# TARGET T0367 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0367.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 38 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.004 0.001 0.003 0.258 0.034 0.701 2 D 0.005 0.003 0.007 0.830 0.016 0.139 3 E 0.001 0.001 0.006 0.967 0.007 0.019 4 L 0.001 0.001 0.005 0.983 0.004 0.007 5 E 0.002 0.001 0.004 0.977 0.009 0.009 6 L 0.001 0.001 0.003 0.963 0.016 0.016 7 R 0.001 0.001 0.002 0.959 0.012 0.025 8 I 0.001 0.001 0.001 0.979 0.006 0.013 9 R 0.001 0.001 0.001 0.983 0.008 0.008 10 K 0.001 0.001 0.002 0.991 0.004 0.003 11 A 0.001 0.001 0.001 0.989 0.005 0.004 12 E 0.001 0.001 0.001 0.991 0.005 0.003 13 K 0.001 0.001 0.001 0.978 0.010 0.010 14 L 0.001 0.001 0.001 0.968 0.009 0.022 15 V 0.001 0.001 0.002 0.979 0.007 0.012 16 Q 0.001 0.001 0.002 0.982 0.007 0.008 17 D 0.001 0.001 0.002 0.979 0.008 0.011 18 A 0.001 0.001 0.002 0.979 0.009 0.009 19 K 0.001 0.001 0.003 0.978 0.012 0.007 20 K 0.001 0.001 0.003 0.974 0.015 0.008 21 E 0.001 0.001 0.005 0.945 0.031 0.018 22 F 0.001 0.001 0.009 0.911 0.054 0.024 23 E 0.002 0.001 0.007 0.926 0.044 0.020 24 M 0.001 0.001 0.003 0.946 0.024 0.026 25 G 0.004 0.001 0.002 0.420 0.129 0.444 26 L 0.016 0.008 0.005 0.401 0.125 0.445 27 Y 0.023 0.009 0.006 0.786 0.056 0.119 28 E 0.004 0.001 0.007 0.949 0.017 0.022 29 R 0.002 0.001 0.007 0.977 0.007 0.007 30 C 0.002 0.001 0.005 0.985 0.004 0.004 31 C 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 32 S 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 33 T 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 34 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 35 Y 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 36 Y 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 37 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 38 M 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 39 F 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 40 H 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 41 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 42 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 43 K 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 44 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 45 M 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 46 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 47 L 0.001 0.001 0.001 0.993 0.003 0.002 48 G 0.001 0.001 0.003 0.974 0.011 0.012 49 Y 0.001 0.001 0.008 0.923 0.020 0.048 50 G 0.002 0.001 0.004 0.086 0.111 0.796 51 R 0.012 0.014 0.009 0.031 0.148 0.786 52 D 0.039 0.029 0.010 0.033 0.185 0.703 53 S 0.057 0.020 0.056 0.055 0.396 0.416 54 K 0.059 0.015 0.081 0.053 0.501 0.291 55 T 0.092 0.011 0.084 0.081 0.465 0.267 56 H 0.246 0.025 0.045 0.123 0.341 0.219 57 R 0.290 0.011 0.031 0.184 0.221 0.262 58 G 0.450 0.021 0.035 0.197 0.123 0.174 59 T 