# TARGET T0373 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0373.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1386 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.030 0.007 0.033 0.047 0.052 0.179 0.037 0.614 2 P 0.080 0.049 0.032 0.025 0.030 0.138 0.078 0.568 3 T 0.096 0.200 0.012 0.007 0.011 0.110 0.048 0.517 4 N 0.089 0.560 0.010 0.004 0.004 0.058 0.049 0.226 5 Q 0.036 0.871 0.002 0.001 0.001 0.012 0.023 0.055 6 D 0.014 0.925 0.001 0.001 0.001 0.005 0.032 0.020 7 L 0.003 0.958 0.001 0.001 0.001 0.003 0.022 0.011 8 Q 0.003 0.932 0.001 0.001 0.002 0.004 0.047 0.010 9 L 0.001 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.002 10 A 0.002 0.973 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.002 11 A 0.002 0.672 0.003 0.002 0.001 0.003 0.311 0.006 12 H 0.002 0.897 0.002 0.001 0.001 0.002 0.095 0.003 13 L 0.009 0.968 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.003 14 R 0.007 0.197 0.003 0.001 0.001 0.006 0.767 0.020 15 S 0.001 0.062 0.001 0.001 0.001 0.004 0.925 0.008 16 Q 0.007 0.927 0.001 0.001 0.001 0.005 0.047 0.012 17 V 0.015 0.410 0.006 0.001 0.001 0.014 0.515 0.037 18 T 0.010 0.564 0.006 0.001 0.001 0.023 0.342 0.052 19 T 0.015 0.914 0.003 0.001 0.001 0.010 0.030 0.027 20 L 0.009 0.937 0.005 0.001 0.001 0.005 0.021 0.022 21 T 0.017 0.902 0.006 0.001 0.001 0.009 0.043 0.022 22 R 0.014 0.920 0.007 0.001 0.001 0.007 0.027 0.024 23 R 0.014 0.892 0.032 0.001 0.001 0.006 0.033 0.022 24 L 0.027 0.877 0.020 0.001 0.001 0.007 0.039 0.029 25 R 0.062 0.754 0.031 0.001 0.001 0.013 0.060 0.076 26 R 0.108 0.401 0.130 0.004 0.003 0.026 0.109 0.219 27 E 0.254 0.137 0.050 0.005 0.005 0.062 0.126 0.361 28 A 0.149 0.017 0.037 0.004 0.003 0.075 0.098 0.617 29 Q 0.085 0.010 0.007 0.002 0.003 0.069 0.018 0.807 30 A 0.043 0.005 0.004 0.001 0.002 0.058 0.016 0.872 31 D 0.046 0.022 0.012 0.006 0.008 0.160 0.030 0.717 32 P 0.020 0.026 0.020 0.006 0.013 0.137 0.033 0.745 33 V 0.012 0.061 0.031 0.013 0.010 0.108 0.056 0.710 34 Q 0.050 0.767 0.016 0.005 0.006 0.021 0.047 0.087 35 F 0.034 0.860 0.006 0.002 0.003 0.012 0.033 0.050 36 S 0.003 0.933 0.005 0.003 0.004 0.005 0.023 0.024 37 Q 0.002 0.952 0.002 0.001 0.003 0.002 0.032 0.007 38 L 0.002 0.911 0.005 0.005 0.005 0.003 0.062 0.007 39 V 0.003 0.950 0.004 0.008 0.008 0.002 0.021 0.004 40 V 0.007 0.952 0.003 0.002 0.004 0.003 0.022 0.007 41 L 0.008 0.862 0.010 0.008 0.011 0.005 0.081 0.014 42 G 0.013 0.819 0.017 0.023 0.021 0.008 0.064 0.035 43 A 0.063 0.671 0.029 0.014 0.019 0.026 0.089 0.089 44 I 0.133 0.142 0.164 0.068 0.036 0.036 0.305 0.116 45 D 0.239 0.057 0.032 0.016 0.017 0.066 0.085 0.487 46 R 0.140 0.006 0.017 0.003 0.004 0.064 0.040 0.726 47 L 0.078 0.004 0.007 0.004 0.004 0.102 0.015 