# TARGET T0380 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0380.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1009 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.047 0.011 0.034 0.016 0.019 0.070 0.006 0.798 2 I 0.052 0.022 0.039 0.020 0.038 0.169 0.005 0.656 3 D 0.026 0.019 0.016 0.007 0.030 0.104 0.003 0.795 4 E 0.018 0.030 0.006 0.002 0.009 0.082 0.002 0.851 5 K 0.028 0.056 0.002 0.001 0.002 0.474 0.003 0.433 6 F 0.127 0.476 0.002 0.001 0.003 0.139 0.006 0.245 7 L 0.018 0.922 0.002 0.001 0.002 0.005 0.002 0.049 8 I 0.005 0.931 0.003 0.001 0.002 0.005 0.002 0.051 9 E 0.022 0.885 0.003 0.001 0.002 0.011 0.006 0.071 10 S 0.025 0.938 0.002 0.001 0.002 0.004 0.004 0.024 11 N 0.015 0.921 0.004 0.001 0.003 0.007 0.005 0.045 12 E 0.024 0.883 0.004 0.001 0.001 0.021 0.008 0.058 13 L 0.046 0.896 0.003 0.001 0.001 0.006 0.008 0.038 14 V 0.023 0.932 0.003 0.001 0.003 0.002 0.004 0.031 15 E 0.052 0.739 0.009 0.005 0.008 0.023 0.025 0.140 16 S 0.274 0.435 0.014 0.006 0.005 0.017 0.079 0.171 17 S 0.388 0.198 0.035 0.010 0.007 0.019 0.112 0.232 18 K 0.186 0.062 0.153 0.035 0.021 0.115 0.093 0.335 19 I 0.048 0.029 0.449 0.041 0.050 0.116 0.017 0.249 20 V 0.030 0.023 0.454 0.148 0.178 0.066 0.007 0.094 21 M 0.013 0.014 0.324 0.157 0.249 0.053 0.004 0.186 22 V 0.005 0.009 0.319 0.233 0.319 0.031 0.003 0.081 23 G 0.009 0.009 0.171 0.352 0.343 0.036 0.003 0.077 24 T 0.009 0.007 0.063 0.364 0.363 0.034 0.004 0.154 25 N 0.017 0.004 0.073 0.213 0.359 0.048 0.004 0.282 26 G 0.014 0.005 0.029 0.119 0.252 0.141 0.007 0.433 27 E 0.034 0.005 0.014 0.029 0.046 0.155 0.010 0.708 28 N 0.034 0.012 0.009 0.023 0.024 0.263 0.027 0.608 29 G 0.282 0.019 0.017 0.027 0.018 0.049 0.192 0.396 30 Y 0.274 0.002 0.072 0.023 0.043 0.350 0.008 0.227 31 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 32 N 0.014 0.001 0.038 0.123 0.503 0.115 0.003 0.203 33 I 0.097 0.001 0.052 0.061 0.110 0.055 0.004 0.619 34 K 0.018 0.002 0.134 0.376 0.298 0.039 0.002 0.132 35 A 0.005 0.001 0.035 0.065 0.116 0.035 0.001 0.742 36 M 0.012 0.003 0.276 0.166 0.386 0.044 0.002 0.111 37 M 0.011 0.005 0.145 0.288 0.317 0.064 0.003 0.167 38 R 0.014 0.006 0.090 0.213 0.441 0.050 0.004 0.182 39 L 0.021 0.007 0.148 0.257 0.340 0.052 0.004 0.170 40 K 0.021 0.009 0.058 0.263 0.293 0.066 0.005 0.284 41 H 0.027 0.010 0.063 0.190 0.341 0.053 0.006 0.309 42 D 0.017 0.009 0.022 0.092 0.183 0.096 0.008 0.573 43 G 0.067 0.008 0.014 0.041 0.070 0.134 0.031 0.634 44 L 0.208 0.007 0.019 0.026 0.029 0.298 0.050 0.363 45 K 0.158 0.010 0.069 0.088 0.045 0.195 0.064 0.371 46 K 0.092 0.004 0.156 0.087 0.141 0.198 0.012 0.310 47 F 0.021 0.001 0.195 0.244 0.404 