# TARGET T0371 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0371/T0371.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2160 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.086 0.033 0.318 0.504 0.001 0.007 0.002 0.001 0.002 0.002 0.003 0.007 0.016 0.001 0.002 0.015 2 Q 0.009 0.007 0.088 0.093 0.004 0.757 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.024 0.001 0.001 0.001 3 I 0.001 0.007 0.002 0.014 0.005 0.234 0.001 0.003 0.001 0.001 0.702 0.005 0.026 0.001 0.001 0.001 4 E 0.001 0.133 0.002 0.024 0.001 0.005 0.001 0.005 0.001 0.001 0.048 0.752 0.026 0.001 0.001 0.001 5 S 0.002 0.003 0.007 0.018 0.001 0.066 0.004 0.002 0.004 0.002 0.011 0.123 0.731 0.004 0.003 0.018 6 F 0.002 0.003 0.034 0.003 0.001 0.011 0.006 0.001 0.001 0.001 0.095 0.016 0.818 0.002 0.004 0.004 7 K 0.002 0.007 0.009 0.008 0.001 0.007 0.005 0.002 0.001 0.001 0.033 0.128 0.782 0.006 0.004 0.006 8 S 0.004 0.003 0.007 0.012 0.001 0.006 0.006 0.001 0.001 0.001 0.011 0.017 0.890 0.012 0.009 0.021 9 L 0.004 0.024 0.065 0.013 0.001 0.003 0.018 0.001 0.001 0.001 0.010 0.013 0.694 0.011 0.018 0.125 10 L 0.027 0.007 0.160 0.019 0.005 0.051 0.120 0.002 0.001 0.001 0.005 0.014 0.526 0.020 0.012 0.030 11 P 0.017 0.112 0.104 0.035 0.001 0.084 0.022 0.015 0.001 0.001 0.072 0.014 0.472 0.003 0.026 0.022 12 K 0.009 0.488 0.039 0.156 0.001 0.005 0.002 0.001 0.025 0.001 0.012 0.019 0.046 0.005 0.004 0.187 13 Y 0.101 0.004 0.312 0.129 0.001 0.275 0.008 0.001 0.001 0.001 0.005 0.014 0.141 0.001 0.004 0.004 14 K 0.001 0.793 0.153 0.040 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.001 0.001 0.002 15 C 0.001 0.001 0.009 0.981 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 16 I 0.001 0.001 0.849 0.143 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 17 F 0.001 0.002 0.002 0.983 0.006 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 18 F 0.001 0.012 0.004 0.948 0.010 0.019 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 19 D 0.001 0.006 0.001 0.037 0.027 0.915 0.001 0.002 0.001 0.005 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 20 A 0.001 0.030 0.001 0.009 0.135 0.010 0.011 0.008 0.001 0.001 0.771 0.003 0.001 0.016 0.001 0.001 21 F 0.001 0.065 0.005 0.014 0.001 0.014 0.001 0.235 0.005 0.001 0.006 0.194 0.002 0.001 0.454 0.001 22 G 0.003 0.007 0.018 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.200 0.019 0.006 0.002 0.010 0.001 0.002 0.723 23 V 0.893 0.004 0.038 0.025 0.001 0.003 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.015 0.010 0.001 0.001 0.004 24 L 0.011 0.032 0.689 0.090 0.008 0.080 0.014 0.002 0.001 0.001 0.008 0.008 0.048 0.002 0.001 0.005 25 K 0.002 0.095 0.036 0.766 0.014 0.028 0.005 0.006 0.002 0.001 0.009 0.006 0.022 0.001 0.001 0.006 26 T 0.005 0.017 0.023 0.150 0.066 0.614 0.011 0.009 0.007 0.011 0.011 0.019 0.050 0.002 0.002 0.004 27 Y 0.004 0.078 0.027 0.039 0.101 0.044 0.068 0.023 0.003 0.004 0.498 0.013 0.043 0.047 0.003 0.004 28 N 0.006 0.070 0.019 0.053 0.003 0.023 0.007 0.120 0.017 0.004 0.024 0.391 0.034 0.006 0.218 0.005 29 G 0.015 0.020 0.070 0.034 0.004 0.019 0.017 0.005 0.108 0.055 0.040 0.026 0.141 0.006 0.016 0.424 30 L 0.391 0.095 0.148 0.112 0.002 0.011 0.007 0.005 0.007 0.002 0.021 0.053 0.086 0.002 0.008 0.051 31 L 0.020 0.004 0.109 0.014 0.178 0.281 0.224 0.002 0.001 0.007 0.012 0.027 0.064 0.052 0.001 0.004 32 P 0.004 0.065 0.025 0.028 0.001 0.018 0.001 0.448 0.001 0.001 0.262 0.014 0.065 0.001 0.062 0.002 33 G 0.002 0.011 0.003 0.021 0.001 0.051 