# TARGET T0398 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0398.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1610 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.149 0.118 0.097 0.158 0.101 0.099 0.094 0.065 0.055 0.037 0.026 2 L 0.094 0.083 0.043 0.089 0.085 0.102 0.143 0.111 0.101 0.085 0.063 3 T 0.186 0.177 0.065 0.158 0.123 0.085 0.084 0.049 0.039 0.022 0.011 4 G 0.063 0.025 0.012 0.045 0.068 0.069 0.138 0.154 0.168 0.144 0.113 5 K 0.043 0.064 0.056 0.182 0.186 0.134 0.143 0.087 0.057 0.030 0.018 6 H 0.002 0.007 0.010 0.047 0.087 0.145 0.231 0.203 0.148 0.079 0.041 7 V 0.001 0.001 0.002 0.006 0.008 0.020 0.074 0.169 0.234 0.257 0.228 8 V 0.002 0.002 0.003 0.006 0.010 0.023 0.097 0.182 0.248 0.226 0.202 9 I 0.001 0.002 0.003 0.005 0.005 0.009 0.046 0.108 0.222 0.282 0.316 10 I 0.002 0.005 0.005 0.015 0.017 0.030 0.085 0.146 0.216 0.239 0.241 11 G 0.019 0.033 0.020 0.072 0.089 0.112 0.180 0.162 0.142 0.099 0.073 12 G 0.070 0.067 0.028 0.115 0.159 0.148 0.162 0.112 0.074 0.045 0.021 13 D 0.058 0.120 0.034 0.138 0.150 0.130 0.144 0.089 0.070 0.041 0.025 14 A 0.017 0.011 0.008 0.026 0.040 0.064 0.117 0.126 0.198 0.192 0.202 15 R 0.067 0.065 0.044 0.120 0.119 0.146 0.172 0.098 0.080 0.052 0.037 16 Q 0.006 0.024 0.023 0.105 0.116 0.144 0.200 0.149 0.120 0.073 0.041 17 L 0.008 0.005 0.020 0.018 0.020 0.033 0.089 0.117 0.208 0.237 0.245 18 E 0.021 0.019 0.093 0.168 0.146 0.138 0.170 0.090 0.074 0.047 0.033 19 I 0.002 0.007 0.090 0.066 0.062 0.087 0.183 0.155 0.159 0.120 0.069 20 I 0.001 0.001 0.019 0.023 0.031 0.063 0.171 0.159 0.198 0.188 0.146 21 R 0.009 0.012 0.135 0.096 0.093 0.129 0.216 0.122 0.104 0.057 0.028 22 K 0.005 0.017 0.149 0.151 0.144 0.182 0.179 0.082 0.052 0.027 0.012 23 L 0.010 0.014 0.053 0.040 0.044 0.074 0.167 0.157 0.186 0.157 0.099 24 S 0.013 0.018 0.055 0.065 0.067 0.097 0.186 0.148 0.146 0.117 0.087 25 T 0.046 0.092 0.246 0.179 0.158 0.107 0.083 0.038 0.027 0.015 0.008 26 F 0.020 0.030 0.040 0.079 0.103 0.147 0.215 0.135 0.109 0.076 0.046 27 D 0.212 0.155 0.102 0.156 0.119 0.081 0.074 0.040 0.030 0.018 0.014 28 A 0.038 0.041 0.043 0.079 0.087 0.113 0.179 0.139 0.127 0.090 0.063 29 K 0.208 0.187 0.141 0.227 0.122 0.065 0.032 0.010 0.006 0.003 0.002 30 I 0.004 0.003 0.003 0.006 0.008 0.013 0.052 0.099 0.213 0.267 0.331 31 S 0.049 0.074 0.068 0.160 0.134 0.127 0.160 0.085 0.068 0.042 0.035 32 L 0.019 0.025 0.023 0.049 0.049 0.072 0.153 0.142 0.174 0.150 0.143 33 V 0.024 0.032 0.032 0.075 0.086 0.118 0.171 0.128 0.129 0.110 0.095 34 G 0.120 0.129 0.054 0.140 0.133 0.102 0.112 0.072 0.064 0.047 0.029 35 F 0.048 0.030 0.017 0.050 0.059 0.072 0.139 0.134 0.170 0.157 0.122 36 D 0.171 