Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 50 60 | | | | | | 1 MSMKKTKNWLLVFLTVTFCFLMLGCQSKEDKKGGTKPSN..EAALTKTEN..LDFRLSFNKIKVT 2 MIPLKKITVGTIICLSFLGLTACSSSNTQQTSTSKSNVS..QHKNIKADH..EELRLKFNKVKLG 3 MIPLKKITVGTIVCLSFLGLTACSSSNTQQTSTSKSNVS..QHKNIKADH..EELRLKFNKVKLG 4 ----TKKHLLTLLLISFFTSFLVACSTTKDKEPQPSDSEiiTPRLHQAAH..QDKRANFEKIKLA 5 ----TKKHLLTLLLISFFTSFLVACSTTKDKEPQPSDSEniTPRLHQAAH..QDKRANFEKIKLA 6 ----TKKHLLTLLLISFFTSFLVACSTTKDKEPQPSDSEiiTPRLHQAAH..QDKRANFEKIKLA 7 ----TKKHLLTLLLISFFTSFLVACSTTKDKKPQPSDSEiiTPRLHQAAH..QDKRANFEKIKLA 8 ----TKKHLLTLLLISFFTSFLVACSTTKDKEPQPSDSEiiTPRLHQAAH..QDKRANFEKIKLA 9 ----TKKHLLTLLLISFFTSFLVACSTTKDKEPQPSDSEiiTPRLHQAAH..QDKRANFEKIKLA 10 ----------TIVCLSFLGLTACSSSNTQQTXTSKSNVS..QHKNIKADH..EELRLKFNKVKLG 11 MSMKKTKNWLLVFLTVTFCFLMLGCQSKEDKKGGTKPSN..EAALTKTEN..LDFRLSFNKIKVT 12 -EPFYKKIWFWIIAIVIICGVASYGDSKKINITDTKNSD..KTEIKKDDT..RKVTY-------- 13 -EPFYKKIWFWIIAIVIVCGVASYGDSKKINITDTKNSA..KTETKKDDT..RKVTY-------- 14 -EPFYKKIWFWIIAIVIVFGVASYGGSKKINITDTKNSP..KTEIKKDDT..RKVTY-------- 15 -EPFYKKIWFWIIAIVIVCGVASYGDSKKINITDTKNSA..KTDTKKDDT..RKVTY-------- 16 -EPFYKKIWFWIIAMVIVFGVANYGGSKKINIIDTKNSS..ETGIKKDDT..RKVTY-------- 17 -KPFYKKFWIWIIAIIIIGGVIGSNGSKKTGNTSNNSST..KKEAKKEDT..RKITY-------- 18 -KPFYKKFWFWIIAIIIIGGVIGSNGSKKTGNTSNNNST..KKEAKKEDT..RKITY-------- 19 MKKKYLVAATGLALLGLSMSACSSNSGSKSDSAKTSQKK..KKNETISQN..KELREKFDQIKVG 20 MKKKYLVAATGLALLGLSMSACSSNSGSKSDSATTSQQK..KKNETISQN..KELREKFDQVKVG 21 MKKKYLVAATGLALLGLSLSACSSNSSKGNSEKTTEQSK..KKNKVISQN..KELREKFDQIKVG 22 ---------------------------------------..---------..------FNKVKLG 23 MIPLKKITVGTIVCLSFLGLTACSSSNTQQTSTSKSNVS..QHKNIKADH..EELRLKFNKVKLG 24 MKSKMKIIFSITMFFALVSVGVIKLNKENAAAYAAKGKA..LSHHMKNSV..KDKKYSMKK---- 25 -----------VLLIAFAALALTACSSKKATTDSESDKK..AASSISSSNvvKQTSNKINLTNYK 26 -----------VLLIAFAALALTACSSKKATTDSESDKK..AASSISSSNvvKQNSNKINLTNYK 27 -----------------------ATNSSKNDTKKESSEK..KSEDKSKDN..SDLKATYDKINVG 28 -----------------------ATNSSKNDTKKESSEK..KSEDKSKDN..SDLKATYDKINVG 29 ---------------------------------------..---------..------------- 30 MIPLKKITVGTIVCLSFLGLTACSSSNTQQTSTSKSNVS..QHKNIKADH..EELRLKFNKVKLG 31 ---------------------------------------..---------..