# TARGET T0368 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0368.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 3.53726 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.111 0.017 0.033 0.025 0.050 0.065 0.023 0.676 2 K 0.205 0.017 0.104 0.158 0.113 0.086 0.009 0.308 3 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 4 L 0.006 0.009 0.034 0.054 0.285 0.102 0.001 0.508 5 K 0.076 0.023 0.020 0.014 0.022 0.110 0.005 0.731 6 E 0.101 0.080 0.010 0.011 0.020 0.191 0.005 0.581 7 V 0.118 0.515 0.020 0.011 0.013 0.059 0.004 0.261 8 V 0.015 0.773 0.017 0.007 0.011 0.022 0.004 0.151 9 G 0.014 0.765 0.007 0.005 0.010 0.027 0.006 0.166 10 A 0.015 0.929 0.005 0.003 0.004 0.006 0.004 0.034 11 Y 0.007 0.967 0.003 0.002 0.003 0.003 0.003 0.013 12 L 0.009 0.953 0.004 0.003 0.004 0.005 0.003 0.019 13 A 0.010 0.968 0.003 0.002 0.002 0.002 0.002 0.010 14 L 0.036 0.924 0.007 0.002 0.004 0.002 0.008 0.017 15 S 0.063 0.825 0.008 0.004 0.004 0.009 0.020 0.066 16 D 0.055 0.714 0.013 0.003 0.005 0.018 0.017 0.175 17 A 0.053 0.786 0.005 0.002 0.005 0.028 0.010 0.110 18 Q 0.032 0.846 0.007 0.002 0.004 0.031 0.009 0.069 19 R 0.030 0.895 0.004 0.002 0.001 0.009 0.007 0.052 20 Q 0.038 0.899 0.009 0.001 0.001 0.005 0.007 0.040 21 L 0.019 0.930 0.010 0.003 0.003 0.003 0.006 0.026 22 V 0.031 0.851 0.024 0.006 0.010 0.011 0.012 0.056 23 A 0.043 0.740 0.029 0.005 0.008 0.014 0.015 0.146 24 G 0.184 0.502 0.022 0.005 0.005 0.023 0.042 0.216 25 E 0.224 0.335 0.046 0.004 0.004 0.084 0.035 0.267 26 Y 0.102 0.350 0.068 0.007 0.015 0.076 0.016 0.366 27 D 0.036 0.273 0.024 0.005 0.013 0.106 0.007 0.535 28 E 0.033 0.310 0.010 0.003 0.006 0.127 0.006 0.506 29 A 0.027 0.752 0.003 0.001 0.003 0.056 0.003 0.154 30 A 0.012 0.927 0.002 0.001 0.002 0.007 0.002 0.046 31 A 0.021 0.914 0.001 0.001 0.001 0.007 0.004 0.050 32 N 0.081 0.838 0.002 0.001 0.001 0.006 0.014 0.057 33 C 0.069 0.857 0.006 0.001 0.002 0.003 0.012 0.050 34 R 0.015 0.888 0.010 0.003 0.005 0.010 0.006 0.063 35 R 0.021 0.809 0.008 0.003 0.004 0.023 0.011 0.120 36 A 0.037 0.875 0.012 0.003 0.004 0.008 0.007 0.053 37 M 0.032 0.861 0.015 0.007 0.006 0.011 0.011 0.057 38 E 0.092 0.688 0.031 0.019 0.013 0.021 0.032 0.104 39 I 0.127 0.563 0.070 0.020 0.029 0.026 0.023 0.141 40 S 0.060 0.625 0.040 0.047 0.043 0.028 0.015 0.141 41 H 0.121 0.303 0.067 0.061 0.051 0.036 0.066 0.296 42 T 0.179 0.137 0.097 0.030 0.041 0.049 0.074 0.392 43 M 0.188 0.090 0.167 0.084 0.085 0.046 0.051 0.288 44 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.994 45 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 46 E 0.013 0.003 0.016 0.020 0.054 0.135 0.002 0.757 47 E 0.457 0.007 0.007 0.005 0.007 0.148 0.009 0.360 48 A 0.460 0.133 0.080 0.033 0.036 0.036 0.004 0.217 49 F 0.109 0.184 0.102 0.060 0.078 0.079 0.006 0.382 50 D 0.063 0.168 0.094 0.048 0.086 0.064 0.015 0.461 51 H 0.074 0.290 0.077 0.032 0.069 0.073 0.020 0.364 52 A 0.063 0.084 0.018 0.012 0.020 0.612 0.023 0.167 53 G 0.295 0.074 0.015 0.009 0.009 0.176 0.048 0.372 54 F 0.149 0.272 0.119 0.022 0.020 0.146 0.014 0.258 55 D 0.015 0.288 0.112 0.041 0.038 0.152 0.011 0.342 56 A 0.059 0.355 0.071 0.024 0.091 0.132 0.009 0.258 57 F 0.035 0.639 0.058 0.038 0.059 