# TARGET T0381 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0381.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1165 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.027 0.006 0.017 0.044 0.057 0.117 0.035 0.696 2 T 0.185 0.022 0.015 0.032 0.049 0.110 0.056 0.530 3 A 0.030 0.009 0.009 0.016 0.024 0.122 0.044 0.745 4 T 0.045 0.031 0.014 0.013 0.020 0.127 0.045 0.704 5 E 0.133 0.068 0.018 0.022 0.022 0.134 0.060 0.543 6 P 0.082 0.061 0.016 0.012 0.015 0.098 0.044 0.671 7 T 0.382 0.116 0.015 0.013 0.022 0.055 0.095 0.304 8 E 0.170 0.033 0.016 0.016 0.022 0.110 0.046 0.587 9 K 0.028 0.011 0.017 0.021 0.039 0.107 0.044 0.732 10 I 0.036 0.012 0.013 0.012 0.021 0.129 0.040 0.737 11 L 0.044 0.019 0.019 0.023 0.032 0.193 0.045 0.625 12 P 0.039 0.022 0.008 0.006 0.006 0.083 0.021 0.815 13 S 0.329 0.266 0.005 0.006 0.007 0.046 0.080 0.261 14 P 0.107 0.261 0.009 0.005 0.009 0.084 0.041 0.485 15 D 0.023 0.219 0.025 0.016 0.027 0.105 0.160 0.425 16 Y 0.014 0.672 0.008 0.005 0.007 0.033 0.111 0.149 17 V 0.014 0.900 0.004 0.002 0.002 0.010 0.034 0.033 18 Q 0.010 0.832 0.005 0.003 0.003 0.007 0.107 0.034 19 S 0.007 0.825 0.002 0.001 0.001 0.003 0.153 0.009 20 L 0.003 0.946 0.001 0.001 0.001 0.001 0.046 0.004 21 A 0.002 0.933 0.001 0.001 0.001 0.002 0.055 0.007 22 R 0.001 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.002 23 G 0.001 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.001 24 L 0.002 0.920 0.003 0.001 0.001 0.001 0.071 0.002 25 A 0.001 0.982 0.002 0.001 0.001 0.001 0.009 0.003 26 V 0.009 0.954 0.010 0.001 0.001 0.003 0.018 0.005 27 I 0.018 0.874 0.034 0.005 0.002 0.005 0.050 0.013 28 R 0.046 0.715 0.054 0.007 0.006 0.014 0.048 0.110 29 C 0.098 0.456 0.068 0.005 0.006 0.050 0.078 0.240 30 F 0.134 0.090 0.207 0.025 0.012 0.058 0.269 0.204 31 D 0.175 0.042 0.018 0.006 0.006 0.062 0.060 0.631 32 H 0.097 0.016 0.012 0.002 0.003 0.058 0.037 0.775 33 R 0.075 0.017 0.008 0.004 0.005 0.106 0.018 0.767 34 N 0.038 0.010 0.006 0.002 0.003 0.069 0.055 0.816 35 Q 0.050 0.118 0.009 0.004 0.006 0.111 0.039 0.663 36 R 0.042 0.117 0.023 0.006 0.009 0.101 0.139 0.563 37 R 0.018 0.219 0.040 0.023 0.013 0.087 0.181 0.418 38 T 0.015 0.878 0.009 0.002 0.003 0.011 0.036 0.046 39 L 0.011 0.957 0.003 0.001 0.001 0.003 0.010 0.014 40 S 0.004 0.935 0.012 0.002 0.003 0.004 0.029 0.012 41 D 0.014 0.958 0.004 0.001 0.001 0.002 0.011 0.010 42 V 0.054 0.080 0.048 0.002 0.003 0.011 0.785 0.016 