# TARGET T0380 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0380.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1013 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.047 0.115 0.034 0.036 0.041 0.105 0.077 0.546 2 I 0.159 0.400 0.013 0.020 0.020 0.050 0.080 0.258 3 D 0.135 0.557 0.007 0.005 0.008 0.029 0.045 0.214 4 E 0.033 0.660 0.006 0.006 0.006 0.034 0.017 0.238 5 K 0.028 0.672 0.010 0.004 0.006 0.037 0.028 0.215 6 F 0.056 0.354 0.008 0.002 0.003 0.035 0.401 0.141 7 L 0.010 0.073 0.003 0.001 0.001 0.005 0.897 0.012 8 I 0.022 0.788 0.003 0.001 0.001 0.015 0.091 0.078 9 E 0.024 0.851 0.005 0.002 0.002 0.013 0.017 0.086 10 S 0.026 0.886 0.003 0.001 0.002 0.010 0.019 0.054 11 N 0.081 0.734 0.007 0.002 0.002 0.017 0.070 0.088 12 E 0.065 0.309 0.019 0.007 0.004 0.049 0.327 0.221 13 L 0.074 0.081 0.046 0.005 0.005 0.065 0.562 0.162 14 V 0.177 0.066 0.049 0.005 0.006 0.095 0.208 0.395 15 E 0.156 0.042 0.019 0.002 0.004 0.054 0.029 0.694 16 S 0.043 0.026 0.014 0.001 0.003 0.079 0.024 0.810 17 S 0.018 0.035 0.053 0.007 0.018 0.233 0.049 0.586 18 K 0.013 0.036 0.196 0.030 0.080 0.125 0.124 0.397 19 I 0.009 0.019 0.358 0.058 0.081 0.096 0.095 0.283 20 V 0.005 0.005 0.570 0.100 0.106 0.032 0.112 0.070 21 M 0.006 0.005 0.372 0.095 0.179 0.040 0.204 0.100 22 V 0.008 0.007 0.406 0.121 0.218 0.051 0.066 0.123 23 G 0.029 0.006 0.176 0.166 0.262 0.089 0.043 0.229 24 T 0.026 0.007 0.101 0.114 0.209 0.101 0.184 0.258 25 N 0.028 0.004 0.070 0.046 0.100 0.156 0.080 0.516 26 G 0.526 0.002 0.015 0.018 0.028 0.084 0.046 0.281 27 E 0.187 0.002 0.005 0.010 0.010 0.100 0.035 0.652 28 N 0.004 0.001 0.009 0.004 0.024 0.157 0.010 0.791 29 G 0.020 0.001 0.014 0.015 0.050 0.097 0.031 0.772 30 Y 0.079 0.005 0.029 0.192 0.089 0.109 0.077 0.420 31 P 0.012 0.003 0.051 0.055 0.097 0.075 0.021 0.686 32 N 0.016 0.008 0.075 0.144 0.364 0.062 0.032 0.299 33 I 0.010 0.006 0.113 0.106 0.163 0.063 0.032 0.507 34 K 0.020 0.017 0.130 0.307 0.243 0.050 0.045 0.187 35 A 0.029 0.027 0.088 0.143 0.237 0.062 0.050 0.365 36 M 0.040 0.023 0.101 0.162 0.273 0.060 0.047 0.293 37 M 0.028 0.012 0.066 0.244 0.387 0.037 0.040 0.186 38 R 0.017 0.006 0.034 0.208 0.293 0.053 0.043 0.347 39 L 0.005 0.001 0.037 0.366 0.333 0.038 0.031 0.189 40 K 0.043 0.001 0.031 0.133 0.193 0.078 0.067 0.455 41 H 0.423 0.001 0.012 0.035 0.043 0.054 0.055 0.377 42 D 0.183 0.001 0.006 0.007 0.014 0.068 0.014 0.707 43 G 0.026 0.001 0.008 0.005 0.020 0.093 0.011 0.836 44 L 0.004 0.001 0.045 0.024 0.100 0.179 0.021 0.627 45 K 0.001 0.001 0.158 0.139 0.295 0.065 0.048 0.293 46 K 0.001 0.001 0.266 0.310 0.269 0.015 0.058 0.081 47 F 0.001 0.001 0.468 