# TARGET T0396 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0396.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 106.089 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 G 0.029 0.013 0.019 0.013 0.027 0.028 0.006 0.866 2 S 0.074 0.015 0.046 0.041 0.064 0.118 0.009 0.635 3 M 0.013 0.004 0.012 0.007 0.011 0.017 0.001 0.935 4 L 0.042 0.033 0.040 0.049 0.070 0.261 0.006 0.498 5 H 0.201 0.037 0.024 0.016 0.025 0.285 0.008 0.404 6 W 0.159 0.160 0.058 0.022 0.053 0.085 0.015 0.448 7 G 0.094 0.118 0.038 0.025 0.049 0.118 0.013 0.544 8 P 0.005 0.010 0.003 0.001 0.003 0.009 0.001 0.968 9 K 0.029 0.118 0.017 0.017 0.044 0.176 0.008 0.591 10 Y 0.180 0.273 0.018 0.015 0.028 0.108 0.012 0.368 11 W 0.036 0.687 0.018 0.021 0.035 0.035 0.004 0.162 12 R 0.018 0.787 0.011 0.019 0.031 0.029 0.002 0.103 13 S 0.010 0.920 0.006 0.007 0.018 0.004 0.002 0.033 14 L 0.003 0.966 0.003 0.005 0.011 0.001 0.002 0.009 15 H 0.005 0.937 0.005 0.015 0.018 0.003 0.002 0.014 16 L 0.006 0.933 0.009 0.014 0.019 0.002 0.003 0.014 17 Y 0.008 0.865 0.012 0.039 0.061 0.001 0.005 0.008 18 A 0.015 0.817 0.017 0.053 0.064 0.002 0.008 0.024 19 I 0.022 0.744 0.040 0.070 0.083 0.002 0.012 0.025 20 F 0.085 0.417 0.046 0.081 0.150 0.012 0.050 0.159 21 F 0.093 0.218 0.081 0.175 0.159 0.026 0.037 0.210 22 S 0.025 0.027 0.041 0.040 0.050 0.049 0.016 0.751 23 D 0.051 0.016 0.034 0.017 0.029 0.175 0.021 0.657 24 A 0.233 0.007 0.023 0.009 0.010 0.151 0.024 0.542 25 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.997 26 S 0.017 0.005 0.008 0.005 0.012 0.308 0.002 0.644 27 W 0.043 0.006 0.003 0.001 0.002 0.024 0.001 0.920 28 K 0.022 0.059 0.004 0.002 0.005 0.314 0.002 0.592 29 E 0.069 0.112 0.002 0.001 0.002 0.602 0.003 0.209 30 K 0.090 0.774 0.005 0.001 0.002 0.018 0.005 0.106 31 Y 0.010 0.934 0.006 0.001 0.001 0.005 0.001 0.042 32 E 0.006 0.897 0.002 0.001 0.001 0.015 0.002 0.078 33 A 0.005 0.967 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.023 34 I 0.004 0.977 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.014 35 Q 0.004 0.980 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.011 36 W 0.002 0.991 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 37 I 0.002 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 38 L 0.004 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 39 N 0.008 0.977 0.002 0.001 0.001 0.001 0.006 0.006 40 F 0.072 0.864 0.008 0.001 0.001 0.001 0.034 0.020 41 I 0.038 0.836 0.046 0.005 0.004 0.006 0.016 0.050 42 E 0.072 0.632 0.098 0.018 0.015 0.022 0.031 0.113 43 S 0.251 0.384 0.054 0.007 0.013 0.009 0.048 0.234 44 L 0.218 0.225 0.101 0.019 0.015 0.096 0.034 0.292 45 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 46 C 0.033 0.033 0.085 0.016 0.036 0.129 0.006 0.662 47 T 0.085 0.035 0.024 0.008 0.006 0.144 0.003 0.695 48 R 0.053 0.106 0.010 0.002 0.004 0.183 0.004 0.637 49 C 0.212 0.342 0.015 0.002 0.007 0.095 0.008 0.319 50 Q 0.063 0.732 0.010 0.002 0.004 0.037 