Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 50 | | | | | 1 MLSANQIKFLRSLRERKYRLREQAFAVEGPKLVGEML.PFY.....RCRMLVGTA.....AML.. 2 --QNPIIKEVKSLKQKKYREEKKLFFIEGIRFVEEAL.KEG.....VQIERILVS.....DKLae 3 -VKNPRVKQWKKLQTKKERDKKGLFFVEGFHLVEEAL.KAD.....IVTELIVSD.....QTD.. 4 -VQNPRVKQWKKLQTKKERDKKGLFFVEGFHLVEEAL.KTG.....IVTELIVSD.....QTD.. 5 -VQNPRVKQWKKLQTKKERDKKGLFFVEGFHLVEEAL.KAG.....VVTELIVSD.....QTD.. 6 -VQNPRVKQWKKLQTKKERDKKGLFFVEGFHLVEEAL.KVG.....VVTELIVSD.....QTD.. 7 -VQNPRVKQWKKLQTKKERDKKGLFFVEGFHLVEEAL.KAG.....VVTELIVSD.....QTD.. 8 -VQNPRVKQWKKLQTKKERDKKGLFFVEGFHLVEEAL.KAG.....VVTELIVSD.....QTD.. 9 -----------------RDGAKDLDRIEGRNSVLEAI.KAG.....RTINKILVPkg7gsIRQ.. 10 -------------------------IIEALRSGRPMN.KIW.....IGEGSQKGQ.....MQK.. 11 -VQNPRVKQWKKLQTKKERDNKALFFVEGFHLVEEAL.KAG.....VVTELIVSD.....QTD.. 12 --NNPQIKQWRKLLAKKERDKTGMFLAEGYHLAEEAL.KGE.....KAIELIISE.....NAE.. 13 ----------------------------GRNAVVEAL.ESH.....KTLESILISkg7gtINK.. 14 -------------------------LIEGRNAVIEAL.KSD.....STIEQVLVSsg7gsINV.. 15 -KENSIIKEVKKLNEKKHRDLKKSFIVEGLRFVREAL.ESD.....FKIQYLFVS.....EKN.. 16 -------------------------------EPERFI.EAY.....VLKGRQDDR.....LMP.. 17 ------------------------------------L.EVF.....ILKGRDDRR.....LQP.. 18 -------------------------------------.--F.....ILKGREDKR.....LLP.. 19 -------------------------------------.---.....ILKGREDKR.....LLP.. 20 -------------------------------EPERFI.EAY.....VLKGRQDDR.....LMP.. 21 ----------------------------------RFI.EIY.....ALKGREDKR.....LNP.. 22 -------------------------------------.---.....ILKGREDKR.....LLP.. 23 -LQNSLVKQIRQLHQSKGRQEQQLFLVEGTHLLEEAC.KRN.....YPLITVCHT.....FEWqe 24 -------------------------------------.---.....--------R.....STP.. 25 -------------------------------EPERFI.EAY.....VLKGRQDDR.....LMP.. 26 -------------------------------------.---.....ILKGREDKR.....LLP.. 27 -RQNPLTKQIRQLHQAKGRRQMGAFLLEGTHLLQEAI.ATN.....WPLLQVCAT.....PAW.. 28 --------------------------LSGIHPVVEAL.RAG.....NPLERIVIAqg7prLQE.. 29 -------------------------------------.---.....--KGREDKR.....LLP.. 30 -------------------------------PVMEAL.KSG.....REIDKILIAkg7gsLIK.. 31 ---------------------------------ERFI.EAY.....VLKGRQDDR.....LMP.. 32 -------------------------------------.---.....----RQDAK.....MQR.. 33 ------------------------------HSPERII.ELW.....LLQGREDER.....LTP.. 34 -------------------------VIEAIKSDREID.KIL.....IANSAKEGS.....IKK.. 35 ------------------------------------I.EVY.....VLKGREDRR.....LTP.. 36 ------------------------------HSPERII.ELW.....LLQGREDER.....LTP.. 37 -------------------------------------.---.....ILKGREDKR.....LLP.. 38 -------------------------------------.---.....--------R.....LLP.. 39 --------------------------IYGRNPVIEAI.RSG.....KEIEKIYVSkt6gnISK.. 40 -------------------------------------.---.....--------R.....LLP.. 41 ---------------------------------ERFI.EVY.....ALKGREDER.....LNN.. 42 ----------------------------------RFL.DVY.....LLKGRDDRR.....LQP.. 43 ------------------------------HSPERII.ELW.....LLQGREDER.....LTP.. 44 ----------------------------------SID.EIY.....FEANRRDRR.....MQD.. 45 -------------------------------------.