# TARGET T0368 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0368.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 783 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.054 0.120 0.017 0.018 0.030 0.076 0.040 0.645 2 K 0.291 0.106 0.023 0.040 0.030 0.084 0.092 0.334 3 P 0.210 0.085 0.016 0.022 0.029 0.079 0.074 0.485 4 L 0.069 0.046 0.010 0.009 0.018 0.073 0.053 0.723 5 K 0.021 0.029 0.025 0.013 0.014 0.111 0.047 0.742 6 E 0.265 0.162 0.012 0.008 0.009 0.075 0.050 0.419 7 V 0.119 0.290 0.015 0.004 0.004 0.075 0.031 0.462 8 V 0.021 0.512 0.011 0.003 0.007 0.058 0.015 0.373 9 G 0.019 0.839 0.008 0.002 0.003 0.012 0.046 0.070 10 A 0.010 0.924 0.004 0.003 0.002 0.006 0.027 0.024 11 Y 0.015 0.200 0.028 0.004 0.005 0.009 0.712 0.027 12 L 0.014 0.545 0.017 0.007 0.005 0.014 0.364 0.035 13 A 0.047 0.786 0.019 0.003 0.005 0.015 0.063 0.062 14 L 0.027 0.735 0.011 0.005 0.004 0.021 0.089 0.108 15 S 0.013 0.773 0.004 0.002 0.003 0.018 0.081 0.107 16 D 0.012 0.810 0.002 0.001 0.002 0.014 0.110 0.048 17 A 0.004 0.951 0.001 0.001 0.001 0.005 0.028 0.010 18 Q 0.009 0.959 0.003 0.001 0.001 0.003 0.016 0.009 19 R 0.019 0.889 0.012 0.002 0.002 0.007 0.046 0.023 20 Q 0.051 0.364 0.142 0.008 0.008 0.019 0.351 0.056 21 L 0.382 0.243 0.052 0.007 0.006 0.044 0.099 0.167 22 V 0.190 0.125 0.024 0.003 0.004 0.062 0.080 0.511 23 A 0.015 0.075 0.007 0.001 0.002 0.067 0.024 0.809 24 G 0.019 0.303 0.013 0.004 0.005 0.093 0.043 0.520 25 E 0.017 0.847 0.001 0.002 0.001 0.014 0.009 0.109 26 Y 0.015 0.971 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.006 27 D 0.007 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 28 E 0.010 0.423 0.011 0.001 0.001 0.004 0.534 0.017 29 A 0.010 0.896 0.002 0.001 0.001 0.002 0.086 0.005 30 A 0.029 0.885 0.003 0.001 0.001 0.004 0.061 0.017 31 A 0.006 0.826 0.003 0.001 0.001 0.006 0.082 0.074 32 N 0.006 0.938 0.002 0.001 0.001 0.005 0.023 0.025 33 C 0.015 0.949 0.001 0.001 0.001 0.003 0.020 0.011 34 R 0.041 0.843 0.021 0.003 0.002 0.009 0.043 0.039 35 R 0.121 0.630 0.012 0.001 0.002 0.026 0.039 0.168 36 A 0.132 0.115 0.214 0.005 0.006 0.061 0.293 0.175 37 M 0.107 0.113 0.092 0.011 0.009 0.101 0.157 0.410 38 E 0.019 0.013 0.034 0.005 0.007 0.079 0.044 0.798 39 I 0.043 0.011 0.028 0.008 0.009 0.123 0.024 0.755 40 S 0.543 0.017 0.017 0.010 0.010 0.075 0.066 0.262 41 H 0.047 0.009 0.004 0.002 0.004 0.110 0.012 0.811 42 T 0.010 0.017 