This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA N A 3 3 NATAA E A 4 4 NATAA T A 5 5 NATAA E A 6 6 NATAA K A 7 7 NATAA L A 8 8 NATAA V A 9 9 NATAA A A 10 10 NATAA A A 11 11 NATAA L A 12 12 NATAA L A 13 13 NATAA E A 14 14 NATAA R A 15 15 NATAA N A 16 16 NATAA F A 17 17 NATAA G A 18 18 NATAA K A 19 19 NATAA N A 20 20 NATAA I A 21 21 NATAA G A 22 22 NATAA T A 23 23 NATAA R A 24 24 NATAA Y A 25 25 NATRO P A 26 26 NATAA G A 27 27 NATAA N A 28 28 NATAA E A 29 29 NATAA A A 30 30 NATAA A A 31 31 NATAA Q A 32 32 NATAA M A 33 33 NATAA R A 34 34 NATAA A A 35 35 NATAA E A 36 36 NATAA E A 37 37 NATAA V A 38 38 NATAA I A 39 39 NATAA G A 40 40 NATAA E A 41 41 NATAA I A 42 42 NATAA A A 43 43 NATAA I A 44 44 NATAA V A 45 45 NATAA I A 46 46 NATAA A A 47 47 NATRO P A 48 48 NATAA L A 49 49 NATAA V A 50 50 NATAA E A 51 51 NATAA K A 52 52 NATAA L A 53 53 NATAA G A 54 54 NATAA I A 55 55 NATAA E A 56 56 NATAA N A 57 57 NATAA K A 58 58 NATAA T A 59 59 NATAA V A 60 60 NATAA K A 61 61 NATAA K A 62 62 NATAA T A 63 63 NATAA I A 64 64 NATRO P A 65 65 NATAA F A 66 66 NATAA L A 67 67 NATAA Y A 68 68 NATAA E A 69 69 NATAA L A 70 70 NATAA Q A 71 71 NATAA K A 72 72 NATAA N A 73 73 NATAA Q A 74 74 NATAA F A 75 75 NATRO C A 76 76 NATAA D A 77 77 NATAA M A 78 78 NATAA S A 79 79 NATAA A A 80 80 NATAA Y A 81 81 NATRO P A 82 82 NATAA Y A 83 83 NATRO P A 84 84 NATAA L A 85 85 NATAA L A 86 86 NATAA L A 87 87 NATAA V A 88 88 NATAA N A 89 89 NATAA G A 90 90 NATAA T A 91 91 NATAA S A 92 92 NATAA T A 93 93 NATAA D A 94 94 NATAA T A 95 95 NATAA E A 96 96 NATAA K A 97 97 NATAA Y A 98 98 NATAA W A 99 99 NATAA R A 100 100 NATAA D A 101 101 NATAA L A 102 102 NATRO P A 103 103 NATAA T A 104 104 NATAA Y A 105 105 NATAA W A 106 106 NATAA T A 107 107 NATAA D A 108 108 NATAA D A 109 109 NATAA A A 110 110 NATAA N A 111 111 NATAA K A 112 112 NATAA I A 113 113 NATAA V A 114 114 NATAA L A 115 115 NATRO P A 116 116 NATAA Y A 117 117 NATAA V A 118 118 NATAA L A 119 119 NATAA E A 120 120 NATAA H A 121 121 NATAA I A 122 122 NATAA K A 123 123 NATAA N A 124 124 NATAA N A 125 125 NATAA K A 126 126 NATAA V A 127 127 NATAA R A 128 128 NATAA Q A 129 129 NATAA K A 130 130 NATAA L A 131 131 NATAA L A 132 132 NATAA A A 133 133 NATAA F A 134 134 NATAA H A 135 135 NATAA A A 136 136 NATAA W A 137 137 NATAA L A 138 138 NATAA L A 139 139 NATAA G A 140 140 NATAA E A 141 141 NATAA V A 142 142 NATAA V A 143 143 NATAA E A 144 144 NATAA M A 145 145 NATAA N A 146 146 NATAA E