# TARGET T0398 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0398.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1138.46 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.150 0.098 0.058 0.110 0.079 0.076 0.093 0.089 0.102 0.079 0.065 2 L 0.118 0.070 0.040 0.080 0.090 0.102 0.145 0.109 0.102 0.083 0.061 3 T 0.197 0.219 0.062 0.145 0.106 0.073 0.078 0.050 0.039 0.022 0.010 4 G 0.270 0.089 0.026 0.072 0.079 0.081 0.095 0.087 0.082 0.069 0.049 5 K 0.181 0.190 0.081 0.172 0.126 0.082 0.070 0.036 0.029 0.020 0.014 6 H 0.130 0.127 0.089 0.174 0.124 0.104 0.102 0.060 0.048 0.028 0.013 7 V 0.084 0.048 0.035 0.086 0.100 0.113 0.169 0.129 0.112 0.078 0.047 8 V 0.085 0.079 0.072 0.128 0.113 0.099 0.142 0.108 0.086 0.055 0.033 9 I 0.053 0.067 0.082 0.139 0.135 0.132 0.154 0.094 0.073 0.044 0.026 10 I 0.089 0.091 0.098 0.151 0.119 0.107 0.125 0.082 0.061 0.048 0.030 11 G 0.229 0.187 0.059 0.109 0.092 0.073 0.089 0.062 0.048 0.036 0.017 12 G 0.409 0.229 0.061 0.104 0.069 0.045 0.036 0.018 0.015 0.009 0.004 13 D 0.253 0.111 0.043 0.094 0.078 0.079 0.114 0.069 0.072 0.054 0.033 14 A 0.289 0.134 0.131 0.173 0.102 0.063 0.055 0.025 0.017 0.008 0.004 15 R 0.054 0.085 0.076 0.148 0.120 0.127 0.144 0.098 0.079 0.044 0.025 16 Q 0.005 0.016 0.025 0.048 0.061 0.111 0.203 0.180 0.172 0.115 0.062 17 L 0.034 0.021 0.117 0.122 0.127 0.165 0.188 0.096 0.073 0.040 0.018 18 E 0.029 0.061 0.339 0.258 0.156 0.076 0.052 0.016 0.008 0.003 0.001 19 I 0.001 0.005 0.022 0.025 0.029 0.059 0.167 0.192 0.217 0.176 0.108 20 I 0.001 0.002 0.011 0.026 0.053 0.090 0.196 0.181 0.201 0.153 0.088 21 R 0.025 0.045 0.589 0.165 0.094 0.048 0.024 0.006 0.003 0.001 0.001 22 K 0.011 0.046 0.124 0.231 0.219 0.191 0.129 0.031 0.012 0.004 0.001 23 L 0.003 0.002 0.003 0.006 0.007 0.017 0.071 0.132 0.239 0.291 0.228 24 S 0.030 0.055 0.051 0.181 0.173 0.196 0.159 0.072 0.040 0.023 0.020 25 T 0.122 0.141 0.440 0.159 0.077 0.032 0.016 0.006 0.004 0.002 0.001 26 F 0.019 0.020 0.012 0.069 0.098 0.193 0.298 0.147 0.077 0.046 0.021 27 D 0.476 0.265 0.055 0.119 0.050 0.019 0.010 0.003 0.002 0.001 0.001 28 A 0.001 0.002 0.001 0.006 0.010 0.020 0.073 0.139 0.249 0.251 0.248 29 K 0.021 0.095 0.091 0.287 0.235 0.164 0.079 0.017 0.007 0.003 0.002 30 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.030 0.092 0.221 0.282 0.365 31 S 0.006 0.008 0.006 0.050 0.081 0.140 0.255 0.189 0.132 0.078 0.055 32 L 0.002 0.004 0.004 0.012 0.016 0.029 0.091 0.145 0.242 0.230 0.225 33 V 0.002 0.003 0.003 0.017 0.024 0.045 0.114 0.145 0.206 0.223 0.218 34 G 0.044 0.080 0.035 0.150 0.166 0.132 0.150 0.099 0.070 0.045 0.028 35 F 0.018 0.021 0.012 0.052 0.065 0.074 0.149 0.164 0.170 0.158 0.117 36 D 0.139 0.184 0.069 