# TARGET T0398 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-alpha-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 ABCDEFGHIST ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0398.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 10322 # Pos AA A B C D E F G H I S T 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.198 0.153 0.097 0.036 0.205 0.024 0.031 0.077 0.043 0.065 0.072 2 L 0.053 0.114 0.115 0.134 0.086 0.129 0.097 0.129 0.075 0.044 0.025 3 T 0.042 0.093 0.098 0.199 0.061 0.089 0.102 0.112 0.082 0.096 0.028 4 G 0.092 0.062 0.041 0.045 0.096 0.025 0.031 0.086 0.075 0.320 0.128 5 K 0.100 0.292 0.056 0.007 0.326 0.013 0.029 0.061 0.039 0.049 0.029 6 H 0.258 0.109 0.010 0.002 0.534 0.005 0.011 0.024 0.016 0.007 0.023 7 V 0.242 0.129 0.014 0.005 0.511 0.012 0.014 0.020 0.015 0.010 0.029 8 V 0.259 0.125 0.015 0.005 0.433 0.011 0.025 0.026 0.009 0.018 0.073 9 I 0.205 0.141 0.062 0.025 0.239 0.018 0.026 0.021 0.017 0.127 0.118 10 I 0.050 0.407 0.274 0.051 0.139 0.015 0.011 0.015 0.006 0.014 0.017 11 G 0.049 0.139 0.077 0.058 0.095 0.041 0.036 0.191 0.197 0.075 0.041 12 G 0.012 0.056 0.037 0.020 0.020 0.029 0.080 0.464 0.187 0.082 0.013 13 D 0.038 0.095 0.019 0.004 0.046 0.003 0.009 0.423 0.076 0.233 0.053 14 A 0.020 0.008 0.001 0.001 0.021 0.002 0.002 0.769 0.153 0.014 0.009 15 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.007 0.909 0.071 0.003 0.001 16 Q 0.002 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.003 0.924 0.052 0.012 0.001 17 L 0.006 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.004 0.919 0.055 0.005 0.002 18 E 0.002 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.004 0.918 0.064 0.003 0.001 19 I 0.005 0.003 0.001 0.001 0.006 0.001 0.019 0.892 0.066 0.005 0.002 20 I 0.008 0.010 0.005 0.002 0.014 0.007 0.062 0.779 0.097 0.012 0.004 21 R 0.019 0.029 0.015 0.007 0.029 0.015 0.066 0.610 0.155 0.042 0.013 22 K 0.023 0.050 0.023 0.013 0.032 0.019 0.108 0.397 0.141 0.158 0.036 23 L 0.068 0.171 0.083 0.018 0.115 0.017 0.052 0.170 0.081 0.165 0.061 24 S 0.086 0.175 0.084 0.016 0.137 0.022 0.037 0.128 0.087 0.154 0.072 25 T 0.175 0.213 0.108 0.019 0.224 0.016 0.018 0.089 0.051 0.042 0.045 26 F 0.069 0.229 0.081 0.024 0.174 0.053 0.062 0.177 0.076 0.030 0.025 27 D 0.247 0.100 0.025 0.012 0.252 0.013 0.051 0.116 0.055 0.064 0.066 28 A 0.170 0.137 0.020 0.005 0.413 0.012 0.022 0.122 0.052 0.023 0.026 29 K 0.224 0.084 0.007 0.003 0.565 0.007 0.023 0.049 0.013 0.007 0.019 30 I 0.293 0.085 0.009 0.002 0.549 0.004 0.005 0.015 0.005 0.005 0.028 31 S 0.253 0.103 0.018 0.009 0.453 0.018 0.030 0.030 0.008 0.018 0.061 32 L 0.330 0.103 0.024 0.013 0.331 0.009 0.016 0.028 0.017 0.034 0.095 33 V 0.094 