# TARGET T0369 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0369.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 124 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.037 0.170 0.020 0.028 0.037 0.093 0.063 0.552 2 T 0.062 0.565 0.012 0.017 0.016 0.051 0.070 0.207 3 D 0.023 0.883 0.004 0.003 0.003 0.012 0.019 0.053 4 W 0.016 0.948 0.001 0.001 0.001 0.004 0.011 0.019 5 Q 0.023 0.909 0.004 0.001 0.001 0.004 0.045 0.013 6 Q 0.015 0.884 0.003 0.001 0.002 0.007 0.060 0.028 7 A 0.041 0.764 0.017 0.002 0.002 0.013 0.115 0.046 8 L 0.044 0.789 0.005 0.002 0.002 0.013 0.094 0.050 9 D 0.047 0.630 0.014 0.003 0.004 0.020 0.107 0.176 10 R 0.032 0.621 0.007 0.003 0.004 0.036 0.065 0.233 11 H 0.050 0.572 0.023 0.005 0.005 0.046 0.135 0.163 12 V 0.055 0.696 0.009 0.005 0.006 0.035 0.054 0.141 13 G 0.051 0.537 0.018 0.005 0.009 0.040 0.072 0.268 14 V 0.032 0.186 0.024 0.009 0.012 0.070 0.423 0.244 15 G 0.008 0.116 0.012 0.004 0.005 0.019 0.790 0.046 16 V 0.016 0.725 0.006 0.004 0.006 0.022 0.105 0.116 17 R 0.009 0.701 0.016 0.015 0.020 0.035 0.049 0.155 18 T 0.006 0.853 0.006 0.006 0.010 0.015 0.044 0.060 19 T 0.008 0.957 0.001 0.001 0.001 0.002 0.026 0.004 20 R 0.008 0.917 0.008 0.003 0.002 0.003 0.047 0.013 21 D 0.014 0.855 0.025 0.009 0.009 0.010 0.047 0.032 22 L 0.340 0.361 0.071 0.008 0.011 0.021 0.131 0.057 23 I 0.437 0.110 0.055 0.017 0.015 0.040 0.145 0.181 24 R 0.034 0.035 0.009 0.004 0.006 0.038 0.017 0.857 25 L 0.005 0.020 0.006 0.003 0.005 0.098 0.009 0.854 26 I 0.019 0.042 0.041 0.025 0.015 0.176 0.046 0.636 27 Q 0.576 0.140 0.006 0.004 0.003 0.041 0.038 0.193 28 P 0.477 0.124 0.013 0.003 0.003 0.044 0.066 0.269 29 E 0.083 0.086 0.018 0.006 0.008 0.084 0.032 0.682 30 D 0.239 0.048 0.013 0.005 0.010 0.064 0.045 0.576 31 W 0.070 0.016 0.012 0.012 0.013 0.117 0.028 0.732 32 D 0.041 0.016 0.015 0.015 0.034 0.104 0.034 0.740 33 K 0.035 0.008 0.011 0.013 0.021 0.113 0.032 0.767 34 R 0.023 0.008 0.036 0.060 0.056 0.182 0.044 0.591 35 P 0.098 0.010 0.015 0.012 0.021 0.092 0.037 0.716 36 I 0.348 0.025 0.015 0.018 0.021 0.090 0.050 0.432 37 S 0.044 0.018 0.013 0.008 0.015 0.103 0.034 0.765 38 G 0.040 0.115 0.010 0.009 0.018 0.101 0.055 0.653 39 K 0.028 0.280 0.015 0.015 0.022 0.109 0.051 0.480 40 R 0.015 0.518 0.014 0.016 0.017 0.054 0.122 0.244 41 S 0.007 0.897 0.002 0.003 0.003 0.005 0.066 0.017 42 V 0.002 0.973 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.004 43 Y 0.001 0.954 0.001 0.002 0.003 0.001 0.033 0.005 44 E 0.001 0.829 0.001 0.003 0.004 0.002 0.156 0.004 45 V 0.001 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.001 46 A 0.003 0.947 0.002 0.002 0.005 0.002 0.035 0.004 47 V 0.004 0.844 0.006 0.009 0.009 0.006 0.109 0.015 48 H 0.007 