# TARGET T0393 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0393.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2001 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.237 0.093 0.056 0.094 0.082 0.085 0.097 0.079 0.074 0.061 0.043 2 K 0.266 0.232 0.111 0.174 0.093 0.047 0.039 0.018 0.011 0.006 0.003 3 R 0.124 0.078 0.060 0.105 0.118 0.138 0.154 0.096 0.067 0.040 0.021 4 S 0.298 0.289 0.074 0.139 0.073 0.042 0.035 0.019 0.013 0.009 0.007 5 I 0.129 0.049 0.051 0.086 0.089 0.104 0.141 0.099 0.104 0.085 0.064 6 E 0.249 0.145 0.100 0.179 0.106 0.076 0.074 0.030 0.021 0.012 0.008 7 D 0.154 0.187 0.157 0.247 0.127 0.057 0.038 0.016 0.009 0.005 0.004 8 T 0.033 0.047 0.036 0.121 0.158 0.164 0.202 0.123 0.070 0.034 0.014 9 P 0.038 0.098 0.091 0.257 0.244 0.159 0.078 0.019 0.010 0.004 0.003 10 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.039 0.111 0.238 0.291 0.308 11 V 0.002 0.004 0.006 0.035 0.069 0.119 0.295 0.213 0.142 0.069 0.047 12 L 0.001 0.004 0.006 0.008 0.007 0.015 0.063 0.123 0.231 0.265 0.276 13 I 0.003 0.002 0.003 0.010 0.014 0.030 0.095 0.148 0.221 0.245 0.231 14 G 0.003 0.008 0.010 0.024 0.035 0.051 0.134 0.184 0.225 0.177 0.148 15 A 0.002 0.008 0.007 0.021 0.024 0.030 0.104 0.168 0.227 0.232 0.178 16 G 0.020 0.022 0.020 0.084 0.150 0.187 0.213 0.129 0.099 0.048 0.028 17 N 0.079 0.056 0.071 0.130 0.163 0.166 0.168 0.077 0.048 0.027 0.016 18 L 0.001 0.003 0.008 0.014 0.016 0.022 0.059 0.121 0.219 0.256 0.282 19 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.007 0.043 0.091 0.208 0.279 0.366 20 T 0.009 0.012 0.051 0.110 0.173 0.205 0.224 0.095 0.064 0.035 0.021 21 N 0.004 0.014 0.065 0.103 0.131 0.166 0.253 0.129 0.077 0.036 0.021 22 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.050 0.149 0.290 0.488 23 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.045 0.083 0.183 0.284 0.399 24 K 0.001 0.002 0.131 0.214 0.226 0.216 0.136 0.041 0.021 0.009 0.003 25 A 0.001 0.001 0.007 0.019 0.058 0.182 0.425 0.165 0.082 0.042 0.019 26 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.027 0.120 0.299 0.547 27 Y 0.001 0.001 0.001 0.007 0.023 0.071 0.245 0.246 0.180 0.132 0.095 28 R 0.005 0.031 0.540 0.221 0.116 0.054 0.021 0.007 0.003 0.001 0.001 29 K 0.006 0.012 0.016 0.043 0.086 0.247 0.429 0.106 0.036 0.014 0.004 30 G 0.669 0.178 0.036 0.073 0.021 0.008 0.006 0.004 0.003 0.002 0.002 31 F 0.001 0.004 0.003 0.017 0.031 0.067 0.150 0.179 0.200 0.182 0.165 32 R 0.162 0.284 0.143 0.240 0.109 0.043 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 33 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.012 0.064 0.133 0.222 0.248 0.312 34 V 0.010 0.016 0.011 0.067 0.096 0.145 0.229 0.161 0.127 0.079 0.059 35 Q 0.006 0.027 0.019 0.068 0.091 0.124 0.209 0.151 0.162 0.086 0.056 36 V 0.001 0.001 0.001 0.006 0.008 0.016 0.058 0.104 0.206 