PFRMAT QA TARGET T0381 AUTHOR 2165-1648-9790 METHOD linear combination of alignment based constraints, METHOD undertaker cost functions, and consensus terms MODEL 1 QMODE 1 MetaTasser_TS4 0.781 MetaTasser_TS5 0.761 MetaTasser_TS2 0.755 Zhang-Server_TS5 0.742 PROTINFO_TS5 0.730 PROTINFO_TS3 0.730 BayesHH_TS1 0.729 Zhang-Server_TS3 0.729 HHpred3_TS1 0.727 Zhang-Server_TS4 0.727 HHpred2_TS1 0.726 PROTINFO-AB_TS5 0.723 Zhang-Server_TS2 0.723 Zhang-Server_TS1 0.723 MetaTasser_TS3 0.721 PROTINFO-AB_TS2 0.719 PROTINFO-AB_TS1 0.718 MetaTasser_TS1 0.716 Pcons6_TS2 0.706 Pcons6_TS5 0.706 Pmodeller6_TS2 0.703 ROBETTA_TS1 0.703 shub_TS1 0.703 Pmodeller6_TS3 0.703 ROBETTA_TS5 0.703 ROBETTA_TS3 0.702 ROBETTA_TS2 0.702 Pmodeller6_TS1 0.701 ROBETTA_TS4 0.701 beautshot_TS1 0.701 FAMS_TS1 0.700 Frankenstein_TS1 0.699 FUNCTION_TS3 0.696 UNI-EID_expm_TS1 0.694 CIRCLE_TS5 0.693 FAMS_TS2 0.693 PROTINFO_TS2 0.693 mGen-3D_TS1 0.693 nFOLD_TS1 0.693 FAMS_TS4 0.693 FAMSD_TS1 0.692 keasar-server_TS1 0.692 FUNCTION_TS1 0.692 FAMSD_TS2 0.691 keasar-server_TS4 0.691 keasar-server_TS5 0.691 Phyre-1_TS1 0.689 beautshotbase_TS1 0.689 PROTINFO-AB_TS3 0.689 CIRCLE_TS2 0.688 FAMSD_TS5 0.688 FAMS_TS5 0.688 Frankenstein_TS2 0.688 UNI-EID_bnmx_TS2 0.687 UNI-EID_sfst_AL2 0.687 FAMSD_TS4 0.687 CIRCLE_TS4 0.687 SAM-T02_AL2 0.687 FAMSD_TS3 0.686 nFOLD_TS2 0.685 PROTINFO_TS1 0.685 Pcons6_TS1 0.684 SAM-T99_AL3 0.684 PROTINFO-AB_TS4 0.682 CPHmodels_TS1 0.682 Huber-Torda-Server_TS1 0.682 FUGMOD_TS1 0.681 SAM_T06_server_TS2 0.680 Huber-Torda-Server_TS2 0.678 FUGUE_AL1 0.677 UNI-EID_bnmx_TS1 0.677 UNI-EID_sfst_AL1 0.677 FORTE1_AL1 0.677 FORTE2_AL1 0.677 3Dpro_TS4 0.677 FOLDpro_TS4 0.677 MIG_FROST_AL1 0.676 3D-JIGSAW_RECOM_TS3 0.675 SAM-T99_AL2 0.672 3D-JIGSAW_RECOM_TS2 0.671 3D-JIGSAW_RECOM_TS4 0.671 3D-JIGSAW_RECOM_TS1 0.671 3D-JIGSAW_TS1 0.671 3D-JIGSAW_TS2 0.671 LOOPP_TS1 0.670 NN_PUT_lab_TS1 0.670 LOOPP_TS2 0.668 3D-JIGSAW_POPULUS_TS3 0.662 CaspIta-FOX_TS1 0.662 SP3_TS2 0.661 SP4_TS1 0.661 SAM-T99_AL5 0.660 SPARKS2_TS2 0.659 3D-JIGSAW_POPULUS_TS2 0.659 GeneSilicoMetaServer_TS4 0.659 GeneSilicoMetaServer_TS3 0.657 RAPTORESS_TS2 0.657 RAPTORESS_TS4 0.657 CIRCLE_TS1 0.656 FAMS_TS3 0.656 GeneSilicoMetaServer_TS1 0.655 CIRCLE_TS3 0.655 RAPTOR-ACE_TS5 0.654 HHpred1_TS1 0.653 SP3_TS1 0.652 SPARKS2_TS1 0.652 Ma-OPUS-server_TS2 0.651 RAPTOR_TS2 0.651 Bilab-ENABLE_TS1 0.650 RAPTORESS_TS3 0.650 Ma-OPUS-server2_TS1 0.650 Ma-OPUS-server2_TS2 0.649 Ma-OPUS-server_TS1 0.649 RAPTOR-ACE_TS4 0.649 RAPTOR_TS1 0.648 RAPTORESS_TS1 0.648 RAPTOR-ACE_TS1 0.648 RAPTOR-ACE_TS2 0.648 GeneSilicoMetaServer_TS5 0.647 SAM-T02_AL1 0.646 RAPTOR-ACE_TS3 0.645 SP4_TS2 0.644 GeneSilicoMetaServer_TS2 0.643 SAM_T06_server_TS3 0.642 Pcons6_TS4 