# TARGET T0364 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0364.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1328 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.150 0.011 0.010 0.032 0.032 0.091 0.057 0.617 2 P 0.063 0.010 0.017 0.022 0.036 0.103 0.089 0.660 3 A 0.029 0.013 0.043 0.052 0.155 0.111 0.110 0.488 4 L 0.014 0.006 0.066 0.074 0.159 0.074 0.059 0.546 5 I 0.014 0.003 0.109 0.182 0.284 0.065 0.056 0.287 6 T 0.007 0.002 0.091 0.111 0.253 0.050 0.113 0.373 7 Y 0.016 0.003 0.081 0.255 0.274 0.058 0.054 0.260 8 R 0.009 0.001 0.081 0.143 0.274 0.055 0.031 0.406 9 T 0.006 0.002 0.071 0.179 0.241 0.065 0.024 0.411 10 T 0.005 0.003 0.101 0.194 0.254 0.078 0.035 0.330 11 V 0.009 0.004 0.064 0.110 0.097 0.081 0.035 0.601 12 Q 0.247 0.040 0.040 0.087 0.068 0.065 0.112 0.340 13 E 0.193 0.062 0.028 0.029 0.034 0.092 0.098 0.464 14 D 0.057 0.073 0.038 0.029 0.051 0.112 0.038 0.603 15 W 0.019 0.028 0.073 0.045 0.094 0.115 0.083 0.544 16 V 0.033 0.030 0.075 0.061 0.074 0.149 0.080 0.499 17 D 0.577 0.038 0.033 0.027 0.029 0.063 0.084 0.150 18 Y 0.090 0.036 0.015 0.018 0.024 0.118 0.047 0.652 19 N 0.011 0.023 0.035 0.010 0.049 0.135 0.026 0.710 20 G 0.027 0.056 0.089 0.066 0.135 0.114 0.127 0.389 21 H 0.050 0.146 0.098 0.152 0.140 0.097 0.078 0.240 22 L 0.061 0.145 0.132 0.058 0.108 0.075 0.091 0.330 23 R 0.053 0.324 0.040 0.078 0.118 0.067 0.090 0.228 24 D 0.026 0.550 0.026 0.022 0.051 0.040 0.066 0.219 25 A 0.007 0.697 0.019 0.040 0.072 0.030 0.034 0.101 26 F 0.006 0.720 0.017 0.063 0.095 0.011 0.046 0.039 27 Y 0.008 0.864 0.007 0.019 0.025 0.007 0.052 0.019 28 L 0.006 0.624 0.017 0.032 0.032 0.007 0.259 0.022 29 L 0.003 0.826 0.010 0.025 0.023 0.005 0.094 0.014 30 I 0.011 0.946 0.004 0.002 0.005 0.003 0.019 0.010 31 F 0.013 0.333 0.007 0.006 0.005 0.005 0.616 0.014 32 S 0.005 0.768 0.003 0.003 0.003 0.006 0.188 0.026 33 Y 0.007 0.941 0.001 0.001 0.001 0.005 0.018 0.026 34 A 0.005 0.951 0.003 0.002 0.001 0.004 0.022 0.012 35 T 0.020 0.907 0.002 0.001 0.001 0.005 0.049 0.015 36 D 0.018 0.805 0.005 0.001 0.001 0.007 0.134 0.030 37 A 0.011 0.896 0.020 0.002 0.002 0.007 0.033 0.029 38 L 0.158 0.588 0.046 0.003 0.004 0.025 0.095 0.080 39 M 0.140 0.082 0.205 0.009 0.006 0.050 0.325 0.183 40 D 0.507 0.038 0.020 0.002 0.003 0.031 0.020 0.380 41 R 0.102 0.005 0.009 0.001 0.002 0.059 0.018 0.804 42 I 0.008 0.009 0.019 0.003 0.006 0.190 0.009 0.757 43 G 0.015 0.013 0.013 0.003 0.007 0.104 0.012 0.833 44 L 0.018 0.019 0.024 0.011 0.004 0.115 0.035 0.774 45 D 0.237 0.387 0.022 0.005 0.005 0.043 0.180 0.122 46 A 0.275 0.365 0.015 0.003 0.004 0.050 0.072 0.215 47 D 0.154 0.165 0.034 0.014 0.016 0.065 0.061 0.492 48 S 0.083 0.050 0.029 0.017 0.027 0.083 0.250 0.460 49 R 0.044 0.017 0.029 0.020 0.040 0.170 0.202 0.478 50 G 0.367 0.007 0.015 0.013 0.023 0.070 0.074 0.430 51 Q 0.100 0.003 0.005 0.006 0.011 0.074 0.033 0.769 52 S 0.009 0.003 0.017 0.007 0.035 0.133 0.015 0.780 53 G 0.012 0.004 0.052 0.040 0.175 0.145 0.038 0.533 54 N 0.005 0.004 0.087 0.169 0.168 0.070 