0.224 0.208 0.007 0.049 0.044 48 W 0.001 0.001 0.492 0.213 0.238 0.005 0.024 0.027 49 L 0.003 0.001 0.501 0.186 0.215 0.014 0.029 0.053 50 S 0.013 0.005 0.341 0.134 0.200 0.054 0.108 0.144 51 T 0.035 0.015 0.095 0.045 0.085 0.115 0.261 0.350 52 N 0.088 0.084 0.036 0.019 0.033 0.173 0.160 0.407 53 T 0.060 0.212 0.013 0.010 0.017 0.130 0.049 0.508 54 S 0.029 0.742 0.004 0.004 0.009 0.026 0.036 0.149 55 T 0.024 0.889 0.002 0.002 0.004 0.011 0.020 0.048 56 R 0.013 0.773 0.018 0.023 0.016 0.020 0.063 0.075 57 M 0.012 0.939 0.004 0.003 0.004 0.005 0.013 0.021 58 V 0.115 0.765 0.024 0.004 0.005 0.007 0.059 0.023 59 E 0.073 0.603 0.039 0.026 0.018 0.023 0.077 0.141 60 R 0.112 0.088 0.035 0.012 0.016 0.029 0.306 0.403 61 L 0.163 0.047 0.024 0.014 0.012 0.095 0.289 0.356 62 K 0.042 0.016 0.013 0.014 0.015 0.094 0.048 0.757 63 K 0.021 0.004 0.002 0.001 0.002 0.045 0.008 0.917 64 N 0.129 0.037 0.015 0.007 0.010 0.154 0.091 0.557 65 N 0.064 0.037 0.053 0.016 0.035 0.211 0.053 0.531 66 K 0.017 0.011 0.136 0.020 0.068 0.119 0.077 0.551 67 I 0.006 0.007 0.336 0.112 0.154 0.082 0.097 0.208 68 C 0.005 0.003 0.397 0.114 0.240 0.038 0.070 0.132 69 L 0.004 0.002 0.285 0.262 0.292 0.023 0.034 0.098 70 Y 0.005 0.003 0.304 0.220 0.301 0.031 0.028 0.108 71 F 0.005 0.002 0.143 0.258 0.366 0.044 0.041 0.141 72 V 0.037 0.006 0.087 0.113 0.146 0.116 0.065 0.429 73 D 0.399 0.014 0.021 0.053 0.048 0.068 0.067 0.330 74 D 0.100 0.009 0.007 0.011 0.022 0.097 0.031 0.724 75 N 0.049 0.006 0.012 0.012 0.026 0.101 0.063 0.730 76 K 0.111 0.007 0.014 0.038 0.063 0.141 0.076 0.550 77 F 0.032 0.004 0.013 0.037 0.056 0.093 0.055 0.712 78 A 0.007 0.002 0.061 0.102 0.356 0.089 0.027 0.356 79 G 0.002 0.001 0.075 0.141 0.531 0.027 0.037 0.187 80 L 0.001 0.001 0.101 0.384 0.415 0.015 0.014 0.070 81 M 0.001 0.001 0.253 0.278 0.370 0.014 0.023 0.060 82 L 0.006 0.002 0.103 0.373 0.350 0.025 0.023 0.118 83 V 0.012 0.005 0.220 0.144 0.267 0.043 0.030 0.279 84 G 0.016 0.007 0.110 0.250 0.386 0.039 0.025 0.166 85 T 0.016 0.010 0.104 0.208 0.424 0.031 0.046 0.160 86 I 0.014 0.007 0.068 0.252 0.306 0.034 0.029 0.291 87 E 0.004 0.004 0.061 0.415 0.387 0.023 0.016 0.090 88 I 0.018 0.016 0.043 0.108 0.180 0.074 0.024 0.537 89 L 0.066 0.048 0.072 0.194 0.166 0.083 0.054 0.316 90 H 0.042 0.041 0.021 0.027 0.026 0.070 0.127 0.646 91 D 0.163 0.472 0.005 0.005 0.005 0.027 0.175 0.148 92 R 0.068 0.747 0.004 0.003 0.002 0.024 0.019 0.132 93 A 0.021 0.861 0.001 0.001 0.001 0.011 0.006 0.099 94 S 0.019 0.938 0.001 0.001 0.001 0.004 0.010 0.027 95 K 0.038 0.881 0.001 0.001 0.001 0.007 0.050 0.022 96 E 0.009 0.067 0.003 0.001 0.001 0.007 0.890 0.021 97 M 0.012 