# TARGET T0363 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0363.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 105 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.049 0.012 0.027 0.084 0.270 0.557 2 A 0.087 0.039 0.022 0.079 0.203 0.569 3 H 0.076 0.034 0.017 0.076 0.191 0.607 4 H 0.048 0.028 0.041 0.088 0.395 0.400 5 H 0.028 0.028 0.066 0.112 0.529 0.237 6 H 0.015 0.010 0.087 0.084 0.649 0.156 7 H 0.019 0.014 0.067 0.055 0.698 0.147 8 H 0.034 0.023 0.079 0.063 0.607 0.194 9 S 0.047 0.048 0.031 0.023 0.628 0.223 10 L 0.052 0.018 0.155 0.028 0.657 0.090 11 N 0.100 0.036 0.158 0.017 0.572 0.118 12 Q 0.326 0.013 0.063 0.006 0.405 0.187 13 I 0.755 0.007 0.005 0.003 0.072 0.159 14 N 0.935 0.006 0.001 0.001 0.011 0.048 15 I 0.977 0.002 0.001 0.001 0.003 0.018 16 E 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 17 I 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 18 A 0.983 0.001 0.001 0.001 0.004 0.011 19 Y 0.963 0.002 0.001 0.001 0.013 0.021 20 A 0.835 0.010 0.003 0.001 0.056 0.095 21 F 0.482 0.016 0.006 0.001 0.356 0.139 22 P 0.099 0.003 0.030 0.001 0.731 0.136 23 E 0.113 0.008 0.033 0.001 0.715 0.130 24 R 0.443 0.019 0.016 0.001 0.380 0.141 25 Y 0.621 0.005 0.004 0.001 0.128 0.242 26 Y 0.938 0.003 0.001 0.001 0.016 0.042 27 L 0.975 0.002 0.001 0.001 0.006 0.017 28 K 0.977 0.001 0.001 0.001 0.005 0.017 29 S 0.977 0.001 0.001 0.001 0.005 0.017 30 F 0.940 0.002 0.001 0.001 0.012 0.045 31 Q 0.906 0.005 0.001 0.001 0.020 0.068 32 V 0.650 0.055 0.002 0.001 0.084 0.209 33 D 0.137 0.067 0.004 0.001 0.754 0.037 34 E 0.015 0.002 0.010 0.002 0.937 0.035 35 G 0.017 0.003 0.009 0.002 0.924 0.046 36 I 0.141 0.125 0.006 0.007 0.648 0.074 37 T 0.137 0.088 0.001 0.019 0.056 0.699 38 V 0.003 0.001 0.006 0.971 0.013 0.007 39 Q 0.001 0.001 0.005 0.984 0.009 0.001 40 T 0.001 0.001 0.003 0.984 0.012 0.001 41 A 0.001 0.001 0.002 0.990 0.008 0.001 42 I 0.001 0.001 0.001 0.992 0.005 0.001 43 T 0.001 0.001 0.006 0.982 0.009 0.002 44 Q 0.001 0.001 0.004 0.970 0.014 0.011 45 S 0.001 0.001 0.004 0.924 0.021 0.051 46 G 0.001 0.001 0.007 0.176 0.119 0.696 47 I 0.010 0.004 0.098 0.187 0.278 0.423 48 L 0.055 0.015 0.294 0.152 0.359 0.126 49 S 0.057 0.011 0.258 0.164 0.392 0.119 50 Q 0.043 0.011 0.117 0.111 0.394 0.324 51 F 0.039 0.022 0.070 0.048 0.583 0.238 52 P 0.032 0.010 0.063 0.031 0.574 0.290 53 E 0.044 0.018 0.090 0.023 0.598 0.226 54 I 0.132 0.056 0.044 0.014 0.505 0.249 55 D 0.147 0.068 0.045 0.021 0.421 0.298 56 L 0.025 0.004 0.545 0.047 0.343 0.035 57 S 0.008 0.001 0.658 0.036 0.272 0.026 58 T 0.023 0.002 0.682 0.045 0.223 0.025 59 N 0.134 0.009 0.120 0.056 0.453 0.228 60 K 0.148 0.006 0.008 0.008 0.170 0.660 61 I 0.785 0.008 0.002 0.003 0.048 0.153 62 G 0.946 0.004 0.001 0.002 0.016 0.031 63 I 0.950 0.006 0.002 0.003 0.011 0.029 64 F 0.864 0.002 0.009 0.007 0.036 0.081 65 S 0.715 0.006 0.013 0.008 0.100 0.158 66 R 0.499 0.007 0.011 0.018 0.177 0.288 67 P 0.413 0.025 0.004 0.011 0.165 0.381 68 I 0.334 0.053 0.003 0.012 0.162 0.436 69 K 0.253 0.024 0.013 0.017 0.342 0.352 70 L 0.146 0.007 0.063 0.046 0.492 0.246 71 T 0.098 0.019 0.113 0.042 0.498 0.230 72 D 0.179 0.029 0.104 0.048 0.433 0.207 73 V 0.184 0.041 0.072 0.038 0.302 0.362 74 L 0.150 0.082 0.038 0.039 0.252 0.439 75 K 0.050 0.017 0.017 0.035 0.763 0.117 76 E 0.029 0.008 0.040 0.062 0.795 0.066 77 G 0.042 0.004 0.009 0.006 0.870 0.069 78 D 0.303 0.017 0.007 0.002 0.566 0.106 79 R 0.732 0.009 0.001 0.001 0.040 0.218 80 I 0.950 0.009 0.001 0.001 0.008 0.033 81 E 0.971 0.002 0.001 0.001 0.004 0.023 82 I 0.955 0.003 0.001 0.001 0.007 0.034 83 Y 0.819 0.011 0.003 0.004 0.029 0.133 84 R 0.449 0.003 0.013 0.010 0.155 0.370 85 P 0.195 0.004 0.021 0.006 0.301 0.474 86 L 0.165 0.033 0.024 0.005 0.334 0.438 87 L 0.233 0.036 0.019 0.007 0.335 0.370 88 A 0.264 0.037 0.015 0.014 0.242 0.428 89 D 0.139 0.030 0.006 0.015 0.258 0.552 90 P 0.011 0.002 0.061 0.515 0.303 0.108 91 K 0.004 0.001 0.095 0.746 0.132 0.022 92 E 0.008 0.002 0.077 0.750 0.144 0.019 93 I 0.017 0.002 0.059 0.719 0.142 0.062 94 R 0.028 0.005 0.028 0.757 0.078 0.104 95 R 0.040 0.019 0.043 0.580 0.148 0.171 96 E 0.009 0.002 0.013 0.264 0.151 0.560 97 G 0.001 0.001 0.001 0.005 0.060 0.933