0.169 0.080 0.105 0.175 0.083 0.079 0.056 0.040 0.067 0.052 34 G 0.085 0.147 0.136 0.099 0.139 0.038 0.055 0.082 0.069 0.094 0.055 35 F 0.082 0.119 0.071 0.049 0.132 0.034 0.045 0.093 0.113 0.198 0.064 36 D 0.072 0.258 0.164 0.031 0.192 0.029 0.034 0.071 0.058 0.060 0.030 37 Q 0.069 0.094 0.064 0.025 0.073 0.034 0.089 0.194 0.144 0.159 0.056 38 L 0.045 0.145 0.107 0.040 0.087 0.029 0.060 0.186 0.115 0.148 0.037 39 D 0.052 0.187 0.114 0.056 0.083 0.038 0.035 0.190 0.089 0.110 0.045 40 D 0.040 0.059 0.031 0.020 0.065 0.019 0.031 0.334 0.200 0.160 0.040 41 G 0.028 0.071 0.038 0.009 0.053 0.016 0.036 0.489 0.163 0.080 0.018 42 F 0.075 0.070 0.024 0.008 0.099 0.009 0.028 0.451 0.096 0.102 0.038 43 I 0.080 0.108 0.029 0.013 0.136 0.017 0.027 0.380 0.120 0.058 0.031 44 G 0.031 0.049 0.035 0.017 0.044 0.031 0.048 0.544 0.117 0.060 0.023 45 V 0.036 0.048 0.024 0.010 0.060 0.011 0.038 0.546 0.128 0.082 0.018 46 T 0.033 0.087 0.028 0.011 0.062 0.017 0.037 0.499 0.136 0.073 0.018 47 K 0.034 0.026 0.012 0.007 0.044 0.010 0.020 0.581 0.145 0.088 0.032 48 M 0.024 0.078 0.027 0.004 0.066 0.008 0.028 0.581 0.129 0.043 0.011 49 R 0.048 0.062 0.020 0.005 0.060 0.008 0.029 0.547 0.100 0.086 0.035 50 I 0.077 0.043 0.010 0.007 0.088 0.014 0.023 0.498 0.161 0.053 0.027 51 D 0.012 0.042 0.019 0.009 0.027 0.028 0.074 0.619 0.134 0.028 0.007 52 E 0.045 0.019 0.015 0.008 0.047 0.011 0.044 0.425 0.121 0.215 0.050 53 V 0.032 0.483 0.146 0.016 0.126 0.015 0.031 0.077 0.031 0.030 0.012 54 D 0.110 0.079 0.054 0.038 0.100 0.026 0.027 0.115 0.045 0.205 0.201 55 W 0.086 0.145 0.036 0.014 0.184 0.012 0.023 0.238 0.145 0.081 0.036 56 N 0.061 0.107 0.052 0.023 0.124 0.053 0.069 0.307 0.104 0.070 0.030 57 T 0.109 0.087 0.062 0.023 0.160 0.020 0.038 0.263 0.114 0.091 0.034 58 V 0.061 0.119 0.051 0.021 0.120 0.030 0.051 0.276 0.160 0.081 0.030 59 D 0.084 0.116 0.050 0.018 0.129 0.022 0.043 0.221 0.140 0.125 0.052 60 A 0.077 0.165 0.041 0.009 0.229 0.014 0.038 0.163 0.125 0.102 0.035 61 I 0.113 0.129 0.028 0.008 0.321 0.013 0.048 0.143 0.083 0.081 0.033 62 L 0.170 0.193 0.056 0.013 0.285 0.013 0.022 0.067 0.054 0.063 0.065 63 L 0.071 0.410 0.164 0.008 0.269 0.007 0.010 0.024 0.013 0.011 0.013 64 P 0.099 0.363 0.096 0.006 0.224 0.008 0.022 0.078 0.046 0.023 0.034 65 I 0.147 0.157 0.048 0.013 0.178 0.017 0.062 0.147 0.077 0.074 0.079 66 S 0.051 0.221 0.097 0.061 0.118 0.072 0.093 0.094 0.058 0.096 0.038 67 G 0.093 0.175 0.196 0.091 0.160 0.021 0.014 0.070 0.035 0.084 0.060 68 T 0.051 0.107 0.035 0.019 0.112 0.021 0.035 0.325 0.168 0.096 0.031 69 N 0.061 0.159 0.110 0.018 0.127 0.022 0.044 0.281 0.089 0.063 0.026 70 E 0.063 0.049 0.027 0.011 0.074 0.013 0.036 0.484 0.126 0.077 0.039 71 A 0.032 