# TARGET T0337 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0337.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1092 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.009 0.012 0.005 0.007 0.036 0.008 0.923 2 D 0.053 0.041 0.020 0.039 0.060 0.082 0.705 3 C 0.047 0.030 0.056 0.068 0.175 0.103 0.520 4 M 0.023 0.012 0.343 0.091 0.091 0.142 0.297 5 R 0.027 0.003 0.375 0.071 0.134 0.245 0.146 6 K 0.022 0.023 0.384 0.086 0.091 0.148 0.245 7 L 0.008 0.024 0.046 0.080 0.336 0.029 0.476 8 D 0.008 0.005 0.006 0.111 0.116 0.028 0.726 9 R 0.001 0.001 0.017 0.923 0.013 0.032 0.014 10 V 0.001 0.001 0.008 0.964 0.003 0.019 0.005 11 D 0.001 0.001 0.002 0.986 0.002 0.007 0.003 12 M 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.002 0.001 13 Q 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 14 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 15 V 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 16 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 17 I 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.008 0.001 18 L 0.001 0.001 0.002 0.978 0.002 0.015 0.002 19 S 0.001 0.001 0.010 0.916 0.005 0.065 0.004 20 E 0.001 0.001 0.014 0.684 0.011 0.284 0.007 21 N 0.001 0.001 0.025 0.261 0.118 0.494 0.101 22 S 0.003 0.005 0.029 0.088 0.187 0.319 0.369 23 R 0.011 0.013 0.037 0.028 0.172 0.211 0.529 24 L 0.019 0.025 0.010 0.016 0.346 0.028 0.557 25 T 0.018 0.032 0.001 0.022 0.066 0.006 0.854 26 Y 0.001 0.001 0.010 0.975 0.004 0.006 0.004 27 R 0.001 0.001 0.009 0.981 0.002 0.006 0.003 28 E 0.001 0.001 0.006 0.988 0.001 0.004 0.001 29 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.002 0.001 30 A 0.001 0.001 0.002 0.988 0.002 0.005 0.002 31 D 0.001 0.001 0.007 0.964 0.002 0.025 0.002 32 I 0.001 0.001 0.010 0.867 0.005 0.114 0.004 33 L 0.001 0.006 0.013 0.375 0.054 0.513 0.037 34 N 0.001 0.005 0.006 0.024 0.138 0.608 0.217 35 T 0.002 0.010 0.002 0.005 0.302 0.019 0.660 36 T 0.002 0.009 0.001 0.006 0.109 0.004 0.870 37 R 0.001 0.001 0.043 0.840 0.057 0.035 0.025 38 Q 0.001 0.001 0.013 0.958 0.009 0.012 0.007 39 R 0.001 0.001 0.009 0.976 0.002 0.009 0.004 40 I 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 41 A 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 42 R 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 43 R 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 44 I 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 45 D 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 46 K 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 47 L 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 48 K 0.001 0.001 0.002 0.982 0.001 0.012 0.001 49 K 0.001 0.001 0.008 0.898 0.004 0.084 0.004 50 L 0.001 0.001 0.005 0.107 0.004 0.881 0.002 51 G 0.002 0.001 0.003 0.013 0.040 0.917 0.024 52 I 0.256 0.017 0.004 0.010 0.059 0.016 0.639 53 I 0.777 0.051 0.004 0.005 0.011 0.004 0.148 54 R 0.783 0.006 0.021 0.009 0.030 0.035 0.116 55 K 0.711 0.004 0.020 0.007 0.086 0.064 0.107 56 F 0.776 0.002 0.003 0.005 0.054 0.009 0.150 57 T 0.851 0.003 0.002 0.003 0.028 0.005 0.109 58 I 0.899 0.004 0.003 0.010 0.017 0.007 0.060 59 I 0.921 0.002 0.001 0.003 0.009 0.003 0.061 60 P 0.855 0.013 0.001 0.004 0.020 0.003 0.104 61 D 0.457 0.009 0.001 0.005 0.022 0.004 0.502 62 I 0.010 0.001 0.394 0.443 0.014 0.123 0.015 63 D 0.003 0.001 0.508 0.296 0.036 0.151 0.006 64 K 0.003 0.001 0.580 0.269 0.015 0.126 0.006 65 L 0.015 0.009 0.222 0.331 0.090 0.248 0.085 66 G 0.039 0.007 0.030 0.012 0.122 0.600 0.189 67 Y 0.193 0.008 0.015 0.006 0.292 0.067 0.419 68 M 0.503 0.005 0.005 0.002 0.173 0.023 0.290 69 Y 0.876 0.001 0.001 0.001 0.018 0.001 0.104 70 A 0.975 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.011 71 I 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 72 V 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 73 L 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 74 I 