# TARGET T0393 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0393.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 511 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.236 0.142 0.043 0.091 0.084 0.070 0.117 0.088 0.062 0.044 0.024 2 K 0.203 0.118 0.052 0.149 0.129 0.108 0.110 0.060 0.037 0.024 0.010 3 R 0.411 0.139 0.084 0.127 0.078 0.054 0.052 0.029 0.016 0.008 0.003 4 S 0.125 0.239 0.064 0.219 0.135 0.075 0.074 0.037 0.018 0.008 0.005 5 I 0.009 0.013 0.007 0.014 0.024 0.034 0.080 0.101 0.188 0.236 0.295 6 E 0.270 0.289 0.107 0.199 0.090 0.024 0.012 0.005 0.002 0.001 0.001 7 D 0.184 0.157 0.131 0.236 0.116 0.073 0.050 0.025 0.014 0.009 0.004 8 T 0.019 0.022 0.022 0.049 0.068 0.124 0.218 0.143 0.151 0.112 0.072 9 P 0.021 0.087 0.075 0.224 0.179 0.145 0.134 0.065 0.040 0.020 0.008 10 I 0.001 0.001 0.008 0.007 0.011 0.040 0.079 0.093 0.236 0.290 0.233 11 V 0.001 0.006 0.013 0.034 0.067 0.087 0.193 0.186 0.185 0.134 0.093 12 L 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.005 0.016 0.054 0.154 0.273 0.490 13 I 0.001 0.001 0.005 0.010 0.035 0.040 0.087 0.181 0.183 0.216 0.243 14 G 0.001 0.003 0.010 0.018 0.034 0.037 0.093 0.156 0.247 0.237 0.164 15 A 0.001 0.001 0.006 0.012 0.030 0.028 0.081 0.170 0.200 0.195 0.276 16 G 0.012 0.013 0.030 0.058 0.079 0.111 0.182 0.138 0.164 0.123 0.087 17 N 0.023 0.041 0.067 0.144 0.156 0.138 0.220 0.104 0.058 0.029 0.021 18 L 0.003 0.007 0.015 0.025 0.050 0.039 0.092 0.155 0.176 0.189 0.250 19 A 0.002 0.005 0.010 0.021 0.040 0.057 0.132 0.139 0.193 0.211 0.190 20 T 0.030 0.042 0.131 0.198 0.182 0.162 0.140 0.050 0.035 0.018 0.013 21 N 0.006 0.009 0.029 0.047 0.084 0.105 0.221 0.172 0.136 0.107 0.084 22 L 0.001 0.001 0.002 0.004 0.008 0.010 0.027 0.051 0.182 0.291 0.424 23 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 0.027 0.075 0.086 0.224 0.286 0.286 24 K 0.005 0.018 0.229 0.215 0.211 0.150 0.097 0.036 0.023 0.011 0.006 25 A 0.003 0.005 0.039 0.052 0.097 0.131 0.286 0.188 0.089 0.070 0.041 26 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.013 0.023 0.178 0.363 0.414 27 Y 0.003 0.004 0.009 0.030 0.076 0.140 0.350 0.149 0.125 0.081 0.033 28 R 0.005 0.083 0.540 0.202 0.077 0.053 0.020 0.008 0.005 0.004 0.002 29 K 0.031 0.058 0.070 0.104 0.135 0.221 0.237 0.090 0.032 0.015 0.008 30 G 0.644 0.163 0.022 0.056 0.024 0.018 0.027 0.021 0.012 0.008 0.005 31 F 0.016 0.010 0.009 0.022 0.033 0.059 0.109 0.112 