0.001 0.002 0.135 0.146 0.034 0.445 0.117 0.001 0.001 0.031 34 I 0.044 0.002 0.005 0.002 0.001 0.032 0.003 0.001 0.001 0.001 0.133 0.111 0.663 0.001 0.001 0.001 35 E 0.001 0.003 0.007 0.001 0.001 0.007 0.001 0.002 0.001 0.001 0.078 0.229 0.668 0.001 0.002 0.001 36 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.068 0.918 0.001 0.001 0.001 37 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.987 0.001 0.001 0.001 38 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.989 0.001 0.001 0.001 39 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.995 0.001 0.001 0.001 40 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 41 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.002 0.001 42 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.001 0.002 43 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.993 0.001 0.001 44 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.995 0.001 45 G 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.989 46 Q 0.994 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 47 D 0.005 0.081 0.845 0.055 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 48 Y 0.002 0.009 0.066 0.912 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 49 Y 0.001 0.002 0.079 0.912 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 50 I 0.001 0.003 0.017 0.912 0.033 0.031 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 51 V 0.001 0.024 0.006 0.804 0.083 0.061 0.002 0.007 0.001 0.002 0.006 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 52 T 0.002 0.076 0.003 0.316 0.055 0.465 0.003 0.035 0.007 0.007 0.013 0.010 0.004 0.001 0.001 0.001 53 N 0.006 0.255 0.022 0.171 0.039 0.119 0.011 0.053 0.023 0.019 0.213 0.041 0.010 0.004 0.005 0.007 54 D 0.028 0.165 0.062 0.114 0.020 0.126 0.029 0.029 0.029 0.020 0.096 0.189 0.023 0.019 0.034 0.017 55 A 0.035 0.075 0.117 0.050 0.005 0.100 0.035 0.020 0.010 0.015 0.213 0.126 0.069 0.008 0.080 0.040 56 S 0.057 0.259 0.082 0.044 0.002 0.064 0.009 0.005 0.030 0.006 0.084 0.097 0.057 0.004 0.023 0.178 57 R 0.083 0.287 0.369 0.142 0.001 0.002 0.002 0.002 0.003 0.002 0.009 0.036 0.022 0.001 0.005 0.036 58 S 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 0.001 0.001 0.001 59 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 60 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 0.001 0.001 61 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.993 0.001 0.001 0.001 62 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 63 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 64 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.995 0.001 0.001 0.001 65 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 66 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 67 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 68 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.990 0.001 0.002 69 L 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.983 0.001 70 G 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.003 0.007 0.001 0.001 0.040 0.005 0.001 0.924 71 L 0.952 0.007 0.006 0.006 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.013 0.002 0.002 0.003 72 F 0.020 0.115 0.441 0.054 0.004 0.095 0.031 0.007 0.006 0.008 0.028 0.049 0.072 0.009 0.018 0.044 73 S 0.052 0.196 0.217 0.259 0.004 0.097 0.011 0.005 0.007 0.002 0.036 0.017 0.048 0.001 0.012 0.035 74 I 0.025 0.138 0.212 0.535 0.002 0.012 0.004 0.003 0.003 0.003 0.018 0.024 0.011 0.001 0.001 0.008 75 T 0.002 0.003 0.010 0.009 0.003 0.944 