# TARGET T0393 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0393.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 667 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.023 0.014 0.013 0.023 0.024 0.036 0.086 0.121 0.190 0.224 0.246 2 K 0.042 0.081 0.083 0.229 0.209 0.145 0.118 0.048 0.026 0.013 0.006 3 R 0.072 0.103 0.167 0.157 0.132 0.117 0.106 0.059 0.046 0.025 0.016 4 S 0.097 0.148 0.067 0.184 0.136 0.128 0.115 0.055 0.033 0.021 0.017 5 I 0.011 0.005 0.005 0.011 0.018 0.034 0.090 0.120 0.196 0.238 0.272 6 E 0.204 0.230 0.132 0.225 0.108 0.054 0.031 0.008 0.004 0.002 0.001 7 D 0.422 0.204 0.115 0.164 0.061 0.019 0.010 0.003 0.002 0.001 0.001 8 T 0.006 0.021 0.015 0.084 0.127 0.152 0.247 0.170 0.102 0.052 0.024 9 P 0.013 0.066 0.046 0.227 0.291 0.227 0.097 0.019 0.008 0.003 0.002 10 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.075 0.200 0.289 0.415 11 V 0.001 0.002 0.002 0.015 0.038 0.096 0.317 0.238 0.155 0.080 0.057 12 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.007 0.037 0.094 0.222 0.285 0.346 13 I 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.017 0.066 0.114 0.199 0.277 0.315 14 G 0.001 0.004 0.005 0.017 0.029 0.043 0.122 0.198 0.243 0.190 0.147 15 A 0.001 0.005 0.004 0.017 0.022 0.030 0.109 0.183 0.238 0.228 0.164 16 G 0.019 0.022 0.019 0.091 0.177 0.204 0.214 0.117 0.082 0.035 0.019 17 N 0.050 0.051 0.059 0.145 0.184 0.185 0.179 0.077 0.041 0.019 0.010 18 L 0.001 0.001 0.006 0.009 0.010 0.014 0.047 0.110 0.226 0.275 0.300 19 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.044 0.097 0.209 0.288 0.352 20 T 0.003 0.008 0.066 0.148 0.222 0.215 0.186 0.075 0.045 0.022 0.011 21 N 0.001 0.006 0.037 0.056 0.089 0.149 0.300 0.171 0.108 0.053 0.031 22 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.056 0.168 0.301 0.453 23 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.066 0.105 0.195 0.276 0.348 24 K 0.001 0.002 0.120 0.249 0.247 0.212 0.113 0.033 0.015 0.006 0.002 25 A 0.001 0.001 0.004 0.010 0.033 0.122 0.416 0.207 0.118 0.062 0.028 26 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.030 0.128 0.317 0.519 27 Y 0.001 0.001 0.003 0.016 0.048 0.117 0.314 0.235 0.144 0.079 0.044 28 R 0.006 0.026 0.490 0.230 0.129 0.074 0.029 0.009 0.004 0.001 0.001 29 K 0.005 0.009 0.008 0.029 0.060 0.200 0.468 0.141 0.052 0.023 0.006 30 G 0.587 0.198 0.039 0.091 0.030 0.015 0.014 0.009 0.008 0.005 0.004 31 F 0.001 0.004 0.004 0.014 0.022 0.040 0.103 0.144 0.197 0.219 0.253 32 R 0.095 0.213 0.144 0.261 0.151 0.078 0.041 0.010 0.005 0.002 0.001 33 I 0.003 0.006 0.004 0.024 0.040 0.070 0.197 0.206 0.194 0.143 0.113 34 V 0.004 0.004 0.004 0.017 0.028 0.058 0.151 0.193 0.223 0.183 0.135 35 Q 0.004 0.013 0.017 0.056 0.085 0.125 0.215 0.169 0.177 0.086 0.054 36 V 0.001 0.002 0.003 0.008 0.008 