0.158 0.080 0.161 0.138 0.098 0.086 0.043 0.030 0.020 0.014 37 Q 0.072 0.125 0.062 0.147 0.121 0.111 0.132 0.084 0.064 0.050 0.033 38 L 0.148 0.097 0.055 0.122 0.124 0.121 0.121 0.074 0.064 0.044 0.029 39 D 0.448 0.161 0.090 0.118 0.068 0.043 0.033 0.016 0.012 0.007 0.004 40 D 0.149 0.126 0.073 0.158 0.121 0.100 0.109 0.063 0.050 0.032 0.019 41 G 0.057 0.043 0.031 0.064 0.068 0.093 0.162 0.132 0.147 0.117 0.086 42 F 0.037 0.034 0.055 0.111 0.109 0.142 0.177 0.109 0.101 0.074 0.051 43 I 0.023 0.050 0.146 0.153 0.134 0.127 0.132 0.082 0.073 0.050 0.031 44 G 0.019 0.027 0.042 0.080 0.078 0.102 0.165 0.143 0.153 0.116 0.075 45 V 0.015 0.010 0.022 0.032 0.041 0.064 0.144 0.156 0.204 0.183 0.129 46 T 0.024 0.030 0.119 0.119 0.119 0.148 0.164 0.100 0.090 0.056 0.032 47 K 0.015 0.046 0.099 0.165 0.173 0.159 0.161 0.081 0.056 0.031 0.015 48 M 0.010 0.008 0.019 0.018 0.019 0.033 0.096 0.127 0.198 0.255 0.216 49 R 0.050 0.067 0.072 0.171 0.166 0.148 0.161 0.075 0.049 0.028 0.013 50 I 0.036 0.054 0.072 0.096 0.100 0.109 0.155 0.124 0.114 0.085 0.055 51 D 0.134 0.147 0.087 0.162 0.126 0.107 0.106 0.051 0.036 0.026 0.016 52 E 0.398 0.140 0.074 0.121 0.075 0.056 0.059 0.029 0.023 0.015 0.009 53 V 0.243 0.088 0.052 0.103 0.084 0.087 0.105 0.074 0.073 0.055 0.037 54 D 0.152 0.187 0.106 0.189 0.111 0.082 0.077 0.037 0.030 0.017 0.011 55 W 0.024 0.023 0.028 0.053 0.056 0.081 0.151 0.145 0.166 0.148 0.124 56 N 0.097 0.123 0.104 0.169 0.152 0.116 0.101 0.054 0.042 0.027 0.016 57 T 0.152 0.145 0.112 0.197 0.133 0.090 0.074 0.040 0.030 0.017 0.010 58 V 0.072 0.037 0.032 0.081 0.095 0.124 0.168 0.127 0.117 0.087 0.061 59 D 0.095 0.118 0.077 0.168 0.133 0.119 0.115 0.068 0.054 0.032 0.019 60 A 0.023 0.020 0.021 0.047 0.058 0.085 0.160 0.166 0.181 0.143 0.097 61 I 0.029 0.024 0.018 0.043 0.048 0.063 0.140 0.142 0.177 0.165 0.152 62 L 0.015 0.017 0.017 0.037 0.043 0.062 0.122 0.146 0.198 0.187 0.156 63 L 0.018 0.034 0.024 0.084 0.111 0.126 0.174 0.144 0.127 0.092 0.066 64 P 0.086 0.073 0.057 0.107 0.099 0.105 0.142 0.111 0.098 0.074 0.048 65 I 0.071 0.044 0.034 0.088 0.114 0.129 0.175 0.122 0.103 0.078 0.042 66 S 0.105 0.105 0.044 0.111 0.092 0.077 0.117 0.098 0.101 0.087 0.062 67 G 0.147 0.086 0.047 0.093 0.092 0.098 0.129 0.094 0.086 0.077 0.051 68 T 0.133 0.107 0.051 0.110 0.094 0.091 0.133 0.091 0.075 0.065 0.052 69 N 0.209 0.145 0.063 0.129 0.113 0.093 0.087 0.056 0.050 0.035 0.019 70 E 0.405 0.159 0.079 0.136 0.077 0.049 0.038 0.020 0.016 0.012 0.008 71 A 0.320 0.151 0.071 0.123 0.087 0.060 0.070 0.040 0.035 0.026 0.018 72 G 0.180 0.076 0.053 0.093 0.086 0.103 0.131 0.095 0.085 0.061 0.037 73 K 0.095 0.168 0.111 0.249 0.157 0.093 0.067 0.027 