43 A 0.015 0.044 0.033 0.004 0.003 0.012 0.857 0.030 44 R 0.430 0.085 0.012 0.001 0.003 0.039 0.031 0.399 45 A 0.072 0.013 0.013 0.004 0.003 0.075 0.067 0.753 46 T 0.010 0.018 0.010 0.003 0.006 0.124 0.070 0.759 47 D 0.034 0.035 0.005 0.002 0.004 0.163 0.024 0.734 48 L 0.021 0.035 0.011 0.007 0.003 0.115 0.267 0.541 49 T 0.045 0.822 0.003 0.001 0.001 0.015 0.065 0.050 50 R 0.016 0.892 0.002 0.001 0.001 0.013 0.024 0.052 51 A 0.003 0.903 0.012 0.002 0.002 0.007 0.044 0.027 52 T 0.002 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 53 A 0.001 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 54 R 0.001 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 55 R 0.001 0.175 0.001 0.001 0.001 0.002 0.814 0.004 56 F 0.001 0.695 0.001 0.001 0.001 0.001 0.300 0.002 57 L 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 58 L 0.002 0.964 0.003 0.006 0.003 0.002 0.014 0.008 59 T 0.008 0.916 0.006 0.004 0.009 0.004 0.046 0.007 60 L 0.172 0.484 0.048 0.010 0.010 0.018 0.217 0.041 61 V 0.454 0.186 0.031 0.034 0.016 0.051 0.078 0.151 62 E 0.038 0.052 0.004 0.002 0.004 0.041 0.015 0.843 63 L 0.015 0.043 0.022 0.008 0.044 0.127 0.022 0.720 64 G 0.021 0.011 0.070 0.207 0.290 0.071 0.136 0.194 65 Y 0.020 0.004 0.020 0.220 0.200 0.082 0.072 0.382 66 V 0.011 0.002 0.036 0.295 0.343 0.041 0.030 0.241 67 A 0.011 0.001 0.025 0.128 0.221 0.081 0.027 0.506 68 T 0.078 0.002 0.025 0.052 0.055 0.082 0.055 0.652 69 D 0.173 0.008 0.012 0.031 0.037 0.099 0.030 0.611 70 G 0.052 0.005 0.012 0.012 0.032 0.095 0.024 0.767 71 S 0.051 0.011 0.029 0.055 0.116 0.115 0.056 0.567 72 A 0.012 0.004 0.041 0.091 0.163 0.071 0.080 0.538 73 F 0.011 0.009 0.063 0.184 0.168 0.078 0.049 0.439 74 W 0.007 0.009 0.078 0.127 0.155 0.082 0.039 0.503 75 L 0.021 0.079 0.067 0.062 0.069 0.079 0.032 0.590 76 T 0.120 0.584 0.019 0.021 0.023 0.026 0.092 0.115 77 P 0.057 0.655 0.031 0.013 0.014 0.031 0.061 0.138 78 R 0.022 0.798 0.014 0.012 0.019 0.016 0.057 0.062 79 V 0.038 0.757 0.027 0.006 0.011 0.016 0.079 0.065 80 L 0.042 0.779 0.022 0.014 0.016 0.022 0.053 0.052 81 E 0.025 0.330 0.047 0.013 0.018 0.036 0.324 0.207 82 L 0.024 0.607 0.028 0.007 0.012 0.033 0.204 0.086 83 G 0.086 0.717 0.022 0.006 0.009 0.023 0.068 0.069 84 Y 0.129 0.247 0.036 0.011 0.014 0.059 0.223 0.279 85 S 0.019 0.106 0.049 0.012 0.015 0.056 0.509 0.234 86 Y 0.184 0.152 0.034 0.008 0.012 0.086 0.175 0.350 87 L 0.270 0.027 0.049 0.015 0.014 0.098 0.132 0.394 88 