# TARGET T0387 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0387.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2612 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.025 0.001 0.004 0.008 0.023 0.065 0.013 0.862 2 M 0.013 0.001 0.008 0.008 0.027 0.097 0.013 0.832 3 K 0.041 0.002 0.039 0.100 0.190 0.127 0.045 0.457 4 P 0.004 0.001 0.037 0.063 0.123 0.063 0.024 0.686 5 K 0.001 0.001 0.185 0.236 0.415 0.025 0.015 0.123 6 L 0.001 0.001 0.148 0.244 0.392 0.016 0.026 0.172 7 C 0.003 0.001 0.191 0.444 0.231 0.012 0.017 0.101 8 R 0.003 0.001 0.212 0.325 0.343 0.014 0.019 0.082 9 L 0.023 0.002 0.073 0.324 0.262 0.038 0.032 0.247 10 A 0.032 0.002 0.077 0.216 0.240 0.060 0.081 0.292 11 K 0.039 0.001 0.018 0.043 0.058 0.087 0.024 0.730 12 G 0.489 0.002 0.006 0.018 0.025 0.051 0.033 0.376 13 E 0.036 0.001 0.007 0.009 0.014 0.096 0.019 0.819 14 N 0.028 0.001 0.029 0.014 0.079 0.186 0.016 0.646 15 G 0.017 0.001 0.037 0.051 0.100 0.101 0.061 0.632 16 Y 0.003 0.001 0.147 0.190 0.199 0.093 0.028 0.340 17 G 0.002 0.001 0.276 0.121 0.350 0.031 0.051 0.169 18 F 0.002 0.001 0.218 0.325 0.254 0.022 0.035 0.143 19 H 0.004 0.001 0.559 0.186 0.176 0.011 0.023 0.040 20 L 0.019 0.002 0.174 0.213 0.264 0.044 0.059 0.224 21 N 0.012 0.002 0.284 0.149 0.193 0.055 0.053 0.251 22 A 0.083 0.002 0.075 0.069 0.114 0.099 0.035 0.522 23 I 0.191 0.003 0.028 0.047 0.051 0.107 0.062 0.511 24 R 0.007 0.001 0.015 0.017 0.036 0.122 0.016 0.786 25 G 0.027 0.002 0.012 0.008 0.023 0.091 0.028 0.810 26 L 0.188 0.012 0.016 0.060 0.031 0.127 0.098 0.468 27 P 0.020 0.015 0.031 0.024 0.051 0.130 0.025 0.703 28 G 0.009 0.012 0.086 0.058 0.290 0.079 0.045 0.420 29 S 0.004 0.008 0.141 0.248 0.368 0.033 0.052 0.145 30 F 0.011 0.019 0.151 0.290 0.328 0.026 0.048 0.128 31 I 0.010 0.021 0.179 0.269 0.309 0.027 0.036 0.148 32 K 0.028 0.028 0.159 0.195 0.244 0.051 0.065 0.229 33 E 0.026 0.010 0.244 0.155 0.168 0.061 0.084 0.252 34 V 0.122 0.009 0.045 0.068 0.083 0.079 0.025 0.569 35 Q 0.710 0.008 0.016 0.017 0.017 0.038 0.030 0.165 36 K 0.010 0.012 0.003 0.005 0.012 0.101 0.003 0.854 37 G 0.003 0.016 0.002 0.001 0.003 0.032 0.002 0.940 38 G 0.129 0.633 0.009 0.030 0.008 0.033 0.030 0.127 39 P 0.322 0.508 0.022 0.009 0.007 0.026 0.031 0.076 40 A 0.539 0.072 0.064 0.015 0.014 0.027 0.079 0.190 41 D 0.724 0.021 0.009 0.005 0.006 0.029 0.026 0.179 42 L 0.094 0.005 0.003 0.002 0.004 0.042 0.017 0.834 43 A 0.007 0.003 0.010 0.009 0.021 0.106 0.010 0.834 44 G 0.014 0.005 0.014 0.013 0.030 0.101 0.042 0.781 45 L 0.040 