# TARGET T0372 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0372.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 17 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 2 I 0.031 0.023 0.003 0.005 0.002 0.007 0.929 3 P 0.077 0.022 0.008 0.011 0.099 0.036 0.747 4 F 0.096 0.009 0.005 0.014 0.150 0.033 0.693 5 K 0.133 0.006 0.005 0.011 0.137 0.020 0.686 6 D 0.246 0.022 0.003 0.005 0.071 0.014 0.639 7 I 0.180 0.038 0.002 0.004 0.067 0.004 0.704 8 T 0.173 0.024 0.001 0.004 0.032 0.002 0.764 9 L 0.010 0.002 0.159 0.619 0.046 0.099 0.065 10 A 0.005 0.003 0.218 0.460 0.063 0.215 0.036 11 D 0.004 0.003 0.265 0.493 0.050 0.103 0.082 12 R 0.002 0.001 0.084 0.841 0.016 0.029 0.026 13 D 0.004 0.001 0.060 0.831 0.015 0.069 0.019 14 T 0.003 0.003 0.066 0.803 0.010 0.100 0.016 15 I 0.003 0.002 0.019 0.916 0.014 0.028 0.019 16 T 0.002 0.001 0.017 0.948 0.008 0.015 0.009 17 A 0.002 0.001 0.015 0.939 0.007 0.027 0.009 18 F 0.001 0.001 0.014 0.938 0.006 0.033 0.008 19 T 0.003 0.002 0.016 0.910 0.011 0.047 0.012 20 M 0.004 0.001 0.029 0.794 0.017 0.138 0.019 21 K 0.004 0.001 0.025 0.697 0.034 0.207 0.031 22 S 0.010 0.006 0.026 0.479 0.142 0.172 0.165 23 D 0.023 0.011 0.030 0.189 0.166 0.220 0.361 24 R 0.068 0.011 0.078 0.190 0.132 0.161 0.359 25 R 0.156 0.014 0.092 0.152 0.138 0.144 0.304 26 N 0.205 0.020 0.093 0.128 0.149 0.123 0.281 27 C 0.226 0.019 0.061 0.073 0.166 0.106 0.350 28 D 0.192 0.013 0.071 0.048 0.228 0.183 0.266 29 L 0.250 0.015 0.039 0.049 0.194 0.160 0.292 30 S 0.378 0.027 0.012 0.038 0.099 0.060 0.386 31 F 0.358 0.017 0.033 0.121 0.093 0.054 0.324 32 S 0.344 0.021 0.086 0.152 0.098 0.077 0.222 33 N 0.357 0.016 0.113 0.133 0.089 0.082 0.210 34 L 0.514 0.012 0.071 0.141 0.059 0.059 0.143 35 C 0.701 0.024 0.036 0.085 0.023 0.043 0.089 36 S 0.732 0.008 0.031 0.063 0.034 0.039 0.093 37 W 0.642 0.007 0.054 0.094 0.047 0.046 0.110 38 R 0.480 0.008 0.104 0.147 0.066 0.085 0.110 39 F 0.376 0.018 0.117 0.113 0.095 0.155 0.126 40 L 0.341 0.013 0.082 0.083 0.136 0.098 0.247 41 Y 0.301 0.011 0.058 0.060 0.134 0.265 0.172 42 D 0.349 0.005 0.025 0.019 0.156 0.281 0.165 43 T 0.677 0.011 0.004 0.008 0.068 0.014 0.218 44 Q 0.870 0.004 0.001 0.002 0.019 0.002 0.101 45 F 0.962 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.030 46 A 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 47 V 0.975 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.019 48 I 0.947 0.002 0.003 0.001 0.006 0.012 0.028 49 D 0.256 0.003 0.031 0.003 0.107 0.576 0.025 50 D 0.123 0.001 0.021 0.001 0.144 0.663 0.048 51 F 0.822 0.004 0.002 0.001 0.013 0.011 0.148 52 L 0.976 0.004 0.001 0.001 0.002 0.001 0.017 53 V 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.006 54 F 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 55 K 0.937 0.001 0.001 0.001 0.006 0.002 0.053 56 F 0.826 0.005 0.002 0.002 0.030 0.008 0.127 57 W 0.548 0.019 0.007 0.004 0.102 0.029 0.290 58 A 0.273 0.020 0.019 0.005 0.151 0.069 0.464 59 G 0.045 0.007 0.037 0.008 0.228 0.534 0.142 60 E 0.020 0.005 0.023 0.004 0.251 0.592 0.105 61 Q 0.117 