# TARGET T0385 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0385.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 24.9235 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.068 0.010 0.122 0.045 0.078 0.082 0.010 0.585 2 T 0.055 0.011 0.096 0.060 0.086 0.118 0.009 0.564 3 S 0.074 0.014 0.150 0.067 0.149 0.121 0.010 0.416 4 S 0.045 0.013 0.073 0.034 0.076 0.088 0.010 0.662 5 E 0.064 0.010 0.084 0.040 0.071 0.154 0.009 0.567 6 P 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.007 0.001 0.986 7 A 0.055 0.029 0.048 0.032 0.114 0.208 0.009 0.504 8 H 0.241 0.045 0.031 0.024 0.036 0.095 0.023 0.506 9 G 0.386 0.030 0.018 0.017 0.022 0.042 0.034 0.451 10 A 0.478 0.024 0.104 0.021 0.041 0.077 0.026 0.229 11 T 0.087 0.024 0.034 0.044 0.064 0.138 0.009 0.601 12 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 13 K 0.015 0.008 0.017 0.022 0.062 0.294 0.006 0.575 14 R 0.564 0.010 0.015 0.005 0.008 0.133 0.026 0.239 15 S 0.411 0.061 0.039 0.035 0.033 0.052 0.007 0.361 16 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 17 S 0.023 0.005 0.017 0.015 0.043 0.259 0.004 0.635 18 E 0.325 0.009 0.011 0.006 0.012 0.142 0.011 0.484 19 G 0.162 0.023 0.011 0.005 0.011 0.255 0.007 0.525 20 S 0.146 0.027 0.013 0.004 0.009 0.171 0.005 0.626 21 A 0.030 0.039 0.009 0.003 0.006 0.147 0.003 0.763 22 D 0.067 0.098 0.007 0.005 0.014 0.328 0.008 0.472 23 N 0.131 0.312 0.013 0.006 0.017 0.191 0.008 0.321 24 A 0.032 0.703 0.005 0.004 0.008 0.081 0.003 0.163 25 A 0.014 0.860 0.003 0.002 0.003 0.027 0.002 0.089 26 L 0.021 0.914 0.002 0.001 0.002 0.010 0.003 0.048 27 C 0.010 0.957 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.024 28 D 0.011 0.952 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.030 29 A 0.010 0.960 0.003 0.001 0.001 0.002 0.004 0.019 30 L 0.006 0.970 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.017 31 A 0.007 0.970 0.002 0.001 0.001 0.002 0.002 0.015 32 V 0.010 0.970 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 33 E 0.008 0.960 0.004 0.001 0.001 0.003 0.003 0.021 34 H 0.004 0.974 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.016 35 A 0.002 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 36 T 0.005 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 37 I 0.012 0.964 0.003 0.001 0.001 0.001 0.005 0.012 38 Y 0.010 0.962 0.007 0.002 0.002 0.003 0.004 0.010 39 G 0.014 0.942 0.006 0.004 0.003 0.002 0.009 0.019 40 Y 0.038 0.814 0.046 0.013 0.011 0.007 0.019 0.053 41 G 0.076 0.583 0.046 0.029 0.024 0.024 0.031 0.187 42 I 0.074 0.491 0.152 0.032 0.046 0.028 0.021 0.156 43 V 0.063 0.526 0.082 0.048 0.073 0.047 0.018 0.144 44 S 0.125 0.444 0.065 0.040 0.052 0.050 0.026 0.199 45 A 0.264 0.205 0.055 0.039 0.037 0.032 0.068 0.300 46 L 0.265 0.099 0.134 0.027 0.035 0.054 0.054 0.331 47 S 0.074 0.049 0.054 0.027 0.055 0.173 0.033 0.535 48 P 0.003 0.003 0.002 0.001 0.002 0.006 0.001 0.983 49 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.995 50 G 0.073 0.016 0.008 0.006 0.007 0.265 0.009 0.616 51 V 0.296 0.171 0.034 0.007 0.011 0.075 0.006 0.399 52 N 0.032 0.350 0.017 0.008 0.019 0.088 0.003 0.483 53 F 