0.017 0.010 0.006 74 V 0.028 0.026 0.039 0.045 0.048 0.065 0.127 0.136 0.172 0.165 0.151 75 D 0.110 0.107 0.093 0.201 0.164 0.113 0.099 0.049 0.034 0.019 0.010 76 T 0.089 0.078 0.089 0.128 0.107 0.108 0.130 0.087 0.083 0.060 0.041 77 I 0.085 0.078 0.066 0.129 0.107 0.115 0.133 0.092 0.085 0.066 0.045 78 F 0.049 0.040 0.037 0.068 0.078 0.099 0.161 0.139 0.145 0.111 0.074 79 S 0.086 0.073 0.049 0.090 0.083 0.084 0.128 0.106 0.116 0.098 0.088 80 N 0.136 0.093 0.068 0.127 0.109 0.106 0.116 0.081 0.075 0.056 0.034 81 E 0.152 0.096 0.063 0.135 0.123 0.112 0.119 0.072 0.062 0.041 0.025 82 S 0.065 0.059 0.042 0.081 0.073 0.077 0.126 0.120 0.141 0.127 0.090 83 I 0.068 0.070 0.053 0.125 0.114 0.128 0.158 0.098 0.091 0.061 0.033 84 V 0.086 0.070 0.100 0.133 0.122 0.115 0.146 0.091 0.069 0.046 0.023 85 L 0.007 0.010 0.012 0.018 0.025 0.040 0.090 0.116 0.190 0.234 0.259 86 T 0.006 0.042 0.027 0.075 0.094 0.119 0.201 0.144 0.143 0.095 0.052 87 E 0.181 0.082 0.134 0.240 0.166 0.095 0.058 0.020 0.015 0.006 0.003 88 E 0.347 0.132 0.272 0.117 0.055 0.033 0.024 0.008 0.005 0.003 0.003 89 M 0.002 0.003 0.008 0.024 0.036 0.093 0.239 0.203 0.199 0.127 0.066 90 I 0.003 0.005 0.014 0.023 0.036 0.079 0.216 0.199 0.199 0.149 0.077 91 E 0.025 0.058 0.742 0.108 0.041 0.016 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 92 K 0.103 0.132 0.284 0.209 0.127 0.081 0.042 0.012 0.006 0.003 0.001 93 T 0.022 0.025 0.009 0.032 0.046 0.093 0.189 0.157 0.164 0.152 0.112 94 P 0.381 0.172 0.052 0.106 0.082 0.078 0.066 0.028 0.020 0.010 0.006 95 N 0.386 0.147 0.123 0.123 0.081 0.051 0.042 0.020 0.014 0.008 0.005 96 H 0.086 0.119 0.059 0.197 0.160 0.128 0.126 0.059 0.036 0.019 0.011 97 C 0.012 0.019 0.013 0.051 0.073 0.122 0.179 0.163 0.159 0.121 0.089 98 V 0.041 0.068 0.056 0.135 0.156 0.157 0.158 0.094 0.068 0.040 0.028 99 V 0.022 0.016 0.016 0.041 0.050 0.075 0.143 0.161 0.181 0.162 0.133 100 Y 0.013 0.020 0.014 0.049 0.066 0.087 0.168 0.168 0.177 0.137 0.101 101 S 0.034 0.041 0.030 0.073 0.072 0.080 0.127 0.131 0.157 0.134 0.121 102 G 0.073 0.047 0.037 0.077 0.077 0.090 0.136 0.124 0.129 0.119 0.089 103 I 0.033 0.036 0.032 0.073 0.083 0.103 0.156 0.137 0.136 0.120 0.091 104 S 0.021 0.034 0.020 0.040 0.042 0.056 0.116 0.128 0.182 0.191 0.170 105 N 0.066 0.052 0.037 0.094 0.096 0.118 0.148 0.106 0.118 0.096 0.069 106 T 0.135 0.062 0.058 0.078 0.069 0.077 0.134 0.102 0.117 0.096 0.072 107 Y 0.026 0.028 0.029 0.058 0.065 0.091 0.154 0.140 0.145 0.142 0.121 108 L 0.007 0.011 0.017 0.029 0.033 0.052 0.113 0.132 0.205 0.214 0.188 109 N 0.024 0.033 0.095 0.157 0.165 0.164 0.171 0.079 0.065 0.032 0.016 110 Q 0.155 0.098 0.341 0.180 0.089 0.057 0.039 0.018 