S 0.060 0.017 0.010 0.004 0.006 0.090 0.042 0.772 89 S 0.058 0.020 0.010 0.002 0.005 0.097 0.034 0.774 90 L 0.015 0.020 0.024 0.009 0.007 0.189 0.024 0.712 91 S 0.058 0.097 0.014 0.004 0.004 0.093 0.031 0.698 92 L 0.186 0.376 0.019 0.005 0.004 0.048 0.144 0.218 93 P 0.118 0.543 0.022 0.003 0.005 0.040 0.079 0.191 94 E 0.076 0.260 0.042 0.009 0.010 0.056 0.216 0.332 95 V 0.011 0.467 0.038 0.011 0.014 0.073 0.117 0.267 96 A 0.017 0.890 0.009 0.001 0.003 0.012 0.022 0.046 97 Q 0.016 0.929 0.006 0.002 0.002 0.006 0.016 0.023 98 P 0.007 0.930 0.010 0.001 0.002 0.006 0.017 0.026 99 H 0.018 0.944 0.003 0.001 0.001 0.003 0.022 0.009 100 L 0.043 0.538 0.017 0.001 0.001 0.006 0.374 0.019 101 E 0.009 0.562 0.012 0.001 0.001 0.010 0.346 0.059 102 K 0.020 0.872 0.008 0.001 0.001 0.009 0.021 0.069 103 L 0.134 0.598 0.027 0.004 0.003 0.029 0.098 0.108 104 S 0.082 0.214 0.036 0.007 0.006 0.049 0.293 0.313 105 H 0.183 0.201 0.008 0.002 0.003 0.053 0.051 0.499 106 K 0.132 0.050 0.023 0.006 0.005 0.106 0.128 0.549 107 V 0.031 0.037 0.028 0.006 0.013 0.190 0.210 0.486 108 H 0.025 0.053 0.035 0.006 0.016 0.112 0.124 0.630 109 E 0.042 0.100 0.086 0.037 0.047 0.119 0.079 0.489 110 S 0.025 0.071 0.106 0.035 0.065 0.112 0.166 0.420 111 S 0.026 0.081 0.109 0.089 0.170 0.097 0.130 0.299 112 S 0.026 0.035 0.134 0.164 0.265 0.057 0.094 0.226 113 V 0.015 0.011 0.086 0.287 0.253 0.054 0.071 0.224 114 S 0.005 0.003 0.128 0.216 0.398 0.034 0.077 0.139 115 I 0.053 0.002 0.070 0.173 0.293 0.065 0.067 0.277 116 L 0.199 0.002 0.050 0.075 0.077 0.080 0.076 0.441 117 D 0.038 0.002 0.010 0.019 0.047 0.094 0.011 0.780 118 G 0.011 0.003 0.016 0.010 0.063 0.103 0.019 0.775 119 A 0.006 0.005 0.053 0.166 0.308 0.111 0.034 0.317 120 D 0.003 0.006 0.116 0.276 0.382 0.025 0.031 0.160 121 I 0.002 0.005 0.112 0.346 0.352 0.015 0.028 0.140 122 V 0.001 0.001 0.283 0.327 0.338 0.005 0.018 0.026 123 Y 0.013 0.003 0.110 0.354 0.430 0.008 0.033 0.048 124 V 0.037 0.003 0.111 0.381 0.279 0.020 0.038 0.130 125 A 0.009 0.002 0.038 0.179 0.378 0.051 0.018 0.323 126 R 0.008 0.002 0.024 0.071 0.183 0.070 0.026 0.617 127 V 0.016 0.004 0.026 0.215 0.178 0.109 0.034 0.417 128 P 0.067 0.011 0.019 0.055 0.063 0.082 0.040 0.663 129 V 0.238 0.047 0.010 0.037 0.046 0.074 0.059 0.488 130 S 0.047 0.015 0.027 0.021 0.030 0.085 0.071 0.704 131 R 0.060 0.036 0.033 0.061 0.100 0.110 0.112 0.487 132 I 0.031 0.022 0.048 0.049 0.098 0.089 0.083 0.581 133 M 0.034 