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.012 0.001 0.001 0.001 76 A 0.001 0.004 0.001 0.002 0.001 0.017 0.001 0.002 0.001 0.001 0.959 0.002 0.012 0.001 0.001 0.001 77 D 0.001 0.060 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.911 0.009 0.001 0.003 0.001 78 K 0.011 0.004 0.102 0.037 0.001 0.007 0.012 0.001 0.006 0.001 0.008 0.007 0.639 0.007 0.013 0.145 79 I 0.016 0.009 0.591 0.032 0.005 0.012 0.046 0.001 0.001 0.001 0.013 0.006 0.224 0.009 0.003 0.030 80 I 0.019 0.060 0.193 0.192 0.039 0.048 0.056 0.021 0.003 0.003 0.012 0.020 0.277 0.021 0.012 0.024 81 S 0.006 0.013 0.028 0.075 0.327 0.109 0.146 0.016 0.007 0.011 0.021 0.009 0.110 0.094 0.007 0.020 82 S 0.009 0.063 0.030 0.045 0.027 0.043 0.024 0.347 0.010 0.008 0.116 0.024 0.098 0.022 0.116 0.018 83 G 0.017 0.062 0.035 0.050 0.003 0.041 0.007 0.059 0.149 0.124 0.074 0.142 0.106 0.004 0.041 0.088 84 M 0.323 0.039 0.076 0.056 0.002 0.029 0.006 0.005 0.026 0.014 0.085 0.107 0.172 0.002 0.008 0.050 85 I 0.083 0.030 0.213 0.081 0.002 0.098 0.006 0.005 0.002 0.002 0.057 0.169 0.233 0.002 0.004 0.010 86 T 0.006 0.035 0.062 0.078 0.003 0.208 0.004 0.005 0.001 0.001 0.069 0.123 0.396 0.002 0.003 0.004 87 K 0.002 0.019 0.016 0.083 0.004 0.039 0.005 0.004 0.002 0.001 0.199 0.062 0.552 0.005 0.002 0.005 88 E 0.004 0.026 0.031 0.077 0.002 0.014 0.006 0.005 0.002 0.001 0.017 0.144 0.649 0.004 0.010 0.009 89 Y 0.005 0.006 0.039 0.044 0.009 0.045 0.036 0.003 0.003 0.002 0.012 0.018 0.677 0.044 0.009 0.048 90 I 0.007 0.028 0.075 0.045 0.003 0.031 0.023 0.016 0.001 0.001 0.050 0.017 0.633 0.010 0.044 0.017 91 D 0.010 0.050 0.059 0.070 0.003 0.046 0.017 0.011 0.016 0.008 0.032 0.055 0.494 0.022 0.021 0.088 92 L 0.082 0.036 0.085 0.081 0.006 0.021 0.023 0.006 0.011 0.003 0.065 0.030 0.432 0.022 0.025 0.073 93 K 0.034 0.046 0.222 0.047 0.031 0.071 0.059 0.006 0.005 0.003 0.028 0.049 0.298 0.035 0.014 0.053 94 V 0.005 0.010 0.033 0.010 0.316 0.022 0.307 0.008 0.001 0.001 0.021 0.009 0.047 0.197 0.007 0.006 95 D 0.003 0.044 0.019 0.017 0.014 0.011 0.032 0.470 0.006 0.003 0.017 0.011 0.025 0.023 0.294 0.011 96 G 0.012 0.038 0.034 0.057 0.001 0.004 0.003 0.026 0.431 0.084 0.007 0.009 0.020 0.001 0.044 0.230 97 G 0.746 0.014 0.088 0.074 0.001 0.005 0.002 0.001 0.018 0.006 0.002 0.005 0.007 0.001 0.001 0.032 98 I 0.080 0.024 0.662 0.214 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.001 0.001 0.002 99 V 0.004 0.009 0.181 0.585 0.045 0.156 0.003 0.001 0.001 0.001 0.007 0.003 0.004 0.001 0.001 0.001 100 A 0.002 0.106 0.034 0.687 0.028 0.080 0.001 0.021 0.001 0.001 0.025 0.005 0.008 0.001 0.001 0.001 101 Y 0.002 0.020 0.007 0.199 0.522 0.103 0.027 0.006 0.011 0.011 0.036 0.021 0.008 0.021 0.001 0.003 102 L 0.013 0.101 0.056 0.158 0.008 0.023 0.002 0.470 0.004 0.002 0.035 0.025 0.019 0.001 0.081 0.003 103 G 0.006 0.024 0.033 0.092 0.006 0.123 0.003 0.012 0.134 0.362 0.034 0.054 0.043 0.001 0.001 0.072 104 T 0.231 0.023 0.020 0.032 0.011 0.190 0.007 0.007 0.002 0.004 0.261 0.091 0.116 0.002 0.002 0.002 105 A 0.003 0.054 0.034 0.028 0.001 0.057 0.001 0.014 0.002 0.002 0.252 0.363 0.180 0.001 0.005 0.002 106 N 0.003 0.012 0.007 0.025 0.001 0.045 0.001 0.001 0.004 0.003 0.045 0.343 0.505 0.001 0.001 0.005 107 S 0.002 0.002 0.003 0.004 0.001 0.017 0.001 0.001 0.001 0.001 0.050 0.046 0.874 0.001 0.001 0.001 108 A 0.001 0.001 0.003 0.003 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.072 0.893 0.001 0.001 0.001 109 N 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.982 