0.294 0.304 37 Y 0.007 0.011 0.011 0.046 0.075 0.093 0.223 0.192 0.173 0.108 0.061 38 S 0.087 0.073 0.045 0.110 0.095 0.095 0.193 0.127 0.098 0.052 0.025 39 R 0.019 0.036 0.022 0.072 0.116 0.152 0.180 0.147 0.105 0.094 0.056 40 T 0.034 0.701 0.065 0.096 0.044 0.024 0.017 0.008 0.006 0.004 0.002 41 E 0.411 0.096 0.058 0.194 0.153 0.059 0.023 0.005 0.002 0.001 0.001 42 E 0.967 0.025 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 43 S 0.001 0.005 0.020 0.098 0.106 0.244 0.333 0.118 0.052 0.018 0.006 44 A 0.001 0.001 0.006 0.004 0.011 0.045 0.216 0.230 0.211 0.174 0.103 45 R 0.001 0.006 0.797 0.115 0.045 0.025 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 46 E 0.002 0.015 0.559 0.248 0.123 0.042 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 47 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.003 0.014 0.103 0.127 0.230 0.258 0.261 48 A 0.001 0.001 0.015 0.023 0.075 0.144 0.384 0.202 0.115 0.035 0.007 49 Q 0.005 0.019 0.897 0.062 0.014 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 50 K 0.013 0.057 0.367 0.188 0.171 0.124 0.064 0.011 0.003 0.001 0.001 51 V 0.005 0.004 0.004 0.007 0.015 0.040 0.181 0.209 0.233 0.178 0.123 52 E 0.497 0.321 0.089 0.070 0.018 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 53 A 0.004 0.003 0.010 0.009 0.013 0.023 0.085 0.120 0.250 0.249 0.234 54 E 0.155 0.292 0.105 0.210 0.126 0.060 0.033 0.010 0.004 0.002 0.002 55 Y 0.011 0.043 0.015 0.049 0.067 0.114 0.213 0.148 0.153 0.106 0.083 56 T 0.018 0.013 0.012 0.032 0.048 0.089 0.150 0.129 0.167 0.156 0.185 57 T 0.263 0.107 0.073 0.145 0.127 0.092 0.082 0.043 0.033 0.021 0.015 58 D 0.024 0.157 0.057 0.196 0.149 0.122 0.124 0.068 0.049 0.032 0.023 59 L 0.005 0.004 0.004 0.012 0.023 0.045 0.108 0.134 0.205 0.220 0.239 60 A 0.231 0.069 0.067 0.146 0.141 0.129 0.125 0.042 0.028 0.013 0.009 61 E 0.027 0.073 0.193 0.283 0.178 0.116 0.075 0.026 0.015 0.007 0.006 62 V 0.001 0.002 0.002 0.008 0.010 0.021 0.068 0.110 0.182 0.252 0.344 63 N 0.005 0.003 0.005 0.014 0.032 0.074 0.181 0.188 0.212 0.155 0.130 64 P 0.193 0.114 0.433 0.170 0.051 0.024 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 65 Y 0.046 0.088 0.088 0.185 0.171 0.190 0.163 0.036 0.018 0.010 0.005 66 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.006 0.039 0.107 0.234 0.305 0.299 67 K 0.055 0.156 0.158 0.305 0.198 0.092 0.028 0.005 0.002 0.001 0.001 68 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.018 0.111 0.220 0.298 0.224 0.121 69 Y 0.001 0.001 0.001 0.005 0.011 0.032 0.130 0.214 0.207 0.191 0.209 70 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.036 0.097 0.221 0.296 0.344 71 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.009 0.053 0.125 0.244 0.282 0.280 72 S 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.008 0.046 0.106 0.219 0.305 0.306 73 L 0.001 0.001 0.001 