PFRMAT RR
TARGET T0399
AUTHOR 4008-1775-0004
REMARK From group SAM-TO6 under the direction of
REMARK Kevin Karplus.
REMARK Residue-residue contact predictions
REMARK  by George Shackelford and Kevin Karplus
REMARK The value given is an approximation of the probability
REMARK as provided by the neural network.
REMARK The predictions are limited to a score >= .18 which
REMARK is an approximation of the probability.
REMARK
METHOD The predictor is an artificial neural network.
METHOD NN: con.aa5str2_5near5nsep5.entmi_epplccrr.th62.17.730_47.net
METHOD Inputs may include separation and sequence length,
METHOD e-value statistic based on mutual information values,
METHOD a statistic based on propensity of residues in contact.
METHOD Other inputs are distributions from alignments and
METHOD secondary predictions from SAM-t04 and/or SAM-t06 of
METHOD the University of California, Santa Cruz
MODEL 1
MSMKKTKNWLLVFLTVTFCFLMLGCQSKEDKKGGTKPSNEAALTKTENLD
FRLSFNKIKVTTDQNHFSG
4 13 0 8 0.0342292
4 14 0 8 0.0277338
4 15 0 8 0.022816
4 16 0 8 0.0244888
5 14 0 8 0.0279274
5 15 0 8 0.0222243
5 16 0 8 0.0234532
5 17 0 8 0.0182326
5 18 0 8 0.0192213
5 19 0 8 0.0161892
5 20 0 8 0.0140062
5 21 0 8 0.0128811
5 22 0 8 0.0123312
5 23 0 8 0.0162082
5 53 0 8 0.0450642
6 15 0 8 0.0352552
6 16 0 8 0.0353877
6 17 0 8 0.0259812
6 18 0 8 0.027299
6 19 0 8 0.0234281
6 20 0 8 0.0203641
6 21 0 8 0.0193673
6 22 0 8 0.0182771
6 23 0 8 0.0242662
6 25 0 8 0.0338457
6 43 0 8 0.0425207
6 51 0 8 0.0503775
6 53 0 8 0.0591292
6 55 0 8 0.0599161
6 60 0 8 0.0692807
7 16 0 8 0.0376848
7 17 0 8 0.0230099
7 18 0 8 0.022637
7 19 0 8 0.0194911
7 20 0 8 0.0170769
7 21 0 8 0.0163968
7 22 0 8 0.0161204
7 23 0 8 0.021343
7 24 0 8 0.0235227
7 25 0 8 0.0325384
7 27 0 8 0.0429124
7 43 0 8 0.0402553
7 45 0 8 0.0427328
7 53 0 8 0.0572426
7 55 0 8 0.0654061
7 60 0 8 0.0813963
8 17 0 8 0.0555183
8 18 0 8 0.0376086
8 19 0 8 0.0317994
8 20 0 8 0.026029
8 21 0 8 0.025628
8 22 0 8 0.0257938
8 23 0 8 0.0337932
8 24 0 8 0.0475532
8 25 0 8 0.0573216
8 26 0 8 0.0653822
8 27 0 8 0.0682123
8 35 0 8 0.080797
8 36 0 8 0.0869771
8 37 0 8 0.079571
8 45 0 8 0.0607142
8 53 0 8 0.0538
8 54 0 8 0.0812182
8 55 0 8 0.0721369
8 56 0 8 0.0616831
8 57 0 8 0.0590036
8 60 0 8 0.0954166
8 61 0 8 0.109401
8 62 0 8 0.0927074
8 63 0 8 0.0820369
9 18 0 8 0.11248
9 19 0 8 0.0913102
9 20 0 8 0.0762237
9 21 0 8 0.0735437
9 22 0 8 0.0707825
9 23 0 8 0.080404