0.100 0.007 0.063 58 C 0.073 0.634 0.073 0.033 0.042 0.060 0.018 0.068 59 H 0.025 0.850 0.037 0.016 0.017 0.008 0.006 0.041 60 A 0.041 0.692 0.071 0.026 0.047 0.026 0.014 0.083 61 G 0.070 0.607 0.021 0.024 0.035 0.050 0.023 0.170 62 L 0.097 0.663 0.039 0.014 0.041 0.022 0.018 0.107 63 A 0.053 0.603 0.028 0.010 0.027 0.043 0.018 0.218 64 E 0.093 0.556 0.011 0.005 0.009 0.028 0.023 0.275 65 A 0.093 0.746 0.010 0.003 0.006 0.018 0.012 0.111 66 L 0.045 0.854 0.008 0.003 0.005 0.010 0.010 0.064 67 A 0.068 0.804 0.012 0.004 0.006 0.006 0.018 0.083 68 G 0.458 0.270 0.013 0.003 0.003 0.012 0.075 0.165 69 L 0.240 0.422 0.157 0.007 0.007 0.012 0.040 0.116 70 R 0.076 0.265 0.089 0.010 0.013 0.088 0.035 0.424 71 S 0.122 0.136 0.071 0.008 0.009 0.157 0.020 0.476 72 F 0.124 0.282 0.105 0.007 0.014 0.084 0.011 0.373 73 D 0.050 0.278 0.068 0.005 0.010 0.155 0.010 0.426 74 E 0.042 0.366 0.026 0.004 0.007 0.194 0.008 0.354 75 A 0.052 0.764 0.007 0.002 0.004 0.056 0.006 0.110 76 L 0.034 0.879 0.007 0.002 0.004 0.011 0.006 0.056 77 H 0.052 0.802 0.010 0.004 0.005 0.023 0.010 0.094 78 S 0.065 0.813 0.007 0.003 0.003 0.013 0.010 0.086 79 A 0.083 0.696 0.014 0.003 0.011 0.012 0.017 0.165 80 D 0.032 0.692 0.007 0.003 0.005 0.035 0.009 0.216 81 K 0.041 0.668 0.006 0.002 0.003 0.058 0.012 0.210 82 A 0.030 0.894 0.003 0.001 0.002 0.008 0.005 0.057 83 L 0.009 0.933 0.004 0.002 0.003 0.004 0.004 0.040 84 H 0.047 0.816 0.009 0.007 0.006 0.014 0.013 0.088 85 Y 0.025 0.888 0.020 0.007 0.006 0.005 0.006 0.042 86 F 0.040 0.843 0.012 0.015 0.017 0.007 0.013 0.052 87 N 0.042 0.675 0.059 0.036 0.033 0.019 0.025 0.111 88 R 0.054 0.539 0.062 0.034 0.037 0.044 0.035 0.195 89 R 0.100 0.367 0.057 0.029 0.035 0.096 0.047 0.268 90 G 0.204 0.233 0.032 0.075 0.029 0.042 0.138 0.246 91 E 0.321 0.040 0.089 0.039 0.060 0.163 0.023 0.265 92 L 0.110 0.028 0.047 0.135 0.237 0.123 0.006 0.315 93 N 0.060 0.040 0.018 0.195 0.300 0.113 0.007 0.267 94 Q 0.057 0.039 0.023 0.115 0.240 0.061 0.011 0.455 95 D 0.038 0.046 0.014 0.051 0.095 0.164 0.013 0.578 96 E 0.119 0.037 0.008 0.036 0.047 0.190 0.035 0.529 97 G 0.161 0.106 0.024 0.081 0.042 0.112 0.079 0.396 98 K 0.260 0.019 0.045 0.040 0.074 0.225 0.017 0.322 99 L 0.026 0.022 0.030 0.084 0.102 0.123 0.003 0.610 100 W 0.029 0.050 0.045 0.210 0.421 0.105 0.004 0.137 101 I 0.021 0.115 0.062 0.274 0.346 0.047 0.003 0.131 102 S 0.008 0.188 0.054 0.211 0.349 0.024 0.002 0.163 103 A 0.009 0.250 0.033 0.226 0.314 0.033 0.004 0.132 104 V 0.020 0.557 0.030 0.114 0.159 0.022 0.008 0.090 105 Y 0.024 0.634 0.043 0.066 0.117 0.020 0.009 0.087 106 S 0.026 0.685 0.018 0.035 0.052 0.023 0.013 0.148 107 R 0.088 0.511 0.025 0.017 0.032 0.039 0.038 0.249 108 A 0.056 0.745 0.019 0.013 0.019 0.030 0.016 0.101 109 L 0.058 0.708 0.021 0.015 0.022 0.037 0.023 0.114 110 A 0.082 0.754 0.019 0.014 0.023 0.019 0.013 0.077 111 L 0.088 0.744 0.025 0.013 0.026 0.012 0.016 0.076 112 D 0.114 0.645 0.027 0.021 0.026 0.016 0.039 0.113 113 G 0.255 0.334 0.048 0.017 0.019 0.024 0.081 0.224 114 L 0.494 0.143 0.062 0.021 0.023 0.038 0.071 0.148 115 G 0.390 0.058 0.087 0.030 0.019 0.049 0.079 0.287 116 R 0.084 0.044 0.355 0.026 0.036 0.095 0.013 0.347 117 G 0.014 0.020 0.050 0.010 0.033 