This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA K A 3 3 NATAA R A 4 4 NATAA S A 5 5 NATAA I A 6 6 NATAA E A 7 7 NATAA D A 8 8 NATAA T A 9 9 NATRO P A 10 10 NATAA I A 11 11 NATAA V A 12 12 NATAA L A 13 13 NATAA I A 14 14 NATAA G A 15 15 NATAA A A 16 16 NATAA G A 17 17 NATAA N A 18 18 NATAA L A 19 19 NATAA A A 20 20 NATAA T A 21 21 NATAA N A 22 22 NATAA L A 23 23 NATAA A A 24 24 NATAA K A 25 25 NATAA A A 26 26 NATAA L A 27 27 NATAA Y A 28 28 NATAA R A 29 29 NATAA K A 30 30 NATAA G A 31 31 NATAA F A 32 32 NATAA R A 33 33 NATAA I A 34 34 NATAA V A 35 35 NATAA Q A 36 36 NATAA V A 37 37 NATAA Y A 38 38 NATAA S A 39 39 NATAA R A 40 40 NATAA T A 41 41 NATAA E A 42 42 NATAA E A 43 43 NATAA S A 44 44 NATAA A A 45 45 NATAA R A 46 46 NATAA E A 47 47 NATAA L A 48 48 NATAA A A 49 49 NATAA Q A 50 50 NATAA K A 51 51 NATAA V A 52 52 NATAA E A 53 53 NATAA A A 54 54 NATAA E A 55 55 NATAA Y A 56 56 NATAA T A 57 57 NATAA T A 58 58 NATAA D A 59 59 NATAA L A 60 60 NATAA A A 61 61 NATAA E A 62 62 NATAA V A 63 63 NATAA N A 64 64 NATRO P A 65 65 NATAA Y A 66 66 NATAA A A 67 67 NATAA K A 68 68 NATAA L A 69 69 NATAA Y A 70 70 NATAA I A 71 71 NATAA V A 72 72 NATAA S A 73 73 NATAA L A 74 74 NATAA K A 75 75 NATAA D A 76 76 NATAA S A 77 77 NATAA A A 78 78 NATAA F A 79 79 NATAA A A 80 80 NATAA E A 81 81 NATAA L A 82 82 NATAA L A 83 83 NATAA Q A 84 84 NATAA G A 85 85 NATAA I A 86 86 NATAA V A 87 87 NATAA E A 88 88 NATAA G A 89 89 NATAA K A 90 90 NATAA R A 91 91 NATAA E A 92 92 NATAA E A 93 93 NATAA A A 94 94 NATAA L A 95 95 NATAA M A 96 96 NATAA V A 97 97 NATAA H A 98 98 NATAA T A 99 99 NATAA A A 100 100 NATAA G A 101 101 NATAA S A 102 102 NATAA I A 103 103 NATRO P A 104 104 NATAA M A 105 105 NATAA N A 106 106 NATAA V A 107 107 NATAA W A 108 108 NATAA E A 109 109 NATAA G A 110 110 NATAA H A 111 111 NATAA V A 112 112 NATRO P A 113 113 NATAA H A 114 114 NATAA Y A 115 115 NATAA G A 116 116 NATAA V A 117 117 NATAA F A 118 118 NATAA Y A 119 119 NATRO P A 120 120 NATAA M A 121 121 NATAA Q A 122 122 NATAA T A 123 123 NATAA F A 124 124 NATAA S A 125 125 NATAA K A 126 126 NATAA Q A 127 127 NATAA R A 128 128 NATAA E A 129 129 NATAA V A 130 130 NATAA D A 131 131 NATAA F A 132 132 NATAA K A 133 133 NATAA E A 134 134 NATAA I A 135 135 NATRO P A 136 136 NATAA F A 137 137 NATAA F A 138 138 NATAA I A 139 139 NATAA E A 140 140 NATAA A A 141 141 NATAA S A 142 142 NATAA S A 143 143 NATAA T A 144 144 NATAA E A 145 145 NATAA D A 146 146 NATAA A A 147 147 NATAA A A 148 148 NATAA F A 149 149 NATAA L A 150 150 NATAA K A 151 151 NATAA A A 152 152 NATAA I A 153 153 NATAA A A 154 154 NATAA S A 155 155 NATAA T A 156 156 NATAA L A 157 157 NATAA S A 158 158 NATAA N A 159 159 NATAA R A 160 160 NATAA V A 161 161 NATAA Y A 162 162 NATAA D A 163 163 NATAA A A 164 164 NATAA D A 165 165 NATAA S A 166 166 NATAA E A 167 167 NATAA Q A 168 168 NATAA R A 169 169 NATAA K A 170 170 NATAA S A 171 171 NATAA L A 172 172 NATAA H A 173 173 NATAA L A 174 174 NATAA A A 175 175 NATAA A A 176 176 NATAA V A 177 177 NATAA F A 178 178 NATAA T A 179 179 NATRO C A 180 180 NATAA N A 181 181 NATAA F A 182 182 NATAA T A 183 183 NATAA N A 184 184 NATAA H A 185 185 NATAA M A 186 186 NATAA Y A 187 187 NATAA A A 188 188 NATAA L A 189 189 NATAA A A 190 190 NATAA A A 191 191 NATAA E A 192 192 NATAA L A 193 193 NATAA L A 194 194 NATAA K A 195 195 NATAA K A 196 196 NATAA Y A 197 197 NATAA N A 198 198 NATAA L A 199 199 NATRO P A 200 200 NATAA F A 201 201 NATAA D A 202 202 NATAA V A 203 203 NATAA M A 204 204 NATAA L A 205 205 NATRO P A 206 206 NATAA L A 207 207 NATAA I A 208 208 NATAA D A 209 209 NATAA E A 210 210 NATAA T A 211 211 NATAA A A 212 212 NATAA R A 213 213 NATAA K A 214 214 NATAA V A 215 215 NATAA H A 216 216 NATAA E A 217 217 NATAA L A 218 218 NATAA E A 219 219 NATRO P A 220 220 NATAA K A 221 221 NATAA T A 222 222 NATAA A A 223 223 NATAA Q A 224 224 NATAA T A 225 225 NATAA G A 226 226 NATRO P A 227 227 NATAA A A 228 228 NATAA I A 229 229 NATAA R A 230 230 NATAA Y A 231 231 NATAA D A 232 232 NATAA E A 233 233 NATAA N A 234 234 NATAA V A 235 235 NATAA I A 236 236 NATAA G A 237 237 NATAA N A 238 238 NATAA H A 239 239 NATAA L A 240 240 NATAA R A 241 241 NATAA M A 242 242 NATAA L A 243 243 NATAA A A 244 244 NATAA D A 245 245 NATAA D A 246 246 NATRO P A 247 247 NATAA A A 248 248 NATAA M A 249 249 NATAA Q A 250 250 NATAA R A 251 251 NATAA L A 252 252 NATAA Y A 253 253 NATAA E A 254 254 NATAA L A 255 255 NATAA L A 256 256 NATAA S A 257 257 NATAA R A 258 258 NATAA S A 259 259 NATAA I A 260 260 NATAA H A 261 261 NATAA E A 262 262 NATAA R A 263 263 NATAA Q