This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA N A 3 3 NATAA A A 4 4 NATAA M A 5 5 NATAA R A 6 6 NATAA K A 7 7 NATAA D A 8 8 NATAA E A 9 9 NATAA T A 10 10 NATAA S A 11 11 NATAA N A 12 12 NATAA T A 13 13 NATAA S A 14 14 NATRO P A 15 15 NATAA D A 16 16 NATAA I A 17 17 NATAA S A 18 18 NATAA V A 19 19 NATAA A A 20 20 NATAA Q A 21 21 NATRO P A 22 22 NATAA A A 23 23 NATAA S A 24 24 NATAA A A 25 25 NATAA L A 26 26 NATAA R A 27 27 NATAA Y A 28 28 NATAA H A 29 29 NATAA L A 30 30 NATAA R A 31 31 NATRO P A 32 32 NATRO P A 33 33 NATAA R A 34 34 NATAA R A 35 35 NATAA N A 36 36 NATAA D A 37 37 NATAA G A 38 38 NATAA A A 39 39 NATAA A A 40 40 NATAA I A 41 41 NATAA H A 42 42 NATAA Q A 43 43 NATAA L A 44 44 NATAA V A 45 45 NATAA S A 46 46 NATAA E A 47 47 NATRO C A 48 48 NATRO P A 49 49 NATRO P A 50 50 NATAA L A 51 51 NATAA D A 52 52 NATAA L A 53 53 NATAA N A 54 54 NATAA S A 55 55 NATAA L A 56 56 NATAA Y A 57 57 NATAA A A 58 58 NATAA Y A 59 59 NATAA L A 60 60 NATAA L A 61 61 NATAA L A 62 62 NATRO C A 63 63 NATAA E A 64 64 NATAA H A 65 65 NATAA H A 66 66 NATAA A A 67 67 NATAA H A 68 68 NATAA T A 69 69 NATRO C A 70 70 NATAA V A 71 71 NATAA V A 72 72 NATAA A A 73 73 NATAA E A 74 74 NATAA S A 75 75 NATRO P A 76 76 NATAA G A 77 77 NATAA G A 78 78 NATAA R A 79 79 NATAA I A 80 80 NATAA D A 81 81 NATAA G A 82 82 NATAA F A 83 83 NATAA V A 84 84 NATAA S A 85 85 NATAA A A 86 86 NATAA Y A 87 87 NATAA L A 88 88 NATAA L A 89 89 NATRO P A 90 90 NATAA T A 91 91 NATAA R A 92 92 NATRO P A 93 93 NATAA D A 94 94 NATAA V A 95 95 NATAA L A 96 96 NATAA F A 97 97 NATAA V A 98 98 NATAA W A 99 99 NATAA Q A 100 100 NATAA V A 101 101 NATAA A A 102 102 NATAA V A 103 103 NATAA H A 104 104 NATAA S A 105 105 NATAA R A 106 106 NATAA A A 107 107 NATAA R A 108 108 NATAA G A 109 109 NATAA H A 110 110 NATAA R A 111 111 NATAA L A 112 112 NATAA G A 113 113 NATAA R A 114 114 NATAA A A 115 115 NATAA M A 116 116 NATAA L A 117 117 NATAA G A 118 118 NATAA H A 119 119 NATAA I A 120 120 NATAA L A 121 121 NATAA E A 122 122 NATAA R A 123 123 NATAA Q A 124 124 NATAA E A 125 125 NATRO C A 126 126 NATAA R A 127 127 NATAA H A 128 128 NATAA V A 129 129 NATAA R A 130 130 NATAA H A 131 131 NATAA L A 132 132 NATAA E A 133 133 NATAA T A 134 134 NATAA T A 135 135 NATAA V A 136 136 NATAA G A 137 137 NATRO P A 138 138 NATAA D A 139 139 NATAA N A 140 140 NATAA Q A 141 141 NATAA A A 142 142 NATAA S A 143 143 NATAA R A 144 144 NATAA R A 145 145 NATAA T A 146 146 NATAA F A 147 147 NATAA A A 148 148 NATAA G A 149 149 NATAA L A 150 150 NATAA A A 151 151 NATAA G A 152 152 NATAA E A 153 153 NATAA R A 154 154 NATAA G A 155 155 NATAA A A 156 156 NATAA H A 157 157 NATAA V A 158 158 NATAA S A 159 159 NATAA E A 160 160 NATAA Q A 161 161 NATRO P A 162 162 NATAA F A 163 163 NATAA F A 164 164 NATAA D A 165 165 NATAA R A 166 166 NATAA Q A 167 167 NATAA A A 168 168 NATAA F A 169 169 NATAA G A 170 170 NATAA G A 171 171 NATAA A A 172 172 NATAA D A 173 173 NATAA H A 174 174 NATAA D A 175 175 NATAA D A 176 176 NATAA E A 177 177 NATAA M A 178 178 NATAA L A 179 179 NATAA L A 180 180 NATAA R A 181 181 NATAA I A 182 182 NATAA G A 183 183 NATRO P A 184 184 NATAA F A 185 185 NATAA T A 186 186 NATAA H A 187 187 NATRO P A 188 188 NATRO P A 189 189 NATAA H