---.....-------RR.....MQD.. 46 -------------------------------------.---.....-LKGRDDKP.....INS.. 47 -------------------------------------.EIW.....LLKGREDDR.....IMP.. 48 -------------------------------------.EIY.....FEANRRDRR.....MQD.. 49 -----------------------------------FL.EVF.....ILKGRDDRR.....LQP.. 50 -------------------------------------.---.....--------R.....VEE.. 51 -------------------------------------.---.....-------KR.....VKS.. 52 -------------------------------------.---.....-------RR.....MQD.. 53 --DNSFIKKIKKLKDKKGRYEEKLFFVEGLNSVKEAL.DSD.....FKVEYVVVG.....ED-.. 54 --------------------IGKNAVIETLKSGRELY.KLW.....MAENTVKGQ.....AQQ.. 55 -------------------------------------.--Y.....IQEGKSDAR.....TRE.. 56 -------------------------------PVREAL.RAG.....RPINKVVMAkg7gpLAE.. 57 -------------------------------------.---.....-----SDAR.....TRE.. 58 -------------------------------------.---.....--------R.....LLP.. 59 -------------------------------------.---.....-----SDAR.....TRE.. 60 ----------------------------------RFQ.EVF.....ILKGREDKR.....LLP.. 61 ----QPKKQMKGDNRQEEFIVGKNPVIEAIKSGHPIH.KIW.....IGDQSQKGQ.....MTK.. 62 -------------------------------------.EAY.....VLKGRQDDR.....LLP.. 63 -------------------------------------.---.....---GRNDDR.....LTN.. 64 -KENNLFKNTKKLKERKNRTKTSRYIIEGFRLVQEAF.KAK.....VDVDYLIVTed6dkVDE.. 65 ---------------------------EALRGKRRAF.ELF.....VAPGGSDRR.....LEK.. 66 ---------------REDIVIGRNAVIEALRGERTIE.ALY.....ISNSKLEGS.....IKT.. 67 -------------------------------------.---.....----RDDRR.....LQP.. 68 -------------------------------------.---.....---------.....LLP.. 69 -------------------------------------.---.....-LKGRDDRR.....LQP.. 70 ---------------------------------ERVL.ELW.....LMTGRQDER.....VLP.. 71 ---------------------------------ERLI.EVF.....VLKGREDKR.....LQP.. 72 -------------------------------------.EAY.....VLKGRQDDR.....LLP.. 73 --KNELVKKWKKLHTKKGRDQSGQFLIEGYHLVEEAL.KST.....ITIETILVT.....ESV.. 74 -------------------------------------.---.....--------R.....LMP.. 75 ------------------------------HSPERII.ELW.....LLQGRDDER.....LTV.. 76 -KNNNLFKEIKKLKEKKHRIKSNKYLIEGLRFVEEAI.KSK.....VSIDSIIFT.....ESF.. 77 -------------------------------------.---.....---------.....LLP.. 78 -------------------------------------.---.....--KGRDDRR.....LQP.. 79 -------------------------------------.---.....---------.....-QA.. 80 -------------------------------------.---.....----RDDRR.....LQP.. 81 ---------------------------------ERLI.EVF.....VLKGREDKR.....LQP.. 82 -------------------------------------.---.....---------.....LER.. 83 ---------------------------------ERLI.EVF.....VLKGREDKR.....LQP.. 84 -------------------------------------.---.....--------S.....VRD.. 85 ------------------------------HSPERII.ELW.....LLQGRDDER.....LTV.. 86 ---------------------EGLDAVYGVHAVRALF.ERG.....QPPRELWIQeg7arLEA.. 