0.102 0.040 0.028 0.062 0.031 0.049 0.425 0.149 0.061 0.021 72 G 0.029 0.053 0.051 0.051 0.037 0.039 0.041 0.417 0.103 0.143 0.036 73 K 0.071 0.063 0.025 0.011 0.110 0.007 0.018 0.410 0.120 0.125 0.040 74 V 0.084 0.103 0.025 0.008 0.151 0.018 0.025 0.402 0.122 0.035 0.028 75 D 0.066 0.085 0.030 0.013 0.123 0.028 0.075 0.402 0.093 0.057 0.029 76 T 0.087 0.100 0.044 0.009 0.148 0.010 0.035 0.323 0.124 0.086 0.034 77 I 0.097 0.118 0.052 0.013 0.169 0.018 0.042 0.304 0.095 0.053 0.039 78 F 0.069 0.164 0.058 0.030 0.118 0.047 0.095 0.235 0.097 0.057 0.031 79 S 0.065 0.102 0.079 0.061 0.094 0.044 0.064 0.154 0.078 0.196 0.062 80 N 0.098 0.146 0.080 0.024 0.182 0.017 0.030 0.140 0.080 0.140 0.063 81 E 0.088 0.225 0.073 0.017 0.179 0.028 0.041 0.148 0.090 0.067 0.043 82 S 0.093 0.198 0.061 0.016 0.213 0.023 0.050 0.150 0.081 0.072 0.044 83 I 0.189 0.122 0.026 0.008 0.330 0.010 0.023 0.128 0.064 0.051 0.049 84 V 0.138 0.203 0.046 0.011 0.332 0.023 0.030 0.101 0.040 0.036 0.039 85 L 0.148 0.193 0.069 0.016 0.273 0.023 0.033 0.085 0.038 0.069 0.052 86 T 0.127 0.183 0.082 0.017 0.221 0.011 0.016 0.126 0.091 0.082 0.045 87 E 0.055 0.215 0.075 0.011 0.181 0.018 0.034 0.235 0.129 0.031 0.015 88 E 0.082 0.112 0.028 0.007 0.157 0.012 0.050 0.298 0.173 0.056 0.026 89 M 0.074 0.058 0.017 0.007 0.090 0.011 0.042 0.306 0.251 0.102 0.042 90 I 0.044 0.151 0.070 0.022 0.114 0.031 0.066 0.215 0.150 0.109 0.029 91 E 0.053 0.263 0.123 0.017 0.155 0.015 0.050 0.137 0.080 0.080 0.025 92 K 0.048 0.207 0.145 0.017 0.102 0.017 0.054 0.089 0.101 0.181 0.038 93 T 0.062 0.391 0.288 0.008 0.174 0.005 0.008 0.026 0.012 0.012 0.014 94 P 0.036 0.212 0.050 0.017 0.076 0.032 0.070 0.285 0.171 0.030 0.021 95 N 0.057 0.059 0.032 0.026 0.071 0.023 0.058 0.286 0.150 0.178 0.060 96 H 0.086 0.150 0.041 0.009 0.184 0.011 0.021 0.270 0.099 0.086 0.044 97 C 0.145 0.127 0.024 0.005 0.321 0.009 0.021 0.234 0.049 0.033 0.033 98 V 0.175 0.099 0.019 0.008 0.259 0.015 0.026 0.257 0.070 0.032 0.040 99 V 0.077 0.079 0.037 0.021 0.115 0.043 0.080 0.358 0.099 0.052 0.040 100 Y 0.078 0.096 0.066 0.036 0.116 0.038 0.085 0.251 0.090 0.099 0.044 101 S 0.047 0.241 0.141 0.054 0.103 0.039 0.066 0.110 0.062 0.106 0.029 102 G 0.102 0.121 0.089 0.047 0.112 0.023 0.030 0.118 0.056 0.179 0.124 103 I 0.080 0.227 0.080 0.028 0.179 0.026 0.034 0.145 0.081 0.073 0.047 104 S 0.077 0.198 0.091 0.039 0.122 0.045 0.043 0.177 0.069 0.085 0.054 105 N 0.090 0.066 0.029 0.014 0.122 0.014 0.019 0.325 0.166 0.111 0.043 106 T 0.027 0.063 0.028 0.007 0.060 0.019 0.037 0.546 0.160 0.041 0.012 107 Y 0.074 0.052 0.022 0.007 0.103 0.010 0.028 0.463 0.113 0.096 0.030 108 L 0.057 0.077 0.022 0.011 0.091 0.014 0.028 0.449 0.165 0.062 0.024 