0.012 0.007 0.004 111 C 0.012 0.018 0.022 0.049 0.065 0.103 0.203 0.161 0.165 0.123 0.078 112 M 0.008 0.008 0.014 0.019 0.022 0.053 0.138 0.163 0.216 0.201 0.159 113 K 0.035 0.051 0.229 0.196 0.190 0.138 0.100 0.032 0.018 0.007 0.003 114 K 0.153 0.153 0.323 0.168 0.086 0.052 0.034 0.013 0.009 0.005 0.003 115 T 0.018 0.025 0.021 0.047 0.058 0.105 0.201 0.163 0.166 0.132 0.065 116 N 0.038 0.027 0.027 0.047 0.057 0.104 0.190 0.151 0.157 0.118 0.082 117 R 0.059 0.084 0.293 0.181 0.144 0.104 0.074 0.030 0.018 0.009 0.004 118 T 0.020 0.040 0.082 0.167 0.164 0.168 0.169 0.079 0.058 0.035 0.020 119 L 0.004 0.004 0.007 0.011 0.011 0.020 0.077 0.126 0.230 0.265 0.245 120 V 0.010 0.006 0.032 0.041 0.060 0.130 0.237 0.166 0.160 0.100 0.059 121 K 0.009 0.029 0.288 0.212 0.153 0.117 0.092 0.044 0.029 0.017 0.009 122 L 0.002 0.007 0.026 0.027 0.036 0.078 0.204 0.178 0.184 0.155 0.103 123 M 0.010 0.006 0.020 0.022 0.029 0.047 0.129 0.152 0.228 0.215 0.141 124 E 0.050 0.071 0.149 0.159 0.139 0.135 0.138 0.068 0.046 0.028 0.018 125 R 0.020 0.053 0.106 0.142 0.139 0.154 0.166 0.098 0.067 0.040 0.015 126 D 0.202 0.084 0.084 0.096 0.085 0.086 0.119 0.080 0.079 0.055 0.029 127 D 0.220 0.154 0.124 0.163 0.095 0.081 0.073 0.034 0.027 0.016 0.011 128 I 0.055 0.034 0.044 0.064 0.061 0.075 0.136 0.134 0.170 0.145 0.083 129 A 0.093 0.066 0.075 0.097 0.083 0.102 0.151 0.107 0.101 0.071 0.054 130 I 0.038 0.037 0.100 0.085 0.076 0.102 0.163 0.125 0.123 0.086 0.065 131 Y 0.027 0.038 0.071 0.119 0.117 0.139 0.163 0.117 0.098 0.070 0.042 132 N 0.051 0.049 0.108 0.103 0.104 0.106 0.130 0.105 0.108 0.084 0.052 133 S 0.085 0.077 0.078 0.110 0.101 0.098 0.130 0.094 0.102 0.075 0.049 134 I 0.022 0.024 0.023 0.047 0.056 0.084 0.159 0.150 0.185 0.151 0.097 135 P 0.151 0.124 0.092 0.137 0.119 0.107 0.100 0.062 0.051 0.035 0.022 136 T 0.090 0.106 0.064 0.117 0.105 0.099 0.125 0.091 0.086 0.068 0.050 137 A 0.076 0.036 0.025 0.050 0.057 0.081 0.142 0.132 0.161 0.139 0.101 138 E 0.103 0.091 0.074 0.171 0.140 0.119 0.118 0.067 0.059 0.037 0.022 139 G 0.123 0.090 0.125 0.128 0.093 0.086 0.100 0.074 0.075 0.060 0.046 140 T 0.033 0.030 0.039 0.072 0.071 0.100 0.167 0.135 0.139 0.125 0.089 141 I 0.020 0.018 0.027 0.044 0.054 0.089 0.179 0.157 0.176 0.143 0.094 142 M 0.041 0.059 0.187 0.163 0.125 0.116 0.108 0.067 0.065 0.042 0.027 143 M 0.044 0.047 0.119 0.134 0.117 0.121 0.148 0.086 0.085 0.060 0.039 144 A 0.056 0.030 0.052 0.050 0.037 0.049 0.110 0.120 0.178 0.170 0.148 145 I 0.032 0.026 0.058 0.082 0.093 0.145 0.195 0.135 0.120 0.075 0.038 146 Q 0.060 0.090 0.225 0.187 0.128 0.106 0.091 0.046 0.035 0.020 0.012 147 H 0.061 0.069 0.106 0.103 0.098 0.112 0.142 0.099 0.098 