# TARGET T0377 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0377.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 58 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.072 0.003 0.003 0.002 0.106 0.814 2 A 0.397 0.011 0.003 0.002 0.054 0.533 3 M 0.781 0.003 0.001 0.001 0.023 0.191 4 L 0.974 0.002 0.001 0.001 0.004 0.019 5 Y 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 6 L 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 7 I 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 8 F 0.988 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 9 Y 0.957 0.002 0.001 0.001 0.011 0.030 10 D 0.725 0.008 0.003 0.001 0.134 0.128 11 I 0.226 0.031 0.015 0.010 0.473 0.245 12 T 0.038 0.007 0.022 0.016 0.703 0.213 13 D 0.011 0.008 0.025 0.054 0.728 0.176 14 D 0.006 0.003 0.039 0.321 0.470 0.161 15 N 0.003 0.003 0.031 0.734 0.158 0.071 16 L 0.002 0.002 0.017 0.890 0.050 0.040 17 R 0.001 0.001 0.004 0.969 0.013 0.013 18 N 0.001 0.001 0.002 0.980 0.009 0.007 19 R 0.001 0.001 0.002 0.990 0.003 0.004 20 V 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.002 21 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 22 E 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 23 F 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 24 L 0.001 0.001 0.002 0.989 0.006 0.002 25 K 0.001 0.001 0.008 0.966 0.018 0.006 26 K 0.001 0.001 0.010 0.888 0.060 0.041 27 K 0.002 0.001 0.007 0.658 0.106 0.226 28 G 0.008 0.003 0.002 0.039 0.115 0.834 29 L 0.095 0.019 0.006 0.027 0.169 0.684 30 D 0.456 0.008 0.016 0.029 0.158 0.332 31 R 0.771 0.005 0.012 0.010 0.068 0.135 32 I 0.941 0.005 0.002 0.003 0.013 0.036 33 Q 0.937 0.011 0.002 0.003 0.017 0.029 34 Y 0.819 0.002 0.003 0.006 0.051 0.118 35 S 0.808 0.002 0.008 0.005 0.065 0.111 36 V 0.885 0.005 0.005 0.005 0.043 0.056 37 F 0.927 0.003 0.004 0.006 0.020 0.039 38 M 0.931 0.003 0.004 0.004 0.017 0.041 39 G 0.925 0.003 0.002 0.002 0.020 0.048 40 D 0.836 0.007 0.002 0.003 0.045 0.107 41 L 0.327 0.028 0.001 0.002 0.143 0.498 42 N 0.043 0.006 0.001 0.007 0.127 0.817 43 S 0.002 0.001 0.036 0.854 0.074 0.034 44 S 0.001 0.001 0.025 0.928 0.040 0.007 45 R 0.001 0.001 0.024 0.953 0.019 0.003 46 L 0.001 0.001 0.002 0.993 0.002 0.003 47 K 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 48 D 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 49 V 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 50 E 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 51 A 0.001 0.001 0.001 0.991 0.004 0.003 52 G 0.001 0.001 0.001 0.977 0.007 0.013 53 L 0.004 0.002 0.003 0.957 0.012 0.022 54 K 0.005 0.002 0.009 0.880 0.042 0.063 55 I 0.003 0.001 0.016 0.842 0.043 0.094 56 I 0.008 0.003 0.026 0.745 0.088 0.129 57 G 0.010 0.003 0.044 0.674 0.154 0.115 58 N 0.017 0.005 0.057 0.467 0.259 0.196 59 R 0.014 0.004 0.074 0.383 0.272 0.251 60 K 0.026 0.015 0.093 0.297 0.243 0.326 61 K 0.027 0.009 0.093 0.234 0.235 0.402 62 L 0.040 0.019 0.100 0.188 0.249 0.404 63 Q 0.043 0.026 0.043 0.109 0.264 0.515 64 E 0.026 0.014 0.042 0.056 0.398 0.464 65 D 0.017 0.011 0.111 0.082 0.564 0.215 66 E 0.023 0.018 0.180 0.040 0.587 0.151 67 R 0.045 0.007 0.110 0.011 0.673 0.154 68 F 0.166 0.002 0.024 0.007 0.433 0.368 69 F 0.807 0.011 0.003 0.002 0.060 0.118 70 I 0.954 0.006 0.001 0.001 0.010 0.029 71 L 0.967 0.001 0.001 0.001 0.006 0.026 72 I 0.974 0.001 0.001 0.001 0.004 0.020 73 V 0.919 0.001 0.001 0.001 0.016 0.062 74 P 0.746 0.005 0.001 0.001 0.063 0.184 75 I 0.307 0.017 0.002 0.001 0.135 0.538 76 T 0.094 0.014 0.005 0.006 0.300 0.581 77 E 0.014 0.002 0.156 0.213 0.503 0.113 78 N 0.021 0.003 0.214 0.261 0.444 0.056 79 Q 0.049 0.006 0.189 0.357 0.352 0.048 80 F 0.127 0.009 0.105 0.419 0.230 0.110 81 R 0.204 0.006 0.052 0.436 0.179 0.123 82 E 0.309 0.006 0.038 0.393 0.138 0.115 83 R 0.547 0.009 0.016 0.259 0.077 0.093 84 I 0.579 0.010 0.012 0.250 0.067 0.081 85 V 0.568 0.013 0.010 0.222 0.082 0.104 86 I 0.323 0.014 0.015 0.145 0.177 0.326 87 G 0.150 0.007 0.005 0.024 0.263 0.551 88 Y 0.083 0.013 0.006 0.007 0.289 0.603 89 S 0.084 0.020 0.006 0.005 0.223 0.664 90 G 0.109 0.022 0.017 0.006 0.293 0.553 91 S 0.080 0.012 0.025 0.012 0.245 0.626 92 E 0.124 0.026 0.038 0.019 0.256 0.538 93 R 0.111 0.038 0.027 0.019 0.263 0.542 94 E 0.091 0.021 0.020 0.011 0.398 0.460 95 E 0.110 0.026 0.040 0.011 0.531 0.283 96 K 0.078 0.009 0.054 0.009 0.623 0.227 97 S 0.280 0.011 0.041 0.009 0.429 0.231 98 N 0.513 0.021 0.018 0.011 0.145 0.293 99 V 0.664 0.036 0.005 0.008 0.059 0.228 100 V 0.544 0.031 0.002 0.008 0.044 0.370 101 W 0.010 0.002 0.001 0.001 0.013 0.974