0.189 0.198 0.244 32 R 0.059 0.185 0.150 0.254 0.193 0.074 0.044 0.022 0.010 0.006 0.003 33 I 0.005 0.011 0.019 0.041 0.070 0.128 0.190 0.159 0.166 0.128 0.083 34 V 0.005 0.006 0.009 0.019 0.033 0.077 0.152 0.163 0.202 0.185 0.149 35 Q 0.006 0.017 0.029 0.107 0.118 0.128 0.193 0.141 0.125 0.088 0.048 36 V 0.001 0.001 0.004 0.005 0.009 0.019 0.039 0.063 0.196 0.299 0.364 37 Y 0.003 0.005 0.007 0.024 0.060 0.091 0.183 0.156 0.196 0.159 0.115 38 S 0.036 0.041 0.092 0.130 0.127 0.105 0.154 0.107 0.098 0.072 0.039 39 R 0.014 0.023 0.027 0.063 0.107 0.189 0.244 0.133 0.099 0.062 0.038 40 T 0.035 0.310 0.060 0.102 0.073 0.088 0.145 0.076 0.057 0.038 0.016 41 E 0.354 0.131 0.062 0.147 0.122 0.079 0.068 0.022 0.009 0.003 0.002 42 E 0.939 0.029 0.018 0.010 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 43 S 0.012 0.085 0.066 0.211 0.189 0.176 0.158 0.060 0.026 0.013 0.004 44 A 0.001 0.002 0.003 0.005 0.017 0.055 0.167 0.192 0.236 0.219 0.103 45 R 0.012 0.019 0.640 0.178 0.090 0.039 0.016 0.005 0.001 0.001 0.001 46 E 0.001 0.010 0.798 0.131 0.045 0.010 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 47 L 0.001 0.001 0.003 0.002 0.005 0.017 0.059 0.091 0.246 0.356 0.222 48 A 0.001 0.001 0.004 0.007 0.025 0.101 0.318 0.177 0.177 0.159 0.031 49 Q 0.001 0.005 0.928 0.054 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 50 K 0.003 0.012 0.269 0.102 0.138 0.197 0.204 0.054 0.011 0.006 0.002 51 V 0.004 0.004 0.005 0.003 0.005 0.025 0.089 0.122 0.271 0.282 0.190 52 E 0.219 0.256 0.133 0.208 0.107 0.031 0.025 0.013 0.004 0.002 0.001 53 A 0.095 0.025 0.119 0.073 0.091 0.082 0.137 0.110 0.096 0.088 0.083 54 E 0.250 0.235 0.131 0.147 0.101 0.055 0.046 0.019 0.009 0.004 0.002 55 Y 0.038 0.046 0.024 0.070 0.089 0.127 0.212 0.167 0.116 0.069 0.042 56 T 0.047 0.052 0.041 0.077 0.091 0.105 0.148 0.127 0.121 0.102 0.089 57 T 0.218 0.120 0.103 0.186 0.136 0.078 0.082 0.039 0.022 0.011 0.005 58 D 0.219 0.210 0.116 0.209 0.104 0.054 0.044 0.023 0.012 0.007 0.003 59 L 0.016 0.022 0.014 0.046 0.062 0.087 0.169 0.155 0.179 0.148 0.100 60 A 0.160 0.085 0.067 0.156 0.144 0.117 0.129 0.074 0.037 0.022 0.008 61 E 0.091 0.140 0.282 0.253 0.114 0.060 0.032 0.015 0.007 0.004 0.002 62 V 0.013 0.020 0.022 0.039 0.058 0.109 0.201 0.154 0.163 0.138 0.085 63 N 0.027 0.033 0.020 0.054 0.076 0.098 0.173 0.140 0.154 0.139 0.087 64 P 0.161 0.183 0.245 0.229 0.099 0.039 0.023 0.012 0.005 0.002 0.001 65 Y 