87 --NNDLIKKIKKLKDKKGRYEEGMFFVEGTTNVLEAL.KSD.....FEIEYIVMG.....EGV.. 88 -------------------------------SPERLI.EVF.....VLKRREDKR.....LQP.. 89 ----------------------------------SLI.EIW.....LAGGRHDAR.....AKA.. 90 -------------------------------------.---.....--------R.....LMP.. 91 ----------------------------GLHAVRAAL.EQP.....ALQVMALWLdq8rsLQK.. 92 -IRNPLIKQIRKLHRTKGRREEGLLLLEGTHLVETAY.EAN.....CSLMTLCYT.....EQW.. 93 -------------------------------------.---.....---------.....--R.. 94 ---QIDPEQIRRQRSEETRVYGENACQALFLSRPEAI.VRG.....WFLQEVTPR.....FRE.. 95 -------------------------------------.---.....------DAS.....VAE.. 96 ---------------------------EGRNPVLEAL.RSG.....RTINRILVAkg7gsIRE.. 97 -------------------------------------.---.....------DPR.....VQR.. 98 ----------------------------------RLI.EVY.....VLKGREDKR.....LQS.. 99 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-------------------------LVYGLHAVTESL.RAN.....TGNKLYLQDdl6knVDK.. 114 -------------------------------------.---.....-------AR.....MRQ.. 115 --KNEKVKSWKKLHRRKERLKTNTFLIDGIHLIQEAL.KSN.....WVIQELIVV.....EGY.. 116 -------------------------------------.---.....-----DDKR.....LQP.. 117 -------------------------------------.---.....---------.....VEK.. 118 -------------------------------------.---.....-VRGRQDAR.....VQK.. 119 -------------------------------------.---.....---------.....VEK.. 120 --KNEIVKQWKKLLTKKGRLQTKRFLIEGEHLVEEAV.RAG.....IIKELIVRE.....DVQ.. 121 -LSNPIIKDLKALNKKKKRNQEGLFMAEGLKLVIDAL.NLG.....WTIQTLIFSks8ttIEN.. 122 --QNPLVKQLRQLHQTKGRKQQGQLLLEGTHLLEVAL.AQG.....KGFNHGCFT.....AMWqe 123 ------------------------DLVYGLHAVTESL.RAN.....TGNKLYLQDdl6knVDK.. 124 --------------------------IYGLHAVTEAL.NGD.....LVNKLYVQEdl6knVEK.. 125 -------------------------------------.---.....---------.....VDN.. 126 -------------------------------------.---.....---------.....MQD.. 127 --------------------------IYGLHAVTEAL.NGD.....LVNKLYVQEdl6knVEK.. 128 -------------------------------------.---.....---------.....VDN.. 129 -------------------------------------.---.....---------.....VDN.. 130 -------------------------------------.--W.....LLQGRDDER.....LTP.. 131 -------------------------------------.-LY.....LSAQRTDAR.....AKD.. 132 --------------------------IVGRHAVKEAI.VSG.....HTINKILIQdt7gqINE.. 133 -------------------------------------.---.....---------.....ARE.. 134 -------------------VYGHHASVESLKSTQEIN.KVW.....LQTGLQDKI.....RNE.. 135 -------------------------------------.---.....---------.....MQD.. 136 -------------------------------------.---.....---------.....ARE.. 137 -------------------------------------.---.....---------.....VDN.. 138 -------------------------------------.---.....---------.....VDN.. 139 -LQNSLVKQIRKLHSTKERHKQQLFLLEGTHLLEEAC.AVN.....YPLETVCCT.....SDWqa 140 --KNPWIRKLRQLHRSKGRREQGAFLVEGSHLIEEAL.RVG.....WPLQALCYT.....PDW.. 141 -------------------------------------.---.....------DAR.....MKD.. 142 ------PAQLRRQRAEETRVYGENACKALFESRPDAI.VRA.....WFVQSVTPR.....FRE.. 143 -------------------------LVEGRNAVIELL.KSD.....KTIEQIFIAng7gsINK.. 