0.014 0.056 0.111 0.220 0.313 0.264 37 Y 0.005 0.008 0.010 0.041 0.063 0.085 0.222 0.209 0.193 0.110 0.053 38 S 0.054 0.044 0.038 0.068 0.059 0.077 0.200 0.163 0.162 0.092 0.045 39 R 0.015 0.032 0.022 0.077 0.117 0.143 0.180 0.158 0.108 0.095 0.052 40 T 0.026 0.594 0.085 0.121 0.062 0.042 0.033 0.018 0.010 0.006 0.003 41 E 0.386 0.123 0.087 0.187 0.139 0.053 0.019 0.004 0.001 0.001 0.001 42 E 0.954 0.034 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 43 S 0.006 0.014 0.064 0.220 0.163 0.214 0.208 0.067 0.030 0.010 0.004 44 A 0.001 0.001 0.013 0.005 0.009 0.040 0.222 0.219 0.218 0.178 0.094 45 R 0.001 0.003 0.693 0.160 0.071 0.047 0.019 0.004 0.001 0.001 0.001 46 E 0.001 0.009 0.581 0.215 0.127 0.048 0.014 0.003 0.001 0.001 0.001 47 L 0.001 0.001 0.013 0.005 0.010 0.043 0.221 0.182 0.224 0.176 0.124 48 A 0.001 0.001 0.048 0.021 0.050 0.092 0.373 0.214 0.140 0.051 0.012 49 Q 0.004 0.016 0.905 0.056 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 50 K 0.008 0.045 0.453 0.174 0.161 0.097 0.047 0.010 0.004 0.001 0.001 51 V 0.010 0.006 0.015 0.008 0.014 0.032 0.140 0.155 0.242 0.211 0.168 52 E 0.374 0.308 0.149 0.112 0.037 0.013 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 53 A 0.018 0.017 0.060 0.041 0.046 0.059 0.144 0.145 0.201 0.161 0.108 54 E 0.253 0.292 0.107 0.156 0.093 0.048 0.030 0.010 0.005 0.003 0.002 55 Y 0.031 0.062 0.030 0.064 0.077 0.119 0.194 0.127 0.133 0.095 0.070 56 T 0.033 0.031 0.023 0.057 0.074 0.107 0.161 0.127 0.149 0.125 0.112 57 T 0.246 0.106 0.097 0.137 0.118 0.092 0.087 0.047 0.036 0.021 0.013 58 D 0.074 0.204 0.107 0.221 0.147 0.096 0.074 0.032 0.022 0.013 0.010 59 L 0.012 0.011 0.010 0.022 0.033 0.059 0.132 0.154 0.204 0.196 0.166 60 A 0.213 0.068 0.076 0.161 0.153 0.125 0.115 0.042 0.028 0.012 0.007 61 E 0.118 0.133 0.363 0.210 0.087 0.044 0.026 0.009 0.006 0.003 0.003 62 V 0.004 0.006 0.008 0.028 0.036 0.087 0.189 0.176 0.175 0.155 0.136 63 N 0.013 0.009 0.009 0.019 0.031 0.066 0.151 0.166 0.195 0.169 0.171 64 P 0.243 0.158 0.344 0.146 0.052 0.030 0.018 0.005 0.002 0.001 0.001 65 Y 0.106 0.129 0.134 0.229 0.162 0.119 0.081 0.019 0.011 0.006 0.003 66 A 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.009 0.045 0.106 0.230 0.293 0.306 67 K 0.016 0.082 0.118 0.314 0.255 0.144 0.054 0.011 0.004 0.001 0.001 68 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.020 0.116 0.232 0.292 0.213 0.118 69 Y 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 0.028 0.117 0.209 0.211 0.205 0.215 70 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.030 0.090 0.221 0.304 0.348 71 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.010 0.053 0.123 0.246 0.286 0.273 72 S 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.012 0.061 0.130 0.233 0.290 0.262 73 L 0.001 0.002 0.002 0.012 0.023 0.038 