# TARGET T0396 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor2-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 o_notor2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0396.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 106.089 # Pos AA G H I P A B S F J M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 G 0.021 0.010 0.002 0.016 0.014 0.014 0.135 0.002 0.001 0.021 0.764 2 S 0.183 0.036 0.003 0.020 0.024 0.039 0.107 0.012 0.001 0.053 0.521 3 M 0.184 0.027 0.002 0.029 0.023 0.032 0.085 0.011 0.001 0.035 0.571 4 L 0.082 0.020 0.002 0.067 0.029 0.048 0.121 0.004 0.001 0.056 0.571 5 H 0.023 0.030 0.001 0.038 0.025 0.041 0.130 0.003 0.001 0.036 0.672 6 W 0.019 0.146 0.003 0.027 0.031 0.023 0.096 0.004 0.001 0.044 0.607 7 G 0.056 0.594 0.002 0.011 0.019 0.024 0.041 0.008 0.001 0.055 0.188 8 P 0.017 0.757 0.001 0.005 0.008 0.006 0.018 0.002 0.001 0.064 0.121 9 K 0.007 0.624 0.002 0.010 0.008 0.009 0.017 0.002 0.001 0.262 0.059 10 Y 0.002 0.879 0.005 0.007 0.004 0.005 0.007 0.001 0.001 0.068 0.020 11 W 0.004 0.888 0.007 0.007 0.008 0.007 0.003 0.002 0.002 0.053 0.020 12 R 0.010 0.838 0.009 0.006 0.013 0.017 0.004 0.004 0.004 0.075 0.019 13 S 0.006 0.879 0.008 0.007 0.014 0.012 0.005 0.002 0.003 0.039 0.024 14 L 0.015 0.694 0.020 0.013 0.028 0.037 0.017 0.008 0.009 0.106 0.052 15 H 0.032 0.594 0.041 0.016 0.044 0.057 0.025 0.010 0.017 0.090 0.076 16 L 0.040 0.330 0.039 0.025 0.087 0.097 0.044 0.015 0.013 0.087 0.224 17 Y 0.064 0.144 0.019 0.038 0.127 0.212 0.068 0.017 0.009 0.098 0.203 18 A 0.042 0.031 0.006 0.056 0.111 0.153 0.083 0.007 0.004 0.136 0.371 19 I 0.019 0.021 0.010 0.102 0.150 0.149 0.106 0.005 0.004 0.077 0.356 20 F 0.045 0.012 0.003 0.053 0.062 0.111 0.093 0.008 0.002 0.064 0.546 21 F 0.150 0.007 0.003 0.049 0.052 0.058 0.076 0.009 0.002 0.082 0.511 22 S 0.043 0.004 0.001 0.027 0.017 0.021 0.129 0.002 0.001 0.033 0.722 23 D 0.032 0.009 0.001 0.013 0.007 0.008 0.085 0.002 0.001 0.022 0.821 24 A 0.107 0.033 0.001 0.010 0.007 0.008 0.147 0.006 0.001 0.033 0.649 25 P 0.040 0.162 0.001 0.005 0.004 0.004 0.078 0.003 0.001 0.024 0.678 26 S 0.114 0.530 0.001 0.005 0.005 0.007 0.036 0.007 0.001 0.046 0.248 27 W 0.065 0.759 0.001 0.002 0.002 0.003 0.018 0.004 0.001 0.027 0.118 28 K 0.026 0.812 0.001 0.002 0.002 0.002 0.012 0.002 0.001 0.040 0.100 29 E 0.009 0.933 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.001 0.014 0.033 30 K 0.005 0.970 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.013 31 Y 0.010 0.924 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.001 0.043 0.015 32 E 0.003 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.006 