109 N 0.041 0.051 0.030 0.015 0.065 0.025 0.044 0.492 0.133 0.079 0.025 110 Q 0.048 0.097 0.036 0.009 0.105 0.012 0.046 0.425 0.120 0.083 0.019 111 C 0.072 0.094 0.039 0.013 0.101 0.015 0.050 0.368 0.117 0.092 0.040 112 M 0.053 0.082 0.038 0.023 0.098 0.032 0.048 0.349 0.166 0.081 0.030 113 K 0.027 0.115 0.062 0.028 0.054 0.039 0.109 0.340 0.135 0.071 0.020 114 K 0.051 0.044 0.040 0.018 0.055 0.015 0.043 0.213 0.088 0.341 0.092 115 T 0.063 0.327 0.119 0.023 0.171 0.018 0.024 0.098 0.057 0.069 0.031 116 N 0.061 0.190 0.096 0.039 0.108 0.044 0.037 0.171 0.094 0.103 0.058 117 R 0.087 0.090 0.034 0.013 0.127 0.012 0.027 0.256 0.173 0.140 0.041 118 T 0.043 0.144 0.047 0.007 0.144 0.016 0.039 0.405 0.100 0.039 0.017 119 L 0.121 0.109 0.033 0.007 0.152 0.008 0.023 0.283 0.104 0.116 0.046 120 V 0.060 0.114 0.036 0.008 0.129 0.009 0.011 0.365 0.215 0.036 0.018 121 K 0.013 0.028 0.014 0.006 0.030 0.014 0.047 0.659 0.161 0.022 0.005 122 L 0.024 0.025 0.009 0.003 0.031 0.004 0.046 0.551 0.186 0.109 0.012 123 M 0.089 0.071 0.029 0.022 0.117 0.026 0.045 0.310 0.133 0.116 0.042 124 E 0.026 0.178 0.109 0.046 0.049 0.044 0.086 0.306 0.099 0.043 0.013 125 R 0.032 0.018 0.019 0.020 0.034 0.023 0.079 0.232 0.166 0.307 0.069 126 D 0.041 0.410 0.188 0.018 0.137 0.021 0.034 0.046 0.034 0.052 0.018 127 D 0.122 0.092 0.029 0.017 0.138 0.024 0.051 0.057 0.039 0.252 0.178 128 I 0.246 0.175 0.025 0.005 0.444 0.006 0.011 0.022 0.015 0.016 0.035 129 A 0.165 0.166 0.021 0.007 0.502 0.025 0.031 0.028 0.013 0.014 0.028 130 I 0.356 0.067 0.010 0.004 0.499 0.004 0.006 0.011 0.006 0.008 0.029 131 Y 0.199 0.133 0.030 0.018 0.437 0.026 0.018 0.026 0.015 0.031 0.067 132 N 0.204 0.150 0.053 0.022 0.349 0.018 0.025 0.030 0.020 0.054 0.076 133 S 0.149 0.163 0.080 0.030 0.242 0.019 0.029 0.040 0.047 0.132 0.070 134 I 0.091 0.330 0.142 0.027 0.265 0.017 0.019 0.035 0.023 0.026 0.025 135 P 0.105 0.242 0.098 0.029 0.191 0.034 0.052 0.099 0.057 0.049 0.044 136 T 0.095 0.149 0.088 0.034 0.122 0.033 0.055 0.176 0.083 0.111 0.054 137 A 0.049 0.105 0.067 0.031 0.080 0.030 0.031 0.375 0.124 0.076 0.032 138 E 0.015 0.027 0.015 0.015 0.022 0.021 0.034 0.611 0.167 0.060 0.012 139 G 0.021 0.041 0.025 0.012 0.032 0.013 0.022 0.623 0.109 0.084 0.018 140 T 0.027 0.044 0.014 0.004 0.045 0.004 0.011 0.713 0.080 0.043 0.015 141 I 0.021 0.012 0.003 0.001 0.024 0.002 0.006 0.805 0.107 0.012 0.006 142 M 0.009 0.009 0.003 0.002 0.015 0.006 0.012 0.816 0.118 0.008 0.003 143 M 0.011 0.015 0.006 0.002 0.019 0.005 0.029 0.812 0.080 0.018 0.004 144 A 0.019 0.014 0.006 0.002 0.022 0.003 0.025 0.741 0.121 0.036 0.011 145 I 0.024 0.029 0.009 0.004 0.042 0.010 0.029 0.623 0.188 0.032 0.010 146 Q 0.024 0.070 0.022 0.006 