0.787 48 G 0.040 0.002 0.004 0.002 0.004 0.066 0.022 0.860 49 G 0.022 0.005 0.007 0.003 0.006 0.131 0.019 0.806 50 D 0.014 0.011 0.022 0.013 0.019 0.144 0.048 0.729 51 V 0.015 0.028 0.016 0.013 0.008 0.096 0.029 0.795 52 T 0.081 0.681 0.010 0.006 0.006 0.029 0.052 0.134 53 P 0.043 0.863 0.004 0.002 0.002 0.010 0.016 0.059 54 S 0.014 0.922 0.007 0.002 0.003 0.006 0.018 0.028 55 E 0.010 0.969 0.003 0.001 0.001 0.002 0.006 0.009 56 L 0.052 0.883 0.013 0.002 0.002 0.007 0.024 0.017 57 A 0.073 0.500 0.093 0.012 0.009 0.017 0.225 0.071 58 A 0.320 0.366 0.020 0.005 0.005 0.026 0.056 0.203 59 A 0.306 0.060 0.025 0.004 0.005 0.049 0.107 0.444 60 E 0.042 0.039 0.009 0.008 0.009 0.079 0.062 0.752 61 R 0.015 0.016 0.005 0.003 0.007 0.077 0.027 0.851 62 M 0.017 0.018 0.012 0.006 0.004 0.162 0.089 0.692 63 R 0.244 0.387 0.008 0.005 0.005 0.052 0.101 0.196 64 S 0.074 0.517 0.005 0.001 0.002 0.044 0.030 0.328 65 S 0.011 0.703 0.022 0.004 0.006 0.041 0.052 0.161 66 N 0.006 0.922 0.007 0.002 0.002 0.006 0.034 0.021 67 L 0.003 0.964 0.002 0.001 0.001 0.002 0.021 0.007 68 A 0.003 0.949 0.005 0.001 0.001 0.001 0.035 0.005 69 A 0.002 0.969 0.003 0.002 0.002 0.002 0.015 0.005 70 L 0.004 0.957 0.004 0.001 0.001 0.002 0.025 0.006 71 L 0.005 0.971 0.003 0.001 0.001 0.001 0.017 0.003 72 R 0.007 0.937 0.003 0.002 0.002 0.002 0.026 0.020 73 E 0.031 0.643 0.030 0.010 0.008 0.014 0.196 0.068 74 L 0.139 0.163 0.081 0.023 0.014 0.046 0.419 0.116 75 E 0.808 0.015 0.008 0.002 0.002 0.016 0.030 0.119 76 R 0.100 0.009 0.002 0.001 0.001 0.027 0.008 0.851 77 G 0.004 0.003 0.008 0.002 0.010 0.116 0.005 0.853 78 G 0.011 0.007 0.073 0.057 0.226 0.120 0.077 0.431 79 L 0.008 0.003 0.056 0.351 0.241 0.047 0.057 0.237 80 I 0.009 0.001 0.131 0.350 0.275 0.025 0.017 0.192 81 V 0.003 0.001 0.055 0.341 0.392 0.021 0.014 0.173 82 R 0.021 0.002 0.065 0.225 0.231 0.056 0.024 0.376 83 H 0.009 0.002 0.034 0.201 0.211 0.095 0.019 0.430 84 A 0.011 0.001 0.005 0.021 0.016 0.061 0.011 0.875 85 D 0.839 0.020 0.002 0.008 0.005 0.015 0.047 0.063 86 P 0.409 0.021 0.003 0.005 0.007 0.069 0.025 0.462 87 Q 0.135 0.006 0.002 0.005 0.017 0.049 0.016 0.769 88 D 0.049 0.005 0.008 0.022 0.095 0.110 0.117 0.593 89 G 0.006 0.002 0.022 0.063 0.201 0.144 0.053 0.508 90 R 0.010 0.001 0.052 0.206 0.456 0.041 0.023 0.210 91 R 0.001 0.001 0.049 0.219 0.351 0.039 0.028 0.313 92 T 0.001 0.001 0.169 0.214 0.534 0.014 0.012 0.057 93 R 0.001 0.001 0.068 0.355 0.520 0.005 0.017 0.034 94 V 0.001 0.001 0.164 0.440 0.286 0.013 0.016 0.079 95 S 0.001 0.004 0.193 0.282 0.446 0.012 0.012 0.050 96 L 0.006 0.032 0.124 0.282 0.242 0.036 0.030 0.249 97 S 0.123 0.616 0.055 0.038 0.030 0.019 0.054 0.064 98 S 0.082 0.735 0.016 0.014 0.013 0.022 0.030 0.088 99 E 