# TARGET T0382 # Using neural net t2k-5631-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-CB-burial-14-7-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 CB_burial_14_7 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0382.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 10 # Pos AA A B C D E F G 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.679 0.215 0.077 0.025 0.004 0.001 0.001 2 S 0.786 0.166 0.036 0.010 0.002 0.001 0.001 3 K 0.663 0.196 0.082 0.042 0.014 0.003 0.001 4 L 0.677 0.186 0.075 0.042 0.016 0.004 0.001 5 D 0.683 0.205 0.070 0.030 0.009 0.002 0.001 6 L 0.527 0.203 0.124 0.095 0.038 0.010 0.002 7 H 0.426 0.308 0.151 0.082 0.028 0.005 0.001 8 Q 0.283 0.343 0.202 0.115 0.045 0.012 0.001 9 M 0.172 0.189 0.230 0.235 0.133 0.038 0.002 10 T 0.214 0.389 0.245 0.122 0.026 0.003 0.001 11 T 0.063 0.142 0.200 0.316 0.227 0.049 0.002 12 Q 0.279 0.445 0.207 0.060 0.009 0.001 0.001 13 D 0.140 0.451 0.294 0.099 0.015 0.001 0.001 14 L 0.012 0.028 0.080 0.240 0.434 0.200 0.006 15 V 0.002 0.016 0.047 0.175 0.399 0.334 0.027 16 A 0.023 0.248 0.337 0.262 0.104 0.025 0.002 17 L 0.003 0.027 0.172 0.440 0.289 0.066 0.003 18 F 0.001 0.002 0.003 0.013 0.115 0.619 0.247 19 A 0.004 0.019 0.066 0.223 0.372 0.265 0.052 20 K 0.031 0.233 0.343 0.278 0.092 0.021 0.002 21 V 0.004 0.016 0.053 0.208 0.371 0.303 0.046 22 T 0.002 0.008 0.011 0.033 0.147 0.554 0.246 23 V 0.015 0.072 0.157 0.290 0.283 0.157 0.027 24 E 0.023 0.101 0.186 0.341 0.250 0.084 0.016 25 Q 0.017 0.029 0.033 0.078 0.206 0.444 0.194 26 D 0.063 0.106 0.146 0.236 0.225 0.182 0.044 27 D 0.101 0.264 0.278 0.223 0.102 0.030 0.003 28 A 0.051 0.076 0.142 0.311 0.315 0.099 0.007 29 L 0.081 0.079 0.079 0.133 0.233 0.326 0.069 30 L 0.129 0.194 0.201 0.243 0.160 0.064 0.008 31 G 0.152 0.279 0.263 0.182 0.091 0.029 0.003 32 N 0.204 0.185 0.173 0.200 0.157 0.070 0.010 33 Q 0.282 0.257 0.202 0.146 0.075 0.032 0.006 34 I 0.216 0.233 0.218 0.182 0.106 0.039 0.005 35 S 0.303 0.270 0.173 0.136 0.082 0.031 0.004 36 R 0.291 0.249 0.191 0.156 0.076 0.031 0.005 37 F 0.130 0.103 0.126 0.229 0.256 0.138 0.018 38 N 0.342 0.287 0.183 0.117 0.054 0.016 0.002 39 R 0.246 0.277 0.214 0.157 0.073 0.028 0.005 40 L 0.083 0.087 0.104 0.191 0.264 0.240 0.031 41 F 0.051 0.079 0.142 0.267 0.292 0.154 0.014 42 G 0.286 0.353 0.198 0.104 0.042 0.015 0.002 43 V 0.166 0.255 0.245 0.212 0.095 0.025 0.002 44 M 0.045 0.082 0.119 0.210 0.291 0.234 0.019 45 A 0.214 0.334 0.259 0.138 0.046 0.008 0.001 46 E 0.178 0.413 0.278 0.102 0.025 0.004 0.001 47 I 0.041 0.043 0.074 0.210 0.395 0.228 0.010 48 A 0.047 0.137 0.247 0.345 0.185 0.038 0.002 49 D 0.345 0.468 0.145 0.034 0.007 0.001 0.001 50 E 0.108 0.195 0.324 0.281 0.082 0.009 0.001 51 L 0.048 0.053 0.091 0.255 0.372 0.174 0.008 52 K 0.303 0.372 0.212 0.090 0.021 0.003 0.001 53 A 0.656 0.268 0.059 0.014 0.002 0.001 0.001 54 R 0.351 0.273 0.208 0.124 0.038 0.007 0.001 55 D 0.560 0.266 0.099 0.051 0.019 0.005 0.001 56 G 0.419 0.256 0.174 0.104 0.038 0.008 0.001 57 D 0.277 0.285 0.193 0.149 0.073 0.019 0.003 58 Q 0.132 0.165 0.171 0.212 0.189 0.113 