This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA I A 3 3 NATAA G A 4 4 NATAA T A 5 5 NATAA Q A 6 6 NATAA I A 7 7 NATAA V A 8 8 NATAA T A 9 9 NATAA E A 10 10 NATAA R A 11 11 NATAA L A 12 12 NATAA V A 13 13 NATAA A A 14 14 NATAA L A 15 15 NATAA L A 16 16 NATAA E A 17 17 NATAA S A 18 18 NATAA G A 19 19 NATAA T A 20 20 NATAA E A 21 21 NATAA K A 22 22 NATAA V A 23 23 NATAA L A 24 24 NATAA L A 25 25 NATAA I A 26 26 NATAA D A 27 27 NATAA S A 28 28 NATAA R A 29 29 NATRO P A 30 30 NATAA F A 31 31 NATAA V A 32 32 NATAA E A 33 33 NATAA Y A 34 34 NATAA N A 35 35 NATAA T A 36 36 NATAA S A 37 37 NATAA H A 38 38 NATAA I A 39 39 NATAA L A 40 40 NATAA E A 41 41 NATAA A A 42 42 NATAA I A 43 43 NATAA N A 44 44 NATAA I A 45 45 NATAA N A 46 46 NATRO C A 47 47 NATAA S A 48 48 NATAA K A 49 49 NATAA L A 50 50 NATAA M A 51 51 NATAA K A 52 52 NATAA R A 53 53 NATAA R A 54 54 NATAA L A 55 55 NATAA Q A 56 56 NATAA Q A 57 57 NATAA D A 58 58 NATAA K A 59 59 NATAA V A 60 60 NATAA L A 61 61 NATAA I A 62 62 NATAA T A 63 63 NATAA E A 64 64 NATAA L A 65 65 NATAA I A 66 66 NATAA Q A 67 67 NATAA H A 68 68 NATAA S A 69 69 NATAA A A 70 70 NATAA K A 71 71 NATAA H A 72 72 NATAA K A 73 73 NATAA V A 74 74 NATAA D A 75 75 NATAA I A 76 76 NATAA D A 77 77 NATRO C A 78 78 NATAA S A 79 79 NATAA Q A 80 80 NATAA K A 81 81 NATAA V A 82 82 NATAA V A 83 83 NATAA V A 84 84 NATAA Y A 85 85 NATAA D A 86 86 NATAA Q A 87 87 NATAA S A 88 88 NATAA S A 89 89 NATAA Q A 90 90 NATAA D A 91 91 NATAA V A 92 92 NATAA A A 93 93 NATAA S A 94 94 NATAA L A 95 95 NATAA S A 96 96 NATAA S A 97 97 NATAA D A 98 98 NATRO C A 99 99 NATAA F A 100 100 NATAA L A 101 101 NATAA T A 102 102 NATAA V A 103 103 NATAA L A 104 104 NATAA L A 105 105 NATAA G A 106 106 NATAA K A 107 107 NATAA L A 108 108 NATAA E A 109 109 NATAA K A 110 110 NATAA S A 111 111 NATAA F A 112 112 NATAA N A 113 113 NATAA S A 114 114 NATAA V A 115 115 NATAA H A 116 116 NATAA L A 117 117 NATAA L A 118 118 NATAA A A 119 119 NATAA G A 120 120 NATAA G A 121 121 NATAA F A 122 122 NATAA A A 123 123 NATAA E A 124 124 NATAA F A 125 125 NATAA S A 126 126 NATAA R A 127 127 NATRO C A 128 128 NATAA F A 129 129 NATRO P A 130 130 NATAA G A 131 131 NATAA L A 132 132 NATRO C A 133 133 NATAA E A 134 134 NATAA G A 135 135 NATAA K A 136 136 NATAA S A 137 137 NATAA T A 138 138 NATAA L A 139 139 NATAA V A 140 140 NATRO P A 141 141 NATAA T A 142 142 NATRO C A 143 143 NATAA I A 144 144 NATAA S A 145 145 NATAA Q A 146 146 NATRO P A 147 147 NATAA A A 148 148 NATAA H A 149 149 NATAA H A 150 150 NATAA H A 151 151 NATAA H A 152 152 NATAA H A 153 153 NATAA H