0.052 0.499 0.010 0.005 0.008 0.062 0.004 0.361 54 L 0.025 0.834 0.005 0.002 0.003 0.030 0.003 0.100 55 V 0.019 0.901 0.003 0.002 0.005 0.018 0.004 0.049 56 A 0.004 0.974 0.002 0.001 0.002 0.002 0.001 0.016 57 D 0.004 0.969 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.021 58 A 0.009 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 59 L 0.013 0.964 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 60 K 0.031 0.890 0.003 0.001 0.001 0.006 0.008 0.059 61 Q 0.041 0.864 0.005 0.001 0.001 0.008 0.012 0.068 62 H 0.050 0.867 0.003 0.001 0.001 0.005 0.011 0.063 63 R 0.025 0.874 0.007 0.001 0.001 0.011 0.007 0.074 64 H 0.036 0.786 0.008 0.002 0.001 0.032 0.011 0.125 65 R 0.156 0.654 0.008 0.001 0.001 0.019 0.016 0.145 66 R 0.029 0.863 0.017 0.001 0.002 0.010 0.004 0.074 67 D 0.005 0.866 0.007 0.001 0.002 0.011 0.002 0.107 68 D 0.014 0.799 0.006 0.001 0.001 0.028 0.005 0.146 69 V 0.012 0.927 0.002 0.001 0.001 0.017 0.002 0.037 70 I 0.002 0.979 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.012 71 V 0.001 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 72 M 0.002 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 73 L 0.004 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 74 S 0.002 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 75 A 0.022 0.957 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.005 76 R 0.274 0.544 0.006 0.002 0.001 0.001 0.160 0.013 77 G 0.849 0.007 0.007 0.001 0.001 0.001 0.112 0.022 78 V 0.015 0.008 0.897 0.004 0.003 0.007 0.005 0.061 79 T 0.011 0.020 0.243 0.040 0.064 0.102 0.011 0.510 80 A 0.001 0.001 0.035 0.003 0.003 0.007 0.001 0.949 81 P 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.994 82 I 0.014 0.006 0.165 0.034 0.076 0.081 0.002 0.622 83 A 0.055 0.022 0.024 0.022 0.060 0.089 0.006 0.722 84 A 0.100 0.079 0.018 0.022 0.057 0.124 0.008 0.593 85 A 0.317 0.139 0.014 0.014 0.017 0.094 0.023 0.381 86 G 0.617 0.050 0.010 0.014 0.008 0.025 0.065 0.212 87 Y 0.561 0.034 0.143 0.046 0.053 0.039 0.043 0.081 88 Q 0.104 0.032 0.078 0.066 0.150 0.065 0.025 0.480 89 L 0.048 0.011 0.172 0.208 0.225 0.029 0.006 0.300 90 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 91 M 0.008 0.003 0.195 0.098 0.241 0.077 0.003 0.376 92 Q 0.131 0.006 0.048 0.024 0.036 0.106 0.006 0.643 93 V 0.141 0.011 0.078 0.037 0.062 0.064 0.006 0.601 94 S 0.051 0.011 0.053 0.018 0.023 0.217 0.003 0.625 95 S 0.051 0.012 0.014 0.005 0.012 0.222 0.004 0.679 96 A 0.022 0.032 0.007 0.002 0.011 0.073 0.002 0.850 97 A 0.013 0.044 0.002 0.001 0.003 0.286 0.002 0.648 98 D 0.015 0.107 0.001 0.001 0.001 0.678 0.002 0.197 99 A 0.006 0.974 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.018 100 A 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 101 R 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 102 L 0.004 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 103 A 0.005 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 104 V 0.002 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 105 R 0.004 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 106 M 0.029 0.927 0.003 0.001 0.001 0.001 0.013 0.025 107 