0.007 0.025 0.032 0.018 0.164 0.033 0.680 46 E 0.326 0.023 0.034 0.013 0.017 0.091 0.063 0.432 47 D 0.179 0.056 0.010 0.007 0.011 0.084 0.041 0.612 48 E 0.024 0.035 0.051 0.015 0.072 0.158 0.079 0.566 49 D 0.009 0.022 0.071 0.088 0.247 0.088 0.113 0.361 50 V 0.004 0.007 0.127 0.353 0.355 0.027 0.035 0.092 51 I 0.005 0.005 0.122 0.222 0.353 0.038 0.055 0.200 52 I 0.002 0.001 0.161 0.363 0.362 0.018 0.037 0.056 53 E 0.035 0.002 0.099 0.182 0.318 0.056 0.034 0.275 54 V 0.353 0.004 0.033 0.119 0.085 0.072 0.088 0.245 55 N 0.020 0.004 0.016 0.023 0.064 0.138 0.011 0.723 56 G 0.014 0.003 0.015 0.010 0.045 0.089 0.015 0.810 57 V 0.023 0.006 0.058 0.180 0.117 0.123 0.085 0.410 58 N 0.134 0.011 0.056 0.067 0.084 0.104 0.057 0.488 59 V 0.258 0.007 0.037 0.060 0.052 0.075 0.060 0.451 60 L 0.016 0.007 0.023 0.013 0.025 0.097 0.021 0.798 61 D 0.026 0.033 0.008 0.007 0.018 0.079 0.018 0.812 62 E 0.029 0.135 0.015 0.038 0.022 0.128 0.038 0.596 63 P 0.025 0.881 0.002 0.003 0.003 0.011 0.016 0.059 64 Y 0.015 0.968 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.007 65 E 0.003 0.951 0.003 0.003 0.002 0.003 0.019 0.015 66 K 0.003 0.958 0.002 0.002 0.002 0.002 0.021 0.009 67 V 0.006 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.002 68 V 0.016 0.935 0.004 0.001 0.001 0.002 0.034 0.007 69 D 0.030 0.552 0.012 0.016 0.010 0.012 0.246 0.122 70 R 0.030 0.057 0.015 0.008 0.008 0.026 0.774 0.083 71 I 0.105 0.033 0.038 0.041 0.019 0.043 0.522 0.200 72 Q 0.388 0.004 0.006 0.005 0.011 0.037 0.029 0.521 73 S 0.066 0.001 0.001 0.001 0.001 0.029 0.012 0.890 74 S 0.033 0.001 0.009 0.005 0.013 0.162 0.014 0.764 75 G 0.006 0.001 0.018 0.004 0.020 0.119 0.016 0.818 76 K 0.004 0.001 0.149 0.104 0.186 0.123 0.028 0.406 77 N 0.001 0.001 0.348 0.100 0.188 0.026 0.033 0.304 78 V 0.001 0.001 0.273 0.384 0.237 0.011 0.012 0.083 79 T 0.001 0.001 0.463 0.226 0.262 0.004 0.013 0.031 80 L 0.001 0.001 0.237 0.356 0.322 0.006 0.012 0.066 81 L 0.001 0.001 0.306 0.353 0.302 0.005 0.007 0.025 82 V 0.006 0.001 0.128 0.342 0.337 0.021 0.022 0.142 83 C 0.014 0.004 0.130 0.247 0.277 0.045 0.033 0.250 84 G 0.069 0.006 0.042 0.112 0.151 0.075 0.054 0.492 85 K 0.129 0.007 0.018 0.041 0.045 0.094 0.053 0.614 86 K 0.069 0.004 0.014 0.033 0.045 0.092 0.048 0.694 87 A 0.055 0.005 0.010 0.020 0.037 0.122 0.044 0.706 88 Q 0.022 0.004 0.012 0.028 0.048 0.123 0.024 0.739 89 D 0.023 0.003 0.010 0.019 0.028 0.094 0.023 0.801 90 T 0.130 0.026 0.016 0.037 0.043 0.113 0.088 0.545 91 V 0.064 0.023 0.020 0.028 0.043 0.117 0.043 0.660