0.006 0.003 0.005 0.106 0.008 0.845 43 M 0.040 0.147 0.008 0.006 0.004 0.107 0.016 0.672 44 P 0.138 0.758 0.004 0.002 0.001 0.016 0.012 0.070 45 P 0.195 0.716 0.006 0.001 0.001 0.009 0.021 0.051 46 E 0.134 0.588 0.018 0.004 0.003 0.026 0.055 0.171 47 E 0.156 0.417 0.034 0.006 0.007 0.044 0.066 0.270 48 A 0.204 0.241 0.022 0.005 0.008 0.081 0.054 0.385 49 F 0.102 0.073 0.038 0.008 0.010 0.083 0.107 0.579 50 D 0.099 0.056 0.009 0.003 0.004 0.078 0.049 0.702 51 H 0.182 0.064 0.011 0.003 0.003 0.072 0.065 0.601 52 A 0.072 0.094 0.007 0.003 0.005 0.112 0.021 0.687 53 G 0.037 0.136 0.009 0.003 0.005 0.076 0.030 0.703 54 F 0.032 0.568 0.007 0.006 0.007 0.058 0.034 0.288 55 D 0.024 0.766 0.012 0.004 0.006 0.020 0.076 0.092 56 A 0.011 0.849 0.012 0.006 0.005 0.013 0.051 0.053 57 F 0.014 0.608 0.053 0.011 0.012 0.016 0.234 0.051 58 C 0.041 0.867 0.012 0.003 0.003 0.009 0.042 0.023 59 H 0.046 0.839 0.008 0.002 0.003 0.008 0.059 0.035 60 A 0.005 0.830 0.005 0.002 0.003 0.012 0.059 0.084 61 G 0.003 0.917 0.002 0.001 0.002 0.006 0.046 0.024 62 L 0.002 0.973 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.004 63 A 0.003 0.966 0.002 0.001 0.001 0.001 0.022 0.004 64 E 0.007 0.907 0.008 0.002 0.002 0.003 0.062 0.010 65 A 0.037 0.876 0.016 0.001 0.001 0.005 0.049 0.013 66 L 0.190 0.420 0.069 0.004 0.004 0.018 0.222 0.072 67 A 0.099 0.153 0.036 0.005 0.004 0.059 0.200 0.443 68 G 0.053 0.167 0.013 0.002 0.002 0.059 0.123 0.582 69 L 0.066 0.241 0.011 0.003 0.003 0.093 0.061 0.523 70 R 0.038 0.336 0.012 0.005 0.005 0.097 0.034 0.473 71 S 0.016 0.797 0.002 0.001 0.001 0.016 0.011 0.158 72 F 0.016 0.966 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.007 73 D 0.019 0.947 0.002 0.001 0.001 0.002 0.018 0.011 74 E 0.015 0.245 0.012 0.001 0.001 0.006 0.693 0.027 75 A 0.026 0.661 0.007 0.001 0.001 0.007 0.283 0.016 76 L 0.053 0.780 0.007 0.001 0.001 0.010 0.100 0.049 77 H 0.012 0.696 0.005 0.001 0.001 0.016 0.065 0.204 78 S 0.011 0.919 0.002 0.001 0.001 0.007 0.020 0.039 79 A 0.023 0.929 0.002 0.001 0.001 0.005 0.026 0.015 80 D 0.049 0.796 0.029 0.002 0.001 0.012 0.067 0.045 81 K 0.065 0.770 0.017 0.001 0.001 0.017 0.029 0.099 82 A 0.286 0.336 0.141 0.002 0.002 0.036 0.077 0.120 83 L 0.154 0.176 0.131 0.006 0.005 0.072 0.135 0.321 84 H 0.015 0.055 0.032 0.002 0.003 0.063 0.032 0.797 85 Y 0.035 0.076 0.069 0.005 0.006 0.119 0.049 0.643 86 F 0.326 0.168 0.045 0.011 