A 147 147 NATAA A A 148 148 NATAA L A 149 149 NATAA G A 150 150 NATAA A A 151 151 NATAA D A 152 152 NATAA F A 153 153 NATAA R A 154 154 NATAA V A 155 155 NATAA K A 156 156 NATAA L A 157 157 NATAA V A 158 158 NATAA F A 159 159 NATAA E A 160 160 NATAA S A 161 161 NATAA D A 162 162 NATAA M A 163 163 NATAA R A 164 164 NATAA I A 165 165 NATAA R A 166 166 NATAA L A 167 167 NATAA R A 168 168 NATAA V A 169 169 NATAA Y A 170 170 NATAA E A 171 171 NATAA V A 172 172 NATAA E A 173 173 NATAA Q A 174 174 NATAA I A 175 175 NATAA A A 176 176 NATAA I A 177 177 NATAA E A 178 178 NATAA V A 179 179 NATAA H A 180 180 NATAA F A 181 181 NATAA L A 182 182 NATAA D A 183 183 NATAA N A 184 184 NATAA H A 185 185 NATAA D A 186 186 NATAA T A 187 187 NATAA E A 188 188 NATAA Q A 189 189 NATAA Q A 190 190 NATAA H A 191 191 NATAA L A 192 192 NATAA G A 193 193 NATAA Y A 194 194 NATAA D A 195 195 NATAA V A 196 196 NATAA S A 197 197 NATAA L A 198 198 NATAA D A 199 199 NATAA A A 200 200 NATAA D A 201 201 NATAA F A 202 202 NATAA T A 203 203 NATAA E A 204 204 NATAA K A 205 205 NATAA A A 206 206 NATAA R A 207 207 NATAA L A 208 208 NATAA L A 209 209 NATAA L A 210 210 NATAA R A 211 211 NATAA Q A 212 212 NATAA G A 213 213 NATAA I A 214 214 NATAA L A 215 215 NATAA T A 216 216 NATAA E A 217 217 NATAA N A 218 218 NATAA L A 219 219 NATAA G A 220 220 NATAA L A 221 221 NATAA E A 222 222 NATAA A A 223 223 NATAA L A 224 224 NATAA K A 225 225 NATAA A A 226 226 NATAA Y A 227 227 NATAA M A 228 228 NATAA K A 229 229 NATAA S A 230 230 NATAA V A 231 231 NATAA L A 232 232 NATRO P A 233 233 NATAA I A 234 234 NATAA A A 235 235 NATAA H A 236 236 NATAA S A 237 237 NATAA L A 238 238 NATAA K A 239 239 NATAA N A 240 240 NATAA L A 241 241 NATAA E A 242 242 NATAA H A 243 243 NATAA L A 244 244 NATAA T A 245 245 NATAA F A 246 246 NATAA E A 247 247 NATAA E A 248 248 NATAA T A 249 249 NATAA K A 250 250 NATAA K A 251 251 NATAA L A 252 252 NATAA T A 253 253 NATAA K A 254 254 NATAA L A 255 255 NATAA L A 256 256 NATAA T A 257 257 NATAA Q A 258 258 NATAA E A 259 259 NATAA E A 260 260 NATRO P A 261 261 NATAA K A 262 262 NATAA I A 263 263 NATAA M A 264 264 NATAA E A 265 265 NATAA D A 266 266 NATAA T A 267 267 NATAA D A 268 268 NATAA L A 269 269 NATAA T A 270 270 NATAA S A 271 271 NATAA K A 272 272 NATAA A A 273 273 NATAA L A 274 274 NATAA D A 275 275 NATAA F A 276 276 NATAA L A 277 277 NATAA Q A 278 278 NATAA K A 279 279 NATAA A A 280 280 NATAA A A 281 281 NATAA Q A 282 282 NATAA Q