0.018 0.061 0.110 0.202 0.110 0.054 0.412 134 T 0.020 0.008 0.069 0.112 0.202 0.064 0.116 0.409 135 V 0.014 0.011 0.073 0.140 0.200 0.107 0.098 0.357 136 G 0.024 0.016 0.134 0.095 0.204 0.079 0.073 0.374 137 I 0.050 0.010 0.063 0.125 0.141 0.094 0.071 0.446 138 T 0.037 0.016 0.104 0.083 0.108 0.073 0.152 0.428 139 I 0.067 0.024 0.062 0.067 0.134 0.102 0.060 0.484 140 G 0.058 0.015 0.081 0.071 0.096 0.083 0.072 0.524 141 T 0.013 0.028 0.055 0.097 0.103 0.101 0.039 0.565 142 R 0.015 0.044 0.068 0.035 0.072 0.095 0.038 0.634 143 L 0.138 0.127 0.047 0.088 0.071 0.093 0.098 0.339 144 P 0.085 0.086 0.045 0.025 0.033 0.063 0.389 0.276 145 A 0.035 0.211 0.041 0.023 0.043 0.080 0.277 0.290 146 Y 0.032 0.274 0.061 0.028 0.050 0.067 0.218 0.270 147 A 0.029 0.568 0.037 0.028 0.032 0.047 0.079 0.180 148 T 0.044 0.602 0.030 0.013 0.022 0.050 0.083 0.156 149 S 0.023 0.806 0.011 0.010 0.013 0.022 0.047 0.067 150 M 0.013 0.838 0.007 0.004 0.011 0.022 0.050 0.055 151 G 0.007 0.819 0.022 0.008 0.013 0.010 0.091 0.029 152 R 0.020 0.785 0.035 0.026 0.033 0.014 0.061 0.026 153 V 0.063 0.161 0.278 0.039 0.054 0.031 0.296 0.079 154 L 0.290 0.116 0.136 0.075 0.089 0.062 0.108 0.123 155 L 0.288 0.011 0.058 0.021 0.031 0.064 0.093 0.434 156 A 0.009 0.011 0.019 0.011 0.022 0.125 0.059 0.743 157 G 0.012 0.021 0.012 0.009 0.019 0.137 0.020 0.769 158 L 0.051 0.101 0.010 0.011 0.007 0.162 0.035 0.623 159 P 0.097 0.723 0.001 0.001 0.001 0.020 0.044 0.112 160 D 0.079 0.860 0.001 0.001 0.001 0.006 0.028 0.026 161 D 0.013 0.919 0.002 0.001 0.001 0.008 0.021 0.037 162 E 0.016 0.950 0.002 0.001 0.001 0.002 0.018 0.011 163 L 0.012 0.968 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.005 164 D 0.020 0.915 0.007 0.001 0.001 0.003 0.035 0.020 165 A 0.026 0.818 0.019 0.001 0.001 0.008 0.073 0.054 166 Y 0.158 0.587 0.028 0.002 0.001 0.019 0.111 0.094 167 L 0.297 0.193 0.047 0.003 0.002 0.038 0.184 0.237 168 E 0.050 0.243 0.009 0.001 0.001 0.036 0.032 0.629 169 K 0.075 0.180 0.012 0.001 0.001 0.050 0.024 0.657 170 L 0.061 0.156 0.040 0.010 0.005 0.114 0.082 0.533 171 D 0.244 0.147 0.018 0.003 0.003 0.056 0.052 0.476 172 I 0.217 0.048 0.032 0.004 0.004 0.079 0.168 0.449 173 Q 0.050 0.074 0.041 0.008 0.008 0.115 0.093 0.609 174 R 0.026 0.031 0.025 0.004 0.010 0.096 0.028 0.780 175 L 0.025 0.019 0.046 0.011 0.011 0.143 0.079 0.667 176 T 0.230 0.132 0.036 0.014 0.017 0.077 0.208 0.284 177 E 0.075 0.052 0.025 0.008 0.014 0.118 