144 -------------------------------------.---.....---------.....VDN.. 145 -------------------------------------.VWV.....LPRLRYSPQ.....FWS.. 146 -------------------------------------.---.....---------.....MQE.. 147 -----------------------------QNQRGLNR.IWV.....TPRLRYDPR.....FHN.. 148 -------------------------------------.---.....---------.....MQD.. 149 ------------------------DLVYGLHAVTESL.RAN.....TGNKLYLQDdl6knVDK.. 150 -------------------------VIEALKAGRDIN.KIW.....IAEGAQRHT.....VEP.. 151 -------------------------------------.---.....---------.....MQD.. 152 ---NAVLKHIKGLSLRKNRIKHQQFTIEGLRIVEECF.LHG.....GPIDHILYC.....DHI.. 153 -------------------------------------.---.....---------.....-QA.. 154 ---------------------------------ESIK.EIY.....VEASRRDKR.....MQT.. 155 -------------------VYGRNAVLELLQNKPDTIeKIY.....FQFNTSHPK.....LKE.. 156 -------------------------------------.---.....---------.....MTE.. 157 --------------------------IVGRHAVKEAI.VSG.....HTINKIWIQ.....EGIrk 158 ------------------------FLLEGTHLLQEAI.ATN.....WPLLQVCAT.....PAW.. 159 -------------------------------------.---.....--------R.....MQD.. 160 -------------------------------------.---.....---------.....VHD.. 161 ---QIDPEQLRRQRMEETRIYGENACQAMFKNRSEAI.VRA.....WFVESVTPR.....FRN.. 162 -----------------------------------II.EIY.....FEPTRRDAR.....MRQ.. 163 -------------------------------------.---.....---------.....-TE.. 164 --KNARVKQWKKLLTKKGRDETGLFLLEGFHLVEEAI.KSN.....APLVELIVD.....ERT.. 165 -------------------------------------.---.....---------.....---.. 166 ---------------------------EALKGQRRVY.KIY.....AQRERQDKR.....LEE.. 167 ----IDPEVLRRQRAEETRVYGENACQALFQSRPEAI.VRA.....WFIQSVTPR.....FKE.. 168 -------------------------------------.---.....---------.....-QD.. 169 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-LSNPIIKDLKALSQKKNRNREGLFMAEGLKLVIDAL.NLG.....WKIQTLIFSks8taIEN.. 226 -------------------------------------.---.....---------.....-TE.. 227 -------------------------------------.---.....---------.....---.. 228 ---NQLIKQTKKLLQKKHRKQS--YLIEGWHLFEEAQ.KSG.....QVFRHIFVL.....EEM.. 229 -------------------------------------.---.....---------.....LQS.. 230 ---NPTIKALRALRQRKARDEQGRYLIEGIRPVAEAI.QCG.....APLDMLVVApe8sfAHE.. 231 ----------------------------GKNPVKEAL.NSS.....TQITEVYISnt7ksISE.. 232 -------------------------------------.---.....---------.....IQH.. 233 ---------------------------YGRNPVLEAL.RDG.....RVTEVLVARgv...EEA.. 234 --KNQKVKDWKKLHTKKERTKTNTFLIEGEHLVEEAL.KSP.....GIVKEILVK.....DET.. 235 --------------------EEDEDLIYGRHTVQAAL.KSE.....RYLNRIWIIss8prFHI.. 236 -------------------YGRHPVLSALQKQRNLNR.IWI.....TTRLRYDPS.....FHH.. 237 ---------------------------ALQNSRPLNR.VWL.....TEKLRYDPR.....FLR.. 238 --KNNQLKEWKKLHKKKYREELNQYIIEGFHLVEEAV.KAN.....ADVQWILFNqrgq.QEW.. 239 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--SANQIKFLRSLRERKYRLREQAFAVEGPKLVGEML.PFY.....RCRMLVGTA.....AML.. 254 -------------------------------------.