Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
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AINS.T.IP--.-----....----.--.--PPK.S.....YKVAN...ALD.....L.A.FQES 13 AINS.L.MEY-.-----....----.-N.ENDAV.E.....M---N...ASE.....V.L.MERG 14 TANA.L.S---.-----....--HM.LR.DIKP-.E.....NFPAS...NID.....I.L.DLIK 15 AINS.M.LE--.-----....----.VD.EGRCV.E.....RNAGD...---.....L.L.VERG 16 AINA.V.SQYY.-----....----.--.-IDLS.D.....AFWGD...VLD.....L.V.QG-- 17 AINS.L.LEV-.-----....----.--.DMEQC.Q.....DI--N...AGE.....L.L.IERG 18 AINA.V.SQYY.F----....----.--.---NF.E.....ANGKD...AAE.....L.V.LNRD 19 CLKS.L.LP--.-----....----.--.--DPP.A.....TIAGG...AIE.....L.V.EPAA 20 AINA.V.SQYY.-----....----.--.-IDLR.E.....AKWID...VTE.....L.I.QQD- 21 TLNA.V.MRSL.GMIEG....SVHC.KD.KGP--.A.....ECGLD...LLE.....F.L.EG-Y 22 VLNA.L.SATC.WQVR-....----.-P.PMNYT.L.....KTGAN...ALD.....Q.V.I-IP 23 TANA.L.LASL.-----....----.--.---PH.P.....PFSRD...EVI.....S.S.LSIA 24 ACNA.H.YNRF.D----....--LD.LP.DGNGL.E.....SFGV-...---.....-.-.---- 25 TANA.L.LS--.-----....----.--.-LPPH.A.....PASDD...EVI.....G.S.LDIG 26 AINA.V.SQYY.-----....----.--.-IDFT.E.....SKNED...VLD.....L.I.VSDK 27 AINA.H.YNRY.-----....----.--.---DL.A.....AAAGN...GVK.....T.F.RHVA 28 AINA.H.YNRY.-----....----.--.---DL.A.....AAAGN...GVK.....T.F.RHVA 29 TANA.L.LAD-.-----....----.-S.PSPDV.S.....TV--N...ALE.....P.L.R-IT 30 ACNA.H.YNRY.DLE--....----.LP.GGNGL.E.....SFGV-...---.....-.-.---- 31 AANA.V.AR--.-----....----.--.--PEP.G.....HCLED...PDA.....LtT.VPVR 32 AVNA.V.SQYH.-----....--LD.VS.DLPDV.-.....----D...VVE.....L.V.EGFS 33 CVNA.-.MNY-.-----....----.-H.DASGF.P.....EDSTD...RLW.....MdS.FGIG 34 ALNA.L.AHLA.AERRG....----.PR.GYRVV.E.....D--AD...AFD.....I.A.RIRP 35 CLKS.L.LP--.-----....----.--.--DPC.P.....IIPGN...AID.....M.V.RDAA 36 VVNA.L.SAWF.F----....-DIC.PE.GTYAI.E.....H-DKD...AFD.....L.L.DTID 37 VLNA.L.SHPL.NQAGQ....----.LK.K-RGF.E.....PVEFD...NLE.....F.I.N--- 38 LVNA.LnYEYA.-----....----.--.-LSLP.E.....DKENR...ALF.....E.S.FGIG 39 SMNA.V.CRYL.GLIDR....TVHC.HD.EQP--.E.....QCAAE...LVE.....Q.I.KRDF 40 TVNS.V.IE--.-----....----.--.--GGG.K.....RC--N...AFD.....I.L.MEEC 41 VLNT.L.SYPL.NQAEQ....----.LK.K-RGF.Q.....PVEFD...NLE.....F.I.N--- 42 SLNA.V.MKYL.GKTDR....TIHC.KN.NEPEV.-.....-CAKK...FPE.....F.I.KMEF 43 ILSA.L.SATS.WVND-....----.-P.PQDYV.I.....KRNTD...PLD.....M.V.FS-- 44 AINA.L.S--V.PFFQD....GRYD.FE.KSDDL.S.....DVS--...---.....-.-.-HLF 45 ALNA.V.YRHL.KLCDK....TVHC.KN.--DEI.V.....LCGKQ...VDS.....A.V.M--- 46 VLNA.L.SQDF.-----....