0.191 0.159 0.103 0.079 0.035 0.022 0.012 0.007 37 Q 0.294 0.201 0.067 0.165 0.101 0.067 0.053 0.023 0.015 0.009 0.005 38 L 0.181 0.080 0.040 0.097 0.096 0.099 0.123 0.083 0.082 0.068 0.050 39 D 0.233 0.200 0.076 0.137 0.091 0.073 0.075 0.041 0.036 0.023 0.016 40 D 0.098 0.092 0.051 0.151 0.143 0.133 0.132 0.078 0.061 0.039 0.022 41 G 0.125 0.092 0.060 0.118 0.105 0.109 0.127 0.084 0.077 0.060 0.044 42 F 0.039 0.039 0.053 0.139 0.130 0.136 0.162 0.104 0.094 0.065 0.040 43 I 0.024 0.026 0.046 0.069 0.071 0.093 0.158 0.138 0.161 0.130 0.086 44 G 0.041 0.061 0.092 0.167 0.130 0.125 0.140 0.090 0.078 0.048 0.028 45 V 0.012 0.011 0.029 0.034 0.042 0.062 0.123 0.145 0.209 0.192 0.141 46 T 0.033 0.062 0.142 0.204 0.170 0.133 0.121 0.057 0.042 0.023 0.013 47 K 0.055 0.066 0.099 0.144 0.131 0.139 0.168 0.086 0.064 0.033 0.017 48 M 0.018 0.021 0.043 0.064 0.073 0.110 0.175 0.151 0.141 0.122 0.082 49 R 0.140 0.224 0.140 0.194 0.127 0.072 0.055 0.022 0.014 0.008 0.005 50 I 0.031 0.029 0.032 0.047 0.051 0.064 0.134 0.148 0.175 0.159 0.131 51 D 0.274 0.165 0.082 0.170 0.127 0.076 0.058 0.022 0.014 0.007 0.005 52 E 0.305 0.164 0.097 0.156 0.085 0.065 0.055 0.028 0.021 0.013 0.010 53 V 0.056 0.034 0.022 0.063 0.074 0.108 0.167 0.134 0.146 0.117 0.079 54 D 0.171 0.167 0.078 0.140 0.093 0.081 0.095 0.058 0.055 0.036 0.026 55 W 0.023 0.017 0.017 0.033 0.037 0.051 0.107 0.134 0.200 0.196 0.185 56 N 0.072 0.122 0.100 0.199 0.165 0.127 0.101 0.047 0.033 0.019 0.015 57 T 0.103 0.101 0.064 0.158 0.124 0.104 0.113 0.080 0.070 0.048 0.035 58 V 0.077 0.044 0.037 0.092 0.110 0.135 0.160 0.122 0.111 0.072 0.040 59 D 0.165 0.146 0.095 0.187 0.134 0.096 0.084 0.039 0.029 0.015 0.010 60 A 0.023 0.021 0.023 0.052 0.060 0.080 0.147 0.152 0.168 0.152 0.122 61 I 0.046 0.044 0.033 0.090 0.109 0.126 0.181 0.125 0.105 0.082 0.061 62 L 0.048 0.081 0.071 0.154 0.147 0.133 0.146 0.087 0.067 0.041 0.026 63 L 0.005 0.007 0.006 0.014 0.025 0.039 0.105 0.136 0.201 0.232 0.231 64 P 0.126 0.214 0.124 0.257 0.140 0.064 0.043 0.016 0.009 0.005 0.003 65 I 0.039 0.024 0.016 0.053 0.080 0.113 0.216 0.149 0.147 0.103 0.060 66 S 0.481 0.227 0.088 0.117 0.047 0.019 0.011 0.004 0.003 0.002 0.001 67 G 0.068 0.099 0.035 0.090 0.096 0.116 0.163 0.101 0.093 0.082 0.056 68 T 0.114 0.138 0.057 0.110 0.112 0.111 0.123 0.079 0.071 0.051 0.035 69 N 0.548 0.148 0.088 0.108 0.055 0.026 0.015 0.005 0.004 0.002 0.001 70 E 0.132 0.156 0.141 0.213 0.133 0.083 0.070 0.029 0.021 0.012 0.009 71 A 0.069 0.036 0.027 0.047 0.047 0.070 0.135 0.133 0.163 0.152 0.121 72 G 0.177 0.076 0.071 0.114 0.111 0.129 0.147 0.071 0.055 0.032 0.017 73 K 0.155 0.193 0.377 0.156 0.058 0.031 0.017 0.006 0.004 0.002 0.001 74 V 0.048 0.059 0.051 