# TARGET T0370 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0370.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 320 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.016 0.005 0.013 0.030 0.036 0.138 0.016 0.746 2 T 0.039 0.031 0.014 0.021 0.032 0.112 0.033 0.718 3 T 0.187 0.128 0.009 0.011 0.016 0.102 0.045 0.501 4 P 0.125 0.123 0.018 0.019 0.017 0.094 0.194 0.409 5 P 0.087 0.367 0.012 0.010 0.013 0.067 0.118 0.325 6 A 0.082 0.472 0.013 0.009 0.017 0.061 0.046 0.301 7 R 0.055 0.292 0.024 0.023 0.031 0.082 0.064 0.429 8 T 0.103 0.461 0.015 0.012 0.018 0.049 0.123 0.218 9 A 0.107 0.570 0.010 0.007 0.009 0.038 0.075 0.182 10 K 0.045 0.535 0.014 0.009 0.013 0.052 0.050 0.283 11 Q 0.033 0.363 0.010 0.007 0.008 0.078 0.063 0.438 12 R 0.026 0.436 0.007 0.004 0.004 0.031 0.372 0.120 13 I 0.030 0.881 0.001 0.001 0.001 0.006 0.057 0.024 14 Q 0.034 0.577 0.006 0.002 0.002 0.018 0.275 0.086 15 D 0.012 0.781 0.006 0.002 0.002 0.016 0.113 0.068 16 T 0.064 0.851 0.003 0.001 0.001 0.008 0.042 0.030 17 L 0.089 0.741 0.011 0.003 0.002 0.017 0.060 0.078 18 N 0.058 0.501 0.013 0.003 0.005 0.041 0.092 0.288 19 R 0.114 0.254 0.027 0.003 0.003 0.066 0.217 0.315 20 L 0.134 0.189 0.032 0.008 0.007 0.082 0.253 0.297 21 E 0.083 0.109 0.026 0.003 0.004 0.072 0.081 0.622 22 L 0.052 0.086 0.025 0.003 0.006 0.114 0.076 0.638 23 D 0.082 0.193 0.063 0.007 0.011 0.112 0.103 0.430 24 V 0.040 0.161 0.055 0.013 0.029 0.131 0.089 0.482 25 D 0.011 0.056 0.185 0.026 0.080 0.122 0.167 0.352 26 A 0.008 0.022 0.290 0.103 0.145 0.052 0.264 0.116 27 W 0.014 0.022 0.287 0.138 0.193 0.058 0.138 0.149 28 V 0.010 0.012 0.304 0.159 0.263 0.048 0.056 0.149 29 S 0.021 0.010 0.178 0.169 0.295 0.074 0.046 0.208 30 T 0.018 0.006 0.148 0.171 0.256 0.082 0.089 0.230 31 A 0.031 0.003 0.050 0.085 0.136 0.137 0.056 0.503 32 G 0.276 0.003 0.036 0.053 0.072 0.108 0.117 0.334 33 A 0.085 0.001 0.007 0.014 0.019 0.111 0.021 0.742 34 D 0.053 0.001 0.008 0.009 0.019 0.093 0.020 0.797 35 G 0.014 0.001 0.010 0.016 0.047 0.141 0.025 0.745 36 G 0.036 0.001 0.019 0.027 0.059 0.084 0.023 0.750 37 A 0.101 0.002 0.023 0.151 0.147 0.084 0.040 0.451 38 P 0.006 0.001 0.030 0.066 0.104 0.087 0.016 0.691 39 Y 0.004 0.001 0.059 0.139 0.375 0.079 0.018 0.325 40 L 0.006 0.001 0.058 0.095 0.135 0.060 0.033 0.612 41 V 0.046 0.010 0.068 0.359 0.206 0.055 0.079 0.178 42 P 0.041 0.013 0.060 0.103 0.206 0.061 0.059 0.458 43 L 0.032 0.006 0.063 0.196 0.307 0.062 0.038 0.296 44 S 0.015 0.002 0.064 0.228 0.384 0.038 0.040 0.229 45 Y 0.006 0.001 0.034 0.223 0.329 0.056 0.038 0.313 46 L 0.017 0.001 0.063 0.165 0.297 0.073 0.041 0.342 47 W 0.123 0.001 0.039 0.058 0.064 0.104 0.074 0.537 48 D 0.073 0.002 0.022 0.022 0.037 0.110 0.031 0.703 49 G 0.010 0.001 0.034 0.013 0.055 0.159 0.023 0.704 50 E 0.002 0.001 0.133 0.112 