0.105 0.094 0.100 0.226 0.169 0.110 0.111 0.047 0.021 0.010 0.006 66 A 0.003 0.004 0.005 0.010 0.019 0.033 0.093 0.121 0.213 0.209 0.290 67 K 0.013 0.054 0.087 0.208 0.237 0.144 0.129 0.067 0.034 0.018 0.010 68 L 0.001 0.002 0.014 0.014 0.024 0.056 0.122 0.122 0.229 0.243 0.173 69 Y 0.001 0.002 0.004 0.009 0.018 0.029 0.084 0.118 0.232 0.264 0.239 70 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.011 0.028 0.064 0.193 0.298 0.395 71 V 0.001 0.002 0.006 0.011 0.033 0.037 0.081 0.156 0.192 0.225 0.255 72 S 0.001 0.002 0.009 0.015 0.035 0.036 0.087 0.157 0.213 0.248 0.197 73 L 0.001 0.002 0.005 0.010 0.023 0.040 0.097 0.140 0.237 0.242 0.202 74 K 0.045 0.153 0.095 0.211 0.142 0.113 0.121 0.050 0.040 0.019 0.011 75 D 0.082 0.085 0.064 0.146 0.138 0.144 0.178 0.081 0.045 0.021 0.016 76 S 0.540 0.149 0.059 0.099 0.058 0.033 0.032 0.016 0.007 0.004 0.003 77 A 0.136 0.141 0.055 0.138 0.114 0.100 0.127 0.078 0.051 0.036 0.024 78 F 0.014 0.026 0.019 0.042 0.062 0.108 0.160 0.130 0.168 0.154 0.117 79 A 0.101 0.075 0.113 0.183 0.165 0.130 0.123 0.057 0.030 0.016 0.007 80 E 0.102 0.126 0.257 0.254 0.125 0.064 0.040 0.019 0.008 0.004 0.002 81 L 0.008 0.011 0.017 0.038 0.059 0.080 0.166 0.176 0.186 0.157 0.102 82 L 0.006 0.010 0.012 0.034 0.060 0.122 0.244 0.176 0.154 0.132 0.050 83 Q 0.048 0.095 0.508 0.217 0.082 0.027 0.013 0.006 0.002 0.001 0.001 84 G 0.147 0.084 0.157 0.211 0.157 0.096 0.094 0.036 0.011 0.005 0.002 85 I 0.005 0.005 0.006 0.007 0.010 0.019 0.061 0.090 0.224 0.277 0.295 86 V 0.045 0.099 0.078 0.172 0.204 0.139 0.147 0.067 0.028 0.015 0.006 87 E 0.144 0.172 0.403 0.194 0.058 0.017 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 88 G 0.315 0.070 0.061 0.092 0.095 0.094 0.141 0.070 0.033 0.018 0.010 89 K 0.118 0.120 0.045 0.111 0.088 0.091 0.145 0.109 0.083 0.063 0.028 90 R 0.034 0.157 0.079 0.143 0.131 0.155 0.132 0.070 0.048 0.037 0.016 91 E 0.271 0.238 0.120 0.178 0.099 0.039 0.028 0.016 0.006 0.004 0.002 92 E 0.459 0.125 0.060 0.114 0.067 0.052 0.062 0.033 0.016 0.009 0.003 93 A 0.024 0.037 0.042 0.128 0.130 0.169 0.186 0.111 0.088 0.059 0.027 94 L 0.002 0.007 0.012 0.026 0.039 0.116 0.175 0.142 0.209 0.175 0.097 95 M 0.001 0.005 0.013 0.024 0.039 0.071 0.121 0.113 0.212 0.196 0.204 96 V 0.001 0.001 0.004 0.005 0.010 0.014 0.039 0.083 0.193 0.270 0.382 97 H 0.003 0.007 0.015 0.053 0.104 0.103 0.162 0.178 0.161 0.131 0.082 98 T 0.002 0.003 0.007 0.015 