0.097 0.101 0.127 0.173 0.110 0.101 0.078 0.056 75 D 0.067 0.039 0.035 0.079 0.099 0.117 0.168 0.124 0.122 0.091 0.059 76 T 0.188 0.154 0.211 0.187 0.114 0.071 0.043 0.015 0.009 0.004 0.003 77 I 0.016 0.041 0.071 0.118 0.135 0.158 0.196 0.105 0.078 0.049 0.034 78 F 0.003 0.003 0.003 0.008 0.014 0.029 0.080 0.119 0.180 0.232 0.328 79 S 0.086 0.166 0.111 0.203 0.166 0.100 0.090 0.035 0.022 0.012 0.010 80 N 0.376 0.166 0.152 0.142 0.073 0.044 0.027 0.010 0.006 0.003 0.002 81 E 0.200 0.110 0.048 0.136 0.128 0.112 0.115 0.057 0.040 0.030 0.025 82 S 0.046 0.072 0.038 0.110 0.106 0.127 0.152 0.107 0.102 0.079 0.062 83 I 0.026 0.032 0.020 0.060 0.080 0.111 0.186 0.139 0.147 0.111 0.087 84 V 0.032 0.014 0.013 0.021 0.021 0.037 0.108 0.130 0.178 0.211 0.235 85 L 0.010 0.015 0.011 0.038 0.050 0.074 0.127 0.138 0.187 0.178 0.173 86 T 0.016 0.044 0.019 0.061 0.058 0.068 0.119 0.136 0.186 0.168 0.125 87 E 0.133 0.049 0.061 0.131 0.125 0.125 0.126 0.077 0.078 0.057 0.038 88 E 0.121 0.072 0.071 0.115 0.108 0.101 0.147 0.091 0.083 0.054 0.037 89 M 0.011 0.018 0.018 0.049 0.052 0.086 0.155 0.156 0.187 0.151 0.117 90 I 0.010 0.014 0.024 0.037 0.052 0.087 0.175 0.157 0.182 0.153 0.108 91 E 0.178 0.140 0.270 0.156 0.095 0.059 0.052 0.023 0.015 0.007 0.005 92 K 0.128 0.123 0.099 0.180 0.162 0.127 0.097 0.040 0.024 0.012 0.007 93 T 0.017 0.025 0.012 0.030 0.037 0.057 0.116 0.127 0.175 0.199 0.205 94 P 0.236 0.144 0.067 0.137 0.118 0.104 0.091 0.045 0.030 0.016 0.011 95 N 0.688 0.120 0.067 0.068 0.031 0.014 0.007 0.003 0.002 0.001 0.001 96 H 0.020 0.054 0.027 0.119 0.144 0.174 0.224 0.119 0.069 0.034 0.015 97 C 0.018 0.021 0.015 0.044 0.052 0.078 0.134 0.134 0.172 0.161 0.171 98 V 0.024 0.028 0.026 0.054 0.069 0.102 0.158 0.130 0.154 0.130 0.124 99 V 0.042 0.057 0.072 0.140 0.120 0.122 0.148 0.112 0.084 0.061 0.043 100 Y 0.046 0.045 0.033 0.071 0.086 0.100 0.172 0.141 0.129 0.094 0.083 101 S 0.064 0.065 0.046 0.134 0.120 0.118 0.136 0.101 0.092 0.070 0.054 102 G 0.253 0.166 0.078 0.150 0.122 0.085 0.063 0.030 0.024 0.017 0.011 103 I 0.029 0.033 0.027 0.052 0.052 0.063 0.117 0.118 0.148 0.166 0.195 104 S 0.124 0.105 0.045 0.096 0.097 0.092 0.138 0.094 0.086 0.069 0.054 105 N 0.198 0.084 0.043 0.114 0.105 0.110 0.121 0.074 0.068 0.048 0.035 106 T 0.062 0.044 0.030 0.059 0.060 0.075 0.152 0.124 0.140 0.131 0.123 107 Y 0.011 0.012 0.008 0.025 0.035 0.052 0.104 0.126 0.171 0.221 0.235 108 L 0.015 0.049 0.021 0.060 0.071 0.087 0.147 0.134 0.159 0.141 0.116 109 N 0.035 0.036 0.040 0.105 0.131 0.159 0.186 0.109 0.094 0.060 0.043 110 Q 0.664 0.119 0.079 0.083 0.031 0.012 0.007 0.003 0.002 0.001 0.001 111 C 0.012 0.032 0.018 0.076 0.104 0.128 0.212 0.149 0.134 0.081 0.054 112 M 