# TARGET T0383 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0383.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 8.26074 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.058 0.100 0.014 0.016 0.026 0.086 0.068 0.632 2 N 0.056 0.293 0.013 0.029 0.049 0.076 0.075 0.409 3 A 0.074 0.242 0.020 0.027 0.050 0.094 0.052 0.441 4 M 0.053 0.134 0.043 0.081 0.090 0.090 0.082 0.426 5 N 0.066 0.193 0.035 0.058 0.078 0.076 0.087 0.407 6 L 0.068 0.138 0.041 0.038 0.052 0.076 0.087 0.501 7 K 0.077 0.158 0.038 0.063 0.065 0.098 0.068 0.433 8 R 0.060 0.185 0.013 0.020 0.029 0.054 0.072 0.568 9 E 0.060 0.503 0.008 0.012 0.021 0.049 0.052 0.295 10 Q 0.025 0.238 0.030 0.041 0.057 0.057 0.231 0.321 11 E 0.013 0.169 0.047 0.094 0.085 0.090 0.224 0.279 12 F 0.080 0.226 0.066 0.061 0.077 0.055 0.190 0.245 13 V 0.193 0.154 0.048 0.049 0.055 0.075 0.120 0.307 14 S 0.085 0.138 0.026 0.032 0.056 0.063 0.075 0.524 15 Q 0.018 0.062 0.031 0.022 0.043 0.121 0.037 0.666 16 Y 0.022 0.136 0.083 0.086 0.120 0.118 0.060 0.375 17 H 0.074 0.186 0.065 0.066 0.107 0.081 0.103 0.319 18 F 0.068 0.109 0.087 0.089 0.085 0.069 0.158 0.334 19 D 0.084 0.175 0.051 0.089 0.095 0.072 0.112 0.323 20 A 0.081 0.112 0.039 0.035 0.053 0.089 0.045 0.545 21 R 0.038 0.105 0.041 0.063 0.098 0.096 0.050 0.509 22 N 0.116 0.178 0.015 0.029 0.049 0.079 0.051 0.484 23 F 0.056 0.149 0.021 0.052 0.056 0.099 0.120 0.447 24 E 0.064 0.172 0.018 0.050 0.060 0.096 0.083 0.458 25 W 0.143 0.101 0.021 0.045 0.056 0.071 0.219 0.345 26 E 0.082 0.028 0.033 0.065 0.063 0.098 0.111 0.521 27 N 0.555 0.011 0.008 0.018 0.026 0.038 0.034 0.311 28 E 0.138 0.003 0.004 0.012 0.014 0.081 0.019 0.729 29 N 0.005 0.001 0.004 0.007 0.023 0.100 0.006 0.855 30 G 0.010 0.001 0.004 0.008 0.020 0.088 0.022 0.845 31 A 0.090 0.008 0.015 0.072 0.035 0.115 0.087 0.578 32 P 0.101 0.014 0.024 0.039 0.068 0.082 0.046 0.626 33 E 0.028 0.005 0.031 0.047 0.108 0.073 0.041 0.667 34 T 0.018 0.005 0.080 0.147 0.287 0.065 0.036 0.362 35 K 0.009 0.004 0.048 0.114 0.235 0.060 0.035 0.495 36 V 0.005 0.009 0.080 0.233 0.277 0.061 0.024 0.311 37 D 0.012 0.020 0.091 0.161 0.250 0.062 0.033 0.369 38 V 0.028 0.072 0.080 0.187 0.163 0.055 0.047 0.369 39 N 0.088 0.273 0.070 0.108 0.125 0.043 0.061 0.232 40 F 0.083 0.196 0.067 0.111 0.113 0.045 0.095 0.289 41 Q 0.078 0.219 0.041 0.095 0.100 0.057 0.072 0.339 42 L 0.114 0.164 0.038 0.057 0.072 0.071 0.083 0.401 43 L 0.075 0.167 0.016 0.046 0.050 0.090 0.049 0.506 44 Q 0.110 0.185 0.010 0.026 0.031 0.055 0.056 0.528 45 H 0.060 0.096 0.012 0.023 0.024 0.086 0.119 0.579 46 D 0.202 0.123 0.013 0.027 0.024 0.073 0.148 0.390 47 Q 0.455 0.061 0.003 0.010 0.012 0.036 0.051 0.372 48 E 0.057 0.014 0.006 0.010 0.027 0.082 0.072 0.732 49 N 0.013 0.008 0.014 0.022 0.071 0.120 0.139 0.613 50 Q 0.016 0.013 0.021 0.074 0.141 0.103 0.116 0.516 51 V 0.014 0.013 0.046 0.111 0.188 0.087 0.048 0.494 52 T 0.007 0.009 0.084 0.167 0.443 0.049 0.051 0.190 53 S 0.002 0.004 0.101 0.239 0.465 0.021 0.040 0.128 54 L 0.001 0.003 0.130 0.341 0.441 0.012 0.025 0.048 55 I 0.001 0.002 0.154 0.328 0.380 0.012 0.051 0.072 56 V 0.001 0.002 0.110 0.488 0.339 0.008 0.024 0.027 57 I 0.007 0.004 0.171 0.201 0.408 0.023 0.044 0.142 58 L 0.011 0.003 0.084 0.381 0.358 0.023 0.029 0.110 59 S 0.010 0.004 0.106 0.234 0.392 0.032 0.036 0.186 60 F 0.009 0.005 0.076 0.165 0.267 0.053 0.035 0.390 61 M 0.010 0.002 0.092 0.388 0.290 0.035 0.031 0.151 62 I 0.026 0.003 0.082 0.140 0.155 0.069 0.076 0.449 63 V 