0.432 0.017 0.048 0.233 0.126 0.144 60 I 0.480 0.009 0.058 0.209 0.117 0.128 61 Y 0.489 0.006 0.054 0.216 0.126 0.108 62 L 0.457 0.011 0.050 0.216 0.158 0.109 63 I 0.254 0.009 0.056 0.339 0.221 0.122 64 W 0.102 0.003 0.052 0.328 0.334 0.181 65 E 0.138 0.004 0.032 0.468 0.237 0.121 66 C 0.212 0.013 0.017 0.507 0.148 0.104 67 R 0.233 0.007 0.017 0.522 0.115 0.105 68 E 0.201 0.007 0.027 0.553 0.129 0.083 69 E 0.139 0.006 0.037 0.563 0.145 0.110 70 L 0.077 0.003 0.038 0.503 0.195 0.184 71 G 0.048 0.004 0.014 0.111 0.263 0.560 72 L 0.114 0.020 0.025 0.097 0.260 0.484 73 S 0.128 0.028 0.022 0.106 0.278 0.438 74 D 0.099 0.015 0.043 0.138 0.309 0.395 75 D 0.109 0.006 0.147 0.262 0.301 0.175 76 D 0.167 0.008 0.118 0.252 0.282 0.173 77 C 0.235 0.018 0.092 0.300 0.193 0.161 78 S 0.301 0.018 0.064 0.247 0.169 0.200 79 K 0.292 0.007 0.059 0.303 0.154 0.187 80 L 0.255 0.007 0.033 0.352 0.131 0.221 81 S 0.262 0.019 0.015 0.253 0.133 0.318 82 R 0.158 0.014 0.015 0.318 0.131 0.364 83 A 0.073 0.005 0.046 0.524 0.145 0.208 84 F 0.049 0.006 0.113 0.514 0.193 0.125 85 D 0.046 0.005 0.133 0.495 0.211 0.111 86 L 0.027 0.004 0.102 0.510 0.211 0.145 87 R 0.026 0.011 0.136 0.465 0.256 0.107 88 E 0.023 0.003 0.102 0.437 0.307 0.128 89 E 0.024 0.005 0.056 0.312 0.344 0.260 90 S 0.022 0.012 0.018 0.085 0.380 0.482 91 D 0.025 0.012 0.017 0.049 0.363 0.533 92 Y 0.023 0.007 0.149 0.168 0.465 0.188 93 G 0.030 0.006 0.240 0.207 0.389 0.128 94 I 0.082 0.007 0.261 0.215 0.307 0.129 95 Y 0.160 0.015 0.104 0.169 0.252 0.300 96 K 0.267 0.022 0.057 0.184 0.174 0.296 97 E 0.271 0.020 0.039 0.204 0.149 0.317 98 V 0.147 0.032 0.022 0.221 0.131 0.447 99 S 0.045 0.013 0.009 0.243 0.085 0.605 100 K 0.001 0.001 0.012 0.973 0.007 0.008 101 D 0.001 0.001 0.010 0.974 0.009 0.007 102 L 0.001 0.001 0.013 0.979 0.006 0.002 103 A 0.001 0.001 0.004 0.988 0.005 0.003 104 I 0.001 0.001 0.002 0.991 0.005 0.001 105 K 0.001 0.001 0.003 0.976 0.013 0.007 106 I 0.001 0.001 0.002 0.977 0.008 0.013 107 L 0.001 0.001 0.002 0.982 0.007 0.008 108 K 0.001 0.001 0.002 0.980 0.008 0.009 109 D 0.001 0.001 0.005 0.975 0.008 0.012 110 A 0.001 0.001 0.002 0.985 0.005 0.008 111 E 0.001 0.001 0.001 0.991 0.004 0.004 112 I 0.001 0.001 0.001 0.986 0.005 0.007 113 F 0.001 0.001 0.001 0.989 0.003 0.006 114 V 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.004 115 Q 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.003 116 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.002 117 A 0.001 0.001 0.002 0.992 0.003 0.003 118 K 0.001 0.001 0.005 0.986 0.006 0.003 119 N 0.001 0.001 0.005 0.969 0.017 0.008 120 A 0.001 0.001 0.006 0.963 0.018 0.013 121 V 0.001 0.001 0.010 0.941 0.026 0.020 122 N 0.001 0.001 0.031 0.855 0.072 0.040 123 K 0.001 0.001 0.023 0.598 0.133 0.243 124 N 0.001 0.001 0.008 0.087 0.141 0.762 125 R 0.001 0.001 0.001 0.003 0.023 0.973