# TARGET T0396 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0396.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 114.473 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 G 0.037 0.007 0.013 0.016 0.022 0.090 0.025 0.790 2 S 0.187 0.035 0.019 0.024 0.042 0.113 0.098 0.482 3 M 0.088 0.028 0.018 0.023 0.037 0.106 0.063 0.636 4 L 0.037 0.037 0.033 0.038 0.057 0.121 0.059 0.618 5 H 0.011 0.055 0.030 0.023 0.040 0.109 0.073 0.657 6 W 0.029 0.294 0.032 0.028 0.027 0.099 0.087 0.404 7 G 0.062 0.800 0.005 0.004 0.005 0.015 0.049 0.059 8 P 0.021 0.812 0.003 0.002 0.003 0.015 0.089 0.055 9 K 0.003 0.620 0.003 0.003 0.006 0.009 0.333 0.023 10 Y 0.001 0.876 0.001 0.001 0.003 0.003 0.108 0.006 11 W 0.001 0.921 0.002 0.004 0.005 0.002 0.058 0.005 12 R 0.001 0.930 0.004 0.006 0.010 0.002 0.041 0.005 13 S 0.003 0.896 0.009 0.005 0.011 0.006 0.064 0.007 14 L 0.007 0.786 0.042 0.023 0.022 0.007 0.097 0.016 15 H 0.032 0.713 0.028 0.033 0.053 0.017 0.092 0.031 16 L 0.050 0.310 0.085 0.038 0.074 0.056 0.191 0.195 17 Y 0.052 0.180 0.084 0.170 0.207 0.064 0.104 0.139 18 A 0.067 0.027 0.062 0.066 0.111 0.085 0.096 0.486 19 I 0.013 0.012 0.065 0.191 0.199 0.115 0.083 0.321 20 F 0.031 0.007 0.044 0.075 0.170 0.098 0.049 0.525 21 F 0.345 0.005 0.014 0.044 0.046 0.107 0.042 0.396 22 S 0.028 0.003 0.007 0.020 0.029 0.101 0.028 0.784 23 D 0.034 0.006 0.005 0.003 0.009 0.115 0.017 0.810 24 A 0.063 0.026 0.010 0.018 0.018 0.162 0.037 0.667 25 P 0.047 0.043 0.007 0.007 0.006 0.087 0.019 0.783 26 S 0.218 0.419 0.008 0.007 0.009 0.048 0.051 0.242 27 W 0.079 0.525 0.006 0.005 0.006 0.051 0.033 0.294 28 K 0.041 0.678 0.006 0.006 0.007 0.029 0.037 0.196 29 E 0.011 0.903 0.002 0.002 0.002 0.008 0.028 0.044 30 K 0.010 0.923 0.001 0.001 0.002 0.005 0.038 0.020 31 Y 0.005 0.877 0.002 0.002 0.002 0.005 0.088 0.018 32 E 0.001 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.006 33 A 0.001 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.002 34 I 0.001 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.002 35 Q 0.001 0.490 0.001 0.001 0.001 0.002 0.496 0.007 36 W 0.002 0.907 0.001 0.001 0.001 0.002 0.084 0.003 37 I 0.006 0.957 0.003 0.001 0.001 0.002 0.026 0.005 38 L 0.016 0.830 0.015 0.006 0.005 0.010 0.066 0.052 39 N 0.061 0.332 0.117 0.011 0.016 0.046 0.290 0.128 40 F 0.316 0.156 0.058 0.013 0.011 0.059 0.233 0.154 41 I 0.221 0.019 0.046 0.010 0.009 0.068 0.062 0.566 42 E 0.017 0.008 0.018 0.006 0.013 0.117 0.017 0.804 43 S 0.006 0.004 0.017 0.003 0.007 0.085 0.027 0.851 44 L 0.038 0.020 0.064 0.065 0.033 0.235 0.043 0.502 45 P 0.054 0.058 0.015 0.006 0.011 0.099 0.037 0.720 46 C 0.162 0.462 0.011 0.006 0.008 0.047 0.051 0.253 47 T 0.056 0.592 0.026 0.007 0.007 0.044 0.053 0.217 48 R 0.027 0.676 0.014 0.006 0.006 0.034 0.063 0.174 49 C 0.025 0.917 0.005 0.001 0.001 0.006 0.020 0.024 50 Q 0.032 0.897 0.003 0.001 0.001 0.006 0.036 0.024 51 H 0.016 0.370 0.013 