0.008 0.016 0.026 0.088 0.178 0.258 0.245 0.178 74 K 0.010 0.063 0.025 0.108 0.148 0.166 0.219 0.135 0.078 0.034 0.014 75 D 0.070 0.058 0.034 0.150 0.198 0.170 0.156 0.081 0.051 0.023 0.009 76 S 0.492 0.137 0.047 0.121 0.079 0.047 0.036 0.018 0.012 0.006 0.004 77 A 0.006 0.041 0.013 0.073 0.090 0.133 0.183 0.137 0.136 0.106 0.081 78 F 0.002 0.003 0.003 0.009 0.020 0.049 0.139 0.181 0.239 0.195 0.159 79 A 0.127 0.069 0.089 0.208 0.187 0.159 0.107 0.030 0.016 0.006 0.003 80 E 0.017 0.052 0.205 0.289 0.207 0.123 0.070 0.023 0.009 0.004 0.002 81 L 0.001 0.001 0.003 0.004 0.005 0.008 0.035 0.077 0.188 0.292 0.388 82 L 0.001 0.001 0.004 0.006 0.016 0.047 0.190 0.201 0.219 0.177 0.137 83 Q 0.010 0.034 0.533 0.273 0.101 0.033 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 84 G 0.015 0.039 0.060 0.091 0.156 0.264 0.267 0.064 0.025 0.012 0.006 85 I 0.002 0.002 0.003 0.005 0.005 0.008 0.045 0.104 0.220 0.286 0.321 86 V 0.017 0.026 0.021 0.056 0.100 0.175 0.275 0.127 0.093 0.064 0.046 87 E 0.137 0.183 0.314 0.202 0.081 0.038 0.024 0.010 0.006 0.004 0.002 88 G 0.243 0.077 0.040 0.075 0.073 0.101 0.157 0.079 0.063 0.049 0.043 89 K 0.042 0.033 0.016 0.046 0.050 0.088 0.171 0.132 0.135 0.126 0.162 90 R 0.153 0.265 0.082 0.137 0.096 0.084 0.079 0.035 0.030 0.021 0.018 91 E 0.335 0.147 0.109 0.155 0.095 0.061 0.049 0.021 0.014 0.009 0.006 92 E 0.417 0.175 0.084 0.159 0.090 0.035 0.023 0.008 0.004 0.002 0.001 93 A 0.001 0.014 0.020 0.116 0.207 0.234 0.218 0.109 0.049 0.021 0.010 94 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.032 0.134 0.235 0.247 0.194 0.146 95 M 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.015 0.086 0.175 0.225 0.228 0.264 96 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.027 0.105 0.233 0.331 0.299 97 H 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.009 0.051 0.125 0.237 0.264 0.308 98 T 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.042 0.108 0.202 0.307 0.326 99 A 0.001 0.002 0.002 0.010 0.018 0.035 0.121 0.215 0.242 0.207 0.148 100 G 0.002 0.006 0.005 0.017 0.022 0.034 0.098 0.165 0.226 0.220 0.204 101 S 0.007 0.009 0.006 0.028 0.043 0.062 0.115 0.154 0.205 0.192 0.179 102 I 0.024 0.025 0.014 0.067 0.105 0.133 0.174 0.162 0.138 0.095 0.061 103 P 0.017 0.068 0.024 0.089 0.117 0.134 0.178 0.130 0.117 0.084 0.044 104 M 0.007 0.008 0.006 0.019 0.027 0.041 0.091 0.113 0.206 0.224 0.261 105 N 0.241 0.117 0.103 0.170 0.126 0.092 0.078 0.031 0.023 0.013 0.009 106 V 0.042 0.084 0.077 0.214 0.179 0.155 0.134 0.054 0.031 0.017 0.012 107 W 0.001 0.002 0.003 0.006 0.008 0.017 0.062 0.116 0.216 0.269 0.298 108 E 0.005 0.007 0.014 0.065 0.138 0.187 0.281 0.139 0.095 0.045 0.022 109 G 0.136 0.114 0.598 0.108 0.028 0.009 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 110 H 0.006 0.019 0.022 0.079 0.126 0.228 0.307 0.109 0.059 0.031 