---.....-------PR.....LET.. 255 --KNERIKAWKKLHSKKGRDQTGRFLIEGEHLVEEAW.KSD.....WKVETVLTT.....ADD.. 256 -------------------------------------.---.....---------.....---.. 257 -------------------------------------.---.....---------.....---.. 258 ------------------------------NAVLEAF.RAG.....KTIDRLFILdg7gpIKS.. 259 -------------------------------------.---.....---RRNDQR.....FQC.. 260 --------------------------IVGRHAVKEAI.ISG.....HAINKILIQdg7qqIND.. 261 --------------------------IYGRHSVLAAL.ESD.....RQLNRIWITnr8prFHN.. 262 -PNNRYVKLARSLQDRSWREKKGLYLIEGIHLLEEAL.QAG.....TSLEVVLHS.....PRIft 263 -------------------------------------.---.....---GRHDPR.....VQV.. 264 -------------------------------------.---.....----RSDPR.....VQV.. 265 ---NQLIKQTKKLLQKKHRKQS--YLIEGWHLFEEAQ.KSG.....QVFRHIFVL.....EEM.. 266 ---------------------------VGRHAVREAI.ITG.....HPINKILIQeg7qqINE.. 267 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-----------------------------------IN.KVF.....VQEGLKADA.....IQE.. 296 -LQNPVIKQLRKLHAAKERQAQGLFLVEGTHPVAAAL.AGG.....WELEFVCAT.....EAW.. 297 -------------------------------------.---.....---------.....-RD.. 298 -LSNPIIKDLKALSQKKNRNREGLFMAEGLKLVIDAL.NLE.....WTIQTLIFSks8taIEN.. 299 -------------------------LARLRHDPAGVL.EIY.....LDLTRRDAR.....ARD.. 300 -----IRHLHRLLSQGKFRRQYAQTVLEGVHLLQVFL.QSG.....RKPVGVYIPea6psEEV.. 301 -------------------------------------.---.....-------PR.....IQA.. 302 ------------------------------NPVMEAL.KSG.....RSVNKVMVTeq7stFQK.. 303 -------------------------------------.---.....---------.....---.. 304 --------------RRPARKTDETELVLGRNPVVECL.RAE.....VPATALYVAmg8erVTE.. 305 --------------------GRNAVLELLQHKPESIE.KIY.....FQFNTSHPK.....LKE.. 306 ---NPIIKDIKALTQKKGREETGTFMAEGLKLVIDAL.ELG.....WTIKTLVYAka8plVEQ.. 307 -------------------------------------.---.....---------.....---.. 308 -------------------------------------.---.....--RIKEIRFqe8kkIKR.. 309 -------------------------------------.---.....---------.....-RD.. 310 --QNNAVKELRAAFHTGRPTDDGYSAVEGVHLLEEAI.RSG.....LRFKTIFFS.....QAA.. 311 ---NPIIKDIKALTNKKSREESGTFLAEGLKLVIDAI.ELG.....WTIRTLVYAka8plVEQ.. 312 -------------------------LVWGIHPVTELL.RRR.....PGLVRELYLaggrdDGR.. 313 ---NPIVKDLRSLALKKFRDQQGVFLAEGLKLVIDAL.EQD.....WRIKTLVFAks8ktVEQ.. 314 ---NPIIKDIKALTQKKGREETGTFMAEGLKLVIDAL.ELG.....WTIKTLVYAka8plVEQ.. 315 -----------------------AVLELLQQKPESIE.KIY.....FQFNTSHPK.....LKE.. 316 -LQNPQVKRLVRLRTRRERERDGVMLIEGARELMRAE.SAG.....VTVPELFVC.....PEL.. 317 ---QIDPEQLRRQRAEETRVYGENACQALFRNRPDAI.VRA.....WFEQSVTPR.....FRD.. 318 -------------KQNFVFESESNDIFWGRHSTQAIL.ESG.....RAIHRIWCTse8prFFQ.. 319 -------------------------------------.---.....--------R.....LEE.. 320 ---NPIVKDLRSLALKKFRDQQGVFLAEGLKLVIDAL.EQD.....WRIKTLVFAks8ktVEQ.. 321 --KNSKVKEWVKLKTNNGRKKFKKFLLEGRHPVETAL.EQA.....TEYEFLIVQ.....EDF.. 322 --SNPLIKRVRSLRDKKHRREEGLFLAEGLRILTEAR.EAG.....FIPVYIFFAad8plVQQ.. 323 -------------------------LVWGIHPVTELL.RRR.....PGLVRKLYLaggrdDGR.. 