0.210 140 H 0.031 0.011 0.055 0.073 0.234 0.373 0.222 141 H 0.032 0.015 0.020 0.024 0.364 0.144 0.401 142 K 0.033 0.024 0.007 0.011 0.405 0.031 0.489 143 P 0.023 0.049 0.006 0.014 0.160 0.019 0.729 144 D 0.011 0.010 0.003 0.024 0.047 0.012 0.892 145 P 0.002 0.001 0.021 0.597 0.034 0.039 0.305 146 E 0.001 0.001 0.010 0.951 0.006 0.020 0.012 147 G 0.001 0.001 0.006 0.971 0.005 0.010 0.007 148 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.002 0.002 149 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 150 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 151 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 152 I 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 153 D 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.006 0.001 154 R 0.001 0.001 0.001 0.934 0.002 0.062 0.001 155 L 0.001 0.001 0.003 0.374 0.021 0.593 0.008 156 K 0.001 0.002 0.002 0.010 0.055 0.834 0.097 157 A 0.006 0.016 0.001 0.001 0.146 0.007 0.822 158 C 0.014 0.009 0.001 0.001 0.031 0.002 0.943 159 P 0.011 0.004 0.548 0.021 0.149 0.182 0.084 160 E 0.007 0.003 0.558 0.014 0.056 0.340 0.021 161 E 0.083 0.005 0.515 0.015 0.081 0.178 0.124 162 V 0.770 0.017 0.011 0.005 0.012 0.009 0.174 163 L 0.913 0.011 0.003 0.002 0.009 0.007 0.054 164 Y 0.950 0.012 0.002 0.001 0.006 0.007 0.021 165 I 0.913 0.003 0.002 0.002 0.013 0.008 0.058 166 G 0.518 0.014 0.004 0.003 0.121 0.052 0.288 167 D 0.056 0.007 0.003 0.005 0.257 0.035 0.637 168 S 0.014 0.005 0.003 0.013 0.229 0.031 0.706 169 T 0.001 0.001 0.041 0.740 0.069 0.130 0.018 170 V 0.001 0.001 0.037 0.852 0.015 0.078 0.016 171 D 0.001 0.001 0.012 0.928 0.011 0.025 0.023 172 A 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.004 0.004 173 G 0.003 0.001 0.001 0.983 0.002 0.005 0.005 174 T 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.006 0.002 175 A 0.002 0.001 0.003 0.985 0.002 0.004 0.003 176 A 0.001 0.001 0.008 0.975 0.002 0.012 0.002 177 A 0.001 0.001 0.010 0.906 0.005 0.073 0.004 178 A 0.001 0.001 0.010 0.374 0.033 0.567 0.014 179 G 0.002 0.001 0.003 0.006 0.016 0.895 0.078 180 V 0.021 0.001 0.001 0.001 0.026 0.002 0.950 181 S 0.439 0.002 0.001 0.001 0.340 0.002 0.215 182 F 0.974 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 183 T 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 184 G 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 185 V 0.934 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.059 186 T 0.542 0.007 0.002 0.003 0.085 0.011 0.349 187 S 0.099 0.006 0.018 0.010 0.270 0.134 0.463 188 G 0.021 0.015 0.040 0.014 0.368 0.249 0.292 189 M 0.020 0.017 0.059 0.037 0.370 0.205 0.292 190 T 0.014 0.025 0.051 0.053 0.339 0.134 0.384 191 T 0.009 0.017 0.043 0.107 0.198 0.122 0.505 192 A 0.003 0.004 0.122 0.536 0.084 0.125 0.126 193 Q 0.004 0.003 0.145 0.654 0.039 0.088 0.067 194 E 0.003 0.003 0.142 0.717 0.026 0.056 0.054 195 F 0.004 0.002 0.139 0.744 0.018 0.050 0.042 196 Q 0.005 0.002 0.219 0.640 0.013 0.094 0.025 197 A 0.011 0.002 0.189 0.580 0.024 0.155 0.038 198 Y 0.014 0.013 0.089 0.503 0.104 0.194 0.082 199 P 0.053 0.030 0.025 0.080 0.147 0.232 0.433 200 Y 0.052 0.003 0.003 0.006 0.062 0.019 0.856 201 D 0.298 0.003 0.005 0.007 0.493 0.020 0.173 202 R 0.919 0.027 0.002 0.004 0.010 0.003 0.034 203 I 0.949 0.007 0.002 0.004 0.002 0.003 0.033 204 I 0.803 0.009 0.001 0.004 0.017 0.007 0.159 205 S 0.161 0.016 0.002 0.002 0.337 0.027 0.455 206 T 0.018 0.007 0.001 0.002 0.656 0.006 0.312 207 L 0.001 0.002 0.162 0.662 0.058 0.066 0.050 208 G 0.001 0.001 0.249 0.674 0.016 0.051 0.008 209 Q 0.001 0.004 0.291 0.646 0.008 0.044 0.006 210 L 0.001 0.001 0.049 0.924 0.005 0.015 0.005 211 I 0.001 0.001 0.028 0.942 0.003 0.021 0.005 212 S 0.001 0.001 0.039 0.883 0.003 0.066 0.008 213 V 0.001 0.001 0.027 0.900 0.005 0.056 0.011 214 P 0.002 0.010 0.032 0.860 0.019 0.048 0.029 215 E 0.002 0.002 0.072 0.694 0.020 0.188 0.023 216 D 0.001 0.002 0.091 0.658 0.044 0.160 0.044 217 K 0.002 0.006 0.104 0.497 0.088 0.184 0.119 218 S 0.002 0.007 0.032 0.117 0.081 0.662 0.099 219 G 0.002 0.003 0.015 0.024 0.266 0.442 0.248 220 C 0.006 0.011 0.007 0.017 0.491 0.048 0.421 221 P 0.009 0.028 0.003 0.008 0.007 0.029 0.917 222 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999