0.921 0.005 0.003 0.006 0.005 0.041 0.011 49 L 0.019 0.841 0.015 0.009 0.010 0.011 0.065 0.029 50 A 0.021 0.703 0.041 0.020 0.019 0.025 0.092 0.080 51 V 0.039 0.638 0.024 0.011 0.014 0.036 0.096 0.143 52 L 0.035 0.585 0.039 0.012 0.011 0.035 0.155 0.128 53 L 0.025 0.791 0.007 0.006 0.008 0.022 0.043 0.099 54 E 0.040 0.659 0.011 0.005 0.008 0.034 0.061 0.181 55 A 0.014 0.779 0.013 0.015 0.015 0.023 0.049 0.092 56 D 0.055 0.746 0.011 0.006 0.012 0.018 0.064 0.088 57 L 0.035 0.148 0.033 0.020 0.019 0.042 0.567 0.135 58 R 0.024 0.192 0.053 0.058 0.064 0.058 0.373 0.178 59 I 0.368 0.085 0.037 0.017 0.037 0.075 0.071 0.311 60 A 0.090 0.020 0.049 0.057 0.058 0.122 0.142 0.461 61 T 0.021 0.018 0.018 0.010 0.030 0.091 0.048 0.764 62 G 0.030 0.024 0.013 0.011 0.021 0.144 0.033 0.725 63 A 0.037 0.053 0.021 0.033 0.021 0.161 0.031 0.642 64 T 0.157 0.252 0.012 0.007 0.010 0.070 0.053 0.439 65 A 0.154 0.322 0.021 0.010 0.010 0.065 0.062 0.356 66 D 0.131 0.276 0.033 0.015 0.014 0.060 0.097 0.374 67 E 0.146 0.226 0.031 0.015 0.015 0.068 0.091 0.408 68 M 0.175 0.145 0.024 0.012 0.020 0.095 0.064 0.466 69 A 0.090 0.054 0.038 0.016 0.022 0.092 0.083 0.604 70 Q 0.103 0.049 0.017 0.011 0.021 0.091 0.049 0.659 71 F 0.174 0.026 0.019 0.014 0.021 0.088 0.085 0.574 72 Y 0.037 0.009 0.022 0.026 0.034 0.124 0.030 0.718 73 A 0.035 0.007 0.016 0.014 0.032 0.077 0.023 0.795 74 V 0.070 0.019 0.015 0.017 0.017 0.123 0.043 0.696 75 P 0.014 0.030 0.019 0.015 0.017 0.139 0.018 0.747 76 V 0.013 0.057 0.007 0.005 0.004 0.071 0.012 0.831 77 L 0.068 0.864 0.002 0.001 0.001 0.007 0.019 0.038 78 P 0.051 0.925 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.009 79 E 0.017 0.918 0.003 0.001 0.001 0.004 0.031 0.026 80 Q 0.010 0.911 0.004 0.001 0.001 0.006 0.037 0.031 81 L 0.026 0.933 0.002 0.001 0.001 0.004 0.026 0.010 82 V 0.028 0.911 0.004 0.001 0.001 0.004 0.037 0.016 83 D 0.027 0.785 0.003 0.001 0.001 0.008 0.071 0.104 84 R 0.015 0.167 0.005 0.001 0.001 0.012 0.753 0.047 85 L 0.013 0.716 0.002 0.001 0.001 0.007 0.235 0.026 86 D 0.025 0.858 0.002 0.001 0.001 0.009 0.029 0.076 87 Q 0.008 0.839 0.005 0.001 0.001 0.015 0.044 0.087 88 S 0.014 0.916 0.005 0.001 0.001 0.007 0.041 0.017 89 W 0.038 0.864 0.008 0.001 0.001 0.007 0.054 0.028 90 Q 0.018 0.729 0.038 0.002 0.002 0.021 0.105 0.085 91 Y 0.045 0.680 0.044 0.002 0.002 0.030 0.102 0.096 92 Y 0.094 0.677 0.046 0.003 0.002 0.023 0.074 0.081 93 Q 0.069 0.637 0.031 0.002 0.003 0.024 0.038 0.196 94 D 0.052 0.529 0.015 0.002 0.002 0.040 0.028 0.332 95 R 0.042 0.435 0.063 0.007 0.004 0.065 0.055 0.330 96 L 0.144 0.501 0.025 0.002 0.002 0.037 0.055 0.234 97 M 0.375 0.171 0.021 0.001 0.001 0.043 0.180 0.208 98 A 0.030 0.062 0.015 0.003 0.002 0.055 0.507 0.325 