0.015 0.012 0.004 0.400 0.048 0.404 62 L 0.329 0.029 0.007 0.004 0.086 0.025 0.521 63 A 0.696 0.018 0.009 0.004 0.054 0.021 0.199 64 Y 0.810 0.021 0.009 0.004 0.022 0.013 0.121 65 M 0.753 0.023 0.008 0.005 0.034 0.012 0.165 66 M 0.600 0.021 0.006 0.006 0.080 0.011 0.276 67 P 0.269 0.030 0.010 0.009 0.090 0.024 0.567 68 V 0.060 0.023 0.025 0.012 0.144 0.078 0.658 69 G 0.017 0.010 0.042 0.016 0.218 0.183 0.514 70 N 0.004 0.004 0.101 0.043 0.253 0.417 0.176 71 G 0.003 0.006 0.060 0.059 0.377 0.311 0.184 72 D 0.002 0.013 0.032 0.091 0.238 0.087 0.537 73 L 0.001 0.005 0.029 0.680 0.084 0.054 0.147 74 K 0.001 0.001 0.014 0.912 0.014 0.034 0.024 75 A 0.001 0.001 0.010 0.955 0.006 0.018 0.010 76 V 0.001 0.001 0.003 0.978 0.003 0.008 0.007 77 L 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.004 0.003 78 R 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.002 79 K 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.006 0.002 80 L 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.006 0.002 81 I 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.009 0.002 82 E 0.001 0.001 0.001 0.968 0.003 0.024 0.003 83 D 0.001 0.001 0.003 0.941 0.005 0.041 0.010 84 A 0.003 0.002 0.009 0.886 0.018 0.052 0.029 85 D 0.005 0.002 0.033 0.787 0.024 0.107 0.042 86 K 0.006 0.002 0.061 0.548 0.056 0.268 0.060 87 E 0.003 0.003 0.041 0.224 0.077 0.599 0.053 88 K 0.007 0.003 0.037 0.075 0.124 0.568 0.186 89 H 0.051 0.014 0.041 0.049 0.225 0.125 0.495 90 N 0.116 0.009 0.028 0.020 0.156 0.213 0.458 91 F 0.442 0.018 0.019 0.021 0.101 0.047 0.351 92 C 0.739 0.038 0.009 0.015 0.032 0.010 0.156 93 M 0.748 0.028 0.016 0.011 0.019 0.016 0.162 94 L 0.589 0.009 0.027 0.020 0.080 0.082 0.194 95 G 0.320 0.024 0.026 0.020 0.195 0.134 0.282 96 V 0.079 0.025 0.006 0.014 0.246 0.023 0.606 97 C 0.019 0.005 0.001 0.013 0.105 0.009 0.848 98 S 0.001 0.001 0.045 0.864 0.024 0.057 0.009 99 N 0.001 0.001 0.032 0.917 0.007 0.037 0.006 100 M 0.001 0.001 0.027 0.952 0.002 0.014 0.004 101 R 0.001 0.001 0.005 0.986 0.002 0.005 0.002 102 A 0.001 0.001 0.006 0.977 0.001 0.011 0.002 103 D 0.001 0.001 0.010 0.967 0.001 0.019 0.002 104 L 0.001 0.001 0.010 0.966 0.003 0.016 0.004 105 E 0.001 0.001 0.025 0.946 0.003 0.021 0.003 106 A 0.002 0.001 0.026 0.868 0.007 0.092 0.005 107 I 0.003 0.001 0.021 0.781 0.026 0.149 0.020 108 L 0.024 0.013 0.017 0.176 0.207 0.154 0.409 109 P 0.012 0.002 0.090 0.049 0.133 0.565 0.148 110 E 0.015 0.001 0.102 0.022 0.126 0.695 0.040 111 R 0.214 0.009 0.105 0.027 0.188 0.202 0.254 112 F 0.745 0.016 0.007 0.012 0.018 0.011 0.192 113 I 0.848 0.007 0.002 0.009 0.010 0.004 0.120 114 F 0.798 0.015 0.006 0.019 0.018 0.006 0.138 115 T 0.659 0.009 0.012 0.033 0.035 0.012 0.239 116 E 0.410 0.013 0.038 0.053 0.092 0.020 0.374 117 D 0.247 0.022 0.043 0.077 0.093 0.032 0.487 118 R 0.122 0.009 0.068 0.081 0.119 0.103 0.499 119 A 0.052 0.009 0.067 0.073 0.290 0.145 0.363 120 Y 0.035 0.014 0.048 0.084 0.295 0.159 0.366 121 A 0.009 0.006 0.019 0.060 0.014 0.089 0.803 122 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998