0.026 0.031 0.074 0.146 0.206 0.237 0.253 99 A 0.004 0.006 0.008 0.023 0.041 0.062 0.107 0.152 0.208 0.205 0.184 100 G 0.033 0.036 0.028 0.097 0.121 0.116 0.197 0.142 0.119 0.068 0.043 101 S 0.044 0.045 0.041 0.078 0.082 0.088 0.130 0.111 0.138 0.127 0.116 102 I 0.035 0.039 0.023 0.079 0.103 0.140 0.194 0.128 0.119 0.084 0.056 103 P 0.248 0.284 0.063 0.144 0.077 0.051 0.057 0.032 0.022 0.015 0.008 104 M 0.060 0.041 0.021 0.079 0.098 0.138 0.174 0.116 0.117 0.083 0.074 105 N 0.473 0.184 0.062 0.120 0.065 0.031 0.029 0.017 0.009 0.006 0.003 106 V 0.043 0.050 0.030 0.112 0.112 0.149 0.168 0.110 0.104 0.076 0.044 107 W 0.023 0.042 0.019 0.046 0.055 0.090 0.138 0.122 0.168 0.171 0.126 108 E 0.115 0.127 0.080 0.215 0.173 0.104 0.088 0.048 0.028 0.016 0.007 109 G 0.347 0.136 0.116 0.159 0.088 0.055 0.046 0.027 0.014 0.008 0.004 110 H 0.070 0.083 0.036 0.110 0.094 0.115 0.152 0.104 0.105 0.083 0.048 111 V 0.028 0.045 0.016 0.056 0.071 0.104 0.162 0.143 0.156 0.131 0.089 112 P 0.280 0.231 0.120 0.185 0.094 0.038 0.024 0.014 0.007 0.004 0.002 113 H 0.199 0.104 0.076 0.146 0.106 0.102 0.109 0.068 0.043 0.031 0.015 114 Y 0.065 0.071 0.028 0.109 0.101 0.134 0.166 0.117 0.102 0.070 0.037 115 G 0.065 0.062 0.032 0.099 0.099 0.118 0.152 0.126 0.113 0.083 0.052 116 V 0.033 0.034 0.041 0.081 0.088 0.129 0.158 0.126 0.134 0.109 0.067 117 F 0.023 0.032 0.031 0.076 0.083 0.106 0.166 0.134 0.151 0.121 0.078 118 Y 0.012 0.014 0.013 0.040 0.057 0.080 0.130 0.152 0.194 0.170 0.138 119 P 0.045 0.044 0.031 0.092 0.108 0.101 0.143 0.139 0.132 0.098 0.065 120 M 0.025 0.030 0.024 0.075 0.083 0.088 0.157 0.157 0.154 0.127 0.078 121 Q 0.025 0.026 0.018 0.064 0.082 0.112 0.153 0.143 0.156 0.131 0.090 122 T 0.128 0.076 0.049 0.106 0.102 0.097 0.132 0.104 0.095 0.067 0.042 123 F 0.041 0.038 0.027 0.090 0.110 0.123 0.186 0.136 0.119 0.080 0.050 124 S 0.023 0.032 0.017 0.035 0.042 0.055 0.112 0.110 0.192 0.203 0.180 125 K 0.201 0.245 0.082 0.205 0.122 0.054 0.046 0.021 0.013 0.007 0.003 126 Q 0.455 0.154 0.059 0.125 0.071 0.047 0.040 0.022 0.014 0.009 0.005 127 R 0.210 0.137 0.054 0.147 0.115 0.096 0.105 0.063 0.037 0.023 0.013 128 E 0.106 0.146 0.062 0.175 0.138 0.109 0.116 0.071 0.040 0.025 0.012 129 V 0.044 0.029 0.037 0.058 0.072 0.138 0.181 0.123 0.137 0.118 0.064 130 D 0.126 0.208 0.180 0.243 0.115 0.052 0.040 0.020 0.010 0.006 0.002 131 F 0.026 0.040 0.044 0.084 0.089 0.126 0.179 0.133 0.124 0.099 0.056 