------------- 32 ----------ILVLGSAVALSLVACGDSTKEASNEKKEE..PKQEAKKEN..KENKESKKKITAA 33 -----------LVLGSAVALSLVACGDSTKEASNEKKEX..PKQEAKKEN..KENKESKKKITAA 34 ---------------------------------------..---------..------------- 35 ---------------------------------------..---------..------------- 36 ---------------------------------------..---------..------------- 37 ---------------------------------------..---------..------------- 38 ---------------------------------------..---------..------------- 39 ------------------------------SEKDLTSTN..RSELIAGED..YQFHITYDDIALL 40 ---------------------------------------..---------..------------- 41 ---------------------------------------..---------..------------- 42 ---------------------------------------..---------..------------- 43 ---------------------------------------..---------..------------- 44 ---------------------------------------..---------..------------- 45 --------------------------KVTV---------..---------..------------- 70 80 90 100 110 | | | | | 1 TDQNHFSG.GTSIEQLKQWFG.DPNKSEQRNAGNITLDSYTW.VKDG.....AVINAQ.LYKNST 2 VKANNFKG.GTSLAELKQLFGgEPNEKFDTPAGNVTLKGYRW.NVDD.....ISITIQ.LLNDSS 3 VKANNFKG.GTSLAELKQLFGgEPNEKFDTPAGNVTLKGYRW.NVDD.....ISITIQ.LLNDSS 4 TVDSSFTG.GTSLEELISLFG.EPNQHDPKTAGEVTIDAYTW.QFDQ.....VTLTVN.LYQNSS 5 TVDSSFTG.GTSLEELISLFG.EPNQHDPKTAGEVTIDAYTW.QFDQ.....VTLTVN.LYQNSS 6 TVDSSFTG.GTSLEELISLFG.EPSQHDPKTAGEVTIDAYTW.QFDQ.....VTLTVN.LYQNSS 7 TVDSSFTG.GTSLEELISLFG.EPSQHDPKTAGEVTIDAYTW.QFDQ.....VTLTVN.LYQNSS 8 TVDSSFTG.GTSLEELISLFG.EPSQHDPKTAGEVTINAYTW.QFDQ.....VTLTVN.LYQNSS 9 TVDSSFTG.GTSLEELISLFG.EPSQHDPKTAGEVTIDAYTW.QFDQ.....VTLTVN.LYQNSS 10 VKANNFKG.GTSLAELKQLFGgEPNEKFDTPAGNVTLKGYRW.NVDD.....ISITIQ.LLNDSS 11 TDQNHFSG.GTSIEQLKQWFG.DPNKSEQRNAGNITLDSYTW.VKDG.....AVINAQ.LYKNST 12 EKFCKIKI.GSTYEEVKSILG.EYKESKESEINGMKVVIYSW.YNDDn....SNMEVI.VKNNKV 13 EKFCKIKI.GSTYEEVKSILG.EYKESKESEINGMKVVIYSW.YNDDn....SNMEVI.VKNNKV 14 EKFCKIKI.GSTYEEVKSILG.EYKESKESEIDGMKVVIYTW.YNDDn....SNMEVI.VKNNKV 15 EKFCKIKI.GSTYEEVKSILG.EYKESKESEINDMKVVIYSW.YNDDn....SNMEVI.VKNNKV 16 EKFCKIKI.GSTYEEVKSILG.EYKESKESEINGMKVVIYTW.YNDDn....SNMEVI.VKNNKV 17 EKFSKVKM.GSTYEDVKNMLG.EAKESTSSEMGGIKTVIYTWdNGDG.....SNMNVT.FQNNKA 18 EKFSKVKM.GSTYEDVKNMLG.EGKESTSSEMGGIKTVIYTWdNGDG.....SNMNVT.FQNNKA 