0.070 0.043 148 T 0.149 0.078 0.050 0.097 0.093 0.091 0.124 0.095 0.100 0.074 0.050 149 D 0.256 0.164 0.076 0.150 0.103 0.084 0.069 0.036 0.030 0.019 0.013 150 F 0.044 0.040 0.030 0.071 0.088 0.116 0.153 0.131 0.137 0.110 0.080 151 T 0.079 0.114 0.056 0.212 0.157 0.125 0.108 0.062 0.040 0.025 0.022 152 I 0.008 0.006 0.008 0.014 0.022 0.039 0.089 0.117 0.203 0.207 0.288 153 H 0.055 0.102 0.085 0.251 0.169 0.137 0.116 0.042 0.024 0.012 0.007 154 G 0.493 0.176 0.073 0.134 0.065 0.024 0.016 0.007 0.005 0.003 0.004 155 A 0.001 0.005 0.007 0.033 0.058 0.079 0.206 0.213 0.201 0.124 0.074 156 N 0.006 0.058 0.051 0.266 0.285 0.210 0.093 0.018 0.007 0.003 0.002 157 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.060 0.180 0.286 0.462 158 A 0.001 0.001 0.001 0.007 0.020 0.058 0.252 0.244 0.196 0.118 0.101 159 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.023 0.066 0.196 0.280 0.426 160 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.011 0.053 0.112 0.209 0.287 0.323 161 G 0.001 0.002 0.003 0.011 0.019 0.033 0.114 0.212 0.254 0.196 0.154 162 L 0.002 0.010 0.007 0.026 0.028 0.037 0.116 0.183 0.221 0.212 0.159 163 G 0.009 0.014 0.008 0.061 0.117 0.157 0.203 0.168 0.145 0.073 0.044 164 R 0.078 0.071 0.053 0.127 0.172 0.169 0.161 0.080 0.050 0.026 0.013 165 V 0.001 0.004 0.006 0.015 0.017 0.023 0.062 0.126 0.233 0.252 0.262 166 G 0.001 0.001 0.002 0.004 0.006 0.015 0.066 0.117 0.231 0.253 0.307 167 M 0.009 0.011 0.024 0.081 0.144 0.203 0.243 0.118 0.083 0.052 0.032 168 S 0.003 0.014 0.057 0.095 0.131 0.152 0.227 0.140 0.097 0.050 0.033 169 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.024 0.063 0.171 0.283 0.447 170 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.046 0.084 0.194 0.278 0.386 171 R 0.002 0.004 0.177 0.189 0.188 0.199 0.152 0.045 0.025 0.011 0.006 172 K 0.001 0.001 0.012 0.035 0.076 0.189 0.394 0.158 0.078 0.039 0.019 173 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.023 0.109 0.300 0.563 174 A 0.001 0.002 0.016 0.056 0.091 0.173 0.301 0.177 0.094 0.057 0.033 175 A 0.003 0.016 0.469 0.146 0.113 0.094 0.065 0.037 0.028 0.016 0.012 176 L 0.001 0.001 0.003 0.010 0.024 0.093 0.346 0.213 0.134 0.112 0.064 177 G 0.222 0.266 0.111 0.233 0.091 0.036 0.022 0.009 0.005 0.003 0.003 178 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.023 0.065 0.190 0.279 0.435 179 K 0.154 0.273 0.114 0.330 0.103 0.022 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 180 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.070 0.245 0.304 0.356 181 K 0.017 0.056 0.032 0.260 0.285 0.217 0.102 0.019 0.008 0.003 0.002 182 V 0.001 0.002 0.001 0.004 0.005 0.009 0.039 0.083 0.228 0.299 0.329 183 G 0.010 