0.008 0.008 0.007 0.013 0.019 0.041 0.093 0.129 0.208 0.222 0.251 113 K 0.134 0.105 0.138 0.204 0.171 0.122 0.083 0.022 0.013 0.005 0.003 114 K 0.216 0.148 0.284 0.187 0.076 0.043 0.026 0.009 0.005 0.003 0.002 115 T 0.009 0.016 0.008 0.031 0.043 0.075 0.155 0.169 0.188 0.177 0.130 116 N 0.016 0.027 0.015 0.036 0.048 0.093 0.174 0.160 0.180 0.139 0.113 117 R 0.119 0.094 0.209 0.167 0.147 0.121 0.078 0.028 0.020 0.010 0.007 118 T 0.034 0.043 0.057 0.145 0.153 0.166 0.190 0.087 0.061 0.038 0.025 119 L 0.005 0.007 0.011 0.021 0.019 0.024 0.075 0.127 0.227 0.245 0.241 120 V 0.012 0.006 0.026 0.030 0.037 0.083 0.166 0.147 0.195 0.160 0.139 121 K 0.014 0.026 0.321 0.202 0.141 0.119 0.091 0.040 0.024 0.013 0.007 122 L 0.002 0.009 0.036 0.040 0.060 0.124 0.259 0.172 0.137 0.099 0.061 123 M 0.008 0.006 0.015 0.014 0.014 0.021 0.070 0.104 0.210 0.273 0.265 124 E 0.060 0.056 0.101 0.118 0.122 0.138 0.169 0.092 0.070 0.044 0.029 125 R 0.035 0.067 0.140 0.156 0.136 0.133 0.138 0.081 0.058 0.037 0.018 126 D 0.181 0.111 0.100 0.111 0.103 0.097 0.113 0.068 0.055 0.038 0.023 127 D 0.197 0.131 0.092 0.139 0.097 0.092 0.101 0.053 0.044 0.030 0.023 128 I 0.097 0.052 0.053 0.070 0.071 0.084 0.135 0.118 0.132 0.116 0.072 129 A 0.092 0.086 0.061 0.108 0.098 0.102 0.154 0.102 0.089 0.062 0.047 130 I 0.028 0.029 0.040 0.051 0.050 0.065 0.136 0.141 0.165 0.156 0.140 131 Y 0.023 0.036 0.044 0.115 0.132 0.150 0.166 0.115 0.097 0.072 0.050 132 N 0.095 0.088 0.106 0.159 0.137 0.116 0.105 0.068 0.057 0.041 0.027 133 S 0.026 0.032 0.026 0.066 0.084 0.095 0.166 0.145 0.146 0.123 0.090 134 I 0.020 0.025 0.019 0.048 0.053 0.068 0.150 0.151 0.180 0.157 0.129 135 P 0.131 0.100 0.073 0.129 0.122 0.126 0.119 0.068 0.057 0.042 0.033 136 T 0.140 0.152 0.085 0.189 0.133 0.094 0.088 0.047 0.032 0.023 0.016 137 A 0.128 0.059 0.028 0.063 0.063 0.071 0.121 0.107 0.128 0.124 0.107 138 E 0.173 0.146 0.085 0.173 0.124 0.095 0.091 0.044 0.036 0.020 0.013 139 G 0.318 0.170 0.097 0.163 0.092 0.061 0.041 0.021 0.017 0.011 0.009 140 T 0.025 0.053 0.026 0.092 0.104 0.136 0.184 0.131 0.111 0.086 0.053 141 I 0.022 0.031 0.020 0.072 0.098 0.125 0.185 0.135 0.142 0.102 0.069 142 M 0.022 0.016 0.022 0.037 0.041 0.065 0.117 0.121 0.198 0.175 0.187 143 M 0.015 0.028 0.055 0.152 0.145 0.149 0.174 0.105 0.086 0.054 0.038 144 A 0.010 0.013 0.026 0.035 0.031 0.040 0.102 0.145 0.208 0.201 0.188 145 I 0.009 0.006 0.018 0.033 0.046 0.077 0.141 0.155 0.204 0.178 0.134 146 Q 0.032 0.053 0.153 0.213 0.174 0.138 0.116 0.054 0.037 0.019 0.011 147 H 0.014 0.031 0.048 0.078 0.094 0.148 0.217 0.136 0.113 0.076 0.045 148 T 0.027 0.022 0.012 0.036 0.043 0.056 0.129 0.153 0.182 0.181 0.159 149 D 0.357 0.213 0.067 0.148 0.086 