19 ELSNHGEG.GSTIQDVEKLLG.KANTTDTTTVDSYKTKSYIW.NKGA.....VTVTVQ.FEPDKA 20 ELSKHGEG.GSTIQDVEKLLG.KANTTDTTTVESYKTKSYIW.NKGA.....VTVTVQ.FEPDKV 21 NFLSQGEG.GSTIDEVKQLLG.SPTSTTTTSSNGVKLKQLTW.TKGA.....VTVAIQtLDSNKV 22 VKANNFKG.GTSLAELKQLFGgEPNEKFDTPAGNVTLKGYRW.NVDD.....ISITIQ.LLNDSS 23 VKANNFKG.GTSLAELKQLFGgEPNEKFDTPAGNVTLKGYRW.NVDD.....ISITIQ.LLNDSS 24 --FLRINM.GMNYKSVENILG.VSEKTGQINDKRELMNHQWK.NSDD.....SYIVVI.TKNNYV 25 KIKVVEKT.GSTPSQVTDLLGrEADAKSKAKTSKLKATIYTW.EGVQngsagANLAVE.FANGVA 26 KIKVVEKT.GSTPSQVTDLLGrEADAKSKAKTSKLKATIYTW.EGVQngsagANLAVE.FANGVA 27 DIMNSSEG.GSTEDEVKAILG.EPASSSTTDIQGISTTTLSW.TNVKggdllASITVS.FSDGKA 28 DIMNSSEG.GSTEDEVKAILG.EPASSSTTDIQGISTTTLSW.TNVKggdllASITVS.FSDGKA 29 --------.GSTYEEVKNMLG.EGKESTSSEMGGIKTVIYTWdNGDG.....SNMNVT.FQNNKA 30 VKANNFKG.GTSLAELTIIWW.RTNEX-LITAGNVTL-----.----.....------.------ 31 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 32 DV-EAIKV.GDSLT-------.--------------------.----.....------.------ 33 DV-EAIKV.GDSLT-------.--------------------.----.....------.------ 34 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 35 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 36 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 37 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 38 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 39 FADFKGTAsRLTADEVVAKLG.KAKSGREHNYDNQIITLNLD.YPDAgsn..ASVSIS.FSSYGS 40 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 41 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 42 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 43 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 44 --------.------------.--------------------.----.....------.------ 45 ENYDKIRV.GMTYDEVKQLLG.APNRCSD----VMTVKSCTW.GDEK.....RHVQVS.FVADQV 120 130 140 150 160 170 | | | | | | 1 VA..RSISNFSFS.....REAKIGKEDYDELKIGESY..KKVVEKLG.EPDVLSQSMSSDKEEMQ 2 IV..RSISNFKFI.....RDANITTKDYNSLKNGMSY..NKVKELLG.EPDDISQAVSSDKEELQ 3 IV..RSISNFKFI.....RDANITTKDYNSLKNGMSY..NKVKELLG.EPDDISQAVSSDKEELQ 4 IV..KTISNFTFA.....RELGLSQKEYQQLQKGMSY..EDVKKILT.EPDNYSQASSSDHQTLQ 5 IV..KTISNFTFA.....RELGLSQKEYQQLQKGMSY..EDVKKILT.EPDNYSQASSSDHQTLQ 6 IV..KTISNFTFA.....RELGLSQKEYQQLQKGMSY..EDVKKILT.EPDNYSQASSSDHQTLQ 7 