This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA G A 2 2 NATAA S A 3 3 NATAA M A 4 4 NATAA L A 5 5 NATAA H A 6 6 NATAA W A 7 7 NATAA G A 8 8 NATRO P A 9 9 NATAA K A 10 10 NATAA Y A 11 11 NATAA W A 12 12 NATAA R A 13 13 NATAA S A 14 14 NATAA L A 15 15 NATAA H A 16 16 NATAA L A 17 17 NATAA Y A 18 18 NATAA A A 19 19 NATAA I A 20 20 NATAA F A 21 21 NATAA F A 22 22 NATAA S A 23 23 NATAA D A 24 24 NATAA A A 25 25 NATRO P A 26 26 NATAA S A 27 27 NATAA W A 28 28 NATAA K A 29 29 NATAA E A 30 30 NATAA K A 31 31 NATAA Y A 32 32 NATAA E A 33 33 NATAA A A 34 34 NATAA I A 35 35 NATAA Q A 36 36 NATAA W A 37 37 NATAA I A 38 38 NATAA L A 39 39 NATAA N A 40 40 NATAA F A 41 41 NATAA I A 42 42 NATAA E A 43 43 NATAA S A 44 44 NATAA L A 45 45 NATRO P A 46 46 NATRO C A 47 47 NATAA T A 48 48 NATAA R A 49 49 NATRO C A 50 50 NATAA Q A 51 51 NATAA H A 52 52 NATAA H A 53 53 NATAA A A 54 54 NATAA F A 55 55 NATAA S A 56 56 NATAA Y A 57 57 NATAA L A 58 58 NATAA T A 59 59 NATAA K A 60 60 NATAA N A 61 61 NATRO P A 62 62 NATAA L A 63 63 NATAA T A 64 64 NATAA L A 65 65 NATAA N A 66 66 NATAA N A 67 67 NATAA S A 68 68 NATAA E A 69 69 NATAA D A 70 70 NATAA F A 71 71 NATAA Q A 72 72 NATAA Y A 73 73 NATAA W A 74 74 NATAA T A 75 75 NATAA F A 76 76 NATAA A A 77 77 NATAA F A 78 78 NATAA H A 79 79 NATAA N A 80 80 NATAA N A 81 81 NATAA V A 82 82 NATAA N A 83 83 NATAA N A 84 84 NATAA R A 85 85 NATAA L A 86 86 NATAA N A 87 87 NATAA K A 88 88 NATAA K A 89 89 NATAA I A 90 90 NATAA I A 91 91 NATAA S A 92 92 NATAA W A 93 93 NATAA S A 94 94 NATAA E A 95 95 NATAA Y A 96 96 NATAA K A 97 97 NATAA N A 98 98 NATAA I A 99 99 NATAA Y A 100 100 NATAA E A 101 101 NATAA Q A 102 102 NATAA S A 103 103 NATAA I A 104 104 NATAA L A 105 105 NATAA K