0.018 59 R 0.080 0.130 0.161 0.218 0.233 0.152 0.025 60 T 0.193 0.276 0.255 0.179 0.074 0.019 0.003 61 A 0.120 0.135 0.135 0.196 0.209 0.157 0.048 62 L 0.035 0.026 0.030 0.081 0.193 0.432 0.204 63 L 0.065 0.083 0.128 0.238 0.248 0.193 0.047 64 S 0.091 0.174 0.226 0.248 0.169 0.079 0.014 65 L 0.060 0.065 0.100 0.180 0.285 0.269 0.041 66 F 0.046 0.057 0.067 0.149 0.266 0.353 0.063 67 E 0.070 0.247 0.342 0.251 0.076 0.013 0.001 68 Y 0.132 0.259 0.259 0.211 0.109 0.027 0.003 69 P 0.456 0.343 0.126 0.053 0.017 0.004 0.001 70 N 0.136 0.301 0.268 0.208 0.070 0.014 0.001 71 M 0.063 0.158 0.229 0.283 0.220 0.044 0.002 72 Q 0.173 0.344 0.260 0.164 0.050 0.010 0.001 73 V 0.022 0.074 0.132 0.207 0.263 0.232 0.070 74 R 0.008 0.026 0.049 0.142 0.346 0.351 0.077 75 L 0.004 0.030 0.077 0.218 0.348 0.284 0.040 76 Q 0.037 0.133 0.246 0.316 0.170 0.078 0.019 77 A 0.020 0.052 0.051 0.097 0.193 0.359 0.226 78 A 0.010 0.017 0.047 0.155 0.280 0.381 0.110 79 K 0.031 0.143 0.200 0.278 0.197 0.116 0.035 80 L 0.091 0.153 0.175 0.223 0.215 0.111 0.032 81 T 0.023 0.048 0.081 0.126 0.219 0.377 0.127 82 L 0.051 0.090 0.110 0.225 0.313 0.186 0.025 83 A 0.100 0.180 0.216 0.225 0.163 0.097 0.019 84 V 0.112 0.118 0.112 0.156 0.211 0.238 0.053 85 A 0.085 0.143 0.189 0.325 0.192 0.060 0.005 86 P 0.179 0.279 0.262 0.179 0.079 0.020 0.002 87 V 0.687 0.233 0.060 0.017 0.004 0.001 0.001 88 K 0.380 0.411 0.154 0.046 0.008 0.001 0.001 89 A 0.019 0.038 0.115 0.320 0.384 0.120 0.004 90 R 0.043 0.269 0.354 0.235 0.084 0.015 0.001 91 E 0.210 0.526 0.192 0.056 0.013 0.003 0.001 92 Q 0.010 0.057 0.241 0.429 0.220 0.042 0.002 93 L 0.018 0.026 0.043 0.158 0.422 0.316 0.018 94 E 0.094 0.328 0.320 0.199 0.052 0.007 0.001 95 A 0.200 0.346 0.263 0.133 0.048 0.011 0.001 96 I 0.051 0.089 0.149 0.295 0.283 0.128 0.005 97 V 0.124 0.150 0.189 0.282 0.195 0.056 0.004 98 S 0.614 0.250 0.089 0.033 0.010 0.002 0.001 99 S 0.410 0.288 0.160 0.090 0.039 0.011 0.001 100 K 0.440 0.283 0.155 0.083 0.029 0.009 0.001 101 W 0.446 0.219 0.149 0.105 0.058 0.021 0.002 102 F 0.466 0.208 0.137 0.120 0.055 0.013 0.001 103 P 0.556 0.210 0.114 0.075 0.035 0.009 0.001 104 Q 0.647 0.197 0.084 0.047 0.019 0.006 0.001 105 A 0.589 0.204 0.102 0.063 0.029 0.011 0.002 106 G 0.461 0.192 0.117 0.110 0.071 0.036 0.013 107 D 0.366 0.232 0.155 0.116 0.074 0.041 0.016 108 A 0.377 0.206 0.136 0.117 0.090 0.057 0.015 109 G 0.398 0.248 0.146 0.111 0.060 0.030 0.008 110 M 0.284 0.211 0.171 0.155 0.106 0.060 0.012 111 C 0.299 0.190 0.136 0.148 0.130 0.085 0.013 112 L 0.296 0.204 0.163 0.164 0.109 0.056 0.009 113 D 0.393 0.282 0.159 0.096 0.050 0.018 0.002 114 L 0.395 0.248 0.165 0.120 0.056 0.015 0.001 115 L 0.341 0.224 0.185 0.159 0.070 0.020 0.002 116 D 0.547 0.235 0.123 0.066 0.023 0.005 0.001 117 D 0.651 0.225 0.083 0.030 0.010 0.002 0.001 118 G 0.392 0.250 0.171 0.119 0.054 0.013 0.001 119 T 0.278 0.263 0.222 0.151 0.069 0.016 0.001 120 F 0.228 0.204 0.203 0.204 0.125 0.036 0.002 121 K 0.399 0.301 0.176 0.094 0.025 0.004 0.001 122 P 0.595 0.233 0.107 0.051 0.013 0.002 0.001 123 K 0.792 0.157 0.035 0.013 0.003 0.001 0.001