0.068 0.639 178 R 0.019 0.053 0.068 0.027 0.044 0.122 0.078 0.590 179 T 0.066 0.187 0.045 0.017 0.027 0.097 0.111 0.450 180 I 0.055 0.199 0.047 0.022 0.021 0.117 0.078 0.460 181 T 0.023 0.284 0.040 0.010 0.009 0.069 0.133 0.431 182 A 0.019 0.927 0.001 0.001 0.001 0.004 0.029 0.019 183 R 0.019 0.948 0.001 0.001 0.001 0.003 0.018 0.011 184 D 0.007 0.951 0.001 0.001 0.001 0.002 0.025 0.013 185 E 0.008 0.960 0.001 0.001 0.001 0.002 0.022 0.007 186 L 0.008 0.970 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.003 187 K 0.005 0.968 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.006 188 A 0.003 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.012 189 A 0.007 0.967 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.006 190 I 0.011 0.928 0.003 0.001 0.001 0.002 0.047 0.008 191 L 0.011 0.912 0.005 0.001 0.001 0.004 0.027 0.040 192 A 0.040 0.493 0.089 0.004 0.003 0.026 0.211 0.133 193 V 0.169 0.102 0.184 0.006 0.004 0.066 0.333 0.137 194 R 0.836 0.011 0.013 0.001 0.001 0.015 0.026 0.097 195 A 0.025 0.004 0.003 0.001 0.001 0.033 0.007 0.926 196 D 0.003 0.003 0.026 0.002 0.012 0.152 0.009 0.793 197 G 0.015 0.008 0.107 0.055 0.116 0.138 0.093 0.468 198 I 0.012 0.009 0.157 0.245 0.102 0.079 0.040 0.355 199 C 0.008 0.010 0.258 0.089 0.129 0.058 0.031 0.417 200 V 0.023 0.025 0.137 0.170 0.149 0.078 0.069 0.349 201 L 0.127 0.153 0.083 0.061 0.058 0.062 0.111 0.345 202 D 0.099 0.385 0.028 0.029 0.039 0.048 0.054 0.318 203 Q 0.051 0.445 0.025 0.029 0.042 0.054 0.053 0.302 204 E 0.034 0.199 0.056 0.071 0.064 0.086 0.144 0.347 205 L 0.214 0.305 0.015 0.029 0.028 0.062 0.088 0.258 206 E 0.332 0.218 0.009 0.012 0.018 0.042 0.136 0.231 207 A 0.020 0.052 0.019 0.020 0.039 0.105 0.121 0.625 208 G 0.031 0.071 0.027 0.031 0.070 0.095 0.284 0.391 209 L 0.061 0.065 0.045 0.068 0.075 0.121 0.136 0.428 210 R 0.088 0.032 0.075 0.086 0.190 0.111 0.070 0.348 211 S 0.020 0.009 0.048 0.046 0.082 0.084 0.085 0.627 212 M 0.007 0.007 0.209 0.137 0.239 0.124 0.053 0.225 213 A 0.020 0.007 0.113 0.071 0.188 0.084 0.066 0.452 214 A 0.014 0.005 0.128 0.337 0.206 0.066 0.046 0.198 215 P 0.027 0.008 0.166 0.067 0.148 0.090 0.049 0.445 216 I 0.055 0.007 0.070 0.161 0.164 0.102 0.107 0.334 217 R 0.015 0.002 0.068 0.052 0.064 0.096 0.055 0.650 218 G 0.373 0.007 0.016 0.012 0.023 0.080 0.064 0.425 219 A 0.382 0.006 0.010 0.014 0.013 0.088 0.067 0.421 220 S 0.030 0.008 0.008 0.007 0.028 0.094 0.011 0.814 221 G 0.009 