# TARGET T0396 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0396.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 106.089 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 G 0.055 0.028 0.016 0.014 0.015 0.106 0.037 0.728 2 S 0.133 0.114 0.023 0.018 0.025 0.108 0.079 0.501 3 M 0.113 0.059 0.032 0.019 0.027 0.103 0.111 0.536 4 L 0.068 0.042 0.040 0.036 0.048 0.111 0.087 0.570 5 H 0.037 0.047 0.034 0.022 0.054 0.139 0.057 0.610 6 W 0.046 0.103 0.039 0.017 0.042 0.127 0.057 0.568 7 G 0.111 0.509 0.007 0.013 0.017 0.063 0.110 0.170 8 P 0.049 0.710 0.005 0.005 0.010 0.033 0.076 0.112 9 K 0.023 0.568 0.009 0.008 0.014 0.027 0.250 0.101 10 Y 0.005 0.856 0.006 0.009 0.010 0.010 0.075 0.028 11 W 0.006 0.933 0.004 0.005 0.007 0.003 0.033 0.009 12 R 0.004 0.911 0.003 0.010 0.008 0.003 0.049 0.011 13 S 0.005 0.854 0.007 0.015 0.025 0.005 0.074 0.015 14 L 0.016 0.636 0.029 0.040 0.063 0.011 0.173 0.031 15 H 0.030 0.510 0.040 0.061 0.079 0.017 0.222 0.041 16 L 0.047 0.287 0.070 0.068 0.137 0.049 0.211 0.132 17 Y 0.032 0.143 0.087 0.118 0.169 0.072 0.172 0.207 18 A 0.025 0.027 0.094 0.094 0.186 0.118 0.088 0.368 19 I 0.015 0.024 0.140 0.152 0.192 0.120 0.073 0.283 20 F 0.036 0.013 0.086 0.066 0.117 0.122 0.064 0.497 21 F 0.141 0.011 0.057 0.040 0.044 0.146 0.088 0.473 22 S 0.030 0.008 0.025 0.010 0.018 0.138 0.060 0.711 23 D 0.017 0.010 0.013 0.005 0.009 0.122 0.022 0.801 24 A 0.067 0.061 0.007 0.010 0.009 0.134 0.074 0.639 25 P 0.026 0.075 0.005 0.005 0.004 0.107 0.030 0.749 26 S 0.133 0.595 0.003 0.002 0.003 0.025 0.077 0.162 27 W 0.110 0.604 0.002 0.003 0.002 0.030 0.067 0.181 28 K 0.037 0.699 0.003 0.003 0.004 0.026 0.052 0.175 29 E 0.016 0.869 0.001 0.001 0.004 0.010 0.038 0.061 30 K 0.010 0.927 0.001 0.001 0.002 0.004 0.038 0.017 31 Y 0.005 0.864 0.002 0.003 0.002 0.004 0.108 0.013 32 E 0.003 0.968 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 0.010 33 A 0.002 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.002 34 I 0.002 0.968 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 0.003 35 Q 0.003 0.726 0.003 0.001 0.001 0.002 0.255 0.007 36 W 0.005 0.918 0.004 0.002 0.002 0.003 0.055 0.011 37 I 0.033 0.888 0.008 0.002 0.003 0.004 0.047 0.016 38 L 0.032 0.696 0.014 0.008 0.007 0.025 0.089 0.129 39 N 0.037 0.262 0.054 0.011 0.022 0.049 0.413 0.152 40 F 0.073 0.136 0.129 0.031 0.021 0.074 0.300 0.237 41 I 0.171 0.030 0.076 0.016 0.016 0.091 0.195 0.406 42 E 0.030 0.037 0.047 0.014 0.014 0.126 0.031 0.702 43 S 0.033 0.007 0.024 0.003 0.005 0.129 0.025 0.773 44 L 0.050 0.037 0.039 0.013 0.009 0.150 0.081 0.620 45 P 0.046 0.123 0.013 0.002 0.004 0.082 0.029 0.701 46 C 0.074 0.546 0.005 0.003 0.003 0.036 0.054 0.279 47 T 0.032 0.643 0.007 0.004 0.003 0.025 0.152 0.134 48 R 0.022 0.660 0.015 0.003 0.004 0.022 0.132 0.142 49 C 0.019 0.925 0.002 0.001 0.001 0.003 0.030 0.019 50 Q 0.009 0.966 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.010 51 