132 K 0.118 0.124 0.086 0.170 0.146 0.102 0.102 0.070 0.041 0.026 0.015 133 E 0.177 0.159 0.114 0.201 0.120 0.076 0.067 0.044 0.022 0.013 0.006 134 I 0.031 0.031 0.033 0.070 0.087 0.120 0.179 0.148 0.135 0.102 0.063 135 P 0.037 0.039 0.032 0.083 0.099 0.118 0.178 0.142 0.128 0.090 0.056 136 F 0.031 0.032 0.057 0.095 0.105 0.133 0.168 0.131 0.116 0.084 0.048 137 F 0.014 0.020 0.033 0.067 0.093 0.110 0.177 0.149 0.149 0.107 0.081 138 I 0.008 0.009 0.013 0.029 0.046 0.051 0.123 0.155 0.209 0.188 0.170 139 E 0.064 0.070 0.089 0.173 0.175 0.126 0.146 0.073 0.046 0.025 0.013 140 A 0.142 0.123 0.134 0.187 0.134 0.087 0.094 0.048 0.027 0.015 0.008 141 S 0.147 0.139 0.056 0.115 0.102 0.102 0.140 0.083 0.058 0.038 0.020 142 S 0.185 0.332 0.067 0.120 0.072 0.063 0.081 0.037 0.024 0.014 0.006 143 T 0.486 0.165 0.100 0.126 0.062 0.028 0.019 0.008 0.004 0.002 0.001 144 E 0.588 0.166 0.082 0.091 0.039 0.015 0.011 0.005 0.002 0.001 0.001 145 D 0.017 0.082 0.059 0.122 0.123 0.153 0.202 0.122 0.069 0.041 0.011 146 A 0.010 0.010 0.026 0.046 0.096 0.237 0.311 0.137 0.075 0.041 0.013 147 A 0.059 0.054 0.673 0.154 0.041 0.011 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 148 F 0.003 0.011 0.077 0.105 0.127 0.230 0.279 0.096 0.043 0.022 0.005 149 L 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.010 0.046 0.083 0.243 0.337 0.274 150 K 0.005 0.016 0.316 0.199 0.226 0.127 0.073 0.026 0.008 0.004 0.001 151 A 0.005 0.016 0.752 0.123 0.057 0.024 0.014 0.005 0.001 0.001 0.001 152 I 0.001 0.001 0.007 0.008 0.017 0.071 0.186 0.152 0.233 0.209 0.116 153 A 0.001 0.001 0.003 0.005 0.012 0.031 0.121 0.139 0.249 0.271 0.167 154 S 0.010 0.031 0.590 0.203 0.100 0.035 0.018 0.007 0.003 0.002 0.001 155 T 0.018 0.038 0.226 0.133 0.144 0.157 0.177 0.062 0.024 0.014 0.007 156 L 0.005 0.008 0.007 0.010 0.016 0.041 0.105 0.128 0.234 0.231 0.215 157 S 0.190 0.126 0.056 0.150 0.136 0.086 0.110 0.072 0.039 0.023 0.013 158 N 0.134 0.073 0.168 0.178 0.124 0.097 0.089 0.056 0.040 0.028 0.016 159 R 0.069 0.111 0.077 0.167 0.148 0.130 0.157 0.073 0.038 0.020 0.011 160 V 0.014 0.020 0.015 0.039 0.052 0.081 0.137 0.154 0.184 0.175 0.128 161 Y 0.051 0.035 0.037 0.083 0.113 0.158 0.197 0.127 0.097 0.067 0.035 162 D 0.094 0.145 0.137 0.219 0.138 0.086 0.086 0.043 0.028 0.017 0.008 163 A 0.022 0.024 0.015 0.030 0.046 0.084 0.164 0.130 0.187 0.167 0.130 164 D 0.267 0.417 0.056 0.118 0.058 0.030 0.028 0.012 0.007 