324 -KENKLIKSLKKLKQKKYRESENKFLAEGYKFLDYNY.SPE.....IIIIREDIYq....SNF.. 325 ------------------------------NPVLEAL.PAG.....RVAEVVLARgv6afARQ.. 326 -------------------------------------.---.....---------.....-RD.. 327 -------------------------------------.---.....---------.....-QA.. 328 -------------------------------------.DAA.....PQRIVKLYVqe8qrLQS.. 329 --QNAHVKAWKKLQTKKGRKQQGQYLLDGWHLVNEAV.KAH.....VAIQTLLIT.....AKQ.. 330 -------------------------------------.---.....-QRIVKLYVqe8qrLQS.. 331 -------------------------------------.---.....---------.....--E.. 332 ----------------------------GRHATQAAL.EAG.....RPIHRIWCTae8skFLQ.. 333 -------------------------------------.---.....---------.....VQS.. 334 ---NPKVKQILHLRDRPERDISQTFLIEGYRELLRAA.DAD.....WEVNLLFICpa8mnEPT.. 335 ------------TDETETVLGRNPVLECLRAGVPATA.LYV.....ALGTEVDKR.....LTE.. 336 -------------------KTDDTEIVLGRNPVLECL.RAG.....VPATALYVAlg8erLTE.. 337 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-----------------------CYYMYGKHPVFSAL.NNP.....KRQIDNILC.....TRE.. 534 ---NSKIKNANKLKKKRDRDKTGQALIEGIHLIEEAY.QSG.....IAIKQLFVI.....EPN.. 535 -----------------------NMIIYGKNPIKEAI.KAQ.....RKIYQLYLD.....EKIkd 536 -------------------------WVIGRNPVLEAL.HVG.....LPVRTAYVAeg8srLRE.. 537 ----------GFRRDPRERDGDGPVILYGWHTVTAAL.ANP.....QRKFRKLWL.....TEN.. 538 ----------------------------GKNSTLDAI.ESK.....LNLKRIYLS.....KKE.. 539 --DKRLSKVVTIAKSKKFRDRHGQVLLEGRRLLTDAL.ESG.....AVLQTLFFS.....RVD.. 540 ----------RKPWRDRGERPEGPAILYGWHTVVAAL.ANP.....QRRIRSLFL.....TEN.. 541 -------------------------------------.---.....---------.....---.. 542 -----------KLHRAAQRKKDKRFLVEGENSVEAAV.ATG.....AATDLFVTEsaaerFEE.. 543 ------------LQRKKYRDQEEMFLGEGLRTVRELL.LHL.....PGPDSLVALflspdAEA.. 544 ----------RQPWRDRESRPDGPAILYGWHTVVAAL.GNP.....QRTIRKLLL.....SEN.. 545 ---EEIIHFYRLIHDKKYREANKLFIIEGFKLLDEAL.QNQ.....QTIVSIIINeh7keFET.. 546 ---------------------------EGWHLFEEAV.QAG.....VTIEKIFTL.....ENY.. 547 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-----LGKVVTIAKSRSFRDRHGKVLLEGLRLIRDAL.QAG.....AAPRALFFS.....TAE.. 576 -----------------RSRKGPVFLLEGFREIQKAL.ASG.....YECERIFCGtr6ekEQA.. 577 ----------KKAATQDRRIRFSEDLIWGIHPIVEAL.KYE.....PNRISEIIAqk8akFDE.. 578 ---RRLSSVMTIVKSRPFREKQGKILLEGRRLISDAL.KAG.....AVPKMFFFS.....RLE.. 579 ---RRLSSVMTIVKSRPFREKQGKILLEGRRLISDAL.KAG.....AVPKMFFFS.....RLE.. 580 ----------------------DVALLYGWHTVAEAI.GNP.....KRRFRRLRA.....TEN.. 581 ------------------------------------L.ESG.....RPVHRIWCTae8pkFLQ.. 582 ---RRLSSVMTIVKSRPFREKQGKILLEGRRLISDAL.KAG.....AVPKMFFFS.....RLE.. 583 ----AALRRYAALHHKKHRDSDKLFLAEGLRTVRELC.QQL.....PHEDFLVALll6haEAE.. 584 ---------ARRLKRPAARREQGRFLVEGVQAVGAAL.AVG.....ELLEVFVGVsa...TPR.. 585 ---RRLSSVMTIVKSRPFREKQGKILLEGRRLISDAL.KAG.....AVPKMFFFS.....RLE.. 586 -----------------GRATPGHVRLWGRHAVEAAL.LNP.....ARVHRKLWA.....TRE.. 587 -ISKNQLKLIRQLGQKKYRKQFNQYLVQGEKNVLELL.NSP.....LKAVDIFAT.....EAF.. 588 --SNPTVKFVRSLREKKHRRRERKFLAEGLRLLTDAR.EGG.....RLPEILLMAeg8plLDE.. 589 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