9 24 0 8 0.0857
9 25 0 8 0.112655
9 26 0 8 0.104088
9 27 0 8 0.089211
9 28 0 8 0.0717707
9 30 0 8 0.0722295
9 35 0 8 0.089354
9 36 0 8 0.0851097
9 37 0 8 0.0883738
9 38 0 8 0.0822989
9 39 0 8 0.064119
9 41 0 8 0.0494899
9 42 0 8 0.0554403
9 43 0 8 0.0575458
9 45 0 8 0.0741226
9 46 0 8 0.0742015
9 49 0 8 0.0547784
9 51 0 8 0.0483356
9 52 0 8 0.0597819
9 53 0 8 0.0785015
9 54 0 8 0.0973309
9 55 0 8 0.101068
9 56 0 8 0.0681951
9 57 0 8 0.0660731
9 58 0 8 0.0569362
9 59 0 8 0.0832036
9 60 0 8 0.135544
9 61 0 8 0.128573
9 62 0 8 0.0923073
9 63 0 8 0.0744375
10 19 0 8 0.186034
10 20 0 8 0.167105
10 21 0 8 0.179405
10 22 0 8 0.146097
10 23 0 8 0.154982
10 24 0 8 0.108056
10 25 0 8 0.15377
10 26 0 8 0.122207
10 27 0 8 0.0994327
10 28 0 8 0.0808411
10 30 0 8 0.0745835
10 31 0 8 0.0700072
10 35 0 8 0.0972552
10 36 0 8 0.0855627
10 37 0 8 0.0887409
10 38 0 8 0.0817424
10 39 0 8 0.0670863
10 41 0 8 0.0659635
10 42 0 8 0.0767482
10 43 0 8 0.10094
10 45 0 8 0.081936
10 46 0 8 0.0907884
10 49 0 8 0.0869872
10 51 0 8 0.0770409
10 52 0 8 0.0856672
10 53 0 8 0.157647
10 54 0 8 0.13125
10 55 0 8 0.147622
10 56 0 8 0.0901822
10 57 0 8 0.0868473
10 58 0 8 0.161803
10 59 0 8 0.11496
10 60 0 8 0.212235
10 61 0 8 0.145877
10 62 0 8 0.100309
10 63 0 8 0.069546
11 20 0 8 0.165985
11 21 0 8 0.182979
11 22 0 8 0.13311
11 23 0 8 0.138904
11 24 0 8 0.0881722
11 25 0 8 0.129528
11 26 0 8 0.100223
11 27 0 8 0.0802518
11 28 0 8 0.0636091
11 30 0 8 0.0646837
11 35 0 8 0.0884221
11 36 0 8 0.0813557
11 37 0 8 0.0827909
11 38 0 8 0.0737926
11 39 0 8 0.0560497
11 41 0 8 0.0629357
11 42 0 8 0.0772399
11 43 0 8 0.104719
11 45 0 8 0.0636572
11 46 0 8 0.0799268
11 49 0 8 0.0959979
11 51 0 8 0.0933459
11 52 0 8 0.0969258
11 53 0 8 0.169075
11 54 0 8 0.133241
11 55 0 8 0.142437
11 56 0 8 0.093664
11 57 0 8 0.090518
11 58 0 8 0.19466
11 59 0 8 0.116263
11 60 0 8 0.238057
11 61 0 8 0.149948
11 62 0 8 0.100372
12 21 0 8 0.201848
12 22 0 8 0.131745
12 23 0 8 0.161198
12 24 0 8 0.09135
12 25 0 8 0.133222
12 26 0 8 0.103788
12 27 0 8 0.0842293
12 30 0 8 0.0787491
12 35 0 8 0.105783
12 36 0 8 0.0967607
12 37 0 8 0.0980632
12 38 0 8 0.0926926
12 39 0 8 0.0713994
12 41 0 8 0.0828712
12 42 0 8 0.0996059
12 43 0 8 0.134512
12 45 0 8 0.0722164
12 46 0 8 0.0921577
12 49 0 8 0.139714
12 51 0 8 0.112738
12 52 0 8 0.110164
12 53 0 8 0.194918
12 54 0 8 0.129942
12 55 0 8 0.141045
12 56 0 8 0.101947
12 57 0 8 0.105332