0.004 0.002 165 S 0.549 0.183 0.052 0.109 0.049 0.024 0.017 0.009 0.004 0.002 0.001 166 E 0.724 0.137 0.027 0.055 0.026 0.011 0.009 0.005 0.002 0.001 0.001 167 Q 0.057 0.099 0.041 0.134 0.121 0.133 0.158 0.111 0.074 0.050 0.021 168 R 0.019 0.035 0.043 0.097 0.133 0.210 0.190 0.124 0.073 0.054 0.022 169 K 0.041 0.088 0.238 0.237 0.141 0.104 0.081 0.042 0.017 0.009 0.003 170 S 0.010 0.020 0.065 0.113 0.121 0.161 0.221 0.128 0.084 0.053 0.024 171 L 0.002 0.003 0.008 0.012 0.020 0.042 0.099 0.122 0.229 0.245 0.220 172 H 0.006 0.022 0.067 0.128 0.173 0.157 0.191 0.109 0.077 0.045 0.026 173 L 0.001 0.002 0.017 0.016 0.030 0.048 0.110 0.132 0.204 0.222 0.218 174 A 0.001 0.002 0.006 0.010 0.021 0.038 0.094 0.114 0.230 0.236 0.249 175 A 0.002 0.004 0.010 0.021 0.039 0.053 0.123 0.141 0.211 0.203 0.193 176 V 0.001 0.002 0.009 0.013 0.026 0.043 0.086 0.118 0.208 0.241 0.252 177 F 0.002 0.004 0.011 0.023 0.044 0.067 0.150 0.163 0.216 0.193 0.126 178 T 0.002 0.005 0.011 0.022 0.034 0.047 0.103 0.142 0.219 0.212 0.203 179 C 0.010 0.013 0.026 0.054 0.077 0.117 0.189 0.148 0.152 0.119 0.093 180 N 0.011 0.018 0.035 0.067 0.090 0.122 0.213 0.154 0.132 0.095 0.063 181 F 0.003 0.007 0.013 0.022 0.036 0.044 0.098 0.140 0.198 0.213 0.226 182 T 0.006 0.012 0.020 0.041 0.065 0.084 0.161 0.143 0.182 0.157 0.127 183 N 0.029 0.030 0.066 0.111 0.126 0.138 0.192 0.107 0.095 0.062 0.043 184 H 0.010 0.016 0.032 0.066 0.096 0.115 0.198 0.160 0.127 0.105 0.074 185 M 0.001 0.004 0.006 0.013 0.024 0.032 0.081 0.122 0.219 0.265 0.233 186 Y 0.001 0.002 0.006 0.013 0.035 0.070 0.144 0.134 0.214 0.214 0.167 187 A 0.017 0.021 0.172 0.168 0.168 0.137 0.144 0.075 0.049 0.032 0.016 188 L 0.003 0.010 0.030 0.060 0.097 0.192 0.284 0.130 0.098 0.067 0.030 189 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.023 0.045 0.199 0.291 0.429 190 A 0.004 0.005 0.018 0.047 0.125 0.213 0.313 0.122 0.084 0.047 0.022 191 E 0.019 0.046 0.612 0.202 0.071 0.027 0.015 0.005 0.002 0.001 0.001 192 L 0.001 0.003 0.012 0.020 0.041 0.137 0.275 0.152 0.158 0.128 0.073 193 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.025 0.044 0.192 0.349 0.377 194 K 0.009 0.044 0.272 0.254 0.208 0.100 0.067 0.027 0.011 0.005 0.002 195 K 0.008 0.052 0.356 0.194 0.135 0.126 0.072 0.030 0.013 0.010 0.004 196 Y 0.012 0.009 0.009 0.016 0.028 0.098 0.214 0.176 0.191 0.148 0.099 197 N 0.429 0.257 0.050 0.111 0.054 0.030 0.034 0.019 0.010 0.006 0.003 