0.225 0.007 0.003 0.004 0.027 0.651 0.072 98 L 0.090 0.437 0.035 0.006 0.013 0.062 0.149 0.208 99 W 0.185 0.257 0.022 0.011 0.013 0.072 0.067 0.374 100 T 0.089 0.149 0.013 0.004 0.007 0.066 0.078 0.595 101 D 0.049 0.137 0.011 0.004 0.006 0.129 0.030 0.634 102 G 0.110 0.118 0.048 0.011 0.012 0.132 0.116 0.453 103 C 0.172 0.153 0.031 0.011 0.010 0.103 0.070 0.449 104 E 0.146 0.079 0.067 0.010 0.016 0.074 0.065 0.543 105 I 0.022 0.028 0.108 0.022 0.027 0.117 0.069 0.608 106 Y 0.036 0.012 0.100 0.021 0.028 0.112 0.066 0.625 107 Y 0.361 0.012 0.030 0.022 0.022 0.098 0.077 0.377 108 P 0.082 0.004 0.015 0.009 0.012 0.082 0.020 0.776 109 L 0.028 0.002 0.016 0.014 0.034 0.102 0.015 0.789 110 G 0.030 0.002 0.009 0.017 0.026 0.120 0.027 0.770 111 I 0.008 0.001 0.015 0.039 0.033 0.155 0.020 0.729 112 D 0.063 0.001 0.004 0.005 0.007 0.051 0.019 0.849 113 D 0.698 0.003 0.004 0.004 0.004 0.037 0.097 0.154 114 P 0.048 0.002 0.016 0.005 0.015 0.135 0.018 0.761 115 D 0.015 0.002 0.043 0.019 0.145 0.137 0.030 0.610 116 Y 0.001 0.001 0.072 0.096 0.317 0.083 0.038 0.393 117 T 0.001 0.001 0.161 0.258 0.518 0.011 0.020 0.030 118 A 0.001 0.001 0.103 0.284 0.458 0.007 0.025 0.122 119 L 0.001 0.001 0.238 0.457 0.266 0.005 0.003 0.031 120 C 0.001 0.001 0.193 0.267 0.465 0.012 0.008 0.055 121 F 0.002 0.001 0.176 0.270 0.215 0.039 0.022 0.275 122 T 0.159 0.037 0.098 0.200 0.161 0.043 0.094 0.209 123 A 0.113 0.047 0.054 0.055 0.073 0.095 0.131 0.433 124 E 0.017 0.080 0.083 0.105 0.228 0.071 0.054 0.363 125 W 0.025 0.125 0.069 0.080 0.207 0.058 0.081 0.356 126 G 0.027 0.115 0.064 0.196 0.206 0.060 0.075 0.257 127 N 0.021 0.071 0.115 0.230 0.277 0.040 0.088 0.159 128 Y 0.063 0.116 0.073 0.131 0.178 0.066 0.087 0.287 129 Y 0.126 0.101 0.077 0.107 0.124 0.070 0.062 0.332 130 R 0.037 0.042 0.038 0.070 0.094 0.090 0.064 0.564 131 H 0.103 0.098 0.013 0.019 0.032 0.080 0.063 0.593 132 L 0.128 0.072 0.017 0.037 0.033 0.079 0.205 0.430 133 K 0.044 0.082 0.014 0.020 0.033 0.112 0.086 0.610 134 N 0.099 0.150 0.012 0.020 0.033 0.075 0.060 0.550 135 I 0.061 0.185 0.014 0.033 0.040 0.101 0.038 0.529 136 T 0.037 0.227 0.022 0.025 0.063 0.078 0.076 0.472 137 F 0.036 0.280 0.022 0.059 0.065 0.089 0.086 0.363 138 K 0.049 0.471 0.028 0.044 0.056 0.048 0.093 0.212 139 I 0.088 0.468 0.019 0.030 0.042 0.048 0.095 0.211 140 D 0.039 0.173 0.054 0.079 0.100 0.051 0.247 0.257 141 E 0.069 0.139 0.040 0.086 0.115 0.071 0.126 0.355 142 I 0.159 0.039 0.041 0.068 0.096 0.084 0.115 0.398 143 Y 0.067 0.012 0.018 0.048 0.067 0.101 0.056 0.630 144 N 0.038 0.008 0.008 0.018 0.037 0.078 0.037 0.777 145 Y 0.024 0.007 0.010 0.019 0.032 0.116 0.027 0.765