0.040 0.016 0.120 0.522 0.126 0.039 0.014 147 H 0.060 0.039 0.030 0.018 0.064 0.022 0.080 0.252 0.110 0.243 0.083 148 T 0.035 0.405 0.165 0.033 0.112 0.031 0.049 0.063 0.042 0.048 0.017 149 D 0.100 0.078 0.052 0.033 0.100 0.020 0.024 0.055 0.052 0.276 0.210 150 F 0.077 0.316 0.097 0.011 0.273 0.009 0.020 0.065 0.056 0.055 0.022 151 T 0.174 0.211 0.092 0.012 0.231 0.015 0.041 0.104 0.042 0.030 0.049 152 I 0.125 0.070 0.074 0.087 0.093 0.097 0.086 0.148 0.110 0.057 0.054 153 H 0.011 0.121 0.086 0.355 0.019 0.146 0.144 0.059 0.034 0.018 0.006 154 G 0.030 0.007 0.022 0.114 0.015 0.016 0.006 0.012 0.018 0.598 0.162 155 A 0.057 0.411 0.110 0.018 0.229 0.017 0.035 0.033 0.030 0.039 0.021 156 N 0.259 0.132 0.015 0.006 0.418 0.020 0.046 0.013 0.010 0.024 0.058 157 V 0.195 0.088 0.006 0.002 0.692 0.002 0.004 0.002 0.001 0.001 0.006 158 A 0.191 0.063 0.003 0.001 0.728 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.008 159 V 0.435 0.040 0.004 0.001 0.465 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.047 160 L 0.190 0.142 0.064 0.052 0.255 0.056 0.033 0.012 0.008 0.066 0.123 161 G 0.144 0.143 0.186 0.109 0.192 0.029 0.031 0.027 0.016 0.070 0.053 162 L 0.047 0.095 0.046 0.085 0.085 0.038 0.056 0.134 0.188 0.191 0.034 163 G 0.029 0.132 0.136 0.134 0.053 0.061 0.047 0.190 0.099 0.094 0.025 164 R 0.034 0.071 0.048 0.020 0.060 0.016 0.033 0.453 0.116 0.111 0.039 165 V 0.011 0.040 0.018 0.005 0.016 0.006 0.012 0.716 0.125 0.042 0.010 166 G 0.002 0.005 0.003 0.002 0.003 0.002 0.002 0.902 0.065 0.012 0.002 167 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.958 0.038 0.001 0.001 168 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.008 0.001 0.001 169 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.008 0.001 0.001 170 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.986 0.014 0.001 0.001 171 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.987 0.013 0.001 0.001 172 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.009 0.001 0.001 173 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.965 0.027 0.001 0.001 174 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.830 0.158 0.003 0.001 175 A 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.096 0.634 0.092 0.141 0.024 176 L 0.002 0.789 0.140 0.002 0.020 0.002 0.038 0.004 0.001 0.001 0.001 177 G 0.023 0.001 0.001 0.009 0.003 0.007 0.003 0.002 0.003 0.270 0.678 178 A 0.060 0.416 0.047 0.013 0.405 0.006 0.013 0.005 0.005 0.015 0.017 179 K 0.268 0.043 0.003 0.002 0.651 0.005 0.007 0.002 0.001 0.001 0.017 180 V 0.178 0.091 0.011 0.002 0.711 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 181 K 0.203 0.086 0.005 0.001 0.669 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.031 