12 58 0 8 0.303188
12 59 0 8 0.117231
12 60 0 8 0.241166
12 61 0 8 0.119683
12 62 0 8 0.078498
13 22 0 8 0.111045
13 23 0 8 0.100288
13 24 0 8 0.0788597
13 25 0 8 0.117924
13 26 0 8 0.0813456
13 27 0 8 0.0649756
13 30 0 8 0.0612042
13 35 0 8 0.0850878
13 36 0 8 0.0833338
13 37 0 8 0.110743
13 38 0 8 0.102272
13 39 0 8 0.0757793
13 40 0 8 0.0695415
13 41 0 8 0.0918216
13 42 0 8 0.110355
13 43 0 8 0.114116
13 49 0 8 0.134968
13 50 0 8 0.0940324
13 51 0 8 0.163194
13 52 0 8 0.144011
13 53 0 8 0.189342
13 54 0 8 0.152236
13 55 0 8 0.176605
13 56 0 8 0.128435
13 57 0 8 0.135893
13 58 0 8 0.241789
13 59 0 8 0.156392
13 60 0 8 0.210334
13 61 0 8 0.159684
14 23 0 8 0.193863
14 24 0 8 0.123332
14 25 0 8 0.122408
14 26 0 8 0.0909671
14 27 0 8 0.0688749
14 30 0 8 0.0784869
14 35 0 8 0.0936119
14 36 0 8 0.100628
14 37 0 8 0.104627
14 38 0 8 0.0984211
14 39 0 8 0.0745797
14 40 0 8 0.070003
14 41 0 8 0.0937277
14 42 0 8 0.109891
14 43 0 8 0.127916
14 45 0 8 0.0588106
14 49 0 8 0.154292
14 50 0 8 0.0924076
14 51 0 8 0.145894
14 52 0 8 0.129523
14 53 0 8 0.172514
14 54 0 8 0.11977
14 55 0 8 0.128694
14 56 0 8 0.112098
14 57 0 8 0.0952197
14 58 0 8 0.216696
14 59 0 8 0.0843871
14 60 0 8 0.130155
15 25 0 8 0.0760026
15 27 0 8 0.0465542
15 35 0 8 0.0572076
15 36 0 8 0.0698359
15 37 0 8 0.0702782
15 38 0 8 0.0670124
15 39 0 8 0.0507031
15 41 0 8 0.0549167
15 42 0 8 0.0664866
15 43 0 8 0.0622128
15 49 0 8 0.0845797
15 51 0 8 0.0969354
15 52 0 8 0.093963
15 53 0 8 0.0983397
15 54 0 8 0.0795059
15 55 0 8 0.0754979
15 56 0 8 0.0745014
15 57 0 8 0.0822526
15 58 0 8 0.109441
15 59 0 8 0.066214
15 60 0 8 0.0744139
16 25 0 8 0.0968718
16 26 0 8 0.0530941
16 27 0 8 0.0540527
16 30 0 8 0.0614967
16 35 0 8 0.0751831
16 36 0 8 0.0845121
16 37 0 8 0.0863565
16 38 0 8 0.0811362
16 39 0 8 0.0594891
16 40 0 8 0.0543839
16 41 0 8 0.0772017
16 42 0 8 0.0920186
16 43 0 8 0.122827
16 49 0 8 0.148465
16 51 0 8 0.121019
16 52 0 8 0.102551
16 53 0 8 0.146948
16 54 0 8 0.0873422
16 55 0 8 0.0995628
16 56 0 8 0.082418
16 57 0 8 0.0931714
16 58 0 8 0.238072
16 59 0 8 0.0830252
16 60 0 8 0.156183
17 27 0 8 0.0548519
17 30 0 8 0.0668556
17 35 0 8 0.0753112
17 36 0 8 0.0862698
17 37 0 8 0.0904964
17 38 0 8 0.0843794
17 39 0 8 0.06942
17 41 0 8 0.0736757
17 42 0 8 0.087292
17 43 0 8 0.0833309
17 49 0 8 0.10284
17 51 0 8 0.106125
17 52 0 8 0.101055
17 53 0 8 0.110576
17 54 0 8 0.0918864