0.008 0.106 0.073 0.263 87 N 0.211 0.090 0.016 0.003 0.005 0.075 0.029 0.570 88 R 0.075 0.093 0.014 0.004 0.006 0.083 0.024 0.701 89 R 0.083 0.097 0.026 0.010 0.013 0.100 0.109 0.562 90 G 0.096 0.152 0.022 0.013 0.013 0.115 0.062 0.526 91 E 0.108 0.108 0.033 0.021 0.024 0.096 0.052 0.559 92 L 0.066 0.061 0.020 0.014 0.018 0.116 0.047 0.657 93 N 0.109 0.077 0.030 0.018 0.026 0.097 0.157 0.485 94 Q 0.249 0.075 0.010 0.008 0.011 0.084 0.044 0.520 95 D 0.209 0.128 0.007 0.008 0.009 0.070 0.036 0.533 96 E 0.022 0.149 0.009 0.007 0.019 0.101 0.019 0.675 97 G 0.038 0.323 0.011 0.014 0.040 0.069 0.077 0.429 98 K 0.021 0.354 0.020 0.058 0.036 0.055 0.222 0.233 99 L 0.007 0.688 0.015 0.029 0.036 0.026 0.075 0.125 100 W 0.012 0.816 0.011 0.013 0.022 0.011 0.065 0.049 101 I 0.016 0.839 0.009 0.012 0.014 0.010 0.066 0.034 102 S 0.005 0.164 0.009 0.006 0.008 0.008 0.776 0.024 103 A 0.006 0.704 0.005 0.005 0.005 0.009 0.246 0.021 104 V 0.015 0.924 0.004 0.002 0.003 0.007 0.026 0.019 105 Y 0.008 0.909 0.004 0.003 0.003 0.008 0.028 0.037 106 S 0.004 0.946 0.001 0.001 0.002 0.004 0.022 0.019 107 R 0.005 0.938 0.001 0.001 0.001 0.004 0.040 0.010 108 A 0.004 0.899 0.004 0.002 0.001 0.004 0.077 0.009 109 L 0.009 0.893 0.016 0.003 0.004 0.006 0.055 0.014 110 A 0.058 0.817 0.032 0.003 0.003 0.010 0.050 0.027 111 L 0.094 0.190 0.280 0.014 0.012 0.025 0.296 0.090 112 D 0.273 0.106 0.026 0.008 0.008 0.059 0.053 0.469 113 G 0.131 0.045 0.018 0.003 0.004 0.078 0.038 0.683 114 L 0.021 0.048 0.009 0.002 0.004 0.130 0.013 0.771 115 G 0.065 0.086 0.016 0.006 0.007 0.092 0.036 0.693 116 R 0.051 0.237 0.008 0.007 0.004 0.070 0.037 0.587 117 G 0.177 0.628 0.010 0.002 0.003 0.015 0.085 0.080 118 A 0.178 0.549 0.009 0.004 0.003 0.027 0.068 0.162 119 E 0.016 0.380 0.022 0.007 0.006 0.046 0.110 0.412 120 A 0.017 0.842 0.005 0.001 0.001 0.014 0.035 0.086 121 M 0.054 0.871 0.004 0.001 0.001 0.008 0.038 0.021 122 P 0.024 0.836 0.005 0.002 0.002 0.011 0.050 0.071 123 E 0.014 0.940 0.001 0.001 0.001 0.003 0.017 0.022 124 F 0.022 0.925 0.003 0.001 0.001 0.004 0.032 0.013 125 K 0.022 0.812 0.023 0.004 0.003 0.010 0.057 0.069 126 K 0.087 0.631 0.022 0.003 0.005 0.025 0.029 0.198 127 V 0.292 0.282 0.093 0.008 0.011 0.058 0.098 0.158 128 V 0.171 0.316 0.028 0.008 0.009 0.063 0.037 0.368 129 E 0.007 0.069 0.015 0.005 0.007 0.057 0.012 0.827 130 M 0.009 0.079 0.048 0.009 0.006 0.105 0.038 0.706 131 I 