182 V 0.416 0.090 0.013 0.004 0.276 0.002 0.002 0.004 0.004 0.012 0.176 183 G 0.086 0.196 0.080 0.073 0.219 0.088 0.078 0.030 0.027 0.062 0.061 184 A 0.117 0.232 0.136 0.035 0.234 0.017 0.025 0.048 0.039 0.074 0.042 185 R 0.055 0.190 0.094 0.032 0.101 0.037 0.041 0.137 0.118 0.155 0.040 186 E 0.065 0.363 0.182 0.009 0.209 0.005 0.006 0.087 0.037 0.022 0.016 187 S 0.005 0.015 0.003 0.001 0.010 0.004 0.012 0.647 0.285 0.014 0.003 188 D 0.002 0.005 0.002 0.001 0.003 0.002 0.015 0.889 0.069 0.011 0.002 189 L 0.003 0.007 0.002 0.001 0.003 0.001 0.002 0.871 0.063 0.046 0.003 190 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.945 0.052 0.001 0.001 191 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.964 0.035 0.001 0.001 192 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.972 0.025 0.001 0.001 193 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.954 0.036 0.002 0.001 194 A 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.862 0.123 0.003 0.001 195 E 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.060 0.720 0.085 0.098 0.024 196 M 0.001 0.794 0.165 0.001 0.013 0.002 0.018 0.003 0.001 0.001 0.001 197 G 0.017 0.002 0.003 0.008 0.003 0.005 0.003 0.004 0.004 0.332 0.619 198 M 0.043 0.544 0.157 0.015 0.161 0.003 0.003 0.011 0.017 0.026 0.019 199 E 0.065 0.288 0.114 0.029 0.233 0.065 0.040 0.057 0.041 0.023 0.047 200 P 0.260 0.139 0.055 0.022 0.248 0.009 0.022 0.065 0.060 0.045 0.077 201 F 0.035 0.342 0.148 0.020 0.211 0.032 0.046 0.067 0.035 0.043 0.021 202 H 0.092 0.453 0.225 0.003 0.179 0.001 0.001 0.011 0.004 0.009 0.021 203 I 0.011 0.027 0.005 0.001 0.024 0.003 0.005 0.553 0.351 0.014 0.006 204 S 0.002 0.005 0.003 0.002 0.003 0.009 0.027 0.796 0.142 0.010 0.001 205 K 0.008 0.009 0.003 0.001 0.011 0.001 0.006 0.797 0.075 0.080 0.009 206 A 0.014 0.008 0.001 0.001 0.011 0.001 0.007 0.793 0.108 0.046 0.009 207 A 0.002 0.004 0.002 0.001 0.004 0.002 0.003 0.799 0.176 0.007 0.001 208 Q 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.002 0.028 0.857 0.099 0.007 0.001 209 E 0.008 0.010 0.004 0.002 0.007 0.003 0.077 0.718 0.097 0.069 0.006 210 L 0.072 0.013 0.005 0.012 0.052 0.013 0.018 0.428 0.194 0.147 0.045 211 R 0.008 0.044 0.023 0.021 0.013 0.050 0.080 0.557 0.169 0.030 0.006 212 D 0.050 0.008 0.007 0.005 0.036 0.006 0.032 0.124 0.058 0.612 0.062 213 V 0.208 0.172 0.027 0.003 0.468 0.008 0.011 0.034 0.018 0.018 0.033 214 D 0.160 0.082 0.012 0.012 0.185 0.091 0.209 0.063 0.028 0.089 0.069 215 V 0.255 0.067 0.009 0.002 0.633 0.002 0.005 0.011 0.005 0.005 0.006 216 C 0.185 0.074 0.004 0.002 0.680 0.004 0.007 0.021 0.007 0.003 0.014 217 I 0.318 0.063 0.006 0.002 0.514 0.006 0.006 0.013 0.010 0.007 0.056 218 N 0.177 