0.055 0.038 0.016 0.010 0.006 0.005 150 F 0.022 0.022 0.013 0.043 0.058 0.080 0.140 0.147 0.180 0.164 0.132 151 T 0.228 0.240 0.077 0.253 0.111 0.051 0.024 0.008 0.004 0.002 0.002 152 I 0.002 0.002 0.001 0.005 0.009 0.020 0.067 0.107 0.213 0.227 0.348 153 H 0.065 0.180 0.112 0.305 0.154 0.095 0.057 0.016 0.009 0.004 0.003 154 G 0.286 0.171 0.058 0.173 0.125 0.067 0.056 0.026 0.017 0.011 0.011 155 A 0.003 0.006 0.007 0.035 0.054 0.065 0.174 0.197 0.204 0.143 0.113 156 N 0.020 0.101 0.068 0.319 0.262 0.153 0.060 0.010 0.004 0.001 0.001 157 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.086 0.216 0.296 0.380 158 A 0.001 0.001 0.001 0.008 0.021 0.065 0.225 0.237 0.196 0.128 0.117 159 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.028 0.078 0.203 0.276 0.404 160 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.011 0.050 0.108 0.199 0.281 0.342 161 G 0.003 0.006 0.005 0.022 0.035 0.051 0.135 0.201 0.231 0.172 0.138 162 L 0.012 0.024 0.012 0.071 0.080 0.087 0.168 0.176 0.163 0.124 0.084 163 G 0.024 0.028 0.014 0.085 0.135 0.155 0.174 0.139 0.127 0.070 0.048 164 R 0.113 0.109 0.048 0.153 0.178 0.144 0.123 0.062 0.038 0.020 0.012 165 V 0.002 0.008 0.005 0.015 0.019 0.027 0.062 0.116 0.221 0.260 0.265 166 G 0.002 0.011 0.005 0.014 0.025 0.053 0.132 0.157 0.214 0.190 0.198 167 M 0.035 0.035 0.029 0.114 0.175 0.197 0.185 0.091 0.068 0.043 0.029 168 S 0.020 0.041 0.046 0.116 0.144 0.160 0.198 0.113 0.086 0.046 0.031 169 V 0.001 0.001 0.003 0.009 0.007 0.009 0.036 0.085 0.199 0.272 0.380 170 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.012 0.060 0.091 0.182 0.248 0.399 171 R 0.003 0.005 0.269 0.204 0.154 0.152 0.120 0.042 0.028 0.014 0.009 172 K 0.001 0.001 0.017 0.049 0.092 0.199 0.348 0.150 0.076 0.043 0.025 173 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.018 0.094 0.274 0.609 174 A 0.001 0.002 0.015 0.053 0.099 0.185 0.302 0.169 0.092 0.052 0.030 175 A 0.006 0.024 0.568 0.155 0.100 0.068 0.036 0.017 0.013 0.007 0.007 176 L 0.001 0.001 0.002 0.012 0.034 0.140 0.432 0.198 0.092 0.060 0.028 177 G 0.381 0.315 0.091 0.154 0.041 0.011 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 178 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.021 0.064 0.188 0.283 0.439 179 K 0.151 0.298 0.100 0.327 0.099 0.021 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 180 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.065 0.241 0.302 0.372 181 K 0.014 0.054 0.028 0.312 0.293 0.198 0.079 0.014 0.005 0.002 0.001 182 V 0.001 0.002 0.001 0.005 0.007 0.011 0.045 0.096 0.253 0.299 0.279 183 G 0.011 0.022 0.016 0.154 0.177 0.195 0.219 0.099 0.067 0.027 0.013 184 A 0.064 0.062 0.030 0.085 0.079 0.085 0.183 0.158 0.134 0.084 0.036 185 