0.105 0.005 0.071 0.085 0.120 0.081 0.093 0.439 64 F 0.161 0.003 0.023 0.026 0.036 0.072 0.043 0.635 65 D 0.037 0.003 0.016 0.034 0.065 0.082 0.030 0.733 66 K 0.003 0.001 0.054 0.046 0.212 0.094 0.030 0.560 67 F 0.002 0.001 0.083 0.217 0.433 0.048 0.035 0.181 68 V 0.005 0.002 0.099 0.327 0.267 0.036 0.039 0.225 69 I 0.007 0.006 0.106 0.281 0.238 0.038 0.042 0.282 70 S 0.016 0.020 0.122 0.144 0.268 0.057 0.097 0.275 71 G 0.023 0.047 0.130 0.190 0.226 0.060 0.124 0.200 72 T 0.041 0.150 0.073 0.144 0.217 0.063 0.062 0.250 73 I 0.032 0.089 0.040 0.147 0.322 0.042 0.129 0.198 74 S 0.014 0.060 0.036 0.190 0.381 0.040 0.114 0.166 75 Q 0.017 0.035 0.029 0.310 0.429 0.029 0.043 0.107 76 V 0.026 0.024 0.029 0.222 0.313 0.063 0.042 0.282 77 N 0.003 0.011 0.049 0.273 0.473 0.036 0.031 0.123 78 H 0.027 0.016 0.037 0.100 0.234 0.091 0.031 0.464 79 I 0.397 0.057 0.034 0.178 0.090 0.039 0.088 0.117 80 D 0.078 0.066 0.015 0.058 0.121 0.076 0.031 0.555 81 G 0.031 0.011 0.034 0.039 0.169 0.056 0.055 0.604 82 R 0.022 0.008 0.029 0.410 0.225 0.066 0.030 0.210 83 I 0.044 0.006 0.029 0.075 0.097 0.097 0.021 0.631 84 V 0.016 0.005 0.017 0.066 0.099 0.100 0.021 0.675 85 N 0.021 0.009 0.016 0.033 0.045 0.095 0.036 0.746 86 E 0.290 0.100 0.005 0.018 0.016 0.069 0.060 0.441 87 P 0.238 0.108 0.010 0.020 0.018 0.078 0.086 0.442 88 S 0.096 0.239 0.010 0.010 0.015 0.085 0.057 0.488 89 E 0.075 0.245 0.008 0.006 0.012 0.100 0.022 0.533 90 L 0.043 0.237 0.011 0.013 0.012 0.108 0.038 0.538 91 N 0.043 0.825 0.002 0.002 0.004 0.015 0.030 0.080 92 Q 0.083 0.794 0.002 0.001 0.002 0.013 0.039 0.066 93 E 0.015 0.372 0.024 0.019 0.014 0.049 0.321 0.186 94 E 0.032 0.536 0.010 0.007 0.011 0.037 0.219 0.149 95 V 0.133 0.448 0.014 0.006 0.009 0.032 0.243 0.115 96 E 0.097 0.519 0.010 0.011 0.021 0.038 0.075 0.229 97 T 0.050 0.149 0.007 0.005 0.009 0.063 0.167 0.549 98 L 0.009 0.375 0.013 0.018 0.014 0.100 0.122 0.350 99 A 0.031 0.680 0.006 0.003 0.006 0.036 0.069 0.169 100 R 0.042 0.714 0.005 0.005 0.003 0.017 0.155 0.058 101 P 0.007 0.909 0.008 0.002 0.003 0.009 0.029 0.033 102 C 0.016 0.927 0.004 0.001 0.001 0.004 0.027 0.019 103 L 0.026 0.577 0.041 0.006 0.003 0.012 0.296 0.038 104 N 0.025 0.666 0.052 0.006 0.006 0.021 0.142 0.082 105 M 0.145 0.485 0.054 0.003 0.006 0.036 0.111 0.158 106 L 0.147 0.103 0.128 0.010 0.008 0.058 0.293 0.253 107 N 0.077 0.113 0.020 0.007 0.010 0.062 0.060 0.652 108 R 0.012 0.075 0.018 0.002 0.006 0.074 0.017 0.796 109 L 0.016 0.161 0.084 0.047 0.060 0.177 0.064 0.391 110 T 0.027 0.156 0.043 0.025 0.062 0.069 0.391 0.227 111 Y 0.010 0.379 0.049 0.064 0.054 0.050 0.235 0.160 112 E 0.012 0.589 0.072 0.059 0.095 0.024 0.065 0.083 113 V 0.027 0.444 0.064 0.083 0.122 0.025 0.139 0.097 114 T 0.053 0.253 0.099 0.121 0.166 0.032 0.157 0.119 115 E 0.056 0.057 0.083 0.230 0.215 0.040 0.152 0.168 116 I 0.087 0.031 0.038 0.128 0.143 0.102 0.032 0.440 117 A 0.046 0.009 0.040 0.111 0.187 0.111 0.059 0.437 118 L 0.005 0.001 0.021 0.042 0.061 0.109 0.031 0.730 119 D 0.342 0.008 0.012 0.028 0.043 0.069 0.075 0.423 120 L 0.280 0.006 0.007 0.031 0.020 0.097 0.057 0.502 121 P 0.014 0.003 0.036 0.015 0.067 0.154 0.019 0.691 122 G 0.007 0.002 0.047 0.025 0.102 0.079 0.036 0.702 123 I 0.010 0.002 0.111 0.219 0.135 0.092 0.038 0.394 124 N 0.040 0.004 0.180 0.095 0.131 0.068 0.076 0.407 125 L 0.031 0.005 0.089 0.140 0.133 0.082 0.063 0.458 126 E 0.018 0.004 0.132 0.055 0.097 0.085 0.044 0.565 127 F 0.036 0.008 0.060 0.068 0.093 0.080 0.070 0.585