0.115 0.193 0.238 0.221 0.156 74 K 0.027 0.096 0.041 0.152 0.186 0.169 0.165 0.087 0.047 0.021 0.009 75 D 0.069 0.073 0.036 0.139 0.168 0.138 0.153 0.098 0.071 0.039 0.017 76 S 0.554 0.132 0.054 0.106 0.061 0.034 0.026 0.013 0.010 0.006 0.004 77 A 0.037 0.078 0.030 0.093 0.106 0.142 0.172 0.108 0.104 0.077 0.055 78 F 0.006 0.011 0.007 0.020 0.032 0.079 0.176 0.183 0.210 0.165 0.112 79 A 0.088 0.046 0.077 0.142 0.150 0.173 0.174 0.066 0.049 0.024 0.012 80 E 0.090 0.097 0.413 0.216 0.100 0.044 0.024 0.008 0.004 0.002 0.002 81 L 0.002 0.005 0.017 0.023 0.027 0.050 0.130 0.149 0.210 0.215 0.173 82 L 0.001 0.002 0.012 0.015 0.030 0.070 0.194 0.185 0.208 0.171 0.112 83 Q 0.016 0.039 0.598 0.208 0.089 0.032 0.012 0.003 0.001 0.001 0.001 84 G 0.035 0.087 0.228 0.174 0.171 0.157 0.106 0.025 0.011 0.005 0.002 85 I 0.003 0.003 0.004 0.007 0.008 0.018 0.081 0.125 0.227 0.268 0.255 86 V 0.053 0.062 0.046 0.093 0.123 0.172 0.234 0.098 0.065 0.035 0.019 87 E 0.222 0.192 0.338 0.148 0.054 0.023 0.012 0.004 0.003 0.001 0.001 88 G 0.261 0.084 0.041 0.079 0.071 0.092 0.143 0.077 0.063 0.051 0.039 89 K 0.119 0.084 0.036 0.079 0.071 0.100 0.152 0.102 0.098 0.080 0.080 90 R 0.104 0.141 0.067 0.120 0.111 0.117 0.128 0.072 0.061 0.044 0.035 91 E 0.213 0.144 0.108 0.170 0.124 0.083 0.076 0.037 0.024 0.014 0.008 92 E 0.216 0.127 0.092 0.182 0.152 0.087 0.075 0.034 0.019 0.010 0.006 93 A 0.004 0.020 0.024 0.120 0.176 0.189 0.204 0.130 0.072 0.038 0.023 94 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.011 0.035 0.139 0.232 0.251 0.192 0.135 95 M 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.013 0.069 0.147 0.231 0.251 0.280 96 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.042 0.108 0.215 0.297 0.326 97 H 0.001 0.001 0.002 0.006 0.007 0.017 0.071 0.156 0.248 0.254 0.237 98 T 0.002 0.003 0.003 0.008 0.011 0.023 0.083 0.149 0.217 0.245 0.257 99 A 0.008 0.009 0.007 0.030 0.040 0.060 0.131 0.180 0.209 0.189 0.137 100 G 0.021 0.031 0.016 0.078 0.113 0.132 0.193 0.156 0.130 0.082 0.049 101 S 0.030 0.026 0.016 0.040 0.045 0.055 0.107 0.134 0.183 0.184 0.179 102 I 0.027 0.026 0.012 0.048 0.074 0.100 0.146 0.145 0.156 0.147 0.119 103 P 0.076 0.157 0.045 0.127 0.115 0.108 0.123 0.082 0.075 0.055 0.036 104 M 0.059 0.046 0.031 0.093 0.115 0.137 0.155 0.111 0.112 0.087 0.054 105 N 0.452 0.153 0.084 0.116 0.069 0.041 0.034 0.017 0.014 0.010 0.009 106 V 0.030 0.046 0.037 0.100 0.103 0.123 0.187 0.124 0.111 0.078 0.060 107 W 0.023 0.017 0.016 0.027 0.034 0.062 0.143 0.149 0.175 0.183 0.171 108 E 0.089 0.111 0.142 0.244 0.171 0.100 0.075 0.031 0.021 0.011 0.006 109 G 0.271 0.160 0.242 0.141 0.070 0.043 0.034 0.015 0.011 0.007 0.006 110 H 0.027 0.035 0.029 0.079 0.089 0.121 0.202 0.128 0.116 0.100 0.074 111 V 0.046 0.061 0.030 0.068 0.080 0.111 0.177 0.138 