--LN.TN.PGAYR.L.....DTESD...LFD.....I.L.R-LD 47 VANA.V.FA--.-----....----.--.--PHV.Q.....PSSQG...DFI.....E.N.FSLQ 48 SLNA.V.MRYL.KPELA....TVHC.RN.DEP--.E.....ECAGE...IIG.....Q.L.QQQ- 49 ALNA.V.MRHL.KLVDK....TIHC.RD.QEPGR.-.....-CAAR...LVE.....Y.V.RERF 50 VLNA.V.LRWQ.QCVTN....TVHC.KD.CGP--.K.....DCARD...LPA.....H.I.IRRY 51 SLNA.V.QRSL.GKTDR....TIHC.RD.KGPSI.-.....-CAPK...MAD.....Y.I.MEKY 52 TLNA.V.VRYL.DGDLK....TVHC.RN.DEP--.E.....TCADQ...IIE.....A.I.RPA- 53 CLNA.I.MRYL.EPELG....TVHC.KN.NEP--.E.....ECATE...IGE.....F.V.EKLA 54 ICNA.A.AD--.-----....----.--.--PDP.A.....RCLVD...PDA.....AaA.VPAR 55 GLNA.V.TSHL.GLASG....VIHC.RD.DEP--.T.....KCGAE...MPE.....L.L.RQRF 56 TLNA.L.S--V.PFLED....GRYR.VD.ETGDL.S.....G----...---.....-.V.QSLF 57 GLNA.V.LRGI.EQADG....TIHC.KD.DEP--.A.....QCGEE...FTL.....Q.L.HRRF 58 ILNA.V.SEI-.-----....----.--.-TNPQ.E.....G---D...PLD.....L.L.---- 59 ILNS.V.GN--.-----....----.--.-IEGY.E.....N--GD...PID.....V.L.---- 60 ALNS.V.MKHL.KMVEK....SEHC.IK.GEPEV.-.....-CAKE...LSE.....F.L.MEEY 61 ILNA.L.GSMI.D----....----.FT.QGDPI.-.....-----...---.....-.-.-NLY 62 LANA.I.ARYR.--LGS....EKIP.L-.-QKGA.R.....ALLPQ...KLL.....E.L.TK-- 63 ALDA.Y.LAQI.QPHREapeqEAVP.LPvGTPEV.R.....AKARD...ASI.....AgL.LDIE 64 MC-ArV.CPTE.ELCEE....VCVReVA.EGKPV.EigrlqRYATD...SVMtr6hpF.V.RAAD 65 TLNA.V.MRHL.GMIEG....SVHC.KD.KGP--.A.....ECGLD...LLE.....F.L.EGH- 66 ALDA.V.ASAE.NVEPE....EEIS.LP.R-DYG.R.....AVTLR...AKI.....V.A.DTAE 67 ----.-.----.-----....----.--.-----.-.....-----...---.....-.-.--ML 68 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.P.EDKVAMVGYFgP....LV...PR.ILK...IT.E...K.L..TIL..E.K.....R.Eiefs 12 .K.DKTVTMVGYF.Pg...YV...DK.FMK...KA.R...H.F..YVL..E.L.....N.Q.... 13 .A.GKNVAIVGHF.P....FI...PK.VKK...AV.K...N.L..WVI..E.Q.....N.P.... 14 .P.EDRVAMVGYFaP....LV...PK.ILK...IT.N...K.L..TIL..E.Kreie.S.P.... 15 .R.NKRVALIGHF.P....FV...PA.LRE...AA.E...H.L..WVL..E.L.....R.P.... 16 .D.VKRIAVLGNMpP....IV...KA.LRS...K-.Y...E.V..YVF..E.R.....N.P.... 17 .A.GKRVAVVGHF.P....FV...PG.LRR...VA.R...E.L..WVL..E.R.....R.P.... 18 .D.IKKIAFVGNMiP....VV...NM.LKKs..EK.F...D.I..YVF..E.R.....S.P.... 19 .C.RIPTCFIGYF.K....TA...AA.WRE...KG.Y...P.V..TIV..E.L.....F.P.... 20 .E.IKRIAIIGNM.P....PV...VR.TLK...EK.Y...E.V..YVF..E.R.....N.M.... 21 .R.GVRIALVGFQ.P....VH...AR.RCS...ER.G...E.L..RIL..D.M.....D.P.... 22 .G.EGQVVVVGALaP....FL...KV.LKR...QD.C...R.F..TIL..E.L.....D.P.... 23 .P.QERVAMVGYFgP....IV...AQ.LEK...IG.C...T.L..EIV..E.L.....N.P.... 24 .K.GGGTVVIGAF.P....GI...A-.