0.001 0.001 0.001 110 Y 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.981 0.001 0.001 0.004 111 L 0.001 0.002 0.014 0.011 0.001 0.003 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.934 0.006 0.004 0.012 112 V 0.001 0.004 0.021 0.007 0.004 0.013 0.012 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.885 0.022 0.008 0.015 113 S 0.001 0.001 0.002 0.001 0.015 0.002 0.060 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.043 0.859 0.003 0.006 114 D 0.001 0.006 0.005 0.001 0.001 0.001 0.003 0.042 0.001 0.001 0.003 0.003 0.032 0.002 0.894 0.004 115 G 0.005 0.007 0.015 0.003 0.001 0.001 0.004 0.001 0.059 0.016 0.003 0.004 0.044 0.004 0.003 0.831 116 I 0.889 0.004 0.029 0.010 0.001 0.004 0.009 0.001 0.001 0.001 0.005 0.011 0.027 0.002 0.002 0.004 117 K 0.015 0.091 0.506 0.069 0.007 0.109 0.020 0.014 0.003 0.003 0.024 0.029 0.076 0.006 0.012 0.016 118 M 0.015 0.117 0.092 0.559 0.008 0.035 0.009 0.010 0.014 0.004 0.038 0.021 0.043 0.004 0.008 0.025 119 L 0.033 0.049 0.220 0.428 0.012 0.094 0.015 0.007 0.008 0.006 0.015 0.044 0.051 0.002 0.004 0.011 120 P 0.026 0.072 0.220 0.346 0.006 0.131 0.005 0.016 0.005 0.005 0.052 0.019 0.072 0.002 0.005 0.016 121 V 0.024 0.069 0.083 0.433 0.011 0.108 0.007 0.007 0.009 0.006 0.101 0.062 0.063 0.004 0.002 0.011 122 S 0.021 0.095 0.090 0.274 0.008 0.187 0.007 0.013 0.003 0.003 0.053 0.113 0.118 0.002 0.006 0.006 123 A 0.006 0.059 0.055 0.158 0.014 0.235 0.011 0.010 0.006 0.005 0.163 0.067 0.184 0.006 0.003 0.016 124 I 0.010 0.116 0.065 0.131 0.007 0.087 0.014 0.015 0.003 0.002 0.107 0.157 0.258 0.005 0.014 0.008 125 D 0.008 0.041 0.056 0.075 0.003 0.108 0.008 0.012 0.008 0.005 0.073 0.113 0.440 0.006 0.017 0.027 126 D 0.025 0.026 0.055 0.047 0.008 0.045 0.022 0.006 0.007 0.003 0.168 0.057 0.443 0.032 0.011 0.045 127 S 0.018 0.065 0.120 0.057 0.003 0.027 0.012 0.010 0.003 0.001 0.041 0.119 0.463 0.006 0.034 0.023 128 N 0.011 0.016 0.077 0.031 0.029 0.066 0.094 0.004 0.005 0.004 0.037 0.039 0.447 0.075 0.006 0.058 129 I 0.029 0.069 0.111 0.067 0.004 0.028 0.016 0.063 0.003 0.001 0.064 0.033 0.390 0.006 0.099 0.020 130 G 0.010 0.058 0.100 0.115 0.002 0.050 0.008 0.008 0.029 0.026 0.037 0.074 0.368 0.003 0.008 0.104 131 E 0.117 0.036 0.070 0.082 0.011 0.112 0.023 0.003 0.003 0.002 0.057 0.050 0.401 0.009 0.004 0.019 132 V 0.009 0.059 0.136 0.082 0.002 0.147 0.005 0.018 0.001 0.001 0.114 0.076 0.327 0.003 0.014 0.005 133 N 0.005 0.181 0.084 0.214 0.001 0.039 0.002 0.005 0.008 0.002 0.024 0.141 0.266 0.001 0.007 0.020 134 A 0.024 0.012 0.067 0.376 0.001 0.029 0.001 0.002 0.002 0.001 0.052 0.019 0.400 0.001 0.002 0.012 135 L 0.006 0.012 0.324 0.211 0.003 0.023 0.004 0.001 0.001 0.001 0.023 0.017 0.368 0.003 0.002 0.005 136 V 0.002 0.026 0.059 0.569 0.006 0.027 0.006 0.002 0.001 0.001 0.007 0.010 0.272 0.004 0.002 0.006 137 L 0.003 0.041 0.047 0.599 0.029 0.081 0.017 0.003 0.002 0.001 0.004 0.005 0.135 0.010 0.004 0.018 138 L 0.007 0.080 0.102 0.430 0.056 0.095 0.040 0.024 0.003 0.003 0.021 0.006 0.083 0.012 0.013 0.025 139 D 0.009 0.058 0.037 0.064 0.023 0.512 0.007 0.056 0.007 0.016 0.064 0.028 0.089 0.004 0.014 0.012 140 D 0.010 0.036 0.010 0.010 0.081 0.042 0.068 0.007 0.007 0.008 0.471 0.034 0.040 0.164 0.002 0.010 141 E 0.009 0.068 0.014 0.011 0.001 0.009 0.006 0.111 0.003 0.001 0.035 0.196 0.030 0.004 0.499 0.004 142 G 0.005 0.021 0.057 0.011 0.001 0.003 0.007 0.001 0.097 0.015 0.005 0.013 0.044 0.004 0.009 0.706 143 F 0.645 0.011 0.134 0.058 