0.115 0.038 0.018 0.331 0.032 0.058 0.039 0.029 0.077 0.086 219 T 0.148 0.141 0.067 0.027 0.175 0.018 0.054 0.031 0.040 0.217 0.082 220 I 0.054 0.339 0.277 0.048 0.176 0.019 0.015 0.011 0.014 0.031 0.016 221 P 0.056 0.294 0.184 0.061 0.121 0.028 0.027 0.067 0.100 0.037 0.025 222 A 0.033 0.107 0.044 0.017 0.063 0.019 0.062 0.201 0.340 0.090 0.024 223 L 0.059 0.148 0.037 0.007 0.122 0.014 0.062 0.238 0.167 0.100 0.045 224 V 0.159 0.124 0.023 0.004 0.211 0.008 0.034 0.185 0.069 0.119 0.064 225 V 0.077 0.280 0.087 0.022 0.173 0.038 0.035 0.096 0.044 0.097 0.053 226 T 0.085 0.362 0.211 0.008 0.230 0.007 0.004 0.045 0.015 0.016 0.017 227 A 0.003 0.005 0.001 0.001 0.005 0.004 0.015 0.540 0.405 0.020 0.002 228 N 0.006 0.009 0.006 0.002 0.010 0.004 0.026 0.727 0.161 0.048 0.003 229 V 0.017 0.011 0.002 0.001 0.012 0.001 0.009 0.602 0.203 0.127 0.015 230 L 0.015 0.008 0.003 0.003 0.016 0.006 0.015 0.470 0.393 0.062 0.010 231 A 0.001 0.007 0.005 0.006 0.003 0.018 0.063 0.559 0.316 0.021 0.001 232 E 0.008 0.007 0.004 0.003 0.012 0.003 0.059 0.123 0.125 0.644 0.010 233 M 0.109 0.266 0.204 0.007 0.261 0.004 0.010 0.023 0.032 0.061 0.025 234 P 0.043 0.295 0.394 0.023 0.099 0.038 0.029 0.034 0.022 0.012 0.011 235 S 0.017 0.120 0.043 0.020 0.036 0.039 0.273 0.157 0.241 0.045 0.009 236 H 0.033 0.016 0.007 0.008 0.023 0.011 0.039 0.037 0.042 0.666 0.118 237 T 0.080 0.385 0.028 0.002 0.411 0.003 0.012 0.022 0.009 0.023 0.024 238 F 0.165 0.075 0.005 0.001 0.718 0.004 0.007 0.010 0.004 0.003 0.010 239 V 0.386 0.045 0.003 0.002 0.525 0.003 0.003 0.006 0.003 0.003 0.019 240 I 0.220 0.135 0.021 0.009 0.493 0.020 0.008 0.017 0.007 0.011 0.058 241 D 0.277 0.111 0.039 0.008 0.464 0.005 0.008 0.014 0.010 0.019 0.044 242 L 0.178 0.129 0.039 0.015 0.218 0.015 0.041 0.079 0.107 0.102 0.079 243 A 0.093 0.214 0.088 0.051 0.202 0.037 0.086 0.050 0.041 0.094 0.044 244 S 0.062 0.270 0.201 0.101 0.133 0.044 0.050 0.027 0.024 0.060 0.028 245 K 0.033 0.151 0.449 0.123 0.058 0.027 0.027 0.039 0.026 0.036 0.031 246 P 0.017 0.052 0.057 0.106 0.024 0.059 0.131 0.205 0.266 0.058 0.024 247 G 0.010 0.107 0.104 0.244 0.021 0.074 0.076 0.075 0.094 0.169 0.024 248 G 0.045 0.053 0.046 0.048 0.046 0.013 0.015 0.047 0.040 0.471 0.178 249 T 0.054 0.408 0.145 0.010 0.201 0.011 0.018 0.051 0.026 0.048 0.030 250 D 0.089 0.475 0.176 0.007 0.151 0.005 0.004 0.032 0.010 0.021 0.031 251 F 0.010 0.012 0.003 0.002 0.013 0.003 0.003 0.707 0.230 0.011 0.005 252 R 0.001 0.003 0.001 0.001 0.003 0.002 0.005 0.878 0.100 0.005 0.001 253 Y 0.003 0.004 0.002 0.001 0.004 0.001 0.002 0.908 0.061 0.014 0.002 254 A 0.008 0.002 0.001 0.001 0.006 0.002 0.014 0.890 0.066 0.009 0.002 255 E 0.002 0.009 0.003 0.001 0.003 0.002 