0.015 111 V 0.003 0.003 0.003 0.005 0.007 0.015 0.058 0.120 0.209 0.268 0.309 112 P 0.233 0.226 0.160 0.172 0.104 0.055 0.029 0.010 0.006 0.003 0.003 113 H 0.360 0.146 0.178 0.138 0.076 0.048 0.032 0.011 0.006 0.003 0.002 114 Y 0.053 0.054 0.019 0.089 0.116 0.153 0.223 0.130 0.080 0.051 0.032 115 G 0.189 0.107 0.042 0.106 0.086 0.095 0.100 0.069 0.075 0.064 0.067 116 V 0.046 0.052 0.040 0.075 0.080 0.093 0.139 0.122 0.141 0.121 0.092 117 F 0.067 0.051 0.029 0.076 0.078 0.103 0.172 0.137 0.125 0.093 0.068 118 Y 0.026 0.025 0.010 0.043 0.055 0.073 0.139 0.160 0.178 0.153 0.138 119 P 0.039 0.035 0.016 0.062 0.071 0.083 0.143 0.141 0.158 0.134 0.118 120 M 0.070 0.058 0.040 0.107 0.102 0.108 0.131 0.110 0.113 0.090 0.070 121 Q 0.031 0.026 0.015 0.050 0.063 0.088 0.161 0.167 0.174 0.136 0.088 122 T 0.171 0.121 0.068 0.156 0.115 0.097 0.098 0.069 0.049 0.034 0.021 123 F 0.014 0.016 0.009 0.027 0.040 0.060 0.151 0.170 0.205 0.176 0.133 124 S 0.024 0.032 0.020 0.051 0.055 0.067 0.125 0.144 0.178 0.166 0.139 125 K 0.225 0.163 0.068 0.163 0.118 0.079 0.075 0.042 0.031 0.022 0.014 126 Q 0.240 0.119 0.073 0.146 0.109 0.088 0.085 0.052 0.041 0.029 0.018 127 R 0.120 0.096 0.042 0.101 0.100 0.108 0.139 0.100 0.087 0.065 0.041 128 E 0.172 0.167 0.093 0.187 0.117 0.087 0.076 0.038 0.032 0.019 0.012 129 V 0.209 0.078 0.070 0.078 0.062 0.071 0.100 0.077 0.093 0.081 0.079 130 D 0.105 0.087 0.059 0.122 0.104 0.109 0.143 0.086 0.075 0.057 0.052 131 F 0.041 0.041 0.039 0.080 0.083 0.110 0.163 0.129 0.126 0.102 0.085 132 K 0.137 0.126 0.142 0.207 0.144 0.090 0.072 0.034 0.022 0.014 0.013 133 E 0.137 0.119 0.153 0.193 0.143 0.094 0.075 0.039 0.025 0.014 0.007 134 I 0.018 0.043 0.029 0.121 0.174 0.174 0.193 0.106 0.075 0.043 0.023 135 P 0.001 0.001 0.001 0.005 0.008 0.017 0.057 0.110 0.211 0.259 0.329 136 F 0.004 0.006 0.008 0.024 0.044 0.092 0.233 0.203 0.191 0.113 0.082 137 F 0.004 0.004 0.005 0.011 0.012 0.021 0.087 0.147 0.231 0.241 0.237 138 I 0.002 0.001 0.001 0.006 0.008 0.017 0.060 0.112 0.208 0.281 0.302 139 E 0.006 0.012 0.010 0.039 0.050 0.067 0.158 0.173 0.208 0.163 0.115 140 A 0.011 0.011 0.010 0.026 0.043 0.068 0.175 0.194 0.189 0.171 0.103 141 S 0.034 0.087 0.038 0.114 0.144 0.150 0.160 0.104 0.075 0.060 0.035 142 S 0.115 0.373 0.077 0.159 0.113 0.066 0.049 0.022 0.014 0.009 0.004 143 T 0.790 0.077 0.040 0.052 0.024 0.009 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 144 E 0.636 0.143 0.062 0.080 0.039 0.020 0.013 0.003 0.002 0.001 0.001 145 D 0.004 0.017 0.022 0.042 0.042 0.120 0.286 0.201 0.148 0.080 0.039 146 A 0.010 0.012 0.039 0.096 0.172 0.266 0.251 0.089 0.042 0.016 0.006 147 A 0.115 0.055 0.775 0.041 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 148 F 0.001 0.005 0.049 0.125 0.178 0.265 0.251 0.074 0.033 0.016 0.005 149 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.043 