198 L 0.026 0.015 0.021 0.032 0.050 0.085 0.134 0.117 0.176 0.165 0.179 199 P 0.282 0.427 0.072 0.110 0.056 0.021 0.017 0.008 0.004 0.002 0.001 200 F 0.078 0.060 0.027 0.103 0.112 0.169 0.213 0.112 0.072 0.037 0.018 201 D 0.587 0.165 0.065 0.095 0.041 0.019 0.013 0.008 0.003 0.002 0.001 202 V 0.029 0.041 0.026 0.119 0.135 0.183 0.197 0.122 0.081 0.046 0.022 203 M 0.014 0.045 0.028 0.047 0.061 0.070 0.122 0.140 0.174 0.174 0.126 204 L 0.012 0.016 0.026 0.082 0.136 0.193 0.245 0.132 0.088 0.048 0.022 205 P 0.275 0.149 0.308 0.183 0.052 0.017 0.010 0.004 0.002 0.001 0.001 206 L 0.007 0.008 0.014 0.038 0.072 0.088 0.186 0.179 0.170 0.124 0.115 207 I 0.001 0.003 0.004 0.008 0.017 0.022 0.063 0.118 0.223 0.277 0.265 208 D 0.021 0.037 0.177 0.202 0.206 0.151 0.120 0.046 0.024 0.013 0.004 209 E 0.033 0.048 0.429 0.213 0.116 0.080 0.049 0.020 0.007 0.004 0.002 210 T 0.012 0.021 0.030 0.059 0.082 0.123 0.249 0.174 0.124 0.080 0.046 211 A 0.005 0.005 0.008 0.013 0.022 0.038 0.111 0.136 0.234 0.246 0.183 212 R 0.053 0.060 0.284 0.219 0.166 0.096 0.072 0.028 0.013 0.007 0.003 213 K 0.057 0.126 0.388 0.247 0.099 0.041 0.028 0.010 0.003 0.002 0.001 214 V 0.011 0.010 0.014 0.023 0.040 0.074 0.152 0.156 0.193 0.176 0.152 215 H 0.061 0.063 0.054 0.108 0.125 0.125 0.189 0.129 0.076 0.048 0.022 216 E 0.038 0.084 0.322 0.264 0.140 0.069 0.043 0.021 0.010 0.006 0.003 217 L 0.027 0.020 0.040 0.036 0.052 0.126 0.206 0.132 0.148 0.128 0.083 218 E 0.110 0.205 0.080 0.202 0.135 0.078 0.086 0.051 0.031 0.015 0.008 219 P 0.089 0.041 0.041 0.067 0.078 0.088 0.154 0.140 0.128 0.103 0.071 220 K 0.175 0.148 0.131 0.206 0.133 0.078 0.064 0.033 0.018 0.011 0.005 221 T 0.109 0.128 0.090 0.184 0.131 0.109 0.115 0.067 0.038 0.021 0.010 222 A 0.074 0.062 0.038 0.085 0.090 0.105 0.140 0.125 0.113 0.095 0.072 223 Q 0.071 0.091 0.052 0.122 0.119 0.117 0.151 0.106 0.083 0.056 0.032 224 T 0.151 0.148 0.105 0.189 0.133 0.085 0.078 0.051 0.030 0.019 0.010 225 G 0.180 0.098 0.058 0.126 0.108 0.110 0.132 0.077 0.057 0.035 0.020 226 P 0.168 0.110 0.049 0.143 0.118 0.093 0.116 0.083 0.059 0.038 0.023 227 A 0.046 0.038 0.031 0.077 0.092 0.111 0.160 0.136 0.138 0.103 0.069 228 I 0.035 0.057 0.057 0.127 0.138 0.136 0.168 0.107 0.083 0.059 0.032 229 R 0.038 0.041 0.072 0.122 0.128 0.132 0.164 0.114 0.089 0.063 0.036 230 Y 0.109 0.142 0.086 0.188 0.145 0.102 0.102 0.060 0.035 0.021 0.010 231 D 0.022 0.080 0.039 0.083 0.083 