17 55 0 8 0.0955961
17 57 0 8 0.084477
17 58 0 8 0.106698
17 60 0 8 0.0936062
18 27 0 8 0.0686129
18 30 0 8 0.0728085
18 35 0 8 0.0849329
18 37 0 8 0.103538
18 41 0 8 0.0867328
18 42 0 8 0.101982
18 43 0 8 0.105735
18 49 0 8 0.123162
18 51 0 8 0.129638
18 52 0 8 0.106144
18 53 0 8 0.123691
18 54 0 8 0.0928231
18 55 0 8 0.105212
18 57 0 8 0.0872457
18 58 0 8 0.130175
18 60 0 8 0.103675
19 30 0 8 0.0925331
19 35 0 8 0.0997952
19 36 0 8 0.108022
19 37 0 8 0.122785
19 41 0 8 0.0985628
19 42 0 8 0.115336
19 43 0 8 0.117727
19 49 0 8 0.138007
19 51 0 8 0.148163
19 52 0 8 0.123323
19 53 0 8 0.138804
19 54 0 8 0.107663
19 55 0 8 0.116552
19 57 0 8 0.0975084
19 58 0 8 0.148612
19 60 0 8 0.117523
20 30 0 8 0.0719612
20 35 0 8 0.0854759
20 37 0 8 0.109084
20 41 0 8 0.0904337
20 42 0 8 0.107686
20 43 0 8 0.110338
20 49 0 8 0.131635
20 51 0 8 0.145179
20 52 0 8 0.119296
20 53 0 8 0.137497
20 54 0 8 0.0958028
20 55 0 8 0.111763
20 57 0 8 0.0917705
20 58 0 8 0.155246
20 60 0 8 0.108454
21 30 0 8 0.0554205
21 35 0 8 0.0733728
21 36 0 8 0.0828138
21 37 0 8 0.0951409
21 41 0 8 0.091814
21 42 0 8 0.109069
21 43 0 8 0.123151
21 49 0 8 0.150173
21 51 0 8 0.138895
21 52 0 8 0.103607
21 53 0 8 0.144379
21 54 0 8 0.0758524
21 55 0 8 0.0945085
21 57 0 8 0.0774274
21 58 0 8 0.183856
21 60 0 8 0.112429
22 31 0 8 0.0416972
22 35 0 8 0.0610371
22 36 0 8 0.0718134
22 37 0 8 0.0830809
22 38 0 8 0.0729941
22 39 0 8 0.0581685
22 41 0 8 0.0761199
22 42 0 8 0.0909671
22 43 0 8 0.0872371
22 45 0 8 0.0348497
22 46 0 8 0.0560631
22 49 0 8 0.117373
22 51 0 8 0.123715
22 52 0 8 0.0951054
22 53 0 8 0.110589
22 54 0 8 0.0673014
22 55 0 8 0.0757178
22 57 0 8 0.067321
22 58 0 8 0.120923
22 60 0 8 0.0746833
23 34 0 8 0.0439981
23 35 0 8 0.0637833
23 36 0 8 0.0748364
23 37 0 8 0.0803878
23 38 0 8 0.0699768
23 39 0 8 0.0562958
23 40 0 8 0.050703
23 41 0 8 0.0726926
23 42 0 8 0.0847093
23 43 0 8 0.0972618
23 45 0 8 0.0371614
23 46 0 8 0.0570412
23 49 0 8 0.133404
23 51 0 8 0.10897
23 52 0 8 0.0897267
23 53 0 8 0.1269
23 54 0 8 0.071077
23 55 0 8 0.081361
23 57 0 8 0.0721413
23 58 0 8 0.169535
23 60 0 8 0.106489
24 35 0 8 0.0675378
24 36 0 8 0.0879853
24 37 0 8 0.103716
24 38 0 8 0.0919697
24 39 0 8 0.0855554
24 41 0 8 0.0766068
24 42 0 8 0.0834838
24 43 0 8 0.0629605
24 49 0 8 0.0893074
24 51 0 8 0.0944684
24 53 0 8 0.107826
24 55 0 8 0.0985756
24 58 0 8 0.0961041
24 60 0 8 0.107344
25 34 0 8 0.0774522