0.130 0.096 0.064 112 P 0.323 0.177 0.137 0.156 0.086 0.048 0.032 0.016 0.012 0.007 0.006 113 H 0.237 0.133 0.082 0.140 0.110 0.091 0.097 0.047 0.032 0.019 0.011 114 Y 0.104 0.093 0.038 0.131 0.131 0.125 0.135 0.089 0.075 0.048 0.031 115 G 0.093 0.066 0.030 0.099 0.102 0.121 0.132 0.102 0.099 0.082 0.074 116 V 0.028 0.041 0.032 0.077 0.093 0.105 0.169 0.153 0.138 0.099 0.065 117 F 0.022 0.023 0.015 0.045 0.058 0.078 0.160 0.169 0.179 0.138 0.112 118 Y 0.010 0.010 0.007 0.027 0.037 0.054 0.118 0.161 0.207 0.199 0.171 119 P 0.034 0.032 0.021 0.069 0.082 0.101 0.181 0.158 0.148 0.102 0.072 120 M 0.039 0.027 0.021 0.050 0.045 0.059 0.115 0.142 0.187 0.178 0.139 121 Q 0.017 0.015 0.010 0.031 0.040 0.067 0.145 0.166 0.201 0.177 0.131 122 T 0.064 0.056 0.032 0.069 0.058 0.072 0.128 0.139 0.152 0.139 0.091 123 F 0.022 0.022 0.012 0.035 0.057 0.079 0.162 0.168 0.180 0.156 0.109 124 S 0.047 0.066 0.031 0.071 0.071 0.074 0.126 0.132 0.153 0.135 0.095 125 K 0.218 0.122 0.075 0.188 0.146 0.091 0.071 0.036 0.027 0.016 0.008 126 Q 0.338 0.139 0.099 0.143 0.093 0.066 0.055 0.028 0.020 0.012 0.007 127 R 0.101 0.079 0.061 0.114 0.100 0.118 0.151 0.103 0.082 0.057 0.033 128 E 0.104 0.091 0.074 0.136 0.111 0.112 0.147 0.091 0.068 0.042 0.024 129 V 0.076 0.067 0.145 0.093 0.083 0.093 0.128 0.092 0.096 0.073 0.055 130 D 0.174 0.202 0.188 0.197 0.106 0.055 0.041 0.016 0.011 0.006 0.004 131 F 0.058 0.034 0.031 0.057 0.066 0.095 0.170 0.136 0.142 0.121 0.090 132 K 0.176 0.128 0.103 0.178 0.138 0.104 0.089 0.038 0.025 0.013 0.007 133 E 0.222 0.170 0.175 0.162 0.098 0.067 0.050 0.023 0.017 0.010 0.006 134 I 0.034 0.055 0.034 0.094 0.108 0.126 0.176 0.132 0.115 0.083 0.043 135 P 0.136 0.101 0.063 0.125 0.117 0.119 0.124 0.076 0.068 0.044 0.027 136 F 0.064 0.056 0.062 0.106 0.113 0.119 0.167 0.111 0.103 0.062 0.036 137 F 0.037 0.040 0.040 0.080 0.085 0.097 0.163 0.138 0.140 0.103 0.076 138 I 0.027 0.026 0.031 0.059 0.064 0.087 0.150 0.147 0.170 0.144 0.095 139 E 0.075 0.080 0.099 0.158 0.144 0.127 0.146 0.077 0.054 0.028 0.012 140 A 0.139 0.074 0.116 0.099 0.087 0.093 0.140 0.097 0.074 0.054 0.029 141 S 0.138 0.164 0.081 0.114 0.102 0.096 0.104 0.061 0.055 0.051 0.034 142 S 0.096 0.241 0.091 0.126 0.094 0.091 0.102 0.058 0.050 0.034 0.018 143 T 0.660 0.107 0.091 0.078 0.036 0.015 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 144 E 0.487 0.148 0.154 0.118 0.050 0.022 0.014 0.004 0.002 0.001 0.001 145 D 0.005 0.018 0.042 0.051 0.044 0.121 0.275 0.189 0.142 0.076 0.037 146 A 0.005 0.007 0.054 0.078 0.131 0.238 0.289 0.111 0.056 0.022 0.008 147 A 0.046 0.040 0.844 0.049 0.012 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 148 F 0.001 0.005 0.078 0.153 0.202 0.250 0.201 0.065 0.029 0.013 0.004 149 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.003 