R 0.136 0.170 0.053 0.199 0.151 0.108 0.085 0.047 0.030 0.016 0.006 186 E 0.092 0.264 0.062 0.185 0.130 0.100 0.081 0.043 0.026 0.012 0.005 187 S 0.502 0.103 0.062 0.108 0.079 0.050 0.047 0.023 0.015 0.007 0.003 188 D 0.497 0.209 0.090 0.115 0.048 0.021 0.012 0.004 0.002 0.001 0.001 189 L 0.011 0.026 0.018 0.055 0.066 0.137 0.252 0.182 0.140 0.083 0.030 190 L 0.022 0.017 0.092 0.127 0.139 0.175 0.185 0.107 0.082 0.040 0.015 191 A 0.034 0.041 0.727 0.106 0.046 0.022 0.015 0.005 0.003 0.001 0.001 192 R 0.002 0.009 0.119 0.155 0.160 0.190 0.192 0.094 0.048 0.023 0.008 193 I 0.001 0.002 0.014 0.009 0.014 0.032 0.115 0.160 0.238 0.250 0.165 194 A 0.008 0.021 0.459 0.179 0.142 0.097 0.062 0.019 0.008 0.003 0.001 195 E 0.019 0.060 0.583 0.172 0.086 0.044 0.024 0.007 0.003 0.001 0.001 196 M 0.009 0.007 0.008 0.019 0.033 0.079 0.206 0.176 0.193 0.172 0.098 197 G 0.458 0.212 0.062 0.091 0.053 0.041 0.043 0.016 0.013 0.007 0.004 198 M 0.013 0.009 0.012 0.019 0.027 0.035 0.092 0.120 0.210 0.210 0.253 199 E 0.221 0.311 0.124 0.192 0.086 0.038 0.019 0.005 0.003 0.001 0.001 200 P 0.138 0.091 0.044 0.160 0.149 0.142 0.141 0.062 0.042 0.020 0.010 201 F 0.013 0.009 0.006 0.015 0.027 0.050 0.124 0.164 0.206 0.219 0.168 202 H 0.033 0.234 0.076 0.171 0.148 0.120 0.094 0.046 0.037 0.025 0.016 203 I 0.007 0.013 0.008 0.033 0.062 0.096 0.183 0.176 0.185 0.141 0.096 204 S 0.663 0.133 0.071 0.074 0.034 0.012 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 205 K 0.163 0.205 0.141 0.281 0.130 0.049 0.023 0.005 0.002 0.001 0.001 206 A 0.003 0.004 0.002 0.007 0.012 0.033 0.119 0.155 0.236 0.240 0.190 207 A 0.012 0.010 0.028 0.106 0.178 0.278 0.251 0.077 0.039 0.015 0.006 208 Q 0.075 0.069 0.757 0.081 0.013 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 209 E 0.001 0.005 0.021 0.059 0.085 0.216 0.345 0.144 0.074 0.033 0.016 210 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.006 0.033 0.080 0.178 0.278 0.418 211 R 0.020 0.057 0.296 0.237 0.177 0.124 0.065 0.014 0.006 0.003 0.001 212 D 0.039 0.088 0.467 0.216 0.105 0.055 0.022 0.005 0.002 0.001 0.001 213 V 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 0.017 0.106 0.191 0.256 0.251 0.165 214 D 0.003 0.017 0.019 0.094 0.162 0.233 0.256 0.119 0.058 0.024 0.016 215 V 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.020 0.091 0.185 0.267 0.241 0.183 216 C 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.013 0.079 0.182 0.251 0.251 0.215 217 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.045 0.114 0.241 0.289 0.298 218 N 0.001 0.002 0.002 0.009 0.011 0.024 0.087 0.152 0.261 0.253 0.199 219 T 0.002 0.005 0.004 0.019 0.024 0.044 0.138 0.199 0.231 0.194 0.142 220 I 0.004 0.009 0.006 0.034 0.048 