0.004 0.149 51 H 0.022 0.743 0.003 0.001 0.002 0.035 0.005 0.189 52 H 0.047 0.755 0.002 0.001 0.001 0.034 0.006 0.155 53 A 0.015 0.944 0.004 0.001 0.001 0.006 0.003 0.028 54 F 0.013 0.938 0.004 0.001 0.001 0.005 0.003 0.035 55 S 0.009 0.963 0.002 0.001 0.001 0.004 0.002 0.019 56 Y 0.017 0.959 0.002 0.001 0.001 0.001 0.006 0.015 57 L 0.031 0.941 0.005 0.001 0.001 0.001 0.007 0.014 58 T 0.039 0.900 0.014 0.004 0.003 0.004 0.014 0.023 59 K 0.151 0.625 0.011 0.004 0.005 0.006 0.079 0.117 60 N 0.374 0.275 0.037 0.008 0.007 0.022 0.121 0.157 61 P 0.011 0.005 0.005 0.001 0.001 0.003 0.004 0.971 62 L 0.025 0.021 0.115 0.050 0.052 0.163 0.009 0.566 63 T 0.269 0.015 0.039 0.030 0.023 0.181 0.012 0.431 64 L 0.178 0.050 0.068 0.064 0.064 0.062 0.007 0.507 65 N 0.061 0.044 0.068 0.053 0.071 0.244 0.008 0.450 66 N 0.070 0.023 0.021 0.025 0.037 0.227 0.010 0.587 67 S 0.068 0.039 0.021 0.020 0.039 0.158 0.015 0.640 68 E 0.014 0.012 0.005 0.003 0.004 0.467 0.004 0.490 69 D 0.050 0.024 0.003 0.002 0.003 0.699 0.011 0.209 70 F 0.264 0.326 0.026 0.009 0.016 0.117 0.020 0.222 71 Q 0.027 0.558 0.044 0.030 0.048 0.092 0.005 0.197 72 Y 0.034 0.577 0.031 0.034 0.065 0.072 0.005 0.182 73 W 0.035 0.751 0.022 0.029 0.049 0.019 0.005 0.090 74 T 0.014 0.867 0.025 0.014 0.030 0.008 0.005 0.037 75 F 0.021 0.796 0.042 0.029 0.043 0.009 0.007 0.053 76 A 0.025 0.778 0.029 0.025 0.031 0.014 0.009 0.088 77 F 0.047 0.741 0.024 0.010 0.022 0.018 0.022 0.116 78 H 0.099 0.643 0.028 0.011 0.021 0.023 0.029 0.147 79 N 0.052 0.551 0.048 0.025 0.026 0.055 0.020 0.223 80 N 0.114 0.353 0.030 0.012 0.016 0.064 0.029 0.381 81 V 0.118 0.495 0.037 0.016 0.019 0.101 0.016 0.199 82 N 0.062 0.481 0.021 0.037 0.037 0.102 0.013 0.247 83 N 0.069 0.668 0.046 0.017 0.025 0.021 0.010 0.144 84 R 0.075 0.530 0.018 0.010 0.015 0.089 0.021 0.242 85 L 0.123 0.499 0.011 0.014 0.015 0.135 0.028 0.175 86 N 0.157 0.419 0.025 0.012 0.017 0.065 0.074 0.231 87 K 0.257 0.144 0.076 0.022 0.021 0.069 0.054 0.356 88 K 0.050 0.052 0.078 0.023 0.017 0.056 0.010 0.714 89 I 0.046 0.035 0.045 0.053 0.085 0.045 0.008 0.684 90 I 0.140 0.048 0.103 0.061 0.084 0.124 0.007 0.432 91 S 0.064 0.043 0.052 0.061 0.062 0.140 0.008 0.570 92 W 0.017 0.019 0.022 0.011 0.022 0.038 0.003 0.868 93 S 0.007 0.012 0.004 0.003 0.005 0.682 0.002 0.284 94 E 0.122 0.020 0.002 0.002 0.002 0.702 0.013 0.137 95 Y 0.279 0.436 0.019 0.008 0.017 0.043 0.017 0.182 96 K 0.029 0.618 0.050 0.020 0.026 0.069 0.006 0.182 97 N 0.070 0.316 0.015 0.019 0.039 0.037 0.014 0.490 98 I 0.213 0.446 0.027 0.024 0.053 0.021 0.022 0.195 99 Y 0.075 0.397 0.051 0.075 0.082 0.038 0.018 0.264 100 E 0.045 0.219 0.051 0.049 0.064 0.075 0.017 0.481 101 Q 0.081 0.161 0.059 0.038 0.055 0.056 0.018 0.532 102 S 0.142 0.114 0.044 0.025 0.036 0.106 0.034 0.498 103 I 0.207 0.101 0.056 0.045 0.044 0.090 0.025 0.431 104 L 0.080 0.107 0.060 0.049 0.076 0.121 0.017 0.491 105 K 0.088 0.066 0.045 0.079 0.128 0.089 0.012 0.493