0.101 0.227 0.304 0.317 150 K 0.001 0.005 0.166 0.290 0.305 0.177 0.045 0.008 0.002 0.001 0.001 151 A 0.004 0.026 0.670 0.137 0.091 0.047 0.020 0.003 0.001 0.001 0.001 152 I 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.013 0.102 0.151 0.257 0.264 0.201 153 A 0.001 0.001 0.004 0.003 0.006 0.019 0.191 0.217 0.230 0.202 0.126 154 S 0.003 0.019 0.624 0.231 0.086 0.025 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 155 T 0.003 0.011 0.048 0.040 0.089 0.230 0.378 0.109 0.054 0.027 0.011 156 L 0.001 0.002 0.005 0.006 0.005 0.008 0.042 0.106 0.244 0.309 0.272 157 S 0.014 0.018 0.015 0.035 0.070 0.138 0.286 0.154 0.122 0.078 0.069 158 N 0.194 0.154 0.262 0.215 0.088 0.045 0.023 0.010 0.005 0.003 0.001 159 R 0.081 0.101 0.062 0.145 0.187 0.168 0.156 0.056 0.028 0.012 0.004 160 V 0.015 0.008 0.009 0.016 0.013 0.018 0.054 0.093 0.184 0.242 0.348 161 Y 0.019 0.033 0.031 0.083 0.129 0.165 0.220 0.125 0.098 0.062 0.035 162 D 0.043 0.117 0.090 0.184 0.133 0.123 0.140 0.081 0.052 0.026 0.011 163 A 0.036 0.020 0.012 0.028 0.040 0.066 0.142 0.163 0.162 0.183 0.148 164 D 0.321 0.261 0.072 0.154 0.089 0.042 0.029 0.013 0.010 0.006 0.005 165 S 0.140 0.081 0.029 0.081 0.082 0.095 0.137 0.104 0.107 0.086 0.057 166 E 0.372 0.161 0.069 0.157 0.096 0.056 0.041 0.019 0.014 0.009 0.007 167 Q 0.101 0.111 0.055 0.116 0.114 0.117 0.166 0.086 0.068 0.040 0.027 168 R 0.028 0.022 0.021 0.085 0.113 0.155 0.227 0.143 0.106 0.067 0.034 169 K 0.105 0.087 0.097 0.206 0.184 0.158 0.097 0.030 0.020 0.010 0.006 170 S 0.007 0.012 0.040 0.054 0.062 0.080 0.210 0.179 0.166 0.117 0.073 171 L 0.007 0.005 0.012 0.023 0.033 0.052 0.151 0.156 0.210 0.187 0.165 172 H 0.005 0.005 0.023 0.020 0.019 0.032 0.115 0.151 0.232 0.233 0.163 173 L 0.002 0.004 0.048 0.062 0.096 0.145 0.221 0.161 0.126 0.081 0.055 174 A 0.002 0.002 0.020 0.005 0.004 0.009 0.055 0.098 0.199 0.285 0.322 175 A 0.001 0.002 0.008 0.010 0.010 0.017 0.088 0.162 0.266 0.257 0.179 176 V 0.005 0.008 0.035 0.021 0.022 0.048 0.137 0.146 0.215 0.199 0.163 177 F 0.008 0.006 0.031 0.022 0.037 0.065 0.214 0.175 0.179 0.145 0.116 178 T 0.004 0.007 0.021 0.016 0.016 0.026 0.104 0.141 0.238 0.228 0.200 179 C 0.008 0.008 0.016 0.026 0.031 0.048 0.141 0.150 0.215 0.211 0.147 180 N 0.020 0.012 0.037 0.042 0.072 0.126 0.215 0.157 0.163 0.098 0.058 181 F 0.002 0.007 0.030 0.018 0.024 0.046 0.162 0.172 0.205 0.184 0.149 182 T 0.001 0.001 0.007 0.006 0.007 0.011 0.052 0.117 0.243 0.282 0.274 183 N 0.006 0.007 0.034 0.020 0.022 0.042 0.131 0.136 0.208 0.213 0.181 184 H 0.001 0.005 0.044 0.049 0.082 0.112 0.220 0.177 0.147 0.095 0.069 185 M 0.001 0.001 0.008 0.003 0.003 0.006 0.038 0.082 0.193 0.270 0.397 186 Y 0.001 0.001 0.003 0.005 0.007 0.014 0.087 0.124 0.232 0.269 0.260 187 A 0.001 0.002 0.115 0.052 0.067 0.114 0.241 0.123 0.131 0.088 