0.026 0.518 0.023 0.008 0.012 0.040 0.147 0.226 100 G 0.031 0.847 0.003 0.002 0.002 0.006 0.091 0.018 101 R 0.031 0.889 0.002 0.002 0.002 0.007 0.041 0.026 102 R 0.026 0.778 0.005 0.006 0.008 0.014 0.045 0.118 103 N 0.029 0.219 0.010 0.005 0.007 0.025 0.609 0.095 104 L 0.049 0.423 0.009 0.006 0.005 0.026 0.404 0.078 105 Y 0.098 0.590 0.009 0.005 0.007 0.033 0.061 0.197 106 G 0.035 0.487 0.008 0.004 0.004 0.047 0.044 0.371 107 N 0.046 0.714 0.006 0.002 0.002 0.025 0.072 0.134 108 R 0.060 0.788 0.004 0.001 0.001 0.015 0.061 0.070 109 A 0.019 0.824 0.005 0.001 0.001 0.017 0.047 0.088 110 K 0.011 0.893 0.003 0.001 0.001 0.007 0.048 0.038 111 R 0.006 0.960 0.001 0.001 0.001 0.002 0.024 0.007 112 E 0.003 0.962 0.001 0.001 0.001 0.001 0.028 0.005 113 E 0.003 0.947 0.001 0.001 0.001 0.002 0.040 0.007 114 W 0.004 0.944 0.003 0.001 0.001 0.002 0.040 0.005 115 L 0.006 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.004 116 V 0.017 0.851 0.011 0.001 0.001 0.004 0.103 0.013 117 R 0.017 0.898 0.009 0.001 0.001 0.005 0.040 0.030 118 A 0.128 0.437 0.132 0.003 0.002 0.028 0.147 0.124 119 M 0.418 0.208 0.041 0.003 0.002 0.048 0.058 0.222 120 H 0.304 0.043 0.026 0.001 0.002 0.046 0.111 0.466 121 A 0.050 0.073 0.008 0.001 0.001 0.073 0.019 0.776 122 C 0.013 0.043 0.017 0.002 0.002 0.120 0.041 0.762 123 L 0.015 0.140 0.014 0.002 0.001 0.107 0.044 0.677 124 D 0.056 0.904 0.001 0.001 0.001 0.003 0.021 0.014 125 E 0.020 0.959 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.013 126 S 0.003 0.967 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.014 127 E 0.002 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.002 128 R 0.004 0.963 0.001 0.001 0.001 0.001 0.029 0.002 129 A 0.002 0.969 0.003 0.001 0.001 0.001 0.020 0.004 130 L 0.031 0.678 0.015 0.001 0.001 0.004 0.255 0.015 131 L 0.089 0.516 0.012 0.001 0.001 0.005 0.362 0.016 132 A 0.148 0.471 0.010 0.001 0.001 0.017 0.181 0.172 133 A 0.007 0.450 0.004 0.001 0.001 0.020 0.051 0.467 134 A 0.016 0.880 0.001 0.001 0.001 0.013 0.011 0.079 135 G 0.024 0.138 0.003 0.001 0.001 0.008 0.807 0.019 136 P 0.012 0.646 0.005 0.001 0.001 0.011 0.291 0.034 137 L 0.028 0.925 0.007 0.001 0.001 0.005 0.012 0.022 138 L 0.036 0.819 0.044 0.001 0.001 0.012 0.042 0.044 139 T 0.089 0.431 0.183 0.002 0.003 0.030 0.116 0.146 140 R 0.119 0.275 0.073 0.002 0.002 0.064 0.075 0.391 141 L 0.200 0.088 0.197 0.005 0.004 0.086 0.108 0.313 142 A 0.176 0.026 0.039 0.004 0.005 0.102 0.054 0.593 143 Q 0.058 0.006 0.012 0.002 0.003 0.071 0.019 0.830 144 F 0.023 0.006 0.021 0.004 0.006 0.089 0.031 0.821 145 E 0.037 0.004 0.013 0.006 0.009 0.142 0.027 0.761 146 E 0.097 0.008 0.013 0.010 0.013 0.128 0.036 0.695 147 P 0.033 0.007 0.014 0.007 0.011 0.094 0.022 0.811