# TARGET T0383 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0383.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 7.60968 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.050 0.104 0.016 0.021 0.034 0.086 0.071 0.618 2 N 0.048 0.284 0.016 0.038 0.066 0.082 0.076 0.391 3 A 0.068 0.240 0.023 0.033 0.058 0.092 0.052 0.435 4 M 0.047 0.120 0.052 0.096 0.096 0.088 0.090 0.411 5 N 0.075 0.181 0.039 0.060 0.075 0.076 0.096 0.399 6 L 0.099 0.133 0.039 0.037 0.046 0.070 0.090 0.485 7 K 0.082 0.117 0.031 0.049 0.053 0.098 0.058 0.513 8 R 0.056 0.133 0.011 0.016 0.024 0.057 0.068 0.635 9 E 0.062 0.388 0.009 0.014 0.023 0.063 0.056 0.385 10 Q 0.026 0.186 0.031 0.042 0.062 0.067 0.218 0.368 11 E 0.013 0.135 0.050 0.098 0.095 0.101 0.200 0.308 12 F 0.073 0.174 0.079 0.066 0.087 0.063 0.183 0.275 13 V 0.173 0.121 0.057 0.057 0.063 0.083 0.113 0.333 14 S 0.081 0.098 0.033 0.036 0.064 0.070 0.074 0.544 15 Q 0.018 0.050 0.038 0.026 0.053 0.123 0.039 0.654 16 Y 0.024 0.091 0.103 0.083 0.124 0.126 0.061 0.387 17 H 0.064 0.101 0.090 0.083 0.114 0.092 0.104 0.352 18 F 0.056 0.060 0.106 0.091 0.091 0.078 0.138 0.380 19 D 0.176 0.104 0.053 0.057 0.068 0.086 0.108 0.348 20 A 0.104 0.056 0.029 0.030 0.036 0.109 0.036 0.601 21 R 0.025 0.057 0.018 0.018 0.035 0.091 0.025 0.730 22 N 0.153 0.253 0.009 0.012 0.022 0.074 0.039 0.437 23 F 0.053 0.155 0.024 0.048 0.041 0.116 0.120 0.443 24 E 0.089 0.230 0.015 0.031 0.034 0.090 0.069 0.441 25 W 0.256 0.120 0.021 0.030 0.038 0.064 0.198 0.274 26 E 0.086 0.028 0.029 0.041 0.049 0.105 0.121 0.542 27 N 0.517 0.014 0.006 0.014 0.023 0.035 0.036 0.353 28 E 0.089 0.003 0.005 0.013 0.016 0.101 0.018 0.756 29 N 0.005 0.001 0.009 0.012 0.039 0.120 0.010 0.804 30 G 0.015 0.001 0.008 0.015 0.040 0.095 0.026 0.800 31 A 0.056 0.004 0.022 0.076 0.039 0.109 0.076 0.618 32 P 0.091 0.009 0.040 0.064 0.090 0.094 0.050 0.562 33 E 0.024 0.002 0.030 0.036 0.094 0.070 0.038 0.705 34 T 0.014 0.003 0.103 0.154 0.237 0.073 0.034 0.382 35 K 0.007 0.003 0.067 0.106 0.234 0.066 0.034 0.483 36 V 0.007 0.008 0.083 0.166 0.191 0.077 0.025 0.443 37 D 0.026 0.028 0.119 0.173 0.205 0.068 0.034 0.347 38 V 0.041 0.090 0.070 0.112 0.114 0.065 0.041 0.468 39 N 0.098 0.441 0.043 0.054 0.067 0.036 0.043 0.217 40 F 0.110 0.319 0.064 0.072 0.070 0.039 0.070 0.257 41 Q 0.078 0.285 0.038 0.088 0.071 0.054 0.058 0.329 42 L 0.124 0.151 0.053 0.047 0.057 0.070 0.089 0.409 43 L 0.171 0.159 0.017 0.036 0.037 0.089 0.062 0.429 44 Q 0.146 0.136 0.007 0.016 0.019 0.046 0.048 0.581 45 H 0.032 0.062 0.006 0.010 0.014 0.073 0.066 0.739 46 D 0.145 0.137 0.011 0.023 0.020 0.081 0.147 0.436 47 Q 0.372 0.103 0.004 0.012 0.013 0.043 0.055 0.399 48 E 0.058 0.024 0.007 0.011 0.027 0.083 0.083 0.707 49 N 0.014 0.016 0.018 0.026 0.069 0.123 0.205 0.530 50 Q 0.019 0.030 0.023 0.073 0.117 0.101 0.138 0.498 51 V 0.025 0.042 0.041 0.088 0.141 0.087 0.055 0.521 52 T 0.013 0.035 0.073 0.138 0.365 0.067 0.068 0.240 53 S 0.004 0.016 0.098 0.202 0.442 0.030 0.061 0.147 54 L 0.003 0.010 0.093 0.320 0.443 0.018 0.046 0.067 55 I 0.002 0.004 0.118 0.325 0.366 0.017 0.076 0.091 56 V 0.002 0.004 0.087 0.432 0.394 0.012 0.031 0.037 57 I 0.007 0.005 0.139 0.179 0.412 0.028 0.051 0.177 58 L 0.012 0.004 0.072 0.407 0.348 0.025 0.031 0.100 59 S 0.011 0.005 0.086 0.220 0.410 0.034 0.041 0.192 60 F 0.009 0.005 0.072 0.177 0.315 0.051 0.036 0.336 61 M 0.006 0.002 0.090 0.395 0.334 0.028 0.028 0.118 62 I 0.014 0.002 0.089 0.174 0.192 0.058 0.069 0.402 63 V 