E 0.038 0.875 0.013 0.002 0.002 0.006 0.011 0.052 108 N 0.017 0.788 0.009 0.002 0.002 0.010 0.009 0.163 109 D 0.075 0.529 0.010 0.002 0.002 0.034 0.020 0.329 110 G 0.013 0.899 0.010 0.002 0.001 0.013 0.004 0.058 111 A 0.007 0.892 0.012 0.002 0.004 0.020 0.003 0.060 112 T 0.004 0.942 0.004 0.002 0.003 0.012 0.001 0.032 113 A 0.003 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 114 W 0.003 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 115 R 0.005 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 116 A 0.009 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 117 V 0.055 0.865 0.005 0.002 0.004 0.004 0.019 0.046 118 V 0.026 0.902 0.007 0.003 0.005 0.004 0.007 0.046 119 E 0.028 0.810 0.008 0.004 0.005 0.012 0.014 0.120 120 H 0.108 0.644 0.014 0.004 0.005 0.015 0.039 0.171 121 A 0.125 0.686 0.023 0.007 0.006 0.010 0.026 0.116 122 E 0.130 0.299 0.069 0.015 0.014 0.130 0.055 0.287 123 T 0.214 0.197 0.061 0.014 0.016 0.074 0.027 0.397 124 A 0.054 0.085 0.035 0.004 0.009 0.045 0.008 0.759 125 D 0.027 0.065 0.017 0.004 0.006 0.241 0.009 0.631 126 D 0.095 0.114 0.023 0.004 0.006 0.191 0.012 0.555 127 R 0.064 0.413 0.017 0.005 0.010 0.234 0.006 0.250 128 V 0.029 0.620 0.011 0.005 0.010 0.099 0.004 0.223 129 F 0.014 0.882 0.004 0.003 0.005 0.019 0.002 0.071 130 A 0.013 0.938 0.002 0.002 0.005 0.005 0.002 0.032 131 S 0.013 0.951 0.002 0.002 0.003 0.002 0.003 0.023 132 T 0.040 0.909 0.003 0.002 0.002 0.004 0.011 0.029 133 A 0.071 0.870 0.003 0.002 0.002 0.004 0.012 0.036 134 L 0.086 0.756 0.013 0.004 0.006 0.017 0.021 0.096 135 T 0.075 0.646 0.015 0.004 0.006 0.020 0.019 0.215 136 E 0.038 0.648 0.019 0.002 0.003 0.020 0.011 0.259 137 S 0.015 0.781 0.008 0.001 0.002 0.045 0.006 0.143 138 A 0.018 0.861 0.003 0.001 0.002 0.016 0.004 0.096 139 V 0.009 0.924 0.003 0.001 0.001 0.007 0.002 0.054 140 M 0.005 0.957 0.002 0.001 0.001 0.003 0.002 0.029 141 A 0.001 0.989 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 142 T 0.003 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 143 R 0.009 0.970 0.002 0.001 0.001 0.002 0.002 0.014 144 W 0.013 0.962 0.003 0.001 0.002 0.002 0.003 0.014 145 N 0.011 0.965 0.002 0.001 0.001 0.002 0.004 0.014 146 R 0.036 0.911 0.004 0.002 0.001 0.002 0.015 0.029 147 V 0.125 0.759 0.013 0.003 0.004 0.007 0.032 0.056 148 L 0.072 0.736 0.038 0.013 0.013 0.011 0.028 0.089 149 G 0.177 0.327 0.044 0.014 0.020 0.031 0.101 0.285 150 A 0.147 0.133 0.161 0.013 0.012 0.037 0.081 0.416 151 W 0.106 0.052 0.150 0.051 0.031 0.060 0.023 0.527 152 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 153 I 0.014 0.005 0.256 0.081 0.146 0.124 0.005 0.369 154 T 0.037 0.013 0.108 0.052 0.037 0.062 0.005 0.686 155 A 0.058 0.017 0.144 0.067 0.144 0.060 0.008 0.501 156 A 0.106 0.016 0.127 0.040 0.084 0.098 0.010 0.518 157 F 0.133 0.012 0.125 0.112 0.116 0.129 0.015 0.358 158 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 159 G 0.014 0.005 0.028 0.042 0.122 0.126 0.006 0.658 160 G 0.223 0.004 0.015 0.012 0.020 0.073 0.011 0.643 161 D 0.046 0.006 0.011 0.012 0.020 0.064 0.004 0.837 162 E 0.050 0.007 0.014 0.015 0.031 0.152 0.004 0.728