0.095 0.162 0.134 0.134 0.104 0.063 232 E 0.202 0.085 0.056 0.140 0.157 0.124 0.123 0.058 0.031 0.016 0.009 233 N 0.589 0.134 0.112 0.099 0.034 0.014 0.010 0.005 0.002 0.001 0.001 234 V 0.008 0.017 0.017 0.041 0.063 0.139 0.216 0.138 0.174 0.124 0.062 235 I 0.002 0.005 0.005 0.012 0.026 0.044 0.130 0.151 0.231 0.232 0.163 236 G 0.036 0.059 0.412 0.263 0.133 0.056 0.024 0.010 0.004 0.002 0.001 237 N 0.027 0.058 0.278 0.236 0.172 0.103 0.079 0.032 0.009 0.004 0.002 238 H 0.001 0.003 0.006 0.015 0.027 0.036 0.099 0.183 0.236 0.229 0.165 239 L 0.002 0.002 0.005 0.012 0.035 0.109 0.271 0.181 0.179 0.145 0.060 240 R 0.009 0.031 0.686 0.186 0.061 0.016 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 241 M 0.004 0.004 0.030 0.026 0.054 0.172 0.334 0.149 0.110 0.085 0.033 242 L 0.001 0.002 0.003 0.004 0.006 0.020 0.062 0.070 0.266 0.337 0.229 243 A 0.030 0.059 0.112 0.162 0.187 0.142 0.183 0.070 0.034 0.016 0.006 244 D 0.088 0.201 0.468 0.161 0.049 0.018 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 245 D 0.223 0.165 0.069 0.115 0.104 0.094 0.130 0.060 0.022 0.011 0.006 246 P 0.659 0.159 0.024 0.053 0.029 0.021 0.024 0.018 0.008 0.005 0.002 247 A 0.205 0.152 0.112 0.178 0.117 0.091 0.074 0.038 0.018 0.010 0.004 248 M 0.065 0.087 0.156 0.160 0.132 0.136 0.140 0.066 0.032 0.019 0.007 249 Q 0.039 0.046 0.129 0.140 0.131 0.159 0.178 0.089 0.050 0.028 0.011 250 R 0.028 0.055 0.161 0.163 0.138 0.144 0.144 0.086 0.043 0.028 0.010 251 L 0.008 0.022 0.065 0.086 0.095 0.119 0.196 0.158 0.123 0.094 0.035 252 Y 0.018 0.022 0.069 0.090 0.117 0.170 0.232 0.129 0.080 0.053 0.020 253 E 0.089 0.078 0.369 0.201 0.112 0.061 0.049 0.025 0.010 0.005 0.002 254 L 0.025 0.035 0.062 0.089 0.118 0.169 0.244 0.127 0.071 0.041 0.019 255 L 0.007 0.013 0.014 0.017 0.025 0.033 0.105 0.130 0.225 0.232 0.198 256 S 0.119 0.124 0.172 0.188 0.152 0.097 0.088 0.032 0.016 0.008 0.003 257 R 0.285 0.166 0.326 0.155 0.046 0.013 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 258 S 0.093 0.095 0.053 0.085 0.108 0.108 0.190 0.131 0.068 0.041 0.027 259 I 0.049 0.068 0.033 0.084 0.094 0.097 0.189 0.157 0.117 0.078 0.034 260 H 0.280 0.152 0.267 0.165 0.066 0.033 0.022 0.009 0.004 0.002 0.001 261 E 0.117 0.118 0.367 0.232 0.097 0.034 0.022 0.009 0.003 0.001 0.001 262 R 0.055 0.090 0.085 0.098 0.107 0.103 0.193 0.139 0.071 0.040 0.020 263 Q 0.059 0.055 0.071 0.113 0.141 0.121 0.188 0.133 0.067 0.034 0.017