0.001 0.011 0.016 0.002 0.003 0.002 0.011 0.022 0.064 0.001 0.006 0.013 144 N 0.023 0.041 0.461 0.067 0.006 0.211 0.011 0.006 0.002 0.005 0.020 0.027 0.096 0.002 0.003 0.019 145 W 0.019 0.101 0.065 0.321 0.008 0.089 0.003 0.011 0.004 0.004 0.175 0.059 0.124 0.002 0.003 0.012 146 F 0.006 0.010 0.027 0.031 0.039 0.417 0.022 0.003 0.003 0.005 0.052 0.183 0.187 0.010 0.002 0.003 147 H 0.002 0.017 0.008 0.011 0.001 0.017 0.001 0.033 0.001 0.001 0.531 0.056 0.311 0.001 0.010 0.002 148 D 0.001 0.005 0.001 0.004 0.001 0.023 0.001 0.001 0.009 0.004 0.026 0.599 0.314 0.001 0.001 0.011 149 L 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.033 0.036 0.921 0.001 0.001 0.001 150 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.071 0.913 0.001 0.001 0.001 151 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 0.986 0.001 0.001 0.001 152 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.991 0.001 0.001 0.001 153 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 154 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 155 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.004 0.001 0.003 156 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.966 0.011 0.011 0.004 157 R 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.948 0.010 0.013 0.019 158 K 0.008 0.001 0.007 0.001 0.001 0.002 0.042 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.344 0.469 0.020 0.099 159 R 0.015 0.017 0.074 0.003 0.001 0.004 0.027 0.007 0.001 0.001 0.011 0.005 0.288 0.008 0.490 0.052 160 T 0.018 0.065 0.139 0.012 0.001 0.002 0.005 0.001 0.012 0.001 0.002 0.005 0.070 0.002 0.004 0.662 161 I 0.560 0.011 0.205 0.078 0.001 0.043 0.010 0.001 0.001 0.001 0.006 0.008 0.066 0.001 0.001 0.009 162 P 0.005 0.204 0.606 0.142 0.001 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.016 0.001 0.001 0.003 163 A 0.001 0.004 0.022 0.940 0.002 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 164 I 0.004 0.016 0.206 0.717 0.019 0.011 0.004 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.011 0.001 0.001 0.003 165 V 0.004 0.015 0.021 0.835 0.044 0.053 0.006 0.004 0.001 0.001 0.002 0.002 0.008 0.002 0.001 0.002 166 A 0.004 0.072 0.031 0.614 0.031 0.154 0.005 0.041 0.005 0.007 0.015 0.004 0.008 0.001 0.003 0.005 167 N 0.009 0.154 0.014 0.173 0.025 0.456 0.005 0.022 0.019 0.020 0.056 0.023 0.013 0.001 0.002 0.006 168 T 0.021 0.100 0.048 0.092 0.026 0.094 0.015 0.027 0.011 0.012 0.436 0.079 0.023 0.007 0.005 0.005 169 D 0.011 0.154 0.061 0.059 0.004 0.142 0.008 0.023 0.008 0.006 0.076 0.341 0.049 0.004 0.046 0.007 170 N 0.022 0.076 0.072 0.062 0.007 0.062 0.016 0.009 0.029 0.010 0.227 0.092 0.165 0.012 0.015 0.124 171 T 0.095 0.197 0.240 0.131 0.002 0.016 0.014 0.006 0.011 0.001 0.022 0.113 0.089 0.006 0.019 0.038 172 Y 0.032 0.022 0.435 0.146 0.003 0.093 0.019 0.004 0.004 0.005 0.012 0.029 0.158 0.002 0.008 0.027 173 P 0.027 0.067 0.199 0.213 0.006 0.146 0.008 0.006 0.003 0.002 0.110 0.019 0.170 0.002 0.002 0.021 174 L 0.016 0.107 0.079 0.448 0.005 0.058 0.005 0.006 0.004 0.002 0.061 0.089 0.107 0.003 0.002 0.008 175 T 0.008 0.046 0.103 0.261 0.010 0.211 0.009 0.006 0.003 0.003 0.025 0.078 0.225 0.002 0.005 0.007 176 K 0.007 0.037 0.060 0.151 0.013 0.118 0.011 0.016 0.002 0.003 0.207 0.029 0.323 0.007 0.004 0.013 177 T 0.006 0.072 0.027 0.111 0.003 0.133 0.004 0.015 0.004 0.002 0.089 0.221 0.293 0.003 0.012 0.006 178 D 0.006 0.023 0.035 0.082 0.003 0.046 0.008 0.005 0.005 0.003 0.084 0.070 0.595 0.006 0.007 0.024 179 V 0.012 