0.004 0.004 0.021 0.469 0.102 52 H 0.008 0.647 0.008 0.002 0.002 0.012 0.285 0.035 53 A 0.050 0.889 0.004 0.001 0.001 0.007 0.025 0.024 54 F 0.032 0.077 0.019 0.007 0.007 0.019 0.764 0.075 55 S 0.043 0.226 0.018 0.009 0.011 0.064 0.267 0.362 56 Y 0.325 0.063 0.030 0.008 0.013 0.091 0.099 0.371 57 L 0.104 0.024 0.028 0.023 0.015 0.140 0.082 0.584 58 T 0.039 0.011 0.008 0.002 0.010 0.097 0.014 0.820 59 K 0.014 0.005 0.012 0.003 0.005 0.138 0.018 0.805 60 N 0.122 0.042 0.057 0.024 0.023 0.163 0.120 0.450 61 P 0.137 0.015 0.036 0.009 0.016 0.107 0.064 0.618 62 L 0.047 0.008 0.082 0.027 0.038 0.123 0.053 0.621 63 T 0.055 0.007 0.103 0.024 0.039 0.102 0.056 0.613 64 L 0.019 0.004 0.023 0.017 0.022 0.156 0.017 0.742 65 N 0.020 0.007 0.020 0.008 0.010 0.114 0.020 0.801 66 N 0.173 0.162 0.006 0.006 0.006 0.076 0.041 0.530 67 S 0.123 0.522 0.005 0.003 0.004 0.055 0.032 0.256 68 E 0.035 0.674 0.006 0.008 0.014 0.035 0.056 0.172 69 D 0.021 0.678 0.007 0.013 0.031 0.031 0.108 0.111 70 F 0.007 0.313 0.011 0.027 0.055 0.035 0.466 0.086 71 Q 0.005 0.504 0.012 0.042 0.104 0.018 0.279 0.036 72 Y 0.009 0.733 0.010 0.044 0.081 0.015 0.061 0.046 73 W 0.008 0.622 0.032 0.083 0.133 0.020 0.049 0.053 74 T 0.014 0.517 0.038 0.056 0.126 0.020 0.184 0.045 75 F 0.023 0.505 0.031 0.050 0.047 0.027 0.246 0.071 76 A 0.023 0.589 0.044 0.042 0.047 0.033 0.136 0.086 77 F 0.026 0.743 0.017 0.010 0.017 0.029 0.056 0.103 78 H 0.032 0.604 0.030 0.010 0.014 0.032 0.162 0.116 79 N 0.024 0.632 0.029 0.014 0.014 0.028 0.157 0.102 80 N 0.039 0.749 0.027 0.007 0.010 0.024 0.056 0.088 81 V 0.164 0.557 0.032 0.014 0.013 0.032 0.058 0.130 82 N 0.077 0.116 0.082 0.023 0.023 0.053 0.357 0.270 83 N 0.173 0.112 0.023 0.010 0.012 0.073 0.059 0.537 84 R 0.281 0.035 0.021 0.012 0.011 0.090 0.040 0.510 85 L 0.017 0.011 0.009 0.007 0.011 0.097 0.019 0.829 86 N 0.102 0.025 0.007 0.006 0.020 0.073 0.035 0.731 87 K 0.060 0.017 0.014 0.040 0.030 0.126 0.072 0.641 88 K 0.030 0.037 0.039 0.032 0.056 0.126 0.060 0.621 89 I 0.032 0.024 0.030 0.028 0.051 0.116 0.045 0.672 90 I 0.021 0.024 0.061 0.039 0.025 0.120 0.038 0.672 91 S 0.230 0.355 0.021 0.010 0.012 0.040 0.085 0.245 92 W 0.216 0.330 0.014 0.007 0.008 0.059 0.054 0.312 93 S 0.045 0.143 0.026 0.014 0.016 0.091 0.100 0.566 94 E 0.084 0.281 0.014 0.008 0.012 0.071 0.136 0.393 95 Y 0.190 0.332 0.015 0.011 0.016 0.078 0.091 0.268 96 K 0.101 0.241 0.022 0.021 0.036 0.074 0.060 0.445 97 N 0.041 0.148 0.024 0.017 0.042 0.081 0.063 0.582 98 I 0.026 0.057 0.059 0.045 0.058 0.134 0.129 0.493 99 Y 0.076 0.077 0.059 0.067 0.053 0.099 0.158 0.410 100 E 0.153 0.074 0.027 0.023 0.027 0.079 0.082 0.535 101 Q 0.101 0.026 0.031 0.022 0.030 0.098 0.049 0.642 102 S 0.095 0.015 0.017 0.023 0.031 0.094 0.048 0.676 103 I 0.054 0.007 0.011 0.015 0.021 0.103 0.034 0.755 104 L 0.034 0.007 0.012 0.020 0.032 0.126 0.034 0.734 105 K 0.046 0.008 0.009 0.016 0.027 0.090 0.037 0.766