0.058 0.130 0.194 0.229 0.181 0.107 221 P 0.020 0.044 0.018 0.110 0.182 0.167 0.189 0.123 0.084 0.038 0.025 222 A 0.119 0.100 0.036 0.182 0.183 0.140 0.110 0.064 0.040 0.020 0.008 223 L 0.051 0.046 0.018 0.111 0.169 0.191 0.205 0.104 0.063 0.031 0.012 224 V 0.014 0.016 0.018 0.039 0.041 0.062 0.156 0.170 0.195 0.173 0.116 225 V 0.001 0.002 0.002 0.007 0.018 0.039 0.109 0.156 0.217 0.254 0.195 226 T 0.019 0.408 0.132 0.214 0.091 0.048 0.042 0.020 0.014 0.008 0.004 227 A 0.049 0.028 0.034 0.161 0.247 0.214 0.156 0.056 0.035 0.014 0.006 228 N 0.897 0.056 0.027 0.015 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 229 V 0.001 0.003 0.005 0.049 0.079 0.197 0.355 0.172 0.094 0.034 0.011 230 L 0.001 0.001 0.009 0.006 0.010 0.023 0.084 0.136 0.215 0.264 0.250 231 A 0.008 0.021 0.434 0.216 0.141 0.101 0.057 0.013 0.006 0.002 0.001 232 E 0.009 0.050 0.300 0.209 0.170 0.138 0.083 0.023 0.012 0.005 0.002 233 M 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.011 0.051 0.082 0.171 0.261 0.418 234 P 0.170 0.078 0.032 0.085 0.102 0.131 0.171 0.092 0.070 0.038 0.032 235 S 0.278 0.225 0.243 0.158 0.061 0.022 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 236 H 0.039 0.048 0.031 0.142 0.194 0.211 0.192 0.079 0.037 0.019 0.008 237 T 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 0.021 0.086 0.188 0.242 0.239 0.211 238 F 0.001 0.001 0.001 0.005 0.020 0.070 0.224 0.258 0.201 0.126 0.096 239 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.024 0.102 0.207 0.308 0.355 240 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.036 0.122 0.228 0.315 0.293 241 D 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.011 0.051 0.118 0.244 0.265 0.302 242 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.010 0.046 0.115 0.212 0.320 0.289 243 A 0.001 0.002 0.002 0.017 0.035 0.054 0.156 0.222 0.206 0.163 0.142 244 S 0.003 0.006 0.004 0.020 0.032 0.047 0.123 0.183 0.222 0.196 0.164 245 K 0.057 0.056 0.029 0.151 0.190 0.175 0.152 0.087 0.058 0.028 0.017 246 P 0.120 0.090 0.047 0.150 0.138 0.134 0.133 0.080 0.056 0.036 0.016 247 G 0.187 0.084 0.026 0.109 0.105 0.097 0.132 0.092 0.074 0.061 0.032 248 G 0.063 0.067 0.031 0.076 0.080 0.100 0.172 0.124 0.124 0.094 0.068 249 T 0.007 0.013 0.005 0.021 0.030 0.050 0.100 0.130 0.186 0.235 0.224 250 D 0.033 0.134 0.029 0.124 0.128 0.122 0.143 0.098 0.081 0.062 0.046 251 F 0.040 0.032 0.022 0.121 0.186 0.168 0.170 0.096 0.089 0.049 0.026 252 R 0.551 0.160 0.087 0.112 0.050 0.020 0.011 0.004 0.003 0.001 0.001 253 Y 0.007 0.021 0.015 0.094 0.117 0.162 0.252 0.145 0.103 0.054 0.029 254 A 0.003 0.002 0.004 0.008 0.013 0.029 0.093 0.149 0.231 0.257 0.210 255 E 0.052 0.096 0.275 0.327 0.145 0.066 0.029 0.007 0.003 