33 A 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 34 I 0.002 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.003 35 Q 0.007 0.641 0.005 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.003 0.317 0.018 36 W 0.006 0.836 0.026 0.001 0.001 0.001 0.005 0.002 0.010 0.097 0.015 37 I 0.039 0.857 0.019 0.002 0.001 0.001 0.006 0.004 0.014 0.033 0.024 38 L 0.087 0.520 0.027 0.007 0.004 0.007 0.019 0.011 0.017 0.109 0.193 39 N 0.058 0.169 0.024 0.012 0.008 0.013 0.084 0.012 0.017 0.227 0.376 40 F 0.147 0.147 0.028 0.019 0.009 0.017 0.108 0.016 0.016 0.137 0.353 41 I 0.111 0.029 0.008 0.025 0.010 0.010 0.113 0.009 0.006 0.087 0.593 42 E 0.027 0.017 0.004 0.038 0.015 0.028 0.116 0.006 0.002 0.043 0.704 43 S 0.022 0.012 0.001 0.025 0.013 0.015 0.095 0.003 0.001 0.055 0.756 44 L 0.070 0.030 0.005 0.061 0.027 0.028 0.157 0.007 0.003 0.098 0.513 45 P 0.032 0.090 0.002 0.023 0.008 0.010 0.107 0.005 0.001 0.023 0.698 46 C 0.149 0.328 0.002 0.018 0.011 0.016 0.045 0.014 0.001 0.042 0.375 47 T 0.086 0.470 0.002 0.014 0.011 0.011 0.066 0.006 0.001 0.063 0.270 48 R 0.020 0.606 0.004 0.012 0.006 0.010 0.040 0.005 0.001 0.077 0.220 49 C 0.044 0.783 0.005 0.004 0.005 0.005 0.014 0.009 0.003 0.041 0.087 50 Q 0.030 0.894 0.001 0.002 0.002 0.002 0.007 0.003 0.001 0.015 0.043 51 H 0.023 0.337 0.002 0.006 0.006 0.008 0.024 0.006 0.002 0.423 0.162 52 H 0.010 0.790 0.007 0.003 0.003 0.003 0.011 0.003 0.004 0.116 0.049 53 A 0.017 0.923 0.004 0.002 0.002 0.001 0.004 0.003 0.002 0.015 0.027 54 F 0.071 0.145 0.005 0.006 0.005 0.007 0.019 0.013 0.004 0.604 0.121 55 S 0.053 0.285 0.026 0.010 0.009 0.009 0.060 0.006 0.013 0.354 0.175 56 Y 0.183 0.143 0.034 0.024 0.015 0.017 0.084 0.012 0.014 0.170 0.303 57 L 0.224 0.024 0.016 0.025 0.012 0.021 0.079 0.013 0.009 0.099 0.479 58 T 0.046 0.005 0.002 0.015 0.009 0.018 0.100 0.002 0.001 0.030 0.771 59 K 0.011 0.005 0.001 0.013 0.009 0.009 0.133 0.001 0.001 0.023 0.795 60 N 0.071 0.011 0.001 0.023 0.014 0.019 0.195 0.004 0.001 0.054 0.607 61 P 0.076 0.007 0.001 0.019 0.010 0.014 0.126 0.003 0.001 0.061 0.683 62 L 0.032 0.006 0.001 0.036 0.017 0.020 0.098 0.002 0.001 0.050 0.738 63 T 0.051 0.007 0.001 0.041 0.015 0.031 0.081 0.002 0.001 0.047 0.725 64 L 0.021 0.007 0.001 0.056 0.018 0.023 0.095 0.001 0.001 0.045 0.733 65 N 0.009 0.018 0.001 0.040 0.020 0.022 0.178 0.001 0.001 0.051 0.659 66 N 0.068 0.334 0.001 0.010 0.010 0.011 0.089 0.005 0.001 0.058 0.413 67 S 0.203 0.426 0.001 0.007 0.005 0.006 0.031 0.008 0.001 0.122 0.190 68 E 0.016 0.774 0.001 0.004 0.003 0.003 0.017 0.001 0.001 0.037 0.143 69 D 0.015 0.783 0.002 