PFRMAT QA TARGET T0381 AUTHOR 7072-3475-1278 METHOD linear combination of alignment based constraints and METHOD undertaker cost functions MODEL 1 QMODE 1 MetaTasser_TS4 0.737 HHpred2_TS1 0.734 Zhang-Server_TS3 0.733 Zhang-Server_TS5 0.733 MetaTasser_TS5 0.731 BayesHH_TS1 0.731 HHpred3_TS1 0.730 Pmodeller6_TS3 0.730 ROBETTA_TS5 0.730 Pmodeller6_TS2 0.730 ROBETTA_TS1 0.730 Zhang-Server_TS2 0.730 ROBETTA_TS3 0.729 Zhang-Server_TS4 0.729 Zhang-Server_TS1 0.729 3Dpro_TS1 0.729 FOLDpro_TS2 0.729 MetaTasser_TS2 0.728 ROBETTA_TS2 0.728 PROTINFO_TS5 0.728 Frankenstein_TS2 0.728 Phyre-2_TS4 0.727 ROBETTA_TS4 0.727 Pmodeller6_TS1 0.727 RAPTOR-ACE_TS5 0.727 Phyre-2_TS5 0.726 FOLDpro_TS3 0.726 Phyre-2_TS2 0.726 Phyre-2_TS3 0.726 HHpred1_TS1 0.726 RAPTOR_TS2 0.726 SP3_TS1 0.725 SPARKS2_TS1 0.725 Phyre-2_TS1 0.725 PROTINFO_TS3 0.725 Ma-OPUS-server2_TS2 0.724 Ma-OPUS-server_TS1 0.724 SP4_TS2 0.724 Bilab-ENABLE_TS1 0.724 FAMS_TS1 0.724 3Dpro_TS3 0.724 FOLDpro_TS1 0.724 Bilab-ENABLE_TS4 0.724 ROKKY_TS1 0.724 RAPTOR-ACE_TS1 0.723 ROKKY_TS2 0.723 Ma-OPUS-server2_TS1 0.723 RAPTOR_TS1 0.723 Frankenstein_TS1 0.722 RAPTOR-ACE_TS2 0.722 Bilab-ENABLE_TS2 0.722 SPARKS2_TS2 0.721 RAPTORESS_TS2 0.721 RAPTORESS_TS4 0.721 Pcons6_TS4 0.721 FUNCTION_TS3 0.720 RAPTOR-ACE_TS4 0.720 3Dpro_TS2 0.720 Bilab-ENABLE_TS3 0.719 PROTINFO-AB_TS1 0.719 RAPTORESS_TS3 0.719 SP3_TS2 0.719 SP4_TS1 0.719 Bilab-ENABLE_TS5 0.719 FAMSD_TS1 0.718 3Dpro_TS5 0.718 FOLDpro_TS5 0.718 Pcons6_TS2 0.718 Pcons6_TS5 0.718 GeneSilicoMetaServer_TS4 0.717 RAPTORESS_TS1 0.717 PROTINFO-AB_TS5 0.716 PROTINFO-AB_TS3 0.715 MetaTasser_TS3 0.715 Pcons6_TS1 0.715 PROTINFO_TS2 0.715 FUNCTION_TS1 0.715 CIRCLE_TS5 0.714 FAMS_TS2 0.714 keasar-server_TS1 0.714 CIRCLE_TS1 0.713 FAMS_TS3 0.713 PROTINFO-AB_TS2 0.713 MetaTasser_TS1 0.713 CIRCLE_TS3 0.713 FUNCTION_TS2 0.711 GeneSilicoMetaServer_TS5 0.711 GeneSilicoMetaServer_TS2 0.711 RAPTORESS_TS5 0.711 GeneSilicoMetaServer_TS3 0.710 FAMSD_TS2 0.710 FAMSD_TS4 0.710 beautshot_TS1 0.710 FAMS_TS4 0.710 keasar-server_TS4 0.710 keasar-server_TS5 0.710 SAM_T06_server_TS1 0.709 CIRCLE_TS2 0.708 GeneSilicoMetaServer_TS1 0.708 beautshotbase_TS1 0.708 shub_TS1 0.708 Pcons6_TS3 0.707 FAMSD_TS5 0.707 FAMS_TS5 0.707 Pmodeller6_TS4 0.706 FUGMOD_TS1 0.706 Pmodeller6_TS5 0.706 FAMSD_TS3 0.706 3Dpro_TS4 0.706 FOLDpro_TS4 0.706 karypis.srv_TS1 0.706 Ma-OPUS-server_TS2 0.706 PROTINFO-AB_TS4 0.704 RAPTOR-ACE_TS3 0.703 FUNCTION_TS4 0.703 Phyre-1_TS1 0.701 CPHmodels_TS1 0.701 LOOPP_TS1 0.699 NN_PUT_lab_TS1 0.699 3D-JIGSAW_POPULUS_TS1 0.699 CaspIta-FOX_TS2 0.699 SAM_T06_server_TS2 0.698 CIRCLE_TS4 0.696 karypis.srv_TS2 0.695 PROTINFO_TS1 0.694 3D-JIGSAW_POPULUS_TS2 0.693 FUNCTION_TS5 0.692 CaspIta-FOX_TS1 