0.001 0.001 256 K 0.050 0.105 0.364 0.203 0.119 0.079 0.049 0.016 0.009 0.004 0.002 257 R 0.011 0.011 0.007 0.039 0.057 0.133 0.257 0.178 0.133 0.104 0.069 258 G 0.685 0.213 0.032 0.045 0.015 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 259 I 0.004 0.006 0.007 0.016 0.020 0.028 0.074 0.118 0.223 0.238 0.266 260 K 0.040 0.109 0.065 0.216 0.204 0.165 0.119 0.042 0.022 0.010 0.007 261 A 0.005 0.015 0.015 0.052 0.074 0.116 0.221 0.181 0.161 0.093 0.066 262 L 0.004 0.005 0.006 0.026 0.043 0.089 0.169 0.184 0.180 0.158 0.136 263 L 0.002 0.003 0.004 0.013 0.021 0.038 0.102 0.178 0.239 0.211 0.189 264 V 0.004 0.005 0.004 0.014 0.019 0.031 0.099 0.154 0.222 0.222 0.225 265 P 0.016 0.011 0.009 0.027 0.033 0.049 0.121 0.161 0.205 0.196 0.174 266 G 0.041 0.033 0.015 0.067 0.075 0.088 0.155 0.156 0.157 0.120 0.093 267 L 0.018 0.018 0.009 0.028 0.032 0.047 0.101 0.141 0.204 0.206 0.198 268 P 0.057 0.051 0.022 0.067 0.075 0.091 0.134 0.131 0.142 0.121 0.108 269 G 0.099 0.060 0.023 0.069 0.078 0.087 0.134 0.131 0.126 0.103 0.088 270 I 0.106 0.070 0.025 0.085 0.098 0.113 0.146 0.108 0.094 0.080 0.074 271 V 0.061 0.069 0.031 0.107 0.123 0.107 0.111 0.098 0.101 0.096 0.096 272 A 0.079 0.098 0.021 0.069 0.088 0.082 0.118 0.119 0.128 0.109 0.090 273 P 0.272 0.112 0.031 0.089 0.075 0.074 0.098 0.072 0.069 0.058 0.049 274 K 0.085 0.051 0.019 0.087 0.156 0.172 0.183 0.093 0.077 0.047 0.030 275 T 0.062 0.162 0.067 0.157 0.104 0.093 0.092 0.067 0.072 0.062 0.063 276 A 0.007 0.008 0.007 0.031 0.049 0.080 0.156 0.140 0.182 0.173 0.166 277 G 0.042 0.012 0.017 0.027 0.032 0.069 0.185 0.155 0.193 0.147 0.122 278 R 0.012 0.021 0.072 0.203 0.185 0.190 0.166 0.074 0.042 0.023 0.013 279 I 0.001 0.004 0.035 0.031 0.030 0.037 0.101 0.130 0.168 0.211 0.251 280 L 0.001 0.001 0.008 0.005 0.006 0.009 0.041 0.077 0.184 0.295 0.375 281 A 0.001 0.004 0.088 0.082 0.104 0.127 0.225 0.136 0.125 0.073 0.035 282 D 0.007 0.023 0.207 0.196 0.174 0.189 0.125 0.040 0.022 0.012 0.007 283 V 0.001 0.003 0.010 0.011 0.016 0.038 0.168 0.185 0.239 0.201 0.129 284 L 0.004 0.003 0.009 0.011 0.009 0.015 0.062 0.117 0.230 0.270 0.268 285 V 0.009 0.016 0.100 0.089 0.130 0.191 0.244 0.100 0.070 0.034 0.017 286 K 0.050 0.086 0.293 0.185 0.138 0.100 0.085 0.031 0.018 0.009 0.004 287 L 0.018 0.016 0.016 0.027 0.039 0.072 0.202 0.186 0.200 0.152 0.071 288 L 0.096 0.070 0.042 0.098 0.084 0.099 0.155 0.117 0.111 0.083 0.045 289 A 0.123 0.124 0.097 0.120 0.121 0.115 0.129 0.076 0.051 0.030 0.013 290 E 0.408 0.222 0.088 0.122 0.062 0.038 0.028 0.015 0.009 0.006 0.002 291 P 0.516 0.122 0.043 0.083 0.067 0.051 0.049 0.028 0.020 0.014 0.007 292 S 0.538 0.213 0.034 0.073 0.044 0.028 0.026 0.017 0.013 0.009 0.005