0.030 0.048 0.076 0.002 0.022 0.007 0.005 0.002 0.001 0.042 0.076 0.649 0.005 0.009 0.015 180 A 0.010 0.016 0.067 0.060 0.018 0.035 0.058 0.003 0.004 0.002 0.023 0.028 0.529 0.098 0.008 0.042 181 I 0.007 0.038 0.119 0.075 0.010 0.031 0.032 0.014 0.001 0.001 0.023 0.026 0.528 0.006 0.070 0.019 182 A 0.006 0.010 0.026 0.014 0.147 0.058 0.127 0.008 0.006 0.016 0.030 0.020 0.220 0.238 0.005 0.070 183 I 0.036 0.036 0.025 0.013 0.016 0.023 0.038 0.170 0.004 0.002 0.097 0.033 0.184 0.049 0.262 0.013 184 G 0.009 0.047 0.054 0.025 0.001 0.011 0.002 0.043 0.074 0.076 0.049 0.110 0.253 0.002 0.083 0.162 185 G 0.193 0.003 0.015 0.011 0.001 0.062 0.003 0.001 0.008 0.019 0.054 0.123 0.479 0.001 0.001 0.027 186 V 0.013 0.004 0.012 0.003 0.001 0.038 0.001 0.001 0.001 0.001 0.309 0.112 0.505 0.001 0.001 0.001 187 A 0.001 0.008 0.004 0.004 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.429 0.524 0.001 0.001 0.001 188 T 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.017 0.967 0.001 0.001 0.001 189 M 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.018 0.969 0.001 0.001 0.002 190 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.980 0.001 0.001 0.001 191 E 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.987 0.001 0.001 0.001 192 S 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.985 0.001 0.001 0.003 193 I 0.001 0.001 0.014 0.002 0.002 0.001 0.057 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.649 0.222 0.005 0.042 194 L 0.002 0.016 0.057 0.013 0.001 0.002 0.018 0.011 0.001 0.001 0.002 0.004 0.570 0.014 0.266 0.025 195 G 0.005 0.007 0.052 0.023 0.002 0.022 0.022 0.002 0.011 0.012 0.006 0.003 0.448 0.022 0.014 0.348 196 R 0.184 0.053 0.095 0.063 0.003 0.025 0.023 0.008 0.002 0.002 0.076 0.016 0.391 0.008 0.019 0.034 197 R 0.023 0.122 0.177 0.078 0.004 0.112 0.011 0.008 0.007 0.004 0.044 0.122 0.233 0.009 0.011 0.035 198 F 0.026 0.062 0.117 0.144 0.029 0.104 0.045 0.007 0.005 0.002 0.104 0.057 0.243 0.026 0.009 0.020 199 I 0.014 0.160 0.158 0.200 0.010 0.049 0.015 0.027 0.005 0.002 0.038 0.083 0.186 0.005 0.032 0.016 200 R 0.016 0.022 0.074 0.141 0.081 0.071 0.127 0.014 0.020 0.021 0.049 0.032 0.129 0.138 0.008 0.057 201 F 0.054 0.113 0.164 0.230 0.004 0.016 0.015 0.075 0.011 0.002 0.022 0.029 0.103 0.004 0.136 0.021 202 G 0.038 0.022 0.157 0.245 0.006 0.035 0.018 0.005 0.061 0.086 0.022 0.035 0.082 0.006 0.005 0.179 203 K 0.323 0.034 0.141 0.295 0.018 0.052 0.012 0.004 0.003 0.002 0.022 0.019 0.056 0.003 0.003 0.013 204 P 0.012 0.078 0.137 0.420 0.012 0.092 0.005 0.027 0.002 0.010 0.062 0.054 0.073 0.003 0.005 0.009 205 D 0.001 0.004 0.002 0.006 0.001 0.840 0.001 0.003 0.001 0.005 0.024 0.035 0.076 0.001 0.001 0.001 206 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.880 0.024 0.086 0.001 0.001 0.001 207 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.950 0.042 0.001 0.001 0.001 208 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.009 0.985 0.001 0.001 0.001 209 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.989 0.001 0.001 0.001 210 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 211 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 212 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 213 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 214 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 215 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.966 0.024 0.002 0.007 216 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.968 0.009 