0.692 3D-JIGSAW_POPULUS_TS4 0.691 3D-JIGSAW_POPULUS_TS5 0.691 3D-JIGSAW_POPULUS_TS3 0.691 3D-JIGSAW_RECOM_TS3 0.686 3D-JIGSAW_RECOM_TS4 0.686 3D-JIGSAW_RECOM_TS2 0.686 3D-JIGSAW_RECOM_TS1 0.685 3D-JIGSAW_RECOM_TS5 0.685 3D-JIGSAW_TS1 0.684 3D-JIGSAW_TS2 0.684 LOOPP_TS2 0.683 mGen-3D_TS1 0.679 nFOLD_TS1 0.679 Huber-Torda-Server_TS1 0.675 nFOLD_TS2 0.662 UNI-EID_expm_TS1 0.657 Huber-Torda-Server_TS2 0.645 karypis.srv.2_TS5 0.600 karypis.srv.2_TS2 0.595 karypis.srv.2_TS4 0.589 karypis.srv.2_TS1 0.586 karypis.srv.2_TS3 0.581 SAM_T06_server_TS3 0.555 keasar-server_TS2 0.554 keasar-server_TS3 0.554 CaspIta-FOX_TS4 0.541 PROTINFO_TS4 0.541 LOOPP_TS4 0.526 SAM_T06_server_TS5 0.523 CaspIta-FOX_TS3 0.522 panther2_TS1 0.510 karypis.srv_TS5 0.509 LOOPP_TS3 0.507 LOOPP_TS5 0.506 CaspIta-FOX_TS5 0.503 nFOLD_TS4 0.497 nFOLD_TS3 0.495 karypis.srv_TS3 0.488 Huber-Torda-Server_TS3 0.488 SAM_T06_server_TS4 0.473 karypis.srv_TS4 0.445 Huber-Torda-Server_TS4 0.409 SAM-T99_AL4 0.404 UNI-EID_bnmx_TS2 0.403 UNI-EID_sfst_AL2 0.403 SAM-T99_AL3 0.403 SAM-T02_AL2 0.402 SAM-T99_AL5 0.402 SP4_TS3 0.398 SPARKS2_TS3 0.397 SAM-T99_AL2 0.396 UNI-EID_bnmx_TS1 0.395 UNI-EID_sfst_AL1 0.395 MIG_FROST_AL1 0.395 FORTE1_AL1 0.395 FORTE2_AL1 0.395 SAM-T99_AL1 0.395 FUGUE_AL1 0.394 SP3_TS3 0.391 3D-JIGSAW_TS3 0.390 SAM-T02_AL1 0.384 SPARKS2_TS4 0.372 SP4_TS4 0.363 SP3_TS4 0.361 Ma-OPUS-server2_TS4 0.357 Ma-OPUS-server_TS4 0.357 FORTE1_AL2 0.356 FORTE2_AL2 0.356 UNI-EID_bnmx_TS4 0.356 ABIpro_TS2 0.356 UNI-EID_sfst_AL4 0.355 Ma-OPUS-server_TS3 0.355 Ma-OPUS-server2_TS3 0.355 UNI-EID_sfst_AL3 0.354 SP3_TS5 0.353 SP4_TS5 0.353 SPARKS2_TS5 0.353 UNI-EID_bnmx_TS3 0.352 RAPTOR_TS4 0.352 forecast-s_AL1 0.349 FORTE1_AL3 0.349 FORTE2_AL3 0.349 Ma-OPUS-server2_TS5 0.345 ABIpro_TS4 0.344 UNI-EID_bnmx_TS5 0.343 UNI-EID_sfst_AL5 0.343 Ma-OPUS-server_TS5 0.343 FUGMOD_TS3 0.341 RAPTOR_TS5 0.341 ABIpro_TS1 0.339 SAM-T02_AL3 0.338 ABIpro_TS5 0.338 FUGMOD_TS2 0.337 RAPTOR_TS3 0.330 SAM-T02_AL5 0.328 SAM-T02_AL4 0.325 Frankenstein_TS3 0.320 FUGMOD_TS5 0.314 FUGMOD_TS4 0.312 ABIpro_TS3 0.304 Distill_TS2 0.295 Distill_TS5 0.293 Distill_TS1 0.292 Distill_TS4 0.291 Distill_TS3 0.288 Frankenstein_TS4 0.255 nFOLD_TS5 0.249 FUGUE_AL2 0.241 FORTE1_AL5 0.239 FUGUE_AL3 0.238 forecast-s_AL4 0.237 forecast-s_AL5 0.236 forecast-s_AL3 0.235 FUGUE_AL5 0.233 FORTE1_AL4 0.233 FORTE2_AL4 0.233 FUGUE_AL4 0.231 forecast-s_AL2 0.230 FORTE2_AL5 0.216 karypis.srv.4_TS2 0.214 karypis.srv.4_TS1 0.213 Huber-Torda-Server_TS5 0.186 FPSOLVER-SERVER_TS2 0.185 karypis.srv.4_TS5 0.172 FPSOLVER-SERVER_TS4 0.165 FPSOLVER-SERVER_TS5 0.161 karypis.srv.4_TS4 0.156 FPSOLVER-SERVER_TS3 0.152 karypis.srv.4_TS3 0.151 FPSOLVER-SERVER_TS1 0.142 END