0.639 RAPTORESS_TS5 0.639 Bilab-ENABLE_TS4 0.627 FOLDpro_TS3 0.626 3Dpro_TS1 0.625 FOLDpro_TS2 0.625 Bilab-ENABLE_TS3 0.624 Bilab-ENABLE_TS5 0.623 3Dpro_TS2 0.620 ROKKY_TS1 0.620 3Dpro_TS3 0.619 FOLDpro_TS1 0.619 Bilab-ENABLE_TS2 0.617 Pcons6_TS3 0.617 FUNCTION_TS2 0.613 Phyre-2_TS4 0.607 Phyre-2_TS5 0.605 Phyre-2_TS2 0.605 Phyre-2_TS3 0.605 3D-JIGSAW_RECOM_TS5 0.605 FUNCTION_TS4 0.605 CaspIta-FOX_TS2 0.604 Phyre-2_TS1 0.604 3D-JIGSAW_POPULUS_TS1 0.603 ROKKY_TS2 0.593 3D-JIGSAW_POPULUS_TS5 0.593 3D-JIGSAW_POPULUS_TS4 0.590 SAM-T99_AL4 0.588 SAM-T99_AL1 0.585 FUNCTION_TS5 0.577 forecast-s_AL1 0.575 FORTE1_AL3 0.574 FORTE2_AL3 0.574 SAM_T06_server_TS1 0.568 Pmodeller6_TS5 0.566 3Dpro_TS5 0.566 FOLDpro_TS5 0.566 Pmodeller6_TS4 0.554 PROTINFO_TS4 0.553 CaspIta-FOX_TS4 0.549 keasar-server_TS2 0.548 keasar-server_TS3 0.548 FORTE1_AL2 0.542 FORTE2_AL2 0.542 UNI-EID_bnmx_TS4 0.540 UNI-EID_sfst_AL4 0.539 LOOPP_TS4 0.531 panther2_TS1 0.528 nFOLD_TS4 0.528 nFOLD_TS3 0.524 CaspIta-FOX_TS3 0.523 SAM_T06_server_TS5 0.522 UNI-EID_sfst_AL3 0.521 LOOPP_TS3 0.520 UNI-EID_bnmx_TS3 0.518 LOOPP_TS5 0.518 UNI-EID_bnmx_TS5 0.517 UNI-EID_sfst_AL5 0.517 Huber-Torda-Server_TS3 0.510 CaspIta-FOX_TS5 0.499 SAM-T02_AL4 0.487 SAM-T02_AL3 0.485 SAM-T02_AL5 0.482 SP4_TS3 0.478 Distill_TS2 0.478 SPARKS2_TS3 0.468 SAM_T06_server_TS4 0.467 Ma-OPUS-server2_TS4 0.465 Ma-OPUS-server_TS4 0.465 Ma-OPUS-server_TS3 0.463 SP3_TS3 0.462 Ma-OPUS-server2_TS3 0.461 RAPTOR_TS4 0.458 Distill_TS3 0.456 Distill_TS1 0.455 Distill_TS5 0.454 Distill_TS4 0.452 SPARKS2_TS4 0.445 Ma-OPUS-server_TS5 0.442 Ma-OPUS-server2_TS5 0.442 SP3_TS4 0.442 SP4_TS4 0.439 RAPTOR_TS3 0.438 SP3_TS5 0.434 SP4_TS5 0.434 SPARKS2_TS5 0.434 RAPTOR_TS5 0.430 Frankenstein_TS3 0.428 Huber-Torda-Server_TS4 0.414 Frankenstein_TS4 0.327 3D-JIGSAW_TS3 0.312 karypis.srv_TS1 0.287 karypis.srv_TS2 0.253 karypis.srv.2_TS5 0.229 karypis.srv.2_TS2 0.221 karypis.srv.2_TS3 0.220 karypis.srv.2_TS4 0.217 karypis.srv.2_TS1 0.216 forecast-s_AL2 0.195 karypis.srv_TS5 0.190 ABIpro_TS5 0.182 karypis.srv_TS3 0.180 ABIpro_TS2 0.179 FUGMOD_TS2 0.178 FUGUE_AL2 0.178 ABIpro_TS1 0.176 ABIpro_TS4 0.174 karypis.srv_TS4 0.170 forecast-s_AL3 0.167 ABIpro_TS3 0.166 FUGMOD_TS3 0.166 forecast-s_AL5 0.165 FUGMOD_TS5 0.164 FUGUE_AL3 0.161 FUGMOD_TS4 0.160 FUGUE_AL5 0.160 FUGUE_AL4 0.159 forecast-s_AL4 0.158 FORTE1_AL5 0.150 FORTE1_AL4 0.146 FORTE2_AL4 0.146 FORTE2_AL5 0.133 nFOLD_TS5 0.131 karypis.srv.4_TS2 0.119 karypis.srv.4_TS1 0.117 Huber-Torda-Server_TS5 0.103 FPSOLVER-SERVER_TS4 0.097 karypis.srv.4_TS5 0.097 karypis.srv.4_TS3 0.095 FPSOLVER-SERVER_TS5 0.093 FPSOLVER-SERVER_TS2 0.092 karypis.srv.4_TS4 0.090 FPSOLVER-SERVER_TS3 0.085 FPSOLVER-SERVER_TS1 0.084 END