This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA D A 3 3 NATRO P A 4 4 NATAA E A 5 5 NATAA I A 6 6 NATAA S A 7 7 NATAA E A 8 8 NATAA Q A 9 9 NATAA D A 10 10 NATAA E A 11 11 NATAA E A 12 12 NATAA K A 13 13 NATAA K A 14 14 NATAA K A 15 15 NATAA Y A 16 16 NATAA T A 17 17 NATAA S A 18 18 NATAA V A 19 19 NATRO C A 20 20 NATAA V A 21 21 NATAA G A 22 22 NATAA R A 23 23 NATAA E A 24 24 NATAA E A 25 25 NATAA D A 26 26 NATAA I A 27 27 NATAA R A 28 28 NATAA K A 29 29 NATAA S A 30 30 NATAA E A 31 31 NATAA R A 32 32 NATAA M A 33 33 NATAA T A 34 34 NATAA A A 35 35 NATAA V A 36 36 NATAA V A 37 37 NATAA H A 38 38 NATAA D A 39 39 NATAA R A 40 40 NATAA E A 41 41 NATAA V A 42 42 NATAA V A 43 43 NATAA I A 44 44 NATAA F A 45 45 NATAA Y A 46 46 NATAA H A 47 47 NATAA K A 48 48 NATAA G A 49 49 NATAA E A 50 50 NATAA Y A 51 51 NATAA H A 52 52 NATAA A A 53 53 NATAA M A 54 54 NATAA D A 55 55 NATAA I A 56 56 NATAA R A 57 57 NATRO C A 58 58 NATAA Y A 59 59 NATAA H A 60 60 NATAA S A 61 61 NATAA G A 62 62 NATAA G A 63 63 NATRO P A 64 64 NATAA L A 65 65 NATAA H A 66 66 NATAA L A 67 67 NATAA G A 68 68 NATAA E A 69 69 NATAA I A 70 70 NATAA E A 71 71 NATAA D A 72 72 NATAA F A 73 73 NATAA N A 74 74 NATAA G A 75 75 NATAA Q A 76 76 NATAA S A 77 77 NATRO C A 78 78 NATAA I A 79 79 NATAA V A 80 80 NATRO C A 81 81 NATRO P A 82 82 NATAA W A 83 83 NATAA H A 84 84 NATAA K A 85 85 NATAA Y A 86 86 NATAA K A 87 87 NATAA I A 88 88 NATAA T A 89 89 NATAA L A 90 90 NATAA A A 91 91 NATAA T A 92 92 NATAA G A 93 93 NATAA E A 94 94 NATAA G A 95 95 NATAA L A 96 96 NATAA Y A 97 97 NATAA Q A 98 98 NATAA S A 99 99 NATAA I A 100 100 NATAA N A 101 101 NATRO P A 102 102 NATAA K A 103 103 NATAA D A 104 104 NATRO P A 105 105 NATAA S A 106 106 NATAA A A 107 107 NATAA K A 108 108 NATRO P A 109 109 NATAA K A 110 110 NATAA W A 111 111 NATRO C A 112 112 NATAA S A 113 113 NATAA K A 114 114 NATAA G A 115 115 NATAA V A 116 116 NATAA K A 117 117 NATAA Q A 118 118 NATAA R A 119 119 NATAA I A 120 120 NATAA H A 121 121 NATAA T A 122 122 NATAA V A 123 123 NATAA K A 124 124 NATAA V A 125 125 NATAA D A 126 126 NATAA N A 127 127 NATAA G A 128 128 NATAA N A 129 129 NATAA I A 130 130 NATAA Y A 131 131 NATAA V A 132 132 NATAA T A 133 133 NATAA L A 134 134 NATAA S A 135 135 NATAA K A 136 136 NATAA E A 137 137 NATRO P A 138 138 NATAA F A 139 139 NATAA K A 140 140 NATRO C A 141 141 NATAA D A 142 142 NATAA S A 143 143 NATAA D A 144 144 NATAA Y A 145 145 NATAA Y A 146 146 NATAA A A 147 147 NATAA T A 148 148 NATAA G A 149 149 NATAA E A 150 150 NATAA F A 151 151 NATAA K A 152 152 NATAA V A 153 153 NATAA I A 154 154 NATAA Q A 155 155 NATAA S A 156 156 NATAA S A 157 157 NATAA S