0.978 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.019 75 K 0.913 0.002 0.001 0.001 0.007 0.001 0.077 76 S 0.800 0.010 0.001 0.001 0.026 0.003 0.160 77 K 0.328 0.080 0.003 0.001 0.082 0.010 0.496 78 V 0.091 0.009 0.003 0.001 0.111 0.018 0.767 79 P 0.004 0.003 0.206 0.107 0.204 0.356 0.119 80 S 0.003 0.009 0.183 0.208 0.177 0.294 0.125 81 D 0.003 0.007 0.151 0.412 0.097 0.117 0.214 82 A 0.001 0.001 0.020 0.913 0.021 0.017 0.028 83 D 0.001 0.001 0.005 0.963 0.006 0.016 0.009 84 K 0.001 0.001 0.004 0.975 0.004 0.012 0.005 85 V 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.008 0.002 86 I 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.006 0.001 87 S 0.001 0.001 0.002 0.986 0.001 0.009 0.001 88 E 0.001 0.001 0.003 0.980 0.001 0.013 0.002 89 I 0.001 0.001 0.012 0.964 0.002 0.018 0.003 90 S 0.001 0.001 0.016 0.824 0.006 0.149 0.004 91 D 0.001 0.001 0.011 0.627 0.018 0.330 0.013 92 I 0.003 0.004 0.005 0.166 0.277 0.049 0.496 93 E 0.018 0.004 0.026 0.211 0.184 0.182 0.374 94 Y 0.164 0.012 0.062 0.220 0.194 0.152 0.196 95 V 0.600 0.016 0.025 0.110 0.047 0.027 0.175 96 K 0.801 0.003 0.010 0.085 0.025 0.007 0.070 97 S 0.873 0.003 0.006 0.074 0.010 0.006 0.027 98 V 0.836 0.004 0.011 0.075 0.009 0.012 0.053 99 E 0.733 0.004 0.011 0.129 0.034 0.023 0.066 100 K 0.714 0.004 0.010 0.109 0.034 0.036 0.093 101 G 0.487 0.021 0.017 0.091 0.084 0.128 0.172 102 V 0.340 0.013 0.010 0.026 0.232 0.130 0.250 103 G 0.080 0.007 0.008 0.006 0.480 0.154 0.266 104 R 0.099 0.013 0.027 0.008 0.364 0.238 0.251 105 Y 0.332 0.007 0.006 0.002 0.175 0.022 0.455 106 N 0.566 0.002 0.004 0.001 0.213 0.006 0.208 107 I 0.972 0.004 0.001 0.001 0.004 0.001 0.017 108 I 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 109 V 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 110 R 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 111 L 0.917 0.002 0.001 0.001 0.009 0.001 0.071 112 L 0.824 0.005 0.002 0.001 0.041 0.004 0.122 113 L 0.491 0.038 0.006 0.003 0.097 0.014 0.352 114 P 0.142 0.014 0.018 0.006 0.192 0.060 0.568 115 K 0.018 0.007 0.102 0.028 0.317 0.361 0.167 116 D 0.008 0.008 0.058 0.064 0.375 0.146 0.340 117 I 0.001 0.001 0.118 0.734 0.053 0.044 0.049 118 K 0.001 0.001 0.032 0.909 0.017 0.030 0.012 119 D 0.001 0.001 0.015 0.936 0.006 0.032 0.009 120 A 0.001 0.001 0.003 0.972 0.004 0.014 0.006 121 E 0.001 0.001 0.001 0.984 0.004 0.008 0.003 122 N 0.001 0.001 0.001 0.981 0.003 0.011 0.004 123 L 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.007 0.004 124 I 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.007 0.004 125 S 0.001 0.001 0.001 0.981 0.003 0.013 0.002 126 E 0.001 0.001 0.002 0.970 0.003 0.021 0.003 127 F 0.001 0.001 0.005 0.961 0.004 0.024 0.006 128 L 0.003 0.002 0.018 0.902 0.009 0.049 0.017 129 Q 0.004 0.001 0.032 0.675 0.017 0.256 0.015 130 R 0.007 0.002 0.022 0.462 0.063 0.401 0.044 131 I 0.011 0.006 0.017 0.041 0.267 0.050 0.610 132 K 0.007 0.002 0.039 0.019 0.166 0.673 0.094 133 N 0.024 0.003 0.050 0.007 0.113 0.744 0.059 134 A 0.390 0.028 0.033 0.010 0.092 0.053 0.393 135 E 0.771 0.012 0.006 0.007 0.028 0.018 0.159 136 N 0.829 0.007 0.004 0.008 0.033 0.011 0.109 137 V 0.850 0.005 0.002 0.008 0.019 0.006 0.110 138 E 0.846 0.004 0.003 0.012 0.025 0.005 0.104 139 V 0.894 0.007 0.006 0.018 0.013 0.004 0.058 140 I 0.907 0.003 0.006 0.022 0.012 0.006 0.045 141 L 0.900 0.006 0.010 0.032 0.009 0.005 0.038 142 I 0.871 0.006 0.009 0.041 0.010 0.007 0.056 143 S 0.699 0.010 0.032 0.116 0.019 0.031 0.093 144 E 0.592 0.004 0.044 0.154 0.054 0.037 0.115 145 V 0.441 0.010 0.056 0.230 0.065 0.048 0.151 146 R 0.328 0.021 0.031 0.285 0.082 0.040 0.214 147 K 0.222 0.015 0.036 0.301 0.090 0.089 0.246 148 F 0.075 0.008 0.020 0.253 0.269 0.186 0.189 149 E 0.033 0.009 0.013 0.148 0.226 0.244 0.327 150 I 0.006 0.009 0.002 0.010 0.006 0.038 0.930 151 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999