0.040 0.094 0.235 0.312 0.312 150 K 0.001 0.002 0.133 0.239 0.300 0.221 0.083 0.015 0.005 0.001 0.001 151 A 0.002 0.016 0.704 0.133 0.087 0.039 0.014 0.002 0.001 0.001 0.001 152 I 0.001 0.001 0.005 0.006 0.011 0.034 0.192 0.191 0.236 0.194 0.130 153 A 0.001 0.001 0.006 0.003 0.005 0.014 0.139 0.205 0.262 0.231 0.133 154 S 0.003 0.018 0.550 0.250 0.118 0.040 0.012 0.004 0.002 0.001 0.001 155 T 0.009 0.034 0.170 0.102 0.152 0.223 0.212 0.054 0.027 0.012 0.005 156 L 0.003 0.003 0.006 0.009 0.011 0.022 0.088 0.139 0.238 0.265 0.214 157 S 0.091 0.078 0.035 0.081 0.099 0.126 0.221 0.109 0.078 0.047 0.035 158 N 0.160 0.134 0.191 0.206 0.117 0.080 0.052 0.026 0.017 0.010 0.005 159 R 0.117 0.160 0.091 0.183 0.165 0.119 0.097 0.035 0.019 0.010 0.004 160 V 0.018 0.014 0.013 0.036 0.037 0.047 0.110 0.137 0.191 0.191 0.206 161 Y 0.018 0.025 0.023 0.063 0.101 0.142 0.228 0.143 0.126 0.084 0.047 162 D 0.060 0.136 0.093 0.236 0.160 0.111 0.107 0.050 0.028 0.013 0.005 163 A 0.010 0.008 0.005 0.013 0.021 0.040 0.106 0.148 0.194 0.239 0.217 164 D 0.193 0.413 0.100 0.166 0.074 0.028 0.014 0.005 0.004 0.002 0.001 165 S 0.306 0.131 0.042 0.141 0.111 0.087 0.085 0.040 0.031 0.017 0.009 166 E 0.715 0.127 0.043 0.061 0.027 0.012 0.008 0.003 0.002 0.001 0.001 167 Q 0.030 0.041 0.030 0.102 0.099 0.155 0.253 0.127 0.094 0.045 0.023 168 R 0.012 0.011 0.019 0.060 0.097 0.170 0.235 0.152 0.123 0.076 0.046 169 K 0.029 0.049 0.271 0.184 0.142 0.135 0.111 0.040 0.023 0.010 0.005 170 S 0.006 0.017 0.085 0.139 0.164 0.167 0.197 0.097 0.071 0.038 0.018 171 L 0.005 0.003 0.011 0.010 0.012 0.022 0.094 0.148 0.250 0.261 0.184 172 H 0.003 0.004 0.024 0.061 0.103 0.177 0.265 0.153 0.117 0.063 0.030 173 L 0.002 0.006 0.132 0.031 0.029 0.041 0.116 0.129 0.190 0.174 0.150 174 A 0.002 0.002 0.010 0.012 0.017 0.038 0.163 0.187 0.218 0.207 0.144 175 A 0.002 0.003 0.012 0.009 0.009 0.019 0.095 0.151 0.271 0.256 0.173 176 V 0.010 0.010 0.073 0.039 0.039 0.063 0.138 0.137 0.182 0.169 0.140 177 F 0.003 0.006 0.029 0.022 0.032 0.059 0.194 0.176 0.192 0.161 0.126 178 T 0.003 0.007 0.027 0.015 0.014 0.019 0.081 0.121 0.224 0.254 0.235 179 C 0.010 0.010 0.036 0.043 0.060 0.095 0.194 0.155 0.180 0.131 0.086 180 N 0.019 0.016 0.077 0.053 0.076 0.119 0.214 0.135 0.140 0.093 0.058 181 F 0.001 0.003 0.021 0.013 0.015 0.028 0.112 0.144 0.222 0.224 0.218 182 T 0.001 0.001 0.008 0.006 0.008 0.015 0.072 0.120 0.236 0.265 0.269 183 N 0.008 0.010 0.082 0.053 0.070 0.117 0.224 0.136 0.138 0.097 0.066 184 H 0.001 0.005 0.054 0.057 0.076 0.106 0.220 0.178 0.145 0.092 0.067 185 M 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.025 0.067 0.177 0.285 0.438 186 Y 0.001 0.001 0.005 0.005 0.007 0.017 0.101 0.128 0.226 0.254 0.256 187 A 0.001 0.003 0.134 0.106 0.140 0.190 0.234 0.088 0.058 0.030 0.016 188 L 