0.013 0.003 217 R 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.954 0.009 0.008 0.019 218 Q 0.005 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.005 0.007 0.852 0.066 0.016 0.035 219 K 0.002 0.002 0.011 0.001 0.001 0.001 0.141 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.111 0.679 0.026 0.021 220 M 0.004 0.008 0.041 0.003 0.001 0.001 0.022 0.018 0.001 0.001 0.004 0.007 0.070 0.003 0.794 0.026 221 E 0.011 0.014 0.043 0.004 0.001 0.002 0.003 0.001 0.027 0.003 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.876 222 I 0.590 0.034 0.284 0.081 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.005 223 S 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 224 K 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 225 R 0.001 0.159 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.831 0.001 0.001 0.001 0.001 226 E 0.007 0.009 0.751 0.101 0.001 0.002 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.049 0.001 0.003 0.073 227 I 0.003 0.001 0.942 0.045 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 228 L 0.002 0.015 0.184 0.771 0.006 0.006 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 229 M 0.001 0.002 0.003 0.652 0.298 0.029 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.001 0.001 230 V 0.002 0.030 0.016 0.428 0.102 0.065 0.003 0.325 0.001 0.001 0.010 0.001 0.005 0.002 0.009 0.001 231 G 0.002 0.073 0.005 0.187 0.013 0.255 0.002 0.062 0.127 0.210 0.035 0.012 0.007 0.001 0.001 0.010 232 D 0.140 0.151 0.014 0.125 0.005 0.072 0.003 0.019 0.024 0.041 0.210 0.165 0.024 0.001 0.001 0.005 233 T 0.011 0.029 0.023 0.020 0.003 0.404 0.002 0.005 0.002 0.003 0.101 0.301 0.090 0.001 0.003 0.002 234 L 0.002 0.004 0.014 0.006 0.001 0.027 0.002 0.003 0.001 0.001 0.641 0.108 0.184 0.002 0.002 0.003 235 H 0.004 0.034 0.007 0.016 0.001 0.007 0.002 0.001 0.002 0.001 0.037 0.650 0.223 0.005 0.006 0.004 236 T 0.002 0.002 0.008 0.006 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.013 0.928 0.001 0.006 0.012 237 D 0.001 0.008 0.005 0.001 0.001 0.014 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.031 0.930 0.001 0.001 0.003 238 I 0.002 0.001 0.002 0.002 0.001 0.022 0.002 0.001 0.001 0.001 0.036 0.021 0.908 0.002 0.001 0.001 239 L 0.001 0.024 0.009 0.009 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.060 0.875 0.001 0.005 0.001 240 G 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.967 0.001 0.001 0.012 241 G 0.001 0.001 0.013 0.004 0.001 0.002 0.010 0.001 0.001 0.001 0.005 0.002 0.954 0.003 0.001 0.003 242 N 0.001 0.004 0.004 0.004 0.001 0.005 0.003 0.002 0.001 0.001 0.005 0.010 0.956 0.001 0.003 0.002 243 K 0.001 0.001 0.001 0.002 0.026 0.001 0.038 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.029 0.891 0.001 0.009 244 F 0.001 0.001 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.043 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.001 0.920 0.001 245 G 0.001 0.005 0.014 0.004 0.001 0.003 0.002 0.001 0.051 0.046 0.001 0.001 0.025 0.001 0.001 0.845 246 L 0.944 0.001 0.004 0.008 0.001 0.016 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.003 0.016 0.001 0.001 0.001 247 D 0.002 0.738 0.173 0.029 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.031 0.011 0.001 0.001 0.003 248 T 0.007 0.004 0.045 0.858 0.001 0.022 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 0.003 0.029 0.001 0.001 0.002 249 A 0.001 0.016 0.678 0.252 0.003 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.031 0.001 0.001 0.001 250 L 0.001 0.007 