0.642 0.290 0.007 0.003 0.001 0.008 0.032 0.017 132 E 0.417 0.099 0.022 0.004 0.005 0.048 0.045 0.361 133 E 0.079 0.039 0.006 0.002 0.004 0.051 0.017 0.801 134 R 0.158 0.026 0.011 0.006 0.007 0.059 0.180 0.553 135 K 0.033 0.020 0.008 0.008 0.009 0.173 0.045 0.703 136 G 0.019 0.021 0.015 0.007 0.013 0.101 0.040 0.785 137 E 0.051 0.049 0.007 0.005 0.005 0.108 0.017 0.757 138 T 0.269 0.388 0.010 0.006 0.007 0.054 0.065 0.201 139 P 0.033 0.428 0.006 0.004 0.006 0.074 0.037 0.412 140 G 0.013 0.858 0.003 0.002 0.004 0.013 0.046 0.061 141 K 0.006 0.945 0.001 0.001 0.002 0.004 0.027 0.013 142 E 0.002 0.951 0.003 0.002 0.004 0.003 0.023 0.011 143 R 0.003 0.957 0.003 0.003 0.004 0.002 0.022 0.006 144 M 0.013 0.908 0.008 0.002 0.003 0.003 0.055 0.007 145 M 0.020 0.783 0.013 0.005 0.005 0.005 0.152 0.018 146 E 0.040 0.749 0.013 0.005 0.005 0.013 0.091 0.084 147 V 0.055 0.713 0.010 0.003 0.003 0.023 0.070 0.123 148 A 0.031 0.777 0.006 0.002 0.002 0.019 0.052 0.111 149 I 0.021 0.798 0.003 0.001 0.001 0.017 0.023 0.136 150 D 0.009 0.907 0.003 0.001 0.001 0.007 0.024 0.049 151 R 0.011 0.966 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.006 152 I 0.013 0.957 0.004 0.001 0.001 0.002 0.014 0.009 153 A 0.019 0.932 0.005 0.001 0.001 0.004 0.013 0.027 154 Q 0.074 0.216 0.012 0.001 0.001 0.011 0.650 0.037 155 L 0.004 0.021 0.002 0.001 0.001 0.003 0.962 0.008 156 G 0.020 0.669 0.004 0.001 0.001 0.019 0.091 0.194 157 A 0.048 0.619 0.007 0.001 0.001 0.038 0.033 0.251 158 S 0.069 0.536 0.018 0.004 0.003 0.043 0.186 0.140 159 N 0.235 0.434 0.013 0.002 0.003 0.033 0.073 0.207 160 Q 0.252 0.180 0.023 0.003 0.003 0.083 0.063 0.395 161 Q 0.066 0.054 0.101 0.008 0.007 0.132 0.146 0.485 162 K 0.124 0.055 0.033 0.003 0.006 0.105 0.060 0.615 163 K 0.075 0.034 0.058 0.003 0.005 0.111 0.047 0.667 164 P 0.022 0.021 0.034 0.004 0.004 0.124 0.020 0.772 165 G 0.210 0.139 0.015 0.003 0.004 0.072 0.053 0.504 166 Y 0.183 0.212 0.018 0.003 0.004 0.081 0.035 0.465 167 K 0.074 0.199 0.046 0.007 0.012 0.092 0.049 0.521 168 A 0.050 0.206 0.047 0.018 0.025 0.091 0.105 0.460 169 W 0.075 0.180 0.068 0.024 0.035 0.108 0.119 0.391 170 W 0.075 0.097 0.060 0.038 0.048 0.081 0.208 0.393 171 E 0.041 0.057 0.047 0.033 0.054 0.105 0.170 0.493 172 F 0.060 0.064 0.043 0.039 0.063 0.131 0.119 0.481 173 W 0.048 0.041 0.027 0.038 0.058 0.121 0.078 0.590 174 S 0.100 0.060 0.018 0.031 0.047 0.095 0.081 0.569