0.072 0.004 0.098 0.128 0.162 0.073 0.093 0.371 64 F 0.150 0.003 0.030 0.033 0.043 0.074 0.048 0.619 65 D 0.041 0.003 0.020 0.036 0.067 0.083 0.031 0.719 66 K 0.003 0.001 0.060 0.044 0.202 0.096 0.029 0.564 67 F 0.002 0.001 0.092 0.204 0.421 0.050 0.037 0.192 68 V 0.005 0.002 0.104 0.328 0.260 0.036 0.040 0.226 69 I 0.007 0.006 0.111 0.274 0.231 0.039 0.044 0.289 70 S 0.016 0.020 0.127 0.144 0.263 0.057 0.099 0.275 71 G 0.023 0.046 0.134 0.185 0.219 0.061 0.124 0.207 72 T 0.043 0.148 0.074 0.137 0.211 0.064 0.063 0.259 73 I 0.034 0.090 0.040 0.143 0.313 0.044 0.129 0.207 74 S 0.015 0.060 0.036 0.184 0.374 0.042 0.115 0.175 75 Q 0.018 0.035 0.029 0.305 0.423 0.031 0.045 0.114 76 V 0.026 0.023 0.028 0.218 0.310 0.064 0.043 0.288 77 N 0.003 0.011 0.047 0.270 0.470 0.037 0.032 0.129 78 H 0.027 0.015 0.036 0.100 0.235 0.090 0.030 0.467 79 I 0.377 0.054 0.034 0.185 0.095 0.041 0.086 0.129 80 D 0.076 0.063 0.014 0.058 0.118 0.075 0.029 0.567 81 G 0.031 0.011 0.035 0.040 0.164 0.057 0.055 0.606 82 R 0.024 0.008 0.029 0.399 0.218 0.068 0.031 0.223 83 I 0.049 0.006 0.030 0.071 0.092 0.097 0.022 0.632 84 V 0.016 0.005 0.017 0.062 0.094 0.102 0.021 0.683 85 N 0.020 0.009 0.016 0.031 0.045 0.093 0.036 0.750 86 E 0.266 0.097 0.006 0.020 0.018 0.073 0.060 0.459 87 P 0.218 0.106 0.011 0.022 0.020 0.080 0.089 0.453 88 S 0.096 0.250 0.011 0.010 0.016 0.083 0.058 0.475 89 E 0.074 0.253 0.008 0.006 0.012 0.100 0.022 0.524 90 L 0.042 0.236 0.013 0.014 0.012 0.108 0.037 0.540 91 N 0.045 0.829 0.002 0.002 0.003 0.014 0.030 0.075 92 Q 0.098 0.791 0.002 0.001 0.002 0.012 0.036 0.058 93 E 0.017 0.370 0.024 0.017 0.013 0.049 0.306 0.205 94 E 0.035 0.509 0.010 0.006 0.009 0.041 0.216 0.175 95 V 0.143 0.422 0.013 0.005 0.008 0.035 0.249 0.125 96 E 0.108 0.496 0.010 0.010 0.018 0.041 0.073 0.246 97 T 0.053 0.140 0.007 0.004 0.007 0.063 0.158 0.568 98 L 0.009 0.359 0.014 0.016 0.012 0.105 0.118 0.366 99 A 0.034 0.648 0.007 0.003 0.006 0.038 0.076 0.188 100 R 0.047 0.691 0.006 0.006 0.003 0.020 0.163 0.065 101 P 0.007 0.897 0.010 0.002 0.003 0.010 0.031 0.038 102 C 0.016 0.928 0.004 0.001 0.001 0.004 0.025 0.020 103 L 0.027 0.597 0.043 0.005 0.003 0.013 0.270 0.041 104 N 0.025 0.679 0.051 0.006 0.006 0.020 0.135 0.078 105 M 0.145 0.501 0.053 0.003 0.006 0.034 0.109 0.148 106 L 0.147 0.107 0.127 0.010 0.008 0.056 0.301 0.242 107 N 0.075 0.120 0.020 0.007 0.010 0.061 0.062 0.644 108 R 0.012 0.078 0.018 0.003 0.006 0.073 0.018 0.792 109 L 0.017 0.166 0.081 0.047 0.060 0.174 0.065 0.389 110 T 0.027 0.157 0.042 0.025 0.062 0.069 0.393 0.226 111 Y 0.010 0.381 0.047 0.063 0.054 0.050 0.231 0.163 112 E 0.012 0.585 0.069 0.061 0.097 0.025 0.067 0.085 113 V 0.026 0.455 0.062 0.081 0.114 0.025 0.139 0.098 114 T 0.049 0.280 0.095 0.114 0.157 0.031 0.161 0.114 115 E 0.056 0.066 0.088 0.215 0.203 0.040 0.164 0.169 116 I 0.092 0.038 0.042 0.134 0.147 0.098 0.035 0.416 117 A 0.056 0.011 0.042 0.107 0.179 0.107 0.062 0.438 118 L 0.005 0.002 0.025 0.049 0.070 0.110 0.035 0.705 119 D 0.294 0.007 0.013 0.028 0.046 0.070 0.066 0.475 120 L 0.342 0.005 0.007 0.029 0.018 0.088 0.056 0.453 121 P 0.015 0.003 0.029 0.014 0.055 0.152 0.016 0.715 122 G 0.007 0.002 0.042 0.020 0.093 0.079 0.031 0.726 123 I 0.011 0.002 0.102 0.207 0.132 0.093 0.040 0.412 124 N 0.040 0.005 0.178 0.102 0.134 0.067 0.076 0.398 125 L 0.030 0.005 0.089 0.140 0.135 0.076 0.062 0.463 126 E 0.017 0.004 0.140 0.062 0.109 0.083 0.044 0.541 127 F 0.033 0.007 0.063 0.071 0.097 0.076 0.068 0.583