# TARGET T0386 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0386.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 5 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 L 0.005 0.004 0.022 0.802 0.069 0.099 2 L 0.002 0.001 0.008 0.941 0.013 0.034 3 K 0.001 0.001 0.006 0.973 0.009 0.010 4 E 0.001 0.001 0.008 0.977 0.007 0.006 5 F 0.001 0.001 0.006 0.980 0.006 0.006 6 M 0.001 0.001 0.006 0.975 0.010 0.007 7 H 0.002 0.001 0.008 0.972 0.013 0.005 8 T 0.002 0.001 0.007 0.950 0.025 0.016 9 M 0.005 0.001 0.008 0.918 0.034 0.034 10 K 0.007 0.004 0.019 0.824 0.075 0.071 11 N 0.010 0.003 0.017 0.617 0.210 0.144 12 T 0.013 0.007 0.023 0.384 0.239 0.335 13 G 0.012 0.005 0.013 0.050 0.308 0.612 14 R 0.018 0.016 0.037 0.034 0.399 0.495 15 N 0.032 0.036 0.041 0.027 0.416 0.448 16 V 0.045 0.023 0.045 0.014 0.707 0.165 17 N 0.088 0.009 0.037 0.010 0.669 0.188 18 D 0.130 0.009 0.030 0.005 0.702 0.124 19 R 0.506 0.013 0.006 0.001 0.356 0.118 20 P 0.858 0.002 0.001 0.001 0.053 0.085 21 V 0.971 0.002 0.001 0.001 0.007 0.020 22 M 0.989 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 23 V 0.987 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 24 A 0.954 0.002 0.001 0.001 0.018 0.024 25 K 0.590 0.009 0.004 0.001 0.333 0.063 26 E 0.043 0.001 0.018 0.007 0.861 0.070 27 G 0.034 0.002 0.012 0.003 0.853 0.095 28 E 0.380 0.065 0.007 0.003 0.429 0.115 29 T 0.624 0.018 0.002 0.003 0.084 0.270 30 Y 0.757 0.042 0.002 0.006 0.046 0.147 31 T 0.448 0.017 0.004 0.013 0.166 0.352 32 G 0.330 0.003 0.005 0.022 0.162 0.478 33 T 0.570 0.026 0.007 0.034 0.138 0.226 34 Y 0.687 0.025 0.008 0.043 0.096 0.142 35 R 0.550 0.013 0.018 0.061 0.167 0.190 36 G 0.361 0.016 0.028 0.045 0.278 0.273 37 A 0.249 0.020 0.071 0.052 0.391 0.217 38 G 0.199 0.017 0.065 0.052 0.409 0.258 39 L 0.200 0.008 0.085 0.051 0.454 0.201 40 E 0.363 0.011 0.048 0.035 0.337 0.207 41 G 0.666 0.010 0.033 0.027 0.160 0.103 42 F 0.877 0.006 0.010 0.009 0.044 0.053 43 A 0.957 0.002 0.004 0.003 0.014 0.019 44 L 0.974 0.002 0.002 0.001 0.009 0.012 45 N 0.975 0.003 0.001 0.001 0.011 0.009 46 V 0.927 0.003 0.002 0.001 0.045 0.022 47 K 0.479 0.002 0.008 0.003 0.427 0.082 48 G 0.254 0.003 0.021 0.005 0.600 0.118 49 A 0.784 0.006 0.006 0.003 0.144 0.057 50 Y 0.908 0.013 0.003 0.002 0.034 0.041 51 I 0.925 0.007 0.001 0.001 0.022 0.045 52 I 0.884 0.014 0.002 0.002 0.048 0.050 53 G 0.509 0.012 0.002 0.002 0.150 0.325 54 N 0.231 0.015 0.015 0.007 0.530 0.202 55 I 0.015 0.005 0.323 0.031 0.562 0.064 56 D 0.009 0.003 0.349 0.033 0.564 0.042 57 H 0.014 0.008 0.261 0.042 0.599 0.075 58 L 0.021 0.015 0.022 0.040 0.316 0.586 59 P 0.027 0.022 0.026 0.063 0.283 0.580 60 P 0.016 0.002 0.260 0.473 0.178 0.071 61 E 0.043 0.003 0.202 0.522 0.190 0.041 62 Q 0.046 0.005 0.196 0.547 0.162 0.044 63 L 0.078 0.008 0.161 0.505 0.156 0.092 64 K 0.114 0.013 0.140 0.465 0.194 0.074 65 I 0.065 0.010 0.083 0.518 0.204 0.120 66 L 0.053 0.025 0.031 0.188 0.289 0.414 67 K 0.021 0.018 0.018 0.051 0.737 0.155 68 P 0.014 0.003 0.033 0.019 0.840 0.091 69 G 0.022 0.003 0.017 0.005 0.864 0.090 70 D 0.252 0.040 0.015 0.003 0.581 0.109 71 K 0.674 0.006 0.003 0.003 0.078 0.236 72 I 0.858 0.018 0.003 0.002 0.026 0.093 73 T 0.782 0.021 0.002 0.003 0.033 0.160 74 F 0.480 0.024 0.002 0.006 0.045 0.444 75 T 0.003 0.001 0.001 0.001 0.009 0.986