--E...RL.P...G.A..KVI..D.R.....K.P.... 25 .A.DDHVAMVGYFaP....VV...AK.IQK...SG.C...R.L..DII..E.M.....N.P.... 26 .D.IKKIGFVGNIaP....VV...NE.LREidgKN.Y...E.I..YVF..E.R.....NsS.... 27 .G.--RVGVIGAF.P....GV...DG.IL-...--.P...N.C..AVM..E.A.....D.P.... 28 .G.--RVGVIGAF.P....GV...DG.IL-...--.P...N.C..AVM..E.A.....D.P.... 29 .P.SCHVVMVGYFgP....LV...RD.LQN...VG.C...R.L..DIV..E.L.....D.Sn... 30 .K.GGGTVVIGAF.P....GI...A-.--E...RL.P...G.A..KIV..D.R.....K.P.... 31 .P.ADTVGLIGFI.R....SI...HR.RIEg..RV.N...R.I..IVF..D.Rsl...D.G.... 32 .E.---VAVIGNMpP....VV...RA.LRE...KG.V...K.T..LVF..E.R.....N.P.... 33 .S.GTRVAMVGFFrP....LM...KL.FRD...RG.A...L.V..EAL..D.D.....F.Q.... 34 .D.ETAV-VVGAFgP....FL...KA.LRG...IG.A...R.H..FVL..E.K.....D.Pat6p 35 .A.RVPTCFVGYF.K....EG...AE.WRE...MG.W...P.V..DIV..E.L.....F.P.... 36 .P.ATPVVVVGALwP....VI...HR.LKL...RG.A...Q.Y..RLF..E.L.....N.K.... 37 .T.EDRVVLVGYG.A....LI...KE.TLA...RC.S...V.I..DVC..D.M.....R.S.... 38 .E.KTRVAMVGYFaP....IA...GM.LGK...MG.A...L.L..EVI..D.I.....S.K.... 39 .G.TPRVALIGYQ.Pa...ML...EK.LAA...SF.-...Q.L..RVV..D.L.....D.P.... 40 .R.NRKIAMVGEF.Prr..YT...DR.IRT...VS.D...E.F..YIL..E.InpfkvN.P.... 41 .A.EDRVVLVGYG.A....LI...KE.TLA...RC.P...V.I..DIC..D.M.....R.F.... 42 .G.NPKVAIIGYQ.P....AI...ID.NIK...DF.F...E.T..RVL..D.L.....N.P.... 43 .R.DKNVAVVGALgP....LL...KK.LKT...GE.V...S.Y..RVL..E.M.....D.I.... 44 .T.GRRVCMVGAIvP....LL...KR.FKK...MG.Vs..E.I..KVI..D.R.....K.K.... 45 .A.DQKILLIGLQ.P....RI...LE.NLS...SK.Q...P.I..RVI..D.L.....D.P.... 46 .K.SSRVGVVGFFrP....MM...DK.LVE...KA.G...E.V..VVV..E.Lse...D.L.... 47 .P.GMKVGMVGNFaP....LV...NP.IRK...SG.A...E.L..IIF..D.E.....H.P.... 48 .P.VAKVGLVGLQ.Pa...IL...EQ.LAT...TF.Gae.N.V..FCV..D.R.....D.E.... 49 .G.NPRIAFIGLQ.Pa...MV...AS.LAG...HF.-...P.I..RVT..D.L.....D.P.... 50 .G.RCRVTLAGMQ.Pa...MI...ES.LAG...VL.-...P.L..RVV..D.L.....D.P.... 51 .G.QVRITQIGYQ.Pk...LI...EA.LAE...KF.-...T.L..RIV..D.L.....D.P.... 52 .D.PHTVGLVGLQ.P....AI...LA.VLS...KN.YgpqN.V..LCV..D.R.....D.T.... 53 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.G.YDRVALLGFQ.Pa...FV...RK.LHE...TF.G...DrL..RVT..D.L.....N.P.... 68 .D.GKNVTVIGYG.PvgqgFA...RR.IRA...LG.A...E.V..TIC..D.I.....D.Pvasl 69 .D.GKNVTVIGYG.PvgqgFA...RR.IRA...LG.A...E.V..TIC..D.I.....D.Pvasl 70 .T.GKRVAVVGAG.Pa...GLsaaHR.LAM...LG.H...E.V..TIF..D.A.....R.P.... 71 .T.GKRVAVVGAG.Pa...GLsaaHR.LAM...LG.H...E.V..TIF..D.A.....R.P.... 160 170 | | 1 .E.....E..G.....D..YP....LP..A..S....E...F..ILPE.CD.YVY.....I.TCA 2 .E.....E..G.....D..YP....LP..A..S....E...F..ILPE.CD.YVY.....I.TCA 3 .E.....E..G.....D..YP....LP..A..S....E...F..ILPE.CD.YVY.....I.TCA 4 .R.....E..G.....D..LP....DP..A..C....E...Y..ILPE.QD.YVF.....I.TAT 5 .Q.....E..G.....D..YP....DP..A..C....E...Y..ILPE.QD.VVF.....I.TGT 6 .N.....A..A.....D..LP....DT..A..C....E...Y..VLPQ.AD.WVF.....L.TAS 7 .Q.....E..G.....D..LP....DT..A..V....E...R..LLPE.AD.WVF.....I.TAS 8 .G.....P..D.....D..LP....DS..A..C....E...Y..LVPE.AD.WVF.....L.TAT 9 .G.....A..E.....D..FP....DT..A..S....E...Y..LLPE.AE.WVF.....L.TAT 10 .K.....T..R.....T..LP....SG..K..A....R...E..ILPA.SD.VII.....L.SAS 11 .E.....T..T.....I..LP....SE..K..A....R...E..ILPA.SD.VII.....I.SAS 12 .N.....V..LntsknI..LF....SF..A..A....E...E..VIPK.SD.IVI.....L.TAT 13 .L.....E..G.....D..HP....AH..A..A....S...D..LIPQ.AD.VVA.....I.TGS 14 .K.....T..L.....T..LP....SE..K..A....R...E..VLPT.SD.VII.....L.SAS 15 .Q.....A..G.....D..AG....AE..E..A....G...A..IVPE.AD.VVA.....I.TGS 16 .K.....L..W.....D..REty..SD..A..L....E...Yd.LLPK.MD.VII.....A.SAS 17 .Q.....S..G.....D..LP....AD..E..A....A...N..VIPG.AD.VVA.....I.TGT 18 .S.....L..L.....M..DGvl..SD..A..F....E...Yr.LLPE.MD.AVF.....I.SGT 19 .R.....P..G.....D..IH....WN..E..A....D...E..VLEK.AE.LVL.....M.TGL 20 .K.....L..W.....D..RDty..SD..T..L....E...Yh.ILPE.VD.GII.....A.SAS 21 .Eni9gvV..V.....L..DG....GA..K..T....E...E..VLRW.CD.LAL.....V.TGT 22 .Atl7elP..F.....Y..RP....PE..D..A....P...E..VIPW.AD.LLI.....I.TGT 23 .H.....K..G.....EktLT....PE..Q..G....E...R..ALGE.CD.VAI.....I.TAT 24 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Y-.-----.-..-..-..---...-....-----.-.-.-.--.-...--...---.----.--. 51 RF.CCES-.-..-..-..---...-....-----.-.-.-.--.-...--...---.----.--. 52 HL.CFEA-.-..-..-..---...-....-----.-.-.-.--.-...--...---.----.--. 53 RL.CFCP-.-..-..-..---...-....-----.-.-.-.--.-...--...---.----.--. 54 VL.AGFRW.QvaD..P..DAA...L....EQVAA.G.A.H.FK.H...LK...GRT.SVTL.RVe 55 RI.CPYG-.-..-..-..---...-....-----.-.-.-.--.-...--...---.----.--. 56 MV.GTVVV.S..D..S..DRA...L....DILAE.G.GgG.YR.L...FKe..CVR.KINL.LNv 57 RI.C----.-..-..-..---...-....-----.-.-.-.--.-...--...---.----.--. 58 MI.GKIVA.I..D..K..LKA...F....RIVCE.G.GdP.SK.L...AT...YTR.KIYA.KLd 59 YI.GKVIA.V..D..K..IKA...L....RVVCE.G.G.L.AK.H...LSr..FTK.KIYV.KL. 60 RF.C----.-..-..-..---...-....-----.-.-.-.--.-...--...---.----.--. 61 VL.GKLFP.V..E..K..YRV...F....RTICE.G.G.S.NK.L...LS...KYI.MRYF.KKl 62 HV.ASMLL.E..PsiK..ESL...F....RHQW-.-.-.-.--.-...--...---.----.--. 63 ALnAE---.-..-..-..---...-....-----.-.-.-.--.-...--...---.----.--. 64 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