IV..KTISNFTFA.....RELGLSQKEYQQLQKGMSY..EDVKKILT.EPDNYSQASSSDHQTLQ 8 IV..KTISNFTFA.....RELGLSQKEYQQLQKGMSY..EDAKKILT.EPDNYSQASSSDHQTLQ 9 IV..KTISNFTFA.....RELGLSQKEYQQLQKRMSY..EDVKKILT.EPDNYSQASSSDHQTLQ 10 IV..RSISNFKFI.....RDANITTKDYNSLKNGMSY..NKVKELLG.EPDDISQAVSSDKEELQ 11 VA..RSISNFSFS.....REAKIGKEDYDELKIGESY..KKVVEKLG.EPDVLSQSMSSDKEEMQ 12 IG..KAQAGLSMG.....K-ADVNLIKYAKITTGMDY..SKVEEILG.DGKLMSISKTNGSTKSI 13 IG..KAQAGLSMG.....K-ADVNLIKYAKITTGMDY..SKVEEILG.DGKLMSISKTNGSTKSI 14 IG..KAQAGLSMG.....K-ADVNLIKYTKIRTGMDY..SKVKEILG.DGKLMSISKTNGSTKSI 15 IG..KAQAGLSMG.....K-ADVNLIKYAKITTGMDY..SKVEEILG.DGKLMSISKTNGSTKSI 16 IG..KAQADLSMG.....K-ADVNLIKYAKITTGMDY..SKVEEILG.DGKLMSISKTNGSTKSI 17 LA..KAQAGLSRK.....R-ADVNMEKYNKIQTGMDY..NKVKEILG.DGELMSISEVGGSNTSI 18 LA..KAQAGLSRE.....K-ADVNMEKYNTIQTGMDY..NKIKEILG.AGELMSISEVGGSNTSI 19 VT..KDITGFKWGk....RDEKLDLAAFNSIQDGATY..DDIVKKYG.EPDSLNESLLLGTKTVT 20 VT..KDITGFKWGk....RDEKLDLAAFNSIQDGASY..DDIVKKYG.EPDSLNESLLLGTKTVT 21 VS..KEITGFKWGk....RDEKLTLGEFNNIADGSTY..QSLVDKYG.EPDGLHEANVAGTKITN 22 IV..RSISNFKFI.....RDANITTKDYNSLKNGMSY..NKVKELLG.EPDDISQAVSSDKEELQ 23 IV..RSISNFKFI.....RDANITTKDYNSLKNXXSY..NKVKELLG.EPDDISQAV-------- 24 VS..KIEIGLEKI.....N-ANISRVKYKKISRGMSY..EKVKNLVG.KGELLSETNLMGSNSKM 25 IA..KQISGLVVN.....RSKQITPKDYKSLKKGMTQ..EEVEAIVG.KPNGYSESDYSNSEVVL 26 IA..KQISGLVVN.....RSKQITPKDYKSLKKGMTQ..EEVEAIVG.KPNGYSESDYSNSEVVL 27 AS..KSVSGLKVA.....KHDKVTADQVNNIATDGSYseEQARKDLG.DPTGITSTNINGEKNDT 28 AS..KSVSGLKVA.....KHDKVTADQVNNIATDGSYseEQARKDLG.DPTGITSTNINGEKNDT 29 LA..KAQAGLSRE.....R-ADVNAEKYNRIQTGMDY..NKVKEILG.DGE-------------- 30 --..---------.....-------------------..--------.----------------- 31 --..---------.....---------YEDLKNGTSY..DNAVKILG.VPDVYSIAVSSDATMTQ 32 --..----G----.....-------------AGGEKY..EDVVAKFG.EPDNKAESQAGDIKMII 33 --..----G----.....-------------AGGEKY..EDVVAKFG.EPDNKAESQAGDIKMII 34 --..---------.....---------YEDLKNGTSY..DNAVKTLG.VPDVYSIAVSSDATMTQ 35 --..---------.....---------YEDLKNGTSY..DNAVQTLG.VPDVYSIAVSSDATMTQ 36 --..---------.....----ITKENYDKVKNGMSY..EEVVKIIGsEGEIVTETGEKGDDMYG 37 IA..IVLSAFLFG.....CFSKINQENYAKIENGMTM..EQVKDILG.EPTESQTAGIGSLSGTN 38 --..---------.....--ELVSQEKYKQLKLDMSY..EDVKKIMG.SPGKVKKFPGQPSTETT 39 VGtpKLDSLFSHHls8pnRNSQLTRQDFSGIEKGKSY..QEVVGQLG.LPDSLSI---------- 40 --..