0.021 0.015 0.125 0.163 0.182 0.232 0.114 0.081 0.037 0.020 184 A 0.102 0.088 0.040 0.104 0.091 0.096 0.166 0.127 0.096 0.061 0.031 185 R 0.056 0.091 0.036 0.142 0.153 0.144 0.142 0.093 0.069 0.051 0.023 186 E 0.090 0.415 0.070 0.166 0.100 0.063 0.045 0.024 0.016 0.008 0.004 187 S 0.569 0.096 0.055 0.114 0.078 0.039 0.027 0.010 0.007 0.003 0.001 188 D 0.746 0.136 0.050 0.042 0.014 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 189 L 0.008 0.017 0.016 0.053 0.063 0.157 0.280 0.181 0.132 0.066 0.027 190 L 0.016 0.011 0.050 0.072 0.097 0.167 0.224 0.149 0.118 0.067 0.029 191 A 0.020 0.032 0.783 0.079 0.036 0.023 0.016 0.005 0.003 0.001 0.001 192 R 0.004 0.020 0.209 0.250 0.197 0.153 0.098 0.037 0.020 0.009 0.003 193 I 0.004 0.003 0.016 0.007 0.009 0.019 0.074 0.114 0.217 0.280 0.257 194 A 0.011 0.018 0.223 0.163 0.175 0.179 0.147 0.049 0.023 0.008 0.003 195 E 0.017 0.051 0.626 0.144 0.084 0.041 0.022 0.007 0.004 0.002 0.001 196 M 0.013 0.018 0.020 0.041 0.068 0.138 0.267 0.163 0.125 0.098 0.049 197 G 0.445 0.159 0.060 0.084 0.057 0.047 0.063 0.030 0.028 0.017 0.010 198 M 0.010 0.010 0.011 0.020 0.029 0.044 0.109 0.136 0.202 0.208 0.221 199 E 0.198 0.328 0.148 0.178 0.079 0.035 0.019 0.007 0.004 0.002 0.001 200 P 0.154 0.095 0.051 0.140 0.127 0.120 0.132 0.073 0.057 0.033 0.019 201 F 0.089 0.038 0.022 0.048 0.060 0.091 0.158 0.135 0.152 0.122 0.086 202 H 0.094 0.191 0.125 0.200 0.145 0.096 0.069 0.032 0.025 0.014 0.009 203 I 0.032 0.033 0.025 0.049 0.056 0.081 0.152 0.146 0.164 0.153 0.109 204 S 0.212 0.130 0.096 0.151 0.125 0.090 0.093 0.043 0.032 0.018 0.010 205 K 0.369 0.176 0.172 0.160 0.066 0.029 0.017 0.005 0.003 0.002 0.001 206 A 0.059 0.047 0.043 0.080 0.079 0.116 0.177 0.119 0.110 0.093 0.077 207 A 0.036 0.031 0.046 0.082 0.095 0.141 0.202 0.133 0.109 0.075 0.050 208 Q 0.142 0.133 0.309 0.181 0.095 0.056 0.045 0.019 0.011 0.006 0.004 209 E 0.065 0.121 0.208 0.218 0.145 0.103 0.077 0.028 0.018 0.010 0.007 210 L 0.006 0.003 0.005 0.009 0.013 0.022 0.069 0.112 0.190 0.254 0.318 211 R 0.064 0.068 0.051 0.145 0.165 0.161 0.166 0.080 0.057 0.027 0.015 212 D 0.037 0.058 0.096 0.145 0.132 0.154 0.157 0.088 0.069 0.038 0.024 213 V 0.005 0.004 0.003 0.011 0.014 0.024 0.085 0.153 0.224 0.250 0.227 214 D 0.015 0.017 0.015 0.044 0.056 0.095 0.178 0.166 0.176 0.121 0.117 215 V 0.005 0.006 0.006 0.012 0.012 0.021 0.063 0.111 0.204 0.261 0.299 216 C 0.005 0.007 0.005 0.023 0.034 0.060 0.130 0.171 0.207 0.185 0.173 217 I 0.013 0.019 0.014 0.039 0.047 0.062 0.133 0.162 0.200 0.169 0.142 218 N 0.066 0.050 0.034 0.102 0.116 0.127 0.154 0.112 0.103 0.076 0.058 219 T 0.097 0.100 0.047 0.171 0.147 0.128 0.127 0.074 0.051 0.034 