0.007 0.026 0.017 0.123 0.121 0.027 0.669 222 L 0.006 0.007 0.058 0.303 0.308 0.076 0.037 0.205 223 T 0.017 0.011 0.066 0.275 0.354 0.039 0.057 0.180 224 V 0.005 0.006 0.101 0.238 0.323 0.042 0.058 0.228 225 A 0.001 0.002 0.226 0.228 0.479 0.010 0.025 0.027 226 A 0.002 0.003 0.117 0.218 0.507 0.014 0.052 0.087 227 V 0.003 0.003 0.158 0.371 0.395 0.012 0.023 0.036 228 N 0.013 0.007 0.127 0.269 0.449 0.025 0.041 0.069 229 I 0.012 0.016 0.113 0.165 0.257 0.090 0.038 0.308 230 S 0.026 0.043 0.115 0.077 0.131 0.099 0.038 0.471 231 T 0.123 0.093 0.065 0.082 0.085 0.100 0.124 0.328 232 P 0.276 0.099 0.023 0.022 0.031 0.073 0.069 0.407 233 A 0.164 0.057 0.021 0.033 0.042 0.079 0.176 0.429 234 A 0.033 0.095 0.014 0.015 0.028 0.105 0.055 0.655 235 R 0.032 0.124 0.013 0.019 0.033 0.117 0.024 0.638 236 Y 0.017 0.126 0.017 0.029 0.021 0.101 0.030 0.660 237 S 0.056 0.873 0.002 0.002 0.003 0.008 0.017 0.038 238 L 0.091 0.842 0.002 0.001 0.001 0.006 0.030 0.028 239 E 0.026 0.639 0.013 0.005 0.004 0.017 0.204 0.092 240 D 0.035 0.625 0.014 0.003 0.003 0.026 0.164 0.129 241 L 0.120 0.643 0.013 0.002 0.002 0.027 0.105 0.089 242 H 0.184 0.619 0.004 0.001 0.002 0.013 0.092 0.085 243 S 0.068 0.305 0.003 0.001 0.001 0.034 0.165 0.423 244 D 0.003 0.178 0.006 0.002 0.001 0.049 0.523 0.237 245 L 0.004 0.941 0.001 0.001 0.001 0.006 0.024 0.024 246 I 0.008 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 247 P 0.011 0.952 0.002 0.001 0.001 0.002 0.021 0.011 248 S 0.001 0.047 0.001 0.001 0.001 0.001 0.948 0.002 249 L 0.004 0.828 0.001 0.001 0.001 0.002 0.161 0.004 250 R 0.005 0.277 0.003 0.001 0.001 0.004 0.697 0.014 251 V 0.001 0.902 0.005 0.001 0.001 0.005 0.067 0.020 252 T 0.013 0.953 0.002 0.001 0.001 0.004 0.018 0.010 253 A 0.019 0.922 0.006 0.001 0.001 0.003 0.036 0.012 254 T 0.022 0.826 0.008 0.001 0.001 0.013 0.093 0.036 255 D 0.013 0.888 0.012 0.001 0.001 0.008 0.044 0.034 256 I 0.025 0.831 0.053 0.001 0.001 0.009 0.055 0.026 257 E 0.238 0.485 0.113 0.001 0.001 0.017 0.068 0.077 258 Q 0.169 0.138 0.086 0.003 0.002 0.058 0.176 0.369 259 D 0.073 0.105 0.078 0.002 0.002 0.060 0.080 0.602 260 L 0.070 0.029 0.027 0.003 0.003 0.098 0.069 0.701 261 A 0.056 0.024 0.023 0.005 0.004 0.113 0.036 0.738 262 T 0.150 0.018 0.018 0.003 0.005 0.083 0.055 0.668 263 V 0.088 0.012 0.023 0.008 0.008 0.151 0.042 0.669 264 N 0.068 0.011 0.016 0.005 0.011 0.090 0.041 0.758 265 R 0.035 0.012 0.020 0.009 0.014 0.118 0.032 0.760