This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA T A 3 3 NATAA S A 4 4 NATAA S A 5 5 NATAA E A 6 6 NATRO P A 7 7 NATAA A A 8 8 NATAA H A 9 9 NATAA G A 10 10 NATAA A A 11 11 NATAA T A 12 12 NATRO P A 13 13 NATAA K A 14 14 NATAA R A 15 15 NATAA S A 16 16 NATRO P A 17 17 NATAA S A 18 18 NATAA E A 19 19 NATAA G A 20 20 NATAA S A 21 21 NATAA A A 22 22 NATAA D A 23 23 NATAA N A 24 24 NATAA A A 25 25 NATAA A A 26 26 NATAA L A 27 27 NATRO C A 28 28 NATAA D A 29 29 NATAA A A 30 30 NATAA L A 31 31 NATAA A A 32 32 NATAA V A 33 33 NATAA E A 34 34 NATAA H A 35 35 NATAA A A 36 36 NATAA T A 37 37 NATAA I A 38 38 NATAA Y A 39 39 NATAA G A 40 40 NATAA Y A 41 41 NATAA G A 42 42 NATAA I A 43 43 NATAA V A 44 44 NATAA S A 45 45 NATAA A A 46 46 NATAA L A 47 47 NATAA S A 48 48 NATRO P A 49 49 NATRO P A 50 50 NATAA G A 51 51 NATAA V A 52 52 NATAA N A 53 53 NATAA F A 54 54 NATAA L A 55 55 NATAA V A 56 56 NATAA A A 57 57 NATAA D A 58 58 NATAA A A 59 59 NATAA L A 60 60 NATAA K A 61 61 NATAA Q A 62 62 NATAA H A 63 63 NATAA R A 64 64 NATAA H A 65 65 NATAA R A 66 66 NATAA R A 67 67 NATAA D A 68 68 NATAA D A 69 69 NATAA V A 70 70 NATAA I A 71 71 NATAA V A 72 72 NATAA M A 73 73 NATAA L A 74 74 NATAA S A 75 75 NATAA A A 76 76 NATAA R A 77 77 NATAA G A 78 78 NATAA V A 79 79 NATAA T A 80 80 NATAA A A 81 81 NATRO P A 82 82 NATAA I A 83 83 NATAA A A 84 84 NATAA A A 85 85 NATAA A A 86 86 NATAA G A 87 87 NATAA Y A 88 88 NATAA Q A 89 89 NATAA L A 90 90 NATRO P A 91 91 NATAA M A 92 92 NATAA Q A 93 93 NATAA V A 94 94 NATAA S A 95 95 NATAA S A 96 96 NATAA A A 97 97 NATAA A A 98 98 NATAA D A 99 99 NATAA A A 100 100 NATAA A A 101 101 NATAA R A 102 102 NATAA L A 103 103 NATAA A A 104 104 NATAA V A 105 105 NATAA R A 106 106 NATAA M A 107 107 NATAA E A 108 108 NATAA N A 109 109 NATAA D A 110 110 NATAA G A 111 111 NATAA A A 112 112 NATAA T A 113 113 NATAA A A 114 114 NATAA W A 115 115 NATAA R A 116 116 NATAA A A 117 117 NATAA V A 118 118 NATAA V A 119 119 NATAA E A 120 120 NATAA H A 121 121 NATAA A A 122 122 NATAA E A 123 123 NATAA T A 124 124 NATAA A A 125 125 NATAA D A 126 126 NATAA D A 127 127 NATAA R A 128 128 NATAA V A 129 129 NATAA F A 130 130 NATAA A A 131 131 NATAA S A 132 132 NATAA T A 133 133 NATAA A A 134 134 NATAA L A 135 135 NATAA T A 136 136 NATAA E A 137 137 NATAA S A 138 138 NATAA A A 139 139 NATAA V A 140 140 NATAA M A 141 141 NATAA A A 142 142 NATAA T A 143 143 NATAA R A 144 144 NATAA W A 145 145 NATAA N A 146 146 NATAA R A 147 147 NATAA V A 148 148 NATAA L A 149 149 NATAA G A 150 150 NATAA A A 151 151 NATAA W A 152 152 NATRO P A 153 153 NATAA I A 154 154 NATAA T A 155 155 NATAA A A 156 156 NATAA A A 157 157 NATAA F A 158 158 NATRO P A 159 159 NATAA G A 160 160 NATAA G A 161 161 NATAA D A 162 162 NATAA E