0.024 220 I 0.059 0.089 0.041 0.111 0.124 0.124 0.146 0.101 0.092 0.069 0.044 221 P 0.034 0.028 0.017 0.046 0.067 0.086 0.152 0.135 0.155 0.129 0.152 222 A 0.199 0.128 0.058 0.164 0.129 0.103 0.098 0.048 0.035 0.022 0.015 223 L 0.019 0.035 0.024 0.098 0.135 0.171 0.229 0.122 0.090 0.051 0.026 224 V 0.008 0.005 0.011 0.015 0.016 0.025 0.082 0.127 0.196 0.249 0.266 225 V 0.001 0.002 0.004 0.010 0.025 0.050 0.119 0.141 0.205 0.231 0.212 226 T 0.004 0.104 0.102 0.159 0.112 0.099 0.150 0.098 0.086 0.056 0.030 227 A 0.021 0.015 0.035 0.121 0.201 0.233 0.208 0.079 0.052 0.024 0.012 228 N 0.710 0.087 0.102 0.057 0.021 0.009 0.008 0.003 0.002 0.001 0.001 229 V 0.001 0.002 0.005 0.035 0.052 0.124 0.289 0.211 0.162 0.083 0.035 230 L 0.001 0.001 0.007 0.005 0.009 0.023 0.094 0.135 0.217 0.255 0.252 231 A 0.011 0.022 0.457 0.213 0.139 0.090 0.049 0.011 0.004 0.002 0.001 232 E 0.005 0.034 0.158 0.203 0.213 0.200 0.127 0.035 0.016 0.007 0.003 233 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.035 0.067 0.160 0.257 0.469 234 P 0.078 0.047 0.021 0.075 0.104 0.156 0.230 0.123 0.086 0.045 0.036 235 S 0.272 0.214 0.273 0.154 0.054 0.020 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 236 H 0.082 0.079 0.042 0.180 0.189 0.178 0.147 0.055 0.026 0.015 0.007 237 T 0.001 0.001 0.001 0.006 0.012 0.029 0.102 0.193 0.240 0.226 0.190 238 F 0.001 0.001 0.002 0.012 0.042 0.120 0.276 0.241 0.166 0.085 0.055 239 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.035 0.120 0.215 0.304 0.318 240 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.014 0.074 0.160 0.245 0.268 0.231 241 D 0.001 0.002 0.002 0.011 0.014 0.029 0.086 0.155 0.267 0.241 0.192 242 L 0.001 0.001 0.001 0.005 0.008 0.014 0.056 0.123 0.199 0.287 0.307 243 A 0.003 0.008 0.008 0.033 0.055 0.069 0.164 0.189 0.181 0.150 0.140 244 S 0.020 0.036 0.018 0.120 0.162 0.159 0.208 0.131 0.078 0.043 0.025 245 K 0.122 0.095 0.046 0.174 0.175 0.142 0.106 0.062 0.042 0.023 0.011 246 P 0.255 0.168 0.061 0.135 0.093 0.077 0.075 0.047 0.039 0.032 0.018 247 G 0.132 0.079 0.025 0.084 0.088 0.093 0.148 0.102 0.103 0.086 0.057 248 G 0.076 0.074 0.023 0.068 0.082 0.112 0.155 0.122 0.123 0.092 0.072 249 T 0.035 0.073 0.030 0.094 0.091 0.088 0.109 0.103 0.129 0.126 0.122 250 D 0.024 0.047 0.017 0.063 0.077 0.096 0.156 0.140 0.153 0.127 0.101 251 F 0.068 0.029 0.025 0.109 0.151 0.157 0.157 0.102 0.102 0.066 0.035 252 R 0.165 0.114 0.162 0.203 0.126 0.086 0.070 0.029 0.023 0.013 0.009 253 Y 0.005 0.009 0.019 0.063 0.066 0.102 0.209 0.170 0.167 0.115 0.075 254 A 0.004 0.002 0.010 0.009 0.010 0.020 0.072 0.129 0.220 0.280 0.243 255 E 0.012 0.028 0.211 0.244 0.182 0.141 0.103 0.040 0.021 0.011 