This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA W A 3 3 NATAA K A 4 4 NATAA A A 5 5 NATAA V A 6 6 NATAA M A 7 7 NATAA N A 8 8 NATAA A A 9 9 NATAA W A 10 10 NATAA N A 11 11 NATAA G A 12 12 NATAA T A 13 13 NATAA E A 14 14 NATAA S A 15 15 NATAA Q A 16 16 NATAA S A 17 17 NATAA K A 18 18 NATAA N A 19 19 NATAA V A 20 20 NATAA S A 21 21 NATAA N A 22 22 NATAA I A 23 23 NATAA Q A 24 24 NATAA S A 25 25 NATAA Y A 26 26 NATAA S A 27 27 NATAA F A 28 28 NATAA E A 29 29 NATAA D A 30 30 NATAA M A 31 31 NATAA K A 32 32 NATAA R A 33 33 NATAA I A 34 34 NATAA V A 35 35 NATAA G A 36 36 NATAA K A 37 37 NATAA H A 38 38 NATAA D A 39 39 NATRO P A 40 40 NATAA N A 41 41 NATAA V A 42 42 NATAA V A 43 43 NATAA L A 44 44 NATAA V A 45 45 NATAA D A 46 46 NATAA V A 47 47 NATAA R A 48 48 NATAA E A 49 49 NATRO P A 50 50 NATAA S A 51 51 NATAA E A 52 52 NATAA Y A 53 53 NATAA S A 54 54 NATAA I A 55 55 NATAA V A 56 56 NATAA H A 57 57 NATAA I A 58 58 NATRO P A 59 59 NATAA A A 60 60 NATAA S A 61 61 NATAA I A 62 62 NATAA N A 63 63 NATAA V A 64 64 NATRO P A 65 65 NATAA Y A 66 66 NATAA R A 67 67 NATAA S A 68 68 NATAA H A 69 69 NATRO P A 70 70 NATAA D A 71 71 NATAA A A 72 72 NATAA F A 73 73 NATAA A A 74 74 NATAA L A 75 75 NATAA D A 76 76 NATRO P A 77 77 NATAA L A 78 78 NATAA E A 79 79 NATAA F A 80 80 NATAA E A 81 81 NATAA K A 82 82 NATAA Q A 83 83 NATAA I A 84 84 NATAA G A 85 85 NATAA I A 86 86 NATRO P A 87 87 NATAA K A 88 88 NATRO P A 89 89 NATAA D A 90 90 NATAA S A 91 91 NATAA A A 92 92 NATAA K A 93 93 NATAA E A 94 94 NATAA L A 95 95 NATAA I A 96 96 NATAA F A 97 97 NATAA Y A 98 98 NATRO C A 99 99 NATAA A A 100 100 NATAA S A 101 101 NATAA G A 102 102 NATAA K A 103 103 NATAA R A 104 104 NATAA G A 105 105 NATAA G A 106 106 NATAA E A 107 107 NATAA A A 108 108 NATAA Q A 109 109 NATAA K A 110 110 NATAA V A 111 111 NATAA A A 112 112 NATAA S A 113 113 NATAA S A 114 114 NATAA H A 115 115 NATAA G A 116 116 NATAA Y A 117 117 NATAA S A 118 118 NATAA N A 119 119 NATAA T A 120 120 NATAA S A 121 121 NATAA L A 122 122 NATAA Y A 123 123 NATRO P A 124 124 NATAA G A 125 125 NATAA S A 126 126 NATAA M A 127 127 NATAA N A 128 128 NATAA D A 129 129 NATAA W A 130 130 NATAA V A 131 131 NATAA S A 132 132 NATAA H A 133 133 NATAA G A 134 134 NATAA G A 135 135 NATAA D A 136 136 NATAA K A 137 137 NATAA L A 138 138 NATAA D A 139 139 NATAA L