25 35 0 8 0.10622
25 36 0 8 0.121399
25 37 0 8 0.149717
25 38 0 8 0.133669
25 39 0 8 0.108612
25 40 0 8 0.0835361
25 41 0 8 0.108708
25 42 0 8 0.24555
25 43 0 8 0.195088
25 45 0 8 0.0820322
25 46 0 8 0.124415
25 49 0 8 0.2101
25 51 0 8 0.227991
25 52 0 8 0.200915
25 53 0 8 0.231776
25 54 0 8 0.163416
25 55 0 8 0.181117
25 57 0 8 0.147878
25 58 0 8 0.217111
25 60 0 8 0.195328
26 35 0 8 0.122554
26 36 0 8 0.165354
26 37 0 8 0.163181
26 38 0 8 0.144144
26 39 0 8 0.113907
26 41 0 8 0.087149
26 42 0 8 0.0914392
26 43 0 8 0.0670878
26 45 0 8 0.0445124
26 49 0 8 0.0796542
26 51 0 8 0.0832461
26 53 0 8 0.09998
26 54 0 8 0.105118
26 55 0 8 0.0864699
26 58 0 8 0.0895105
26 60 0 8 0.100234
27 36 0 8 0.0816637
27 37 0 8 0.0861135
27 38 0 8 0.0797964
27 41 0 8 0.0494446
27 42 0 8 0.0516782
27 43 0 8 0.0368352
27 49 0 8 0.0557663
27 51 0 8 0.0626741
27 53 0 8 0.0695815
27 55 0 8 0.0605236
27 58 0 8 0.0660831
27 60 0 8 0.0690742
28 37 0 8 0.0604649
28 43 0 8 0.032808
28 51 0 8 0.0582077
28 53 0 8 0.0721921
30 43 0 8 0.0243525
30 53 0 8 0.0439265
31 41 0 8 0.024275
31 42 0 8 0.0271489
31 43 0 8 0.0258141
31 49 0 8 0.0340006
31 51 0 8 0.0347801
31 53 0 8 0.0427281
31 55 0 8 0.0441874
31 58 0 8 0.0420238
31 60 0 8 0.0625439
34 43 0 8 0.0290977
34 53 0 8 0.0499728
34 55 0 8 0.049961
35 45 0 8 0.0150477
35 46 0 8 0.0195
35 49 0 8 0.0386666
35 51 0 8 0.0426504
35 52 0 8 0.0330713
35 53 0 8 0.039399
35 54 0 8 0.0273088
35 55 0 8 0.0375402
35 57 0 8 0.0224258
35 58 0 8 0.0423835
35 60 0 8 0.0566649
36 45 0 8 0.0115362
36 49 0 8 0.0247954
36 51 0 8 0.02915
36 52 0 8 0.0259939
36 53 0 8 0.0346658
36 54 0 8 0.0251587
36 55 0 8 0.0328927
36 57 0 8 0.0229439
36 58 0 8 0.0363903
36 60 0 8 0.0484002
37 49 0 8 0.0309335
37 51 0 8 0.0364677
37 52 0 8 0.0303481
37 53 0 8 0.0428857
37 54 0 8 0.0308027
37 55 0 8 0.0425142
37 57 0 8 0.0263609
37 58 0 8 0.0428784
37 60 0 8 0.0582651
38 51 0 8 0.029145
38 53 0 8 0.0352462
38 55 0 8 0.0372891
38 60 0 8 0.0546043
39 49 0 8 0.0202374
39 51 0 8 0.02418
39 53 0 8 0.0314496
39 54 0 8 0.0276345
39 55 0 8 0.0345131
39 58 0 8 0.0319492
39 60 0 8 0.0523563
40 49 0 8 0.0196317
40 51 0 8 0.0224276
40 52 0 8 0.0257533
40 53 0 8 0.0315145
40 54 0 8 0.0273137
40 55 0 8 0.034456
40 57 0 8 0.0259314
40 58 0 8 0.0314576
40 60 0 8 0.0550716
40 61 0 8 0.0288238
40 62 0 8 0.0311713
41 51 0 8 0.0382406
41 52 0 8 0.0293652
41 53 0 8 0.0571456
41 54 0 8 0.0363986