0.007 256 K 0.011 0.037 0.356 0.141 0.126 0.122 0.106 0.044 0.031 0.015 0.010 257 R 0.014 0.014 0.013 0.043 0.060 0.128 0.255 0.161 0.134 0.112 0.067 258 G 0.594 0.216 0.057 0.070 0.029 0.015 0.011 0.004 0.003 0.002 0.001 259 I 0.017 0.024 0.025 0.049 0.052 0.064 0.119 0.136 0.187 0.169 0.157 260 K 0.079 0.138 0.104 0.199 0.174 0.133 0.099 0.036 0.021 0.010 0.006 261 A 0.031 0.059 0.056 0.164 0.155 0.152 0.173 0.090 0.066 0.034 0.022 262 L 0.010 0.011 0.015 0.034 0.049 0.084 0.153 0.163 0.185 0.164 0.133 263 L 0.007 0.018 0.020 0.056 0.076 0.095 0.155 0.166 0.181 0.122 0.104 264 V 0.019 0.020 0.018 0.038 0.042 0.056 0.131 0.158 0.191 0.178 0.149 265 P 0.074 0.050 0.044 0.105 0.116 0.122 0.174 0.120 0.097 0.060 0.038 266 G 0.175 0.082 0.038 0.110 0.092 0.090 0.123 0.092 0.089 0.064 0.044 267 L 0.028 0.022 0.012 0.032 0.033 0.046 0.089 0.123 0.192 0.214 0.209 268 P 0.082 0.109 0.044 0.103 0.095 0.101 0.134 0.104 0.105 0.073 0.050 269 G 0.136 0.066 0.023 0.054 0.056 0.068 0.119 0.127 0.134 0.119 0.099 270 I 0.082 0.054 0.023 0.085 0.107 0.117 0.159 0.121 0.105 0.080 0.067 271 V 0.086 0.088 0.046 0.120 0.127 0.105 0.115 0.090 0.087 0.073 0.064 272 A 0.136 0.154 0.052 0.133 0.122 0.096 0.102 0.073 0.061 0.043 0.026 273 P 0.234 0.098 0.038 0.083 0.081 0.086 0.119 0.087 0.078 0.058 0.039 274 K 0.235 0.139 0.068 0.157 0.132 0.100 0.083 0.036 0.025 0.015 0.010 275 T 0.132 0.162 0.088 0.163 0.119 0.097 0.087 0.048 0.043 0.033 0.028 276 A 0.024 0.032 0.022 0.055 0.066 0.087 0.156 0.139 0.158 0.138 0.123 277 G 0.109 0.042 0.040 0.085 0.100 0.138 0.199 0.113 0.092 0.051 0.031 278 R 0.096 0.088 0.214 0.232 0.153 0.104 0.064 0.022 0.014 0.008 0.005 279 I 0.009 0.015 0.053 0.075 0.083 0.121 0.217 0.144 0.115 0.094 0.076 280 L 0.003 0.003 0.019 0.012 0.012 0.016 0.054 0.090 0.193 0.277 0.321 281 A 0.006 0.017 0.178 0.108 0.102 0.123 0.194 0.109 0.084 0.051 0.028 282 D 0.020 0.049 0.384 0.239 0.142 0.095 0.047 0.013 0.007 0.003 0.002 283 V 0.007 0.007 0.027 0.019 0.024 0.047 0.180 0.157 0.180 0.183 0.171 284 L 0.015 0.022 0.060 0.078 0.057 0.058 0.127 0.120 0.178 0.158 0.127 285 V 0.004 0.008 0.036 0.024 0.036 0.065 0.183 0.148 0.191 0.157 0.147 286 K 0.058 0.084 0.270 0.245 0.148 0.097 0.059 0.019 0.010 0.006 0.003 287 L 0.008 0.013 0.019 0.026 0.048 0.084 0.261 0.202 0.184 0.110 0.047 288 L 0.013 0.016 0.025 0.046 0.035 0.040 0.091 0.114 0.189 0.213 0.218 289 A 0.018 0.037 0.052 0.075 0.107 0.138 0.226 0.133 0.114 0.069 0.031 290 E 0.287 0.217 0.157 0.184 0.074 0.037 0.023 0.011 0.006 0.003 0.001 291 P 0.125 0.071 0.037 0.080 0.098 0.119 0.162 0.120 0.092 0.065 0.031 292 S 0.212 0.202 0.041 0.118 0.099 0.069 0.081 0.062 0.053 0.037 0.026