0.061 0.002 0.071 48 W 0.006 0.001 0.162 0.286 0.473 0.018 0.001 0.053 49 L 0.001 0.001 0.219 0.300 0.412 0.010 0.001 0.056 50 S 0.002 0.001 0.283 0.238 0.378 0.021 0.001 0.075 51 T 0.005 0.003 0.137 0.204 0.357 0.055 0.002 0.236 52 N 0.012 0.003 0.090 0.054 0.212 0.165 0.004 0.459 53 T 0.023 0.003 0.020 0.014 0.037 0.276 0.004 0.622 54 S 0.042 0.007 0.007 0.004 0.008 0.491 0.008 0.431 55 T 0.174 0.040 0.009 0.005 0.009 0.366 0.013 0.384 56 R 0.087 0.180 0.016 0.009 0.013 0.229 0.008 0.458 57 M 0.040 0.198 0.007 0.007 0.015 0.298 0.007 0.429 58 V 0.055 0.618 0.013 0.008 0.032 0.073 0.005 0.195 59 E 0.008 0.896 0.003 0.005 0.009 0.015 0.002 0.061 60 R 0.014 0.894 0.002 0.003 0.006 0.009 0.004 0.068 61 L 0.031 0.916 0.003 0.003 0.007 0.003 0.005 0.033 62 K 0.023 0.925 0.002 0.003 0.006 0.006 0.006 0.029 63 K 0.121 0.723 0.006 0.006 0.006 0.012 0.052 0.075 64 N 0.330 0.409 0.016 0.008 0.006 0.012 0.113 0.106 65 N 0.191 0.162 0.073 0.023 0.012 0.029 0.113 0.396 66 K 0.074 0.032 0.173 0.035 0.039 0.307 0.037 0.302 67 I 0.119 0.041 0.249 0.097 0.127 0.194 0.017 0.154 68 C 0.041 0.027 0.391 0.191 0.263 0.052 0.005 0.031 69 L 0.008 0.009 0.290 0.312 0.288 0.021 0.003 0.070 70 Y 0.003 0.004 0.326 0.270 0.303 0.013 0.002 0.079 71 F 0.003 0.004 0.148 0.365 0.398 0.015 0.002 0.065 72 V 0.006 0.003 0.138 0.227 0.446 0.031 0.002 0.147 73 D 0.005 0.004 0.051 0.134 0.363 0.068 0.003 0.372 74 D 0.012 0.002 0.015 0.020 0.069 0.069 0.004 0.810 75 N 0.034 0.003 0.005 0.011 0.018 0.489 0.011 0.430 76 K 0.234 0.008 0.006 0.013 0.014 0.374 0.046 0.306 77 F 0.196 0.044 0.040 0.040 0.049 0.295 0.026 0.309 78 A 0.073 0.035 0.066 0.132 0.148 0.168 0.017 0.362 79 G 0.051 0.009 0.058 0.129 0.202 0.079 0.010 0.463 80 L 0.044 0.004 0.110 0.259 0.384 0.032 0.005 0.161 81 M 0.006 0.001 0.180 0.357 0.326 0.016 0.003 0.109 82 L 0.003 0.001 0.123 0.317 0.381 0.015 0.002 0.158 83 V 0.002 0.001 0.228 0.244 0.393 0.018 0.001 0.113 84 G 0.003 0.001 0.150 0.338 0.323 0.033 0.002 0.150 85 T 0.015 0.001 0.207 0.116 0.307 0.091 0.003 0.261 86 I 0.013 0.001 0.160 0.231 0.354 0.064 0.001 0.177 87 E 0.007 0.001 0.176 0.369 0.395 0.018 0.001 0.033 88 I 0.005 0.001 0.054 0.135 0.277 0.029 0.001 0.499 89 L 0.006 0.002 0.306 0.212 0.356 0.020 0.002 0.096 90 H 0.007 0.004 0.057 0.111 0.147 0.151 0.002 0.521 91 D 0.020 0.004 0.029 0.017 0.102 0.120 0.004 0.705 92 R 0.013 0.003 0.004 0.002 0.012 0.080 0.002 0.883 93 A 0.019 0.006 0.002 0.001 0.003 0.420 0.003 0.546 94 S 0.036 0.026 0.001 0.001 0.002 0.744 0.003 0.188 95 K 0.058 0.687 0.002 0.001 0.004 0.019 0.002 0.226 96 E 0.009 0.800 0.003 0.001 0.003 0.035 0.002 0.147 97 M 0.021 0.908 0.002 0.001 