41 55 0 8 0.0597226
41 56 0 8 0.022681
41 57 0 8 0.0292899
41 58 0 8 0.0550095
41 59 0 8 0.0310417
41 60 0 8 0.0976148
41 61 0 8 0.0413753
41 62 0 8 0.045342
41 63 0 8 0.0329261
41 66 0 8 0.0526789
42 51 0 8 0.0571931
42 52 0 8 0.0458911
42 53 0 8 0.083138
42 54 0 8 0.0511759
42 55 0 8 0.0759889
42 56 0 8 0.030657
42 57 0 8 0.0404232
42 58 0 8 0.0745036
42 59 0 8 0.0429081
42 60 0 8 0.111735
42 61 0 8 0.0522233
42 62 0 8 0.0500504
42 63 0 8 0.038521
42 64 0 8 0.0442239
42 66 0 8 0.0560017
43 52 0 8 0.0703595
43 53 0 8 0.168967
43 54 0 8 0.0685899
43 55 0 8 0.109509
43 56 0 8 0.039356
43 57 0 8 0.0543708
43 58 0 8 0.185903
43 59 0 8 0.0571633
43 60 0 8 0.179454
43 61 0 8 0.0610652
43 62 0 8 0.0526833
43 63 0 8 0.0394865
43 64 0 8 0.0456862
43 66 0 8 0.0600897
44 53 0 8 0.0468207
44 54 0 8 0.0308811
44 55 0 8 0.0477444
44 56 0 8 0.0199731
44 57 0 8 0.0239516
44 58 0 8 0.0448251
44 59 0 8 0.0257866
44 60 0 8 0.0704455
44 61 0 8 0.0318323
44 62 0 8 0.0363161
44 66 0 8 0.0416344
45 54 0 8 0.0248272
45 55 0 8 0.0362672
45 56 0 8 0.018038
45 57 0 8 0.0232053
45 58 0 8 0.0341354
45 59 0 8 0.0247871
45 60 0 8 0.0542088
45 61 0 8 0.0272672
45 62 0 8 0.0340689
45 66 0 8 0.0374808
46 55 0 8 0.0495596
46 56 0 8 0.0220235
46 57 0 8 0.0267098
46 58 0 8 0.0489082
46 59 0 8 0.0289503
46 60 0 8 0.0748112
46 61 0 8 0.0365295
46 62 0 8 0.0429533
47 56 0 8 0.0151249
47 57 0 8 0.0178206
47 58 0 8 0.022391
47 59 0 8 0.0215685
47 60 0 8 0.049987
47 61 0 8 0.031086
47 62 0 8 0.0295704
48 57 0 8 0.018139
48 58 0 8 0.0342384
48 59 0 8 0.0221197
48 60 0 8 0.0646039
48 61 0 8 0.0402313
48 62 0 8 0.0460711
48 63 0 8 0.0357597
49 58 0 8 0.205746
49 59 0 8 0.0980248
49 60 0 8 0.28983
49 61 0 8 0.141814
49 62 0 8 0.110328
49 63 0 8 0.0600052
49 64 0 8 0.0589036
49 66 0 8 0.0651281
50 59 0 8 0.129605
50 60 0 8 0.177357
50 61 0 8 0.162649
50 62 0 8 0.126391
50 63 0 8 0.0731587
50 64 0 8 0.0573957
50 66 0 8 0.0587013
51 60 0 8 0.3136
51 61 0 8 0.244562
51 62 0 8 0.173162
51 63 0 8 0.0883812
51 64 0 8 0.0674933
51 66 0 8 0.0706021
52 61 0 8 0.176706
52 62 0 8 0.13659
52 63 0 8 0.0761955
52 64 0 8 0.0513054
52 65 0 8 0.044358
52 66 0 8 0.0498758
53 62 0 8 0.153716
53 63 0 8 0.0791402
53 64 0 8 0.062673
53 65 0 8 0.0507834
53 66 0 8 0.062365
54 63 0 8 0.0507045
54 64 0 8 0.0471192
54 66 0 8 0.0488794
55 64 0 8 0.0607691
55 65 0 8 0.0546907
55 66 0 8 0.0638462
56 66 0 8 0.0596619
57 66 0 8 0.0534251
END