---------.....----LTMENYSKIKTGIGY..TEVVKILG.KPDNCSEALFV------ 41 --..---------.....----LTTENYEKIKMGMDY..GEVAGILG.KPDSCSEALFAKS---- 42 --..---------.....---KLTQENYAKLKMGLGY..GEVVTILG.KPDSCSEALFAKSC--- 43 --..---------.....-ENKVTRENYDKLAIGMEY..SKVVELLG.EPENCQSVVSV------ 44 --..---------.....-------ENYDKLRMGMHY..AEVKSILG.EPTRCSDLLAV----KA 45 V-..---------.....-------------------..--------.----------------- 180 190 200 | | | 1 TVWSSGIKTKSSSA.TIELYFENGLLKNKTQKDLE 2 AAWISGIQSSDSDP.GINLTFENDKLTNKQQHGL- 3 AAWISGIQSSDSDP.GINLTFENDKLTNKQQHGL- 4 AIWVSGLKTDTSGA.NISLVFENNQLTEMSQVGLE 5 AIWVSGLKTDTSGA.NISLVFENNQLTEMSQVGLE 6 AIWVSGLKTDTSGA.NISLVFENNQLTEMSQVGLE 7 AIWVSGLKTDTSGA.NISLVFENNQLTEMSQVGLE 8 AIWVSGLKTDTSGA.NISLVFENNQLTEMSQVGLE 9 AIWVSGLKTDTSGA.NISLVFENNQLTEMSQVGLE 10 AAWISGIQSSDSDP.GINLTFENDKLTNKQQHGL- 11 TVWSSGIKTKSSSA.TIELYFENGLLKNKTQKDLE 12 YLWA-----NPNGT.NMNVTFQNGKVTAKNRLGL- 13 YLWA-----NPNGT.NMNVTFQNGKVTAKNRLGL- 14 YLWA-----NPNGT.NMNVTFQNGKVTTKNRLGL- 15 YLWA-----NPNGT.NMNVTFQNGKVTAKNRLGL- 16 YLWA-----NPNGT.NMNVTFQNGKVTAKNRLGL- 17 YSWV-----NSNGT.NINVTFQDGKSAAKAQFGL- 18 YSWV-----NSNGT.NMNVTFQDGKSAAKAQFGL- 19 GLWYTGIKGKADGA.FASLTFENGALTSKTQTDL- 20 ALWYTGIKGKGAGA.NASLTFENGALTSKTQTDL- 21 AVWLTGIK-GDDGA.SATFSFENDKLSSKTQTKL- 22 AAWISGIQSSDSDP.GINLTFENDKLTNKQQHGL- 23 --------------.-------------------- 24 YQWV-----NSDGS.SMNITFTNGIVDYKTEKKL- 25 WLYTSGLK-SDDQA.NFYVTFQKNKLVAKKAQN-- 26 WLYTSGLK-SDDQA.NFYVTFQKNKLVAKKAQN-- 27 LIWMKNLD-GDLGA.TVTVSFSNGSAISKSSSGL- 28 LIWMKNLD-GDLGA.TVTVSFSNGNAISKSSSGL- 29 --------------.-------------------- 30 --------------.-------------------- 31 ALWSSNLVTKKGKTgSLTLNFKNGTLENKSQENL- 32 ASWTKNVN-GDLGA.NFNVTFT------------- 33 ASWTKNVN-GDLGA.NFNVTFT------------- 34 ALWSSNLVTKKGKTgSLTLNFKNGTLENKSQENL- 35 ALWSSNLVTKKGKTgSLTLNFKNGTLENKSQENL- 36 IAVLYENK-GSSLS.NATFIFLGDKLQSKSQYGLE 37 AIW------KSDSV.TIKLTFVNSKV--------- 38 YVWK----QKNSSY.RILVTLKDGKV--------- 39 --------------.-------------------- 40 ----RNCVWGNEQK.NITVSFVGDKAI-------- 41 CIW------GNEQK.NITVNFVGDKT--------- 42 -VW------GDEQK.NITVNFAGDRVV-------- 43 --------------.-------------------- 44 CTW------GDDAR.YINVNFVADQAV-------- 45 --------------.--------------------