0.002 0.011 0.003 0.052 98 L 0.026 0.948 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.019 99 W 0.032 0.912 0.004 0.003 0.008 0.004 0.006 0.032 100 T 0.076 0.808 0.006 0.004 0.004 0.006 0.020 0.076 101 D 0.108 0.641 0.020 0.004 0.005 0.010 0.037 0.176 102 G 0.109 0.509 0.020 0.008 0.011 0.032 0.032 0.279 103 C 0.103 0.343 0.075 0.015 0.024 0.112 0.029 0.299 104 E 0.083 0.344 0.037 0.013 0.015 0.128 0.022 0.358 105 I 0.183 0.349 0.060 0.013 0.016 0.068 0.030 0.280 106 Y 0.210 0.330 0.062 0.019 0.022 0.048 0.041 0.268 107 Y 0.101 0.157 0.147 0.049 0.064 0.057 0.025 0.400 108 P 0.002 0.005 0.004 0.003 0.005 0.006 0.001 0.975 109 L 0.036 0.028 0.024 0.030 0.058 0.085 0.010 0.729 110 G 0.249 0.029 0.026 0.022 0.025 0.078 0.024 0.547 111 I 0.114 0.026 0.065 0.038 0.044 0.071 0.010 0.633 112 D 0.033 0.011 0.020 0.021 0.039 0.099 0.008 0.769 113 D 0.112 0.014 0.021 0.030 0.050 0.129 0.010 0.635 114 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.994 115 D 0.023 0.003 0.017 0.036 0.052 0.531 0.014 0.324 116 Y 0.479 0.006 0.063 0.052 0.056 0.132 0.025 0.187 117 T 0.078 0.010 0.232 0.227 0.230 0.108 0.006 0.109 118 A 0.011 0.002 0.217 0.216 0.302 0.055 0.002 0.194 119 L 0.004 0.001 0.292 0.296 0.378 0.009 0.001 0.019 120 C 0.003 0.001 0.208 0.293 0.410 0.010 0.001 0.075 121 F 0.001 0.001 0.321 0.258 0.310 0.010 0.001 0.098 122 T 0.002 0.001 0.176 0.279 0.338 0.029 0.001 0.175 123 A 0.001 0.001 0.022 0.023 0.072 0.019 0.001 0.863 124 E 0.004 0.002 0.088 0.134 0.304 0.183 0.002 0.283 125 W 0.075 0.003 0.034 0.043 0.097 0.188 0.007 0.553 126 G 0.135 0.033 0.109 0.261 0.205 0.060 0.013 0.185 127 N 0.063 0.024 0.160 0.228 0.253 0.054 0.008 0.209 128 Y 0.017 0.025 0.063 0.187 0.275 0.031 0.005 0.397 129 Y 0.022 0.033 0.078 0.161 0.391 0.042 0.006 0.267 130 R 0.016 0.029 0.025 0.100 0.147 0.104 0.010 0.569 131 H 0.056 0.038 0.021 0.040 0.085 0.106 0.015 0.639 132 L 0.179 0.058 0.025 0.053 0.103 0.191 0.024 0.368 133 K 0.133 0.104 0.026 0.069 0.059 0.145 0.040 0.423 134 N 0.155 0.105 0.045 0.061 0.089 0.112 0.030 0.403 135 I 0.171 0.073 0.071 0.224 0.228 0.066 0.019 0.148 136 T 0.035 0.029 0.065 0.236 0.285 0.041 0.006 0.304 137 F 0.010 0.017 0.079 0.281 0.374 0.024 0.004 0.211 138 K 0.021 0.020 0.072 0.287 0.393 0.042 0.004 0.162 139 I 0.014 0.020 0.054 0.171 0.295 0.037 0.005 0.404 140 D 0.016 0.021 0.043 0.078 0.172 0.097 0.007 0.566 141 E 0.105 0.018 0.028 0.040 0.060 0.166 0.026 0.556 142 I 0.265 0.022 0.023 0.025 0.037 0.156 0.022 0.450 143 Y 0.118 0.038 0.100 0.088 0.099 0.134 0.019 0.404 144 N 0.028 0.025 0.033 0.054 0.073 0.097 0.008 0.682 145 Y 0.035 0.022 0.043 0.040 0.098 0.057 0.006 0.700