0.005 0.005 0.009 0.012 0.002 0.001 0.071 0.096 70 F 0.018 0.137 0.003 0.006 0.014 0.017 0.025 0.006 0.001 0.694 0.080 71 Q 0.009 0.766 0.008 0.008 0.015 0.013 0.019 0.002 0.002 0.117 0.041 72 Y 0.009 0.840 0.004 0.007 0.019 0.012 0.009 0.002 0.001 0.045 0.053 73 W 0.009 0.790 0.008 0.009 0.021 0.026 0.009 0.004 0.003 0.074 0.048 74 T 0.019 0.721 0.010 0.008 0.013 0.024 0.026 0.003 0.004 0.109 0.063 75 F 0.037 0.463 0.024 0.019 0.021 0.026 0.048 0.009 0.009 0.241 0.103 76 A 0.059 0.425 0.026 0.024 0.018 0.014 0.042 0.012 0.018 0.189 0.172 77 F 0.038 0.672 0.008 0.011 0.008 0.007 0.018 0.010 0.005 0.044 0.179 78 H 0.048 0.598 0.004 0.008 0.005 0.006 0.023 0.012 0.003 0.095 0.198 79 N 0.018 0.754 0.004 0.007 0.006 0.007 0.016 0.005 0.003 0.083 0.097 80 N 0.016 0.832 0.004 0.004 0.004 0.005 0.014 0.004 0.002 0.045 0.071 81 V 0.037 0.727 0.015 0.005 0.008 0.007 0.014 0.009 0.007 0.080 0.091 82 N 0.154 0.285 0.057 0.010 0.016 0.017 0.044 0.015 0.029 0.180 0.193 83 N 0.269 0.137 0.026 0.007 0.010 0.020 0.066 0.012 0.015 0.083 0.355 84 R 0.227 0.033 0.008 0.008 0.010 0.013 0.067 0.008 0.005 0.044 0.577 85 L 0.074 0.021 0.003 0.009 0.009 0.014 0.106 0.004 0.002 0.023 0.734 86 N 0.044 0.019 0.001 0.005 0.006 0.017 0.098 0.003 0.001 0.022 0.784 87 K 0.064 0.019 0.001 0.010 0.023 0.021 0.110 0.005 0.001 0.042 0.704 88 K 0.062 0.019 0.001 0.040 0.028 0.046 0.109 0.003 0.001 0.045 0.648 89 I 0.011 0.014 0.001 0.043 0.023 0.033 0.149 0.001 0.001 0.040 0.684 90 I 0.011 0.029 0.002 0.045 0.033 0.034 0.126 0.003 0.001 0.051 0.664 91 S 0.295 0.381 0.002 0.015 0.012 0.018 0.030 0.012 0.001 0.039 0.195 92 W 0.356 0.302 0.001 0.006 0.007 0.007 0.024 0.007 0.001 0.032 0.259 93 S 0.048 0.260 0.002 0.010 0.009 0.013 0.056 0.003 0.001 0.071 0.526 94 E 0.082 0.401 0.004 0.007 0.009 0.023 0.055 0.007 0.002 0.077 0.333 95 Y 0.118 0.228 0.007 0.008 0.032 0.031 0.067 0.015 0.002 0.087 0.405 96 K 0.076 0.145 0.005 0.018 0.073 0.076 0.068 0.007 0.002 0.075 0.454 97 N 0.026 0.070 0.002 0.023 0.068 0.115 0.080 0.003 0.001 0.066 0.546 98 I 0.016 0.049 0.006 0.035 0.093 0.077 0.120 0.003 0.002 0.078 0.520 99 Y 0.103 0.049 0.010 0.035 0.061 0.114 0.123 0.010 0.005 0.088 0.403 100 E 0.268 0.048 0.003 0.014 0.023 0.036 0.067 0.010 0.002 0.031 0.497 101 Q 0.220 0.023 0.001 0.016 0.023 0.032 0.069 0.006 0.001 0.029 0.579 102 S 0.073 0.012 0.001 0.022 0.018 0.040 0.102 0.003 0.001 0.039 0.688 103 I 0.029 0.007 0.001 0.016 0.016 0.028 0.115 0.002 0.001 0.029 0.755 104 L 0.042 0.008 0.001 0.016 0.031 0.033 0.131 0.003 0.001 0.034 0.699 105 K 0.053 0.013 0.001 0.018 0.031 0.040 0.112 0.003 0.001 0.035 0.693