0.083 0.004 0.785 118 A 0.024 0.017 0.018 0.004 0.014 0.075 0.004 0.846 119 E 0.050 0.038 0.013 0.005 0.007 0.259 0.009 0.620 120 A 0.279 0.134 0.017 0.005 0.008 0.218 0.026 0.313 121 M 0.193 0.370 0.022 0.013 0.022 0.034 0.007 0.340 122 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 123 E 0.015 0.131 0.004 0.006 0.012 0.099 0.004 0.730 124 F 0.232 0.462 0.005 0.002 0.004 0.026 0.014 0.254 125 K 0.028 0.853 0.006 0.003 0.003 0.011 0.003 0.093 126 K 0.018 0.849 0.005 0.002 0.002 0.014 0.003 0.108 127 V 0.026 0.866 0.007 0.002 0.003 0.009 0.005 0.082 128 V 0.007 0.952 0.002 0.001 0.002 0.004 0.002 0.029 129 E 0.005 0.953 0.002 0.001 0.001 0.005 0.002 0.030 130 M 0.013 0.950 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.028 131 I 0.017 0.937 0.002 0.001 0.003 0.002 0.005 0.033 132 E 0.024 0.893 0.003 0.004 0.004 0.005 0.008 0.059 133 E 0.045 0.819 0.011 0.005 0.006 0.006 0.024 0.084 134 R 0.090 0.774 0.009 0.007 0.007 0.012 0.026 0.075 135 K 0.074 0.445 0.028 0.014 0.009 0.021 0.054 0.356 136 G 0.223 0.225 0.061 0.030 0.018 0.025 0.087 0.331 137 E 0.397 0.036 0.091 0.010 0.017 0.069 0.047 0.332 138 T 0.041 0.017 0.023 0.019 0.021 0.078 0.005 0.797 139 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 140 G 0.012 0.005 0.008 0.010 0.023 0.348 0.002 0.592 141 K 0.277 0.017 0.009 0.004 0.012 0.102 0.005 0.574 142 E 0.028 0.132 0.005 0.006 0.010 0.116 0.002 0.701 143 R 0.053 0.329 0.004 0.006 0.010 0.159 0.004 0.434 144 M 0.039 0.803 0.004 0.004 0.007 0.021 0.003 0.120 145 M 0.017 0.882 0.003 0.003 0.009 0.013 0.003 0.070 146 E 0.007 0.950 0.002 0.002 0.002 0.004 0.002 0.032 147 V 0.007 0.966 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.021 148 A 0.011 0.947 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.031 149 I 0.007 0.953 0.003 0.001 0.002 0.003 0.002 0.029 150 D 0.005 0.960 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.027 151 R 0.032 0.902 0.003 0.001 0.001 0.004 0.012 0.044 152 I 0.015 0.957 0.003 0.001 0.001 0.002 0.004 0.016 153 A 0.010 0.936 0.008 0.003 0.003 0.005 0.006 0.027 154 Q 0.055 0.837 0.010 0.004 0.004 0.009 0.016 0.065 155 L 0.110 0.775 0.030 0.006 0.008 0.007 0.019 0.046 156 G 0.109 0.571 0.047 0.016 0.015 0.028 0.039 0.175 157 A 0.100 0.288 0.083 0.018 0.020 0.046 0.035 0.410 158 S 0.129 0.240 0.051 0.019 0.030 0.086 0.023 0.422 159 N 0.121 0.130 0.028 0.013 0.020 0.096 0.021 0.571 160 Q 0.076 0.087 0.028 0.011 0.016 0.128 0.016 0.638 161 Q 0.125 0.105 0.021 0.012 0.019 0.216 0.025 0.478 162 K 0.254 0.130 0.017 0.011 0.019 0.091 0.062 0.416 163 K 0.213 0.104 0.037 0.026 0.031 0.110 0.016 0.462 164 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 165 G 0.039 0.013 0.026 0.066 0.100 0.087 0.014 0.656 166 Y 0.533 0.006 0.040 0.020 0.030 0.040 0.012 0.318 167 K 0.034 0.009 0.083 0.084 0.086 0.077 0.003 0.624 168 A 0.042 0.025 0.134 0.205 0.248 0.089 0.003 0.253 169 W 0.037 0.029 0.197 0.156 0.319 0.058 0.005 0.200 170 W 0.022 0.037 0.143 0.229 0.342 0.054 0.005 0.168 171 E 0.034 0.059 0.121 0.183 0.297 0.068 0.008 0.230 172 F 0.054 0.095 0.087 0.204 0.301 0.053 0.014 0.193 173 W 0.058 0.087 0.093 0.129 0.270 0.063 0.015 0.286 174 S 0.058 0.075 0.040 0.103 0.188 0.067 0.023 0.447