0.326 0.109 0.058 0.259 51 T 0.001 0.001 0.244 0.239 0.325 0.021 0.068 0.101 52 F 0.001 0.001 0.258 0.299 0.304 0.013 0.033 0.091 53 L 0.001 0.001 0.459 0.223 0.238 0.010 0.020 0.048 54 V 0.002 0.001 0.336 0.256 0.289 0.021 0.026 0.070 55 A 0.014 0.003 0.302 0.119 0.154 0.067 0.032 0.310 56 T 0.198 0.015 0.072 0.094 0.106 0.083 0.122 0.309 57 P 0.199 0.021 0.023 0.012 0.021 0.144 0.063 0.519 58 A 0.016 0.004 0.012 0.011 0.018 0.135 0.132 0.672 59 A 0.024 0.028 0.007 0.008 0.012 0.113 0.108 0.701 60 S 0.220 0.217 0.005 0.008 0.011 0.106 0.082 0.349 61 P 0.053 0.150 0.023 0.026 0.031 0.106 0.060 0.552 62 T 0.120 0.378 0.019 0.015 0.045 0.060 0.060 0.303 63 G 0.100 0.121 0.058 0.024 0.037 0.100 0.193 0.366 64 R 0.055 0.077 0.095 0.105 0.113 0.108 0.115 0.332 65 N 0.116 0.029 0.051 0.029 0.065 0.070 0.192 0.449 66 L 0.052 0.021 0.054 0.047 0.064 0.143 0.121 0.497 67 S 0.015 0.010 0.052 0.048 0.089 0.109 0.043 0.636 68 E 0.028 0.009 0.012 0.017 0.032 0.100 0.027 0.776 69 T 0.134 0.044 0.042 0.043 0.050 0.137 0.118 0.433 70 G 0.075 0.041 0.057 0.037 0.088 0.164 0.056 0.482 71 R 0.018 0.012 0.112 0.040 0.142 0.104 0.100 0.472 72 V 0.014 0.006 0.141 0.196 0.247 0.079 0.085 0.233 73 R 0.009 0.002 0.166 0.181 0.358 0.040 0.072 0.172 74 L 0.006 0.001 0.113 0.261 0.320 0.041 0.028 0.230 75 G 0.002 0.001 0.123 0.262 0.419 0.031 0.028 0.135 76 I 0.005 0.001 0.046 0.181 0.249 0.071 0.024 0.422 77 G 0.058 0.001 0.050 0.126 0.158 0.118 0.076 0.414 78 P 0.093 0.001 0.010 0.017 0.021 0.095 0.031 0.732 79 T 0.190 0.002 0.012 0.010 0.020 0.101 0.050 0.615 80 R 0.026 0.001 0.021 0.018 0.044 0.154 0.040 0.696 81 D 0.005 0.001 0.086 0.087 0.282 0.096 0.048 0.395 82 L 0.002 0.001 0.106 0.164 0.313 0.039 0.043 0.333 83 V 0.001 0.001 0.194 0.323 0.338 0.022 0.022 0.100 84 L 0.002 0.001 0.286 0.220 0.281 0.020 0.043 0.147 85 V 0.007 0.001 0.211 0.325 0.268 0.027 0.035 0.126 86 E 0.022 0.001 0.207 0.094 0.197 0.054 0.040 0.384 87 G 0.022 0.001 0.102 0.205 0.277 0.065 0.036 0.292 88 T 0.007 0.001 0.087 0.136 0.362 0.056 0.030 0.321 89 A 0.007 0.001 0.044 0.130 0.255 0.050 0.015 0.498 90 L 0.007 0.001 0.060 0.412 0.314 0.041 0.019 0.145 91 P 0.008 0.002 0.027 0.074 0.108 0.083 0.022 0.677 92 L 0.027 0.004 0.060 0.132 0.117 0.094 0.028 0.538 93 E 0.217 0.016 0.016 0.034 0.028 0.072 0.032 0.583 94 P 0.510 0.060 0.007 0.007 0.007 0.048 0.053 0.309 95 A 0.038 0.039 0.009 0.008 0.012 0.112 0.022 0.760 96 G 0.034 0.077 0.007 0.005 0.006 0.088 0.031 0.751 97 L 0.213 0.529 0.003 0.005 0.004 0.041 0.037 0.168 98 P 0.134 0.562 0.005 0.003 0.005 0.035 0.097 0.160 99 D 0.068 0.507 0.007 0.004 0.009 0.042 0.127 0.236 100 G 0.020 0.108 0.016 0.007 0.011 0.051 0.632 0.155 101 V 0.022 0.673 0.012 0.007 0.009 0.040 0.140 0.097 102 G 0.052 0.806 0.008 0.003 0.007 0.020 0.018 0.088 103 D 0.026 