0.014 0.911 0.013 0.013 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.028 0.001 0.001 0.002 251 V 0.004 0.022 0.031 0.619 0.090 0.148 0.009 0.007 0.001 0.001 0.004 0.004 0.049 0.003 0.002 0.004 252 L 0.004 0.073 0.017 0.281 0.247 0.172 0.038 0.036 0.007 0.013 0.041 0.007 0.027 0.026 0.003 0.009 253 T 0.011 0.194 0.029 0.235 0.022 0.094 0.009 0.188 0.022 0.012 0.059 0.048 0.021 0.004 0.043 0.010 254 G 0.029 0.083 0.082 0.144 0.007 0.084 0.011 0.027 0.083 0.100 0.111 0.070 0.072 0.005 0.014 0.078 255 N 0.198 0.074 0.095 0.099 0.010 0.097 0.018 0.008 0.013 0.010 0.112 0.137 0.093 0.006 0.009 0.021 256 T 0.034 0.142 0.177 0.159 0.002 0.068 0.005 0.017 0.005 0.004 0.095 0.133 0.127 0.002 0.013 0.017 257 R 0.013 0.040 0.063 0.108 0.005 0.317 0.007 0.004 0.007 0.007 0.049 0.152 0.208 0.003 0.003 0.015 258 I 0.011 0.024 0.040 0.041 0.004 0.099 0.007 0.006 0.001 0.001 0.278 0.072 0.407 0.003 0.004 0.004 259 D 0.003 0.034 0.023 0.044 0.001 0.039 0.004 0.008 0.003 0.002 0.087 0.344 0.393 0.004 0.006 0.007 260 D 0.003 0.005 0.007 0.014 0.001 0.038 0.005 0.002 0.001 0.001 0.030 0.074 0.797 0.006 0.005 0.010 261 A 0.001 0.004 0.012 0.004 0.001 0.012 0.008 0.002 0.001 0.001 0.059 0.029 0.846 0.008 0.007 0.008 262 E 0.003 0.004 0.013 0.006 0.001 0.006 0.007 0.004 0.001 0.001 0.028 0.059 0.820 0.016 0.019 0.013 263 T 0.004 0.005 0.015 0.008 0.001 0.008 0.006 0.002 0.002 0.001 0.011 0.023 0.851 0.009 0.020 0.034 264 K 0.010 0.012 0.039 0.011 0.001 0.008 0.011 0.001 0.002 0.001 0.017 0.013 0.756 0.013 0.012 0.095 265 I 0.012 0.011 0.127 0.020 0.001 0.015 0.036 0.001 0.001 0.001 0.012 0.022 0.702 0.008 0.008 0.024 266 K 0.009 0.032 0.111 0.035 0.006 0.043 0.022 0.005 0.001 0.001 0.017 0.019 0.650 0.014 0.010 0.026 267 S 0.004 0.010 0.014 0.013 0.058 0.019 0.131 0.004 0.002 0.001 0.029 0.006 0.095 0.594 0.006 0.015 268 T 0.003 0.028 0.037 0.014 0.001 0.009 0.019 0.100 0.002 0.001 0.024 0.018 0.082 0.005 0.648 0.007 269 G 0.012 0.034 0.044 0.025 0.001 0.006 0.008 0.003 0.162 0.032 0.007 0.015 0.051 0.004 0.007 0.587 270 I 0.747 0.021 0.094 0.071 0.001 0.004 0.006 0.001 0.002 0.001 0.004 0.009 0.022 0.001 0.003 0.015 271 V 0.015 0.037 0.651 0.108 0.006 0.112 0.009 0.002 0.001 0.002 0.006 0.008 0.029 0.001 0.002 0.009 272 P 0.008 0.017 0.028 0.131 0.008 0.607 0.005 0.010 0.001 0.002 0.131 0.012 0.035 0.002 0.001 0.002 273 T 0.003 0.720 0.016 0.095 0.001 0.012 0.001 0.003 0.007 0.001 0.016 0.108 0.013 0.001 0.002 0.002 274 H 0.020 0.013 0.114 0.642 0.001 0.017 0.002 0.003 0.007 0.002 0.051 0.030 0.076 0.001 0.003 0.021 275 I 0.016 0.011 0.654 0.106 0.004 0.057 0.006 0.001 0.001 0.001 0.009 0.022 0.105 0.001 0.001 0.005 276 C 0.003 0.034 0.021 0.147 0.010 0.416 0.004 0.006 0.001 0.001 0.098 0.020 0.233 0.001 0.001 0.003 277 E 0.003 0.215 0.020 0.230 0.003 0.069 0.004 0.007 0.003 0.001 0.108 0.125 0.202 0.002 0.004 0.004 278 S 0.003 0.009 0.008 0.049 0.001 0.266 0.002 0.007 0.002 0.005 0.033 0.126 0.482 0.001 0.003 0.003 279 A 0.002 0.009 0.005 0.004 0.001 0.063 0.002 0.001 0.001 0.001 0.268 0.047 0.586 0.004 0.001 0.006 280 V 0.001 0.005 0.003 0.004 0.001 0.004 0.006 0.001 0.001 0.001 0.026 0.232 0.708 0.006 0.004 0.001 281 I 0.001 0.002 0.007 0.004 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.943 0.003 0.011 0.009 282 E 0.003 0.001 0.010 0.004 0.003 0.003 0.041 0.001 0.002 0.001 0.002 0.002 0.461 0.336 0.006 0.124 283 L 0.006 0.006 0.135 0.006 0.003 0.005 0.143 0.008 0.001 0.001 0.012 0.005 0.407 0.034 0.212 0.017