H 0.005 0.589 0.005 0.002 0.002 0.010 0.352 0.034 52 H 0.002 0.872 0.003 0.002 0.003 0.006 0.092 0.020 53 A 0.024 0.880 0.010 0.001 0.001 0.004 0.069 0.011 54 F 0.057 0.291 0.014 0.012 0.002 0.034 0.469 0.120 55 S 0.043 0.310 0.020 0.006 0.005 0.076 0.113 0.426 56 Y 0.176 0.121 0.114 0.005 0.006 0.071 0.094 0.413 57 L 0.348 0.009 0.022 0.005 0.003 0.071 0.108 0.433 58 T 0.016 0.006 0.011 0.002 0.004 0.108 0.013 0.840 59 K 0.005 0.001 0.026 0.002 0.005 0.119 0.008 0.835 60 N 0.082 0.021 0.027 0.023 0.013 0.141 0.071 0.622 61 P 0.052 0.009 0.032 0.007 0.008 0.129 0.025 0.737 62 L 0.049 0.012 0.087 0.010 0.023 0.095 0.058 0.666 63 T 0.041 0.009 0.079 0.018 0.024 0.111 0.053 0.665 64 L 0.027 0.005 0.079 0.016 0.024 0.141 0.029 0.678 65 N 0.010 0.012 0.027 0.013 0.027 0.114 0.030 0.767 66 N 0.122 0.273 0.012 0.008 0.013 0.079 0.085 0.408 67 S 0.209 0.521 0.003 0.005 0.004 0.035 0.096 0.128 68 E 0.021 0.648 0.005 0.009 0.011 0.044 0.046 0.216 69 D 0.031 0.773 0.009 0.003 0.021 0.016 0.074 0.071 70 F 0.012 0.370 0.018 0.020 0.026 0.024 0.480 0.050 71 Q 0.003 0.743 0.016 0.048 0.026 0.013 0.126 0.025 72 Y 0.014 0.880 0.007 0.011 0.022 0.006 0.032 0.030 73 W 0.006 0.862 0.011 0.021 0.019 0.007 0.043 0.031 74 T 0.014 0.775 0.017 0.015 0.024 0.012 0.117 0.026 75 F 0.036 0.507 0.023 0.024 0.021 0.020 0.326 0.043 76 A 0.038 0.381 0.044 0.027 0.032 0.046 0.247 0.185 77 F 0.036 0.535 0.035 0.020 0.026 0.044 0.145 0.159 78 H 0.027 0.448 0.049 0.020 0.026 0.065 0.147 0.217 79 N 0.031 0.465 0.045 0.020 0.024 0.056 0.094 0.264 80 N 0.056 0.496 0.033 0.019 0.023 0.047 0.110 0.217 81 V 0.082 0.429 0.042 0.022 0.028 0.054 0.104 0.239 82 N 0.134 0.124 0.050 0.019 0.022 0.058 0.397 0.196 83 N 0.168 0.083 0.020 0.020 0.021 0.077 0.109 0.502 84 R 0.258 0.042 0.018 0.007 0.021 0.070 0.046 0.538 85 L 0.056 0.032 0.022 0.018 0.022 0.109 0.028 0.714 86 N 0.177 0.045 0.014 0.014 0.025 0.109 0.039 0.577 87 K 0.110 0.038 0.026 0.022 0.030 0.100 0.095 0.580 88 K 0.091 0.023 0.029 0.028 0.043 0.092 0.049 0.645 89 I 0.019 0.008 0.020 0.018 0.030 0.157 0.042 0.707 90 I 0.008 0.009 0.056 0.022 0.029 0.135 0.026 0.716 91 S 0.467 0.193 0.006 0.006 0.010 0.041 0.071 0.205 92 W 0.208 0.246 0.008 0.005 0.004 0.073 0.068 0.386 93 S 0.031 0.179 0.024 0.010 0.018 0.080 0.150 0.509 94 E 0.053 0.201 0.047 0.023 0.040 0.091 0.208 0.337 95 Y 0.141 0.126 0.056 0.046 0.043 0.087 0.148 0.352 96 K 0.074 0.092 0.045 0.054 0.065 0.097 0.094 0.479 97 N 0.033 0.061 0.035 0.027 0.099 0.103 0.041 0.601 98 I 0.027 0.034 0.061 0.066 0.111 0.128 0.077 0.495 99 Y 0.114 0.041 0.052 0.079 0.086 0.098 0.130 0.400 100 E 0.210 0.037 0.019 0.032 0.033 0.080 0.065 0.524 101 Q 0.100 0.021 0.025 0.017 0.027 0.085 0.044 0.681 102 S 0.084 0.010 0.020 0.025 0.033 0.097 0.043 0.687 103 I 0.072 0.007 0.016 0.019 0.032 0.100 0.031 0.723 104 L 0.039 0.005 0.019 0.018 0.029 0.100 0.024 0.766 105 K 0.067 0.010 0.013 0.025 0.036 0.104 0.036 0.709