0.761 0.017 0.009 0.009 0.024 0.030 0.125 104 T 0.071 0.702 0.017 0.004 0.008 0.028 0.046 0.124 105 F 0.141 0.118 0.056 0.014 0.011 0.048 0.485 0.127 106 A 0.078 0.070 0.056 0.018 0.017 0.094 0.338 0.328 107 E 0.239 0.031 0.024 0.004 0.008 0.068 0.046 0.580 108 K 0.063 0.008 0.016 0.007 0.011 0.105 0.024 0.765 109 T 0.027 0.007 0.015 0.004 0.009 0.103 0.021 0.815 110 G 0.021 0.008 0.012 0.008 0.013 0.154 0.022 0.763 111 F 0.045 0.012 0.020 0.016 0.014 0.122 0.035 0.736 112 D 0.336 0.032 0.016 0.016 0.014 0.083 0.063 0.441 113 P 0.092 0.009 0.017 0.015 0.019 0.089 0.088 0.672 114 R 0.045 0.005 0.018 0.025 0.035 0.102 0.087 0.684 115 R 0.021 0.003 0.015 0.020 0.035 0.135 0.052 0.720 116 L 0.065 0.002 0.011 0.019 0.028 0.107 0.031 0.738 117 T 0.297 0.006 0.013 0.013 0.029 0.086 0.071 0.484 118 T 0.043 0.003 0.023 0.015 0.041 0.147 0.031 0.696 119 S 0.013 0.002 0.104 0.054 0.286 0.130 0.037 0.375 120 Y 0.001 0.001 0.076 0.126 0.311 0.049 0.047 0.389 121 L 0.001 0.001 0.245 0.293 0.406 0.012 0.014 0.029 122 Y 0.001 0.001 0.179 0.234 0.454 0.008 0.026 0.099 123 F 0.001 0.001 0.181 0.538 0.242 0.005 0.005 0.030 124 R 0.001 0.001 0.279 0.202 0.414 0.017 0.014 0.073 125 I 0.004 0.002 0.156 0.240 0.228 0.052 0.033 0.285 126 S 0.128 0.029 0.135 0.196 0.158 0.056 0.081 0.217 127 P 0.106 0.049 0.048 0.042 0.068 0.087 0.074 0.527 128 R 0.025 0.061 0.095 0.099 0.198 0.084 0.045 0.393 129 R 0.032 0.079 0.088 0.080 0.174 0.077 0.075 0.395 130 V 0.039 0.090 0.074 0.160 0.142 0.084 0.060 0.351 131 Q 0.040 0.093 0.125 0.154 0.184 0.062 0.069 0.273 132 A 0.081 0.169 0.058 0.062 0.098 0.075 0.090 0.367 133 W 0.100 0.109 0.073 0.069 0.072 0.079 0.110 0.387 134 R 0.101 0.119 0.030 0.045 0.046 0.089 0.092 0.478 135 E 0.146 0.159 0.010 0.013 0.020 0.065 0.058 0.530 136 A 0.115 0.093 0.011 0.015 0.021 0.094 0.110 0.540 137 N 0.039 0.110 0.013 0.019 0.026 0.108 0.116 0.568 138 E 0.071 0.176 0.010 0.014 0.020 0.103 0.042 0.563 139 L 0.107 0.223 0.014 0.020 0.024 0.097 0.042 0.473 140 S 0.061 0.351 0.012 0.015 0.028 0.074 0.060 0.399 141 G 0.063 0.565 0.009 0.012 0.023 0.040 0.060 0.228 142 R 0.061 0.403 0.023 0.057 0.053 0.059 0.078 0.267 143 E 0.056 0.195 0.039 0.106 0.115 0.076 0.124 0.290 144 L 0.040 0.043 0.068 0.077 0.139 0.091 0.188 0.354 145 M 0.323 0.020 0.036 0.048 0.059 0.078 0.096 0.341 146 R 0.376 0.014 0.008 0.019 0.022 0.049 0.040 0.473 147 D 0.015 0.003 0.005 0.006 0.022 0.077 0.005 0.867 148 G 0.024 0.004 0.013 0.028 0.099 0.086 0.025 0.720 149 E 0.015 0.002 0.021 0.228 0.168 0.088 0.062 0.416 150 W 0.005 0.001 0.038 0.172 0.210 0.068 0.036 0.469 151 L 0.015 0.001 0.029 0.172 0.201 0.055 0.027 0.498 152 V 0.048 0.002 0.032 0.120 0.103 0.064 0.042 0.588 153 T 0.056 0.006 0.023 0.061 0.090 0.076 0.045 0.643 154 D 0.038 0.006 0.017 0.044 0.089 0.090 0.025 0.689