0.001 0.001 0.006 0.010 0.021 0.061 0.236 0.199 0.198 0.155 0.114 189 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.055 0.186 0.329 0.413 190 A 0.001 0.001 0.010 0.022 0.053 0.158 0.340 0.170 0.131 0.075 0.041 191 E 0.002 0.008 0.208 0.190 0.201 0.195 0.131 0.039 0.016 0.007 0.004 192 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.032 0.207 0.218 0.226 0.184 0.122 193 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.070 0.205 0.336 0.366 194 K 0.002 0.010 0.216 0.255 0.260 0.152 0.075 0.019 0.006 0.002 0.002 195 K 0.013 0.052 0.441 0.161 0.151 0.112 0.055 0.010 0.004 0.001 0.001 196 Y 0.002 0.002 0.001 0.007 0.017 0.063 0.288 0.230 0.186 0.141 0.063 197 N 0.733 0.167 0.018 0.039 0.016 0.010 0.009 0.003 0.002 0.001 0.001 198 L 0.003 0.006 0.006 0.014 0.023 0.041 0.103 0.158 0.218 0.235 0.194 199 P 0.178 0.590 0.069 0.095 0.036 0.017 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 200 F 0.055 0.038 0.021 0.096 0.154 0.209 0.211 0.103 0.069 0.030 0.015 201 D 0.682 0.118 0.045 0.062 0.036 0.023 0.016 0.007 0.005 0.003 0.003 202 V 0.019 0.052 0.069 0.195 0.191 0.170 0.153 0.073 0.046 0.020 0.013 203 M 0.006 0.007 0.005 0.011 0.016 0.031 0.105 0.167 0.204 0.237 0.212 204 L 0.007 0.017 0.046 0.100 0.165 0.230 0.230 0.097 0.057 0.033 0.019 205 P 0.130 0.117 0.431 0.185 0.071 0.032 0.021 0.006 0.004 0.002 0.001 206 L 0.002 0.007 0.009 0.032 0.057 0.097 0.219 0.170 0.156 0.140 0.109 207 I 0.002 0.003 0.008 0.007 0.007 0.014 0.058 0.109 0.242 0.286 0.262 208 D 0.020 0.028 0.148 0.221 0.222 0.190 0.120 0.029 0.015 0.005 0.002 209 E 0.050 0.057 0.602 0.168 0.064 0.034 0.017 0.004 0.002 0.001 0.001 210 T 0.002 0.004 0.010 0.018 0.030 0.083 0.241 0.192 0.181 0.146 0.092 211 A 0.002 0.002 0.007 0.007 0.009 0.028 0.123 0.160 0.237 0.234 0.191 212 R 0.013 0.032 0.532 0.185 0.124 0.066 0.034 0.009 0.004 0.002 0.001 213 K 0.040 0.091 0.421 0.197 0.117 0.075 0.039 0.010 0.006 0.003 0.002 214 V 0.009 0.006 0.017 0.015 0.018 0.034 0.111 0.133 0.232 0.240 0.186 215 H 0.039 0.027 0.066 0.088 0.103 0.154 0.248 0.126 0.083 0.045 0.021 216 E 0.050 0.082 0.593 0.144 0.066 0.033 0.019 0.007 0.004 0.002 0.001 217 L 0.022 0.031 0.052 0.072 0.104 0.166 0.221 0.125 0.093 0.074 0.039 218 E 0.214 0.234 0.072 0.104 0.075 0.057 0.071 0.053 0.054 0.042 0.026 219 P 0.239 0.078 0.067 0.084 0.078 0.086 0.115 0.079 0.081 0.055 0.037 220 K 0.324 0.182 0.114 0.145 0.096 0.055 0.045 0.018 0.012 0.006 0.003 221 T 0.190 0.209 0.100 0.171 0.101 0.070 0.065 0.037 0.030 0.018 0.010 222 A 0.244 0.069 0.051 0.100 0.089 0.096 0.103 0.077 0.075 0.057 0.041 223 Q 0.208 0.141 0.131 0.133 0.104 0.088 0.091 0.046 0.031 0.017 0.009 224 T 0.112 0.181 0.095 0.165 0.112 0.084 0.091 0.063 0.049 0.030 0.016 225 G 0.233 0.131 0.038 0.102 0.101 0.091 0.094 0.069 0.060 0.048 