0.009 0.797 0.168 0.006 0.001 256 K 0.008 0.003 0.003 0.002 0.007 0.010 0.113 0.668 0.093 0.077 0.016 257 R 0.008 0.600 0.222 0.012 0.049 0.009 0.055 0.028 0.008 0.006 0.002 258 G 0.061 0.015 0.014 0.038 0.023 0.022 0.016 0.030 0.017 0.326 0.438 259 I 0.168 0.256 0.038 0.010 0.401 0.005 0.010 0.037 0.022 0.023 0.029 260 K 0.222 0.117 0.013 0.005 0.495 0.022 0.023 0.040 0.019 0.009 0.035 261 A 0.259 0.105 0.020 0.006 0.518 0.008 0.012 0.016 0.012 0.009 0.035 262 L 0.183 0.134 0.024 0.004 0.563 0.007 0.014 0.022 0.011 0.014 0.023 263 L 0.251 0.153 0.043 0.010 0.283 0.009 0.023 0.037 0.032 0.051 0.106 264 V 0.117 0.209 0.160 0.065 0.228 0.042 0.031 0.027 0.022 0.039 0.059 265 P 0.016 0.300 0.138 0.161 0.051 0.075 0.117 0.061 0.051 0.021 0.009 266 G 0.032 0.021 0.054 0.068 0.022 0.016 0.019 0.018 0.028 0.598 0.124 267 L 0.036 0.426 0.294 0.022 0.147 0.011 0.009 0.016 0.016 0.014 0.010 268 P 0.035 0.191 0.097 0.091 0.056 0.102 0.108 0.085 0.129 0.065 0.041 269 G 0.053 0.073 0.103 0.091 0.061 0.027 0.044 0.068 0.095 0.294 0.091 270 I 0.124 0.240 0.071 0.012 0.308 0.010 0.021 0.066 0.039 0.060 0.051 271 V 0.124 0.208 0.096 0.030 0.203 0.034 0.039 0.052 0.060 0.092 0.062 272 A 0.064 0.237 0.256 0.092 0.133 0.034 0.024 0.049 0.038 0.039 0.033 273 P 0.091 0.203 0.091 0.030 0.176 0.019 0.038 0.146 0.081 0.081 0.043 274 K 0.064 0.173 0.089 0.017 0.120 0.026 0.053 0.195 0.106 0.118 0.039 275 T 0.085 0.213 0.150 0.016 0.156 0.014 0.021 0.214 0.048 0.048 0.036 276 A 0.012 0.039 0.016 0.009 0.021 0.013 0.023 0.595 0.221 0.042 0.010 277 G 0.009 0.018 0.011 0.011 0.012 0.010 0.015 0.704 0.141 0.059 0.010 278 R 0.013 0.017 0.006 0.002 0.022 0.003 0.009 0.787 0.092 0.038 0.009 279 I 0.011 0.014 0.004 0.001 0.014 0.002 0.013 0.863 0.061 0.013 0.005 280 L 0.010 0.010 0.004 0.002 0.011 0.003 0.010 0.798 0.119 0.027 0.006 281 A 0.002 0.008 0.003 0.002 0.005 0.004 0.009 0.835 0.123 0.007 0.001 282 D 0.004 0.005 0.003 0.001 0.005 0.004 0.032 0.835 0.082 0.026 0.003 283 V 0.008 0.013 0.005 0.001 0.009 0.001 0.013 0.792 0.096 0.056 0.006 284 L 0.016 0.005 0.001 0.001 0.013 0.002 0.006 0.779 0.147 0.023 0.008 285 V 0.003 0.007 0.002 0.001 0.006 0.010 0.025 0.783 0.154 0.007 0.001 286 K 0.019 0.012 0.006 0.003 0.029 0.006 0.052 0.591 0.134 0.132 0.016 287 L 0.093 0.059 0.024 0.006 0.122 0.011 0.054 0.353 0.117 0.117 0.044 288 L 0.082 0.150 0.049 0.016 0.158 0.029 0.065 0.187 0.093 0.128 0.042 289 A 0.088 0.131 0.080 0.040 0.130 0.033 0.056 0.128 0.079 0.169 0.066 290 E 0.064 0.271 0.171 0.028 0.211 0.018 0.036 0.093 0.051 0.038 0.021 291 P 0.071 0.114 0.051 0.021 0.109 0.032 0.074 0.189 0.154 0.133 0.050 292 S 0.077 0.173 0.096 0.028 0.154 0.024 0.046 0.153 0.104 0.103 0.042