99 D 0.072 0.169 0.012 0.002 0.005 0.074 0.116 0.549 100 F 0.110 0.053 0.015 0.009 0.016 0.152 0.111 0.534 101 S 0.025 0.019 0.025 0.014 0.027 0.137 0.266 0.489 102 T 0.070 0.041 0.019 0.019 0.039 0.128 0.097 0.586 103 E 0.061 0.019 0.024 0.028 0.048 0.197 0.047 0.576 104 T 0.028 0.007 0.054 0.027 0.045 0.134 0.064 0.641 105 T 0.245 0.009 0.032 0.027 0.040 0.105 0.050 0.493 106 Y 0.131 0.005 0.030 0.021 0.026 0.100 0.069 0.618 107 W 0.010 0.002 0.036 0.021 0.048 0.142 0.016 0.725 108 G 0.024 0.002 0.025 0.018 0.051 0.094 0.036 0.750 109 V 0.035 0.007 0.023 0.048 0.031 0.115 0.096 0.643 110 T 0.023 0.021 0.032 0.019 0.031 0.114 0.173 0.587 111 D 0.034 0.114 0.016 0.021 0.028 0.106 0.122 0.558 112 S 0.029 0.610 0.010 0.013 0.014 0.044 0.056 0.225 113 T 0.006 0.954 0.001 0.001 0.002 0.003 0.015 0.018 114 T 0.003 0.953 0.001 0.002 0.003 0.003 0.027 0.009 115 G 0.002 0.894 0.002 0.005 0.004 0.003 0.084 0.006 116 W 0.001 0.970 0.001 0.001 0.002 0.001 0.021 0.002 117 L 0.002 0.947 0.002 0.001 0.003 0.001 0.040 0.003 118 L 0.003 0.854 0.005 0.005 0.006 0.003 0.117 0.007 119 E 0.004 0.814 0.008 0.005 0.007 0.006 0.141 0.015 120 A 0.012 0.884 0.012 0.005 0.006 0.008 0.054 0.017 121 A 0.038 0.676 0.028 0.016 0.019 0.025 0.133 0.064 122 V 0.031 0.436 0.030 0.010 0.014 0.051 0.206 0.222 123 H 0.032 0.613 0.024 0.010 0.013 0.043 0.133 0.132 124 L 0.067 0.563 0.027 0.013 0.014 0.051 0.080 0.186 125 Y 0.032 0.289 0.045 0.019 0.025 0.088 0.206 0.296 126 H 0.021 0.472 0.029 0.007 0.009 0.069 0.167 0.226 127 H 0.024 0.918 0.002 0.001 0.002 0.005 0.023 0.026 128 R 0.003 0.957 0.001 0.001 0.001 0.005 0.010 0.023 129 S 0.001 0.935 0.001 0.001 0.003 0.004 0.043 0.012 130 Q 0.001 0.964 0.001 0.001 0.001 0.001 0.031 0.001 131 L 0.001 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.001 132 L 0.001 0.671 0.003 0.003 0.003 0.001 0.317 0.001 133 D 0.001 0.950 0.003 0.004 0.004 0.001 0.035 0.002 134 Y 0.029 0.852 0.026 0.007 0.011 0.005 0.059 0.012 135 L 0.071 0.080 0.301 0.065 0.024 0.023 0.370 0.066 136 N 0.671 0.024 0.011 0.007 0.006 0.027 0.029 0.226 137 L 0.194 0.001 0.005 0.001 0.001 0.030 0.013 0.756 138 L 0.007 0.001 0.013 0.005 0.012 0.210 0.010 0.741 139 G 0.003 0.001 0.006 0.003 0.011 0.057 0.008 0.911 140 Y 0.012 0.003 0.025 0.053 0.026 0.117 0.016 0.748 141 D 0.043 0.007 0.139 0.047 0.042 0.108 0.054 0.559 142 I 0.130 0.013 0.044 0.036 0.028 0.106 0.047 0.597 143 K 0.085 0.016 0.079 0.014 0.020 0.078 0.052 0.656 144 L 0.139 0.018 0.049 0.017 0.022 0.090 0.059 0.606 145 D 0.090 0.021 0.054 0.043 0.060 0.112 0.077 0.545 146 L 0.032 0.008 0.025 0.015 0.032 0.094 0.046 0.748 147 F 0.059 0.011 0.042 0.062 0.087 0.143 0.067 0.529 148 E 0.047 0.007 0.015 0.024 0.044 0.090 0.042 0.732