0.033 226 P 0.336 0.166 0.070 0.121 0.093 0.067 0.063 0.032 0.026 0.016 0.010 227 A 0.129 0.064 0.049 0.107 0.097 0.093 0.134 0.100 0.103 0.076 0.048 228 I 0.061 0.064 0.050 0.121 0.116 0.125 0.167 0.107 0.092 0.058 0.040 229 R 0.107 0.107 0.133 0.153 0.117 0.101 0.108 0.074 0.053 0.031 0.017 230 Y 0.126 0.132 0.123 0.148 0.147 0.121 0.089 0.046 0.032 0.022 0.014 231 D 0.021 0.106 0.065 0.107 0.093 0.100 0.168 0.120 0.102 0.075 0.044 232 E 0.114 0.066 0.068 0.164 0.190 0.152 0.140 0.050 0.032 0.015 0.008 233 N 0.566 0.140 0.169 0.079 0.026 0.010 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 234 V 0.002 0.016 0.026 0.070 0.084 0.159 0.266 0.159 0.115 0.069 0.033 235 I 0.001 0.002 0.007 0.007 0.012 0.033 0.133 0.171 0.235 0.215 0.184 236 G 0.064 0.062 0.347 0.251 0.149 0.078 0.036 0.008 0.003 0.001 0.001 237 N 0.014 0.045 0.324 0.298 0.179 0.090 0.037 0.008 0.003 0.001 0.001 238 H 0.001 0.001 0.005 0.006 0.008 0.017 0.082 0.123 0.234 0.270 0.254 239 L 0.001 0.001 0.010 0.018 0.037 0.100 0.304 0.208 0.170 0.101 0.050 240 R 0.009 0.032 0.731 0.143 0.057 0.019 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 241 M 0.001 0.006 0.024 0.035 0.083 0.206 0.365 0.146 0.075 0.042 0.018 242 L 0.004 0.005 0.008 0.010 0.011 0.017 0.080 0.134 0.231 0.268 0.234 243 A 0.071 0.071 0.097 0.128 0.153 0.165 0.178 0.068 0.038 0.020 0.011 244 D 0.209 0.206 0.278 0.175 0.070 0.034 0.017 0.006 0.003 0.001 0.001 245 D 0.176 0.174 0.061 0.109 0.102 0.101 0.122 0.067 0.044 0.030 0.013 246 P 0.393 0.141 0.058 0.084 0.060 0.058 0.074 0.043 0.040 0.029 0.020 247 A 0.235 0.165 0.090 0.131 0.102 0.090 0.092 0.039 0.031 0.017 0.009 248 M 0.080 0.062 0.079 0.137 0.099 0.124 0.160 0.098 0.089 0.048 0.024 249 Q 0.063 0.054 0.184 0.212 0.138 0.117 0.110 0.054 0.039 0.019 0.010 250 R 0.037 0.038 0.242 0.150 0.108 0.121 0.135 0.074 0.054 0.027 0.013 251 L 0.007 0.012 0.103 0.088 0.091 0.141 0.210 0.138 0.114 0.069 0.027 252 Y 0.005 0.013 0.175 0.086 0.081 0.122 0.206 0.123 0.101 0.061 0.027 253 E 0.013 0.037 0.415 0.182 0.128 0.089 0.076 0.030 0.019 0.008 0.003 254 L 0.022 0.033 0.195 0.099 0.099 0.122 0.179 0.103 0.083 0.047 0.019 255 L 0.028 0.047 0.136 0.134 0.120 0.119 0.156 0.098 0.089 0.053 0.021 256 S 0.055 0.074 0.201 0.137 0.119 0.116 0.149 0.073 0.049 0.021 0.007 257 R 0.144 0.152 0.230 0.215 0.126 0.067 0.042 0.014 0.007 0.003 0.001 258 S 0.123 0.093 0.066 0.069 0.069 0.091 0.183 0.122 0.096 0.061 0.027 259 I 0.092 0.119 0.100 0.154 0.120 0.114 0.132 0.069 0.052 0.033 0.014 260 H 0.168 0.120 0.162 0.157 0.129 0.099 0.092 0.038 0.022 0.009 0.003 261 E 0.200 0.141 0.177 0.258 0.116 0.052 0.031 0.013 0.007 0.003 0.001 262 R 0.055 0.065 0.096 0.117 0.137 0.150 0.179 0.099 0.062 0.029 0.011 263 Q 0.021 0.043 0.072 0.134 0.135 0.126 0.149 0.124 0.096 0.064 0.035