0.065 188 L 0.001 0.001 0.008 0.013 0.026 0.066 0.247 0.202 0.180 0.145 0.112 189 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.019 0.062 0.196 0.325 0.396 190 A 0.001 0.001 0.007 0.011 0.022 0.074 0.239 0.178 0.195 0.156 0.117 191 E 0.001 0.005 0.099 0.120 0.165 0.213 0.222 0.092 0.048 0.022 0.012 192 L 0.001 0.001 0.003 0.006 0.010 0.035 0.183 0.199 0.225 0.193 0.146 193 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.016 0.062 0.195 0.343 0.376 194 K 0.002 0.007 0.101 0.156 0.219 0.230 0.184 0.059 0.024 0.010 0.007 195 K 0.005 0.025 0.294 0.122 0.168 0.176 0.140 0.039 0.021 0.007 0.004 196 Y 0.003 0.002 0.002 0.009 0.019 0.063 0.267 0.221 0.180 0.158 0.076 197 N 0.635 0.168 0.030 0.065 0.032 0.022 0.025 0.009 0.007 0.004 0.002 198 L 0.001 0.002 0.002 0.006 0.011 0.019 0.064 0.134 0.225 0.270 0.267 199 P 0.105 0.673 0.065 0.097 0.032 0.015 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 200 F 0.012 0.014 0.007 0.051 0.138 0.228 0.265 0.132 0.093 0.040 0.022 201 D 0.820 0.094 0.023 0.031 0.015 0.008 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 202 V 0.003 0.041 0.036 0.233 0.243 0.201 0.143 0.054 0.029 0.011 0.006 203 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.040 0.106 0.207 0.291 0.347 204 L 0.003 0.006 0.020 0.104 0.212 0.330 0.222 0.059 0.026 0.012 0.006 205 P 0.013 0.058 0.496 0.264 0.099 0.041 0.021 0.005 0.002 0.001 0.001 206 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.015 0.082 0.143 0.202 0.267 0.281 207 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.036 0.105 0.240 0.312 0.299 208 D 0.002 0.010 0.225 0.254 0.239 0.165 0.071 0.018 0.010 0.004 0.002 209 E 0.003 0.016 0.157 0.144 0.161 0.246 0.188 0.048 0.021 0.011 0.005 210 T 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.054 0.131 0.241 0.304 0.254 211 A 0.003 0.002 0.002 0.006 0.008 0.028 0.112 0.157 0.210 0.234 0.238 212 R 0.020 0.043 0.393 0.184 0.139 0.097 0.067 0.027 0.017 0.009 0.004 213 K 0.031 0.059 0.154 0.150 0.152 0.172 0.154 0.056 0.038 0.021 0.012 214 V 0.014 0.008 0.008 0.013 0.013 0.023 0.071 0.105 0.209 0.258 0.278 215 H 0.047 0.022 0.030 0.051 0.059 0.117 0.206 0.142 0.150 0.112 0.064 216 E 0.117 0.125 0.287 0.179 0.111 0.076 0.058 0.024 0.014 0.006 0.003 217 L 0.009 0.016 0.026 0.041 0.062 0.105 0.185 0.154 0.155 0.143 0.104 218 E 0.064 0.106 0.065 0.135 0.114 0.096 0.121 0.090 0.085 0.072 0.052 219 P 0.169 0.096 0.094 0.133 0.124 0.117 0.123 0.062 0.045 0.023 0.012 220 K 0.360 0.168 0.144 0.144 0.081 0.048 0.030 0.012 0.007 0.004 0.002 221 T 0.111 0.170 0.057 0.155 0.127 0.096 0.122 0.066 0.050 0.031 0.016 222 A 0.167 0.048 0.027 0.057 0.060 0.074 0.119 0.108 0.128 0.112 0.100 223 Q 0.238 0.201 0.113 0.147 0.103 0.071 0.067 0.027 0.017 0.010 0.006 224 T 0.148 0.160 0.079 0.155 0.117 0.093 0.099 0.061 0.046 0.028 0.015 225 G 0.196 