This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA S A 3 3 NATAA K A 4 4 NATAA R A 5 5 NATAA A A 6 6 NATAA N A 7 7 NATAA K A 8 8 NATAA L A 9 9 NATAA V A 10 10 NATAA I A 11 11 NATAA V A 12 12 NATAA T A 13 13 NATAA E A 14 14 NATAA K A 15 15 NATAA V A 16 16 NATAA L A 17 17 NATAA L A 18 18 NATAA K A 19 19 NATAA K A 20 20 NATAA V A 21 21 NATAA A A 22 22 NATAA K A 23 23 NATAA I A 24 24 NATAA I A 25 25 NATAA E A 26 26 NATAA E A 27 27 NATAA A A 28 28 NATAA G A 29 29 NATAA A A 30 30 NATAA T A 31 31 NATAA G A 32 32 NATAA Y A 33 33 NATAA T A 34 34 NATAA V A 35 35 NATAA V A 36 36 NATAA D A 37 37 NATAA T A 38 38 NATAA G A 39 39 NATAA G A 40 40 NATAA K A 41 41 NATAA G A 42 42 NATAA S A 43 43 NATAA R A 44 44 NATAA N A 45 45 NATAA V A 46 46 NATAA R A 47 47 NATAA S A 48 48 NATAA T A 49 49 NATAA G A 50 50 NATAA K A 51 51 NATRO P A 52 52 NATAA N A 53 53 NATAA T A 54 54 NATAA S A 55 55 NATAA D A 56 56 NATAA T A 57 57 NATAA D A 58 58 NATAA S A 59 59 NATAA N A 60 60 NATAA V A 61 61 NATAA K A 62 62 NATAA F A 63 63 NATAA E A 64 64 NATAA V A 65 65 NATAA L A 66 66 NATAA T A 67 67 NATAA E A 68 68 NATAA N A 69 69 NATAA R A 70 70 NATAA E A 71 71 NATAA M A 72 72 NATAA A A 73 73 NATAA E A 74 74 NATAA K A 75 75 NATAA I A 76 76 NATAA A A 77 77 NATAA D A 78 78 NATAA Q A 79 79 NATAA V A 80 80 NATAA A A 81 81 NATAA I A 82 82 NATAA K A 83 83 NATAA F A 84 84 NATAA F A 85 85 NATAA T A 86 86 NATAA D A 87 87 NATAA Y A 88 88 NATAA A A 89 89 NATAA G A 90 90 NATAA I A 91 91 NATAA I A 92 92 NATAA Y A 93 93 NATAA I A 94 94 NATRO C A 95 95 NATAA E A 96 96 NATAA A A 97 97 NATAA E A 98 98 NATAA V A 99 99 NATAA L A 100 100 NATAA Y A 101 101 NATAA G A 102 102 NATAA R A 103 103 NATAA T A 104 104 NATAA F A 105 105 NATRO C A 106 106 NATAA G A 107 107 NATRO P A 108 108 NATAA D A 109 109 NATAA G A 110 110 NATRO C