0.094 0.031 0.099 0.107 0.107 0.130 0.090 0.066 0.049 0.030 226 P 0.429 0.228 0.072 0.117 0.064 0.035 0.027 0.012 0.008 0.005 0.003 227 A 0.127 0.073 0.044 0.129 0.138 0.125 0.142 0.089 0.070 0.043 0.020 228 I 0.107 0.094 0.037 0.111 0.094 0.097 0.141 0.105 0.090 0.069 0.054 229 R 0.117 0.111 0.076 0.145 0.129 0.108 0.121 0.074 0.058 0.036 0.023 230 Y 0.178 0.116 0.042 0.099 0.105 0.100 0.117 0.091 0.069 0.053 0.030 231 D 0.173 0.249 0.070 0.151 0.113 0.079 0.071 0.037 0.028 0.018 0.011 232 E 0.270 0.097 0.048 0.131 0.122 0.108 0.101 0.049 0.037 0.023 0.013 233 N 0.334 0.165 0.086 0.191 0.102 0.052 0.035 0.015 0.011 0.006 0.004 234 V 0.006 0.031 0.022 0.073 0.092 0.121 0.187 0.163 0.152 0.093 0.059 235 I 0.004 0.007 0.004 0.014 0.022 0.043 0.121 0.173 0.227 0.208 0.177 236 G 0.038 0.028 0.039 0.106 0.168 0.222 0.203 0.088 0.059 0.031 0.018 237 N 0.033 0.066 0.147 0.235 0.171 0.124 0.106 0.051 0.035 0.020 0.012 238 H 0.002 0.007 0.008 0.031 0.034 0.049 0.123 0.158 0.213 0.203 0.173 239 L 0.002 0.001 0.005 0.007 0.008 0.015 0.056 0.108 0.215 0.290 0.293 240 R 0.012 0.026 0.231 0.217 0.195 0.149 0.102 0.035 0.020 0.009 0.004 241 M 0.002 0.010 0.055 0.072 0.101 0.166 0.253 0.140 0.102 0.063 0.036 242 L 0.002 0.002 0.003 0.006 0.007 0.017 0.082 0.130 0.208 0.282 0.261 243 A 0.033 0.029 0.039 0.086 0.104 0.137 0.236 0.144 0.107 0.057 0.028 244 D 0.069 0.143 0.321 0.195 0.108 0.073 0.046 0.021 0.013 0.007 0.004 245 D 0.161 0.143 0.079 0.136 0.111 0.113 0.121 0.056 0.041 0.026 0.012 246 P 0.461 0.072 0.048 0.050 0.039 0.043 0.082 0.060 0.059 0.050 0.035 247 A 0.137 0.150 0.104 0.118 0.104 0.111 0.128 0.059 0.045 0.028 0.017 248 M 0.029 0.039 0.058 0.096 0.097 0.138 0.201 0.132 0.109 0.067 0.034 249 Q 0.211 0.098 0.244 0.198 0.114 0.063 0.039 0.015 0.010 0.005 0.003 250 R 0.056 0.077 0.298 0.185 0.142 0.106 0.073 0.029 0.019 0.009 0.005 251 L 0.001 0.005 0.011 0.012 0.016 0.040 0.135 0.172 0.242 0.221 0.146 252 Y 0.007 0.010 0.058 0.063 0.107 0.190 0.283 0.130 0.089 0.043 0.021 253 E 0.053 0.073 0.712 0.106 0.035 0.013 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 254 L 0.003 0.011 0.073 0.099 0.113 0.166 0.230 0.122 0.097 0.057 0.028 255 L 0.002 0.001 0.011 0.004 0.004 0.006 0.033 0.077 0.225 0.310 0.327 256 S 0.004 0.007 0.150 0.119 0.159 0.255 0.208 0.056 0.029 0.010 0.004 257 R 0.005 0.022 0.551 0.183 0.120 0.071 0.032 0.009 0.004 0.002 0.001 258 S 0.003 0.005 0.015 0.012 0.021 0.057 0.222 0.184 0.204 0.162 0.112 259 I 0.024 0.011 0.027 0.026 0.024 0.040 0.135 0.162 0.229 0.206 0.117 260 H 0.052 0.086 0.312 0.152 0.143 0.097 0.090 0.036 0.019 0.009 0.004 261 E 0.112 0.158 0.240 0.168 0.105 0.090 0.071 0.028 0.016 0.009 0.003 262 R 0.228 0.106 0.072 0.083 0.085 0.092 0.116 0.074 0.064 0.053 0.026 263 Q 0.550 0.153 0.051 0.072 0.045 0.036 0.034 0.022 0.018 0.012 0.007