0.059 0.439 55 S 0.004 0.014 0.193 0.204 0.285 0.041 0.068 0.191 56 L 0.003 0.019 0.221 0.234 0.262 0.024 0.056 0.181 57 F 0.004 0.017 0.295 0.328 0.247 0.014 0.032 0.064 58 T 0.008 0.044 0.329 0.162 0.238 0.017 0.104 0.099 59 L 0.030 0.097 0.096 0.270 0.287 0.026 0.094 0.101 60 E 0.034 0.067 0.094 0.139 0.216 0.041 0.164 0.247 61 A 0.010 0.091 0.056 0.196 0.270 0.059 0.083 0.235 62 H 0.018 0.102 0.083 0.121 0.282 0.053 0.089 0.252 63 I 0.051 0.068 0.055 0.230 0.210 0.047 0.094 0.244 64 N 0.057 0.050 0.065 0.214 0.215 0.051 0.099 0.248 65 Y 0.052 0.044 0.036 0.103 0.170 0.072 0.072 0.451 66 L 0.045 0.013 0.049 0.111 0.144 0.071 0.047 0.520 67 H 0.079 0.009 0.025 0.164 0.151 0.076 0.053 0.443 68 E 0.015 0.003 0.026 0.049 0.085 0.077 0.041 0.704 69 V 0.049 0.002 0.030 0.061 0.092 0.117 0.036 0.614 70 K 0.212 0.003 0.026 0.043 0.041 0.077 0.075 0.524 71 L 0.035 0.003 0.013 0.017 0.037 0.098 0.017 0.780 72 G 0.019 0.004 0.034 0.017 0.071 0.083 0.024 0.748 73 T 0.017 0.011 0.062 0.232 0.288 0.071 0.037 0.282 74 E 0.003 0.006 0.108 0.120 0.283 0.043 0.028 0.409 75 V 0.001 0.003 0.098 0.362 0.437 0.013 0.032 0.055 76 W 0.001 0.005 0.152 0.281 0.412 0.014 0.083 0.052 77 V 0.004 0.020 0.092 0.461 0.325 0.009 0.038 0.050 78 Q 0.009 0.029 0.089 0.256 0.496 0.015 0.025 0.081 79 T 0.012 0.021 0.080 0.282 0.424 0.022 0.052 0.107 80 Q 0.025 0.015 0.057 0.382 0.370 0.024 0.032 0.096 81 I 0.024 0.008 0.044 0.236 0.326 0.043 0.060 0.260 82 L 0.027 0.006 0.033 0.220 0.237 0.069 0.037 0.372 83 G 0.079 0.005 0.017 0.108 0.191 0.065 0.041 0.495 84 F 0.035 0.003 0.009 0.035 0.048 0.063 0.027 0.782 85 D 0.118 0.011 0.015 0.067 0.146 0.087 0.049 0.509 86 R 0.033 0.008 0.012 0.038 0.088 0.083 0.030 0.707 87 K 0.009 0.010 0.035 0.140 0.334 0.077 0.023 0.371 88 R 0.003 0.014 0.050 0.163 0.452 0.036 0.029 0.251 89 L 0.002 0.014 0.046 0.334 0.476 0.019 0.020 0.089 90 H 0.002 0.012 0.102 0.328 0.449 0.009 0.051 0.047 91 V 0.002 0.024 0.035 0.455 0.407 0.007 0.036 0.034 92 Y 0.006 0.046 0.068 0.248 0.521 0.012 0.038 0.061 93 H 0.004 0.027 0.022 0.421 0.461 0.008 0.021 0.037 94 S 0.010 0.025 0.040 0.343 0.464 0.016 0.030 0.072 95 L 0.008 0.005 0.040 0.380 0.403 0.021 0.048 0.094 96 H 0.085 0.008 0.040 0.240 0.244 0.055 0.068 0.260 97 R 0.312 0.007 0.013 0.050 0.064 0.065 0.048 0.442 98 A 0.020 0.003 0.003 0.006 0.012 0.088 0.005 0.863 99 G 0.031 0.013 0.004 0.007 0.015 0.074 0.015 0.841 100 F 0.054 0.159 0.008 0.025 0.036 0.103 0.039 0.576 101 D 0.027 0.319 0.018 0.066 0.115 0.056 0.058 0.340 102 E 0.021 0.281 0.024 0.170 0.204 0.034 0.057 0.208 103 V 0.009 0.135 0.028 0.278 0.303 0.024 0.115 0.108 104 L 0.006 0.118 0.046 0.183 0.381 0.029 0.147 0.089 105 A 0.014 0.101 0.028 0.289 0.395 0.016 0.108 0.050 106 A 0.035 0.121 0.023 0.173 0.404 0.030 0.112 0.102 107 S 0.019 0.099 0.029 0.157 0.419 0.041 0.086 0.150 108 E 0.013 0.044 0.024 0.187 0.544 0.041 0.039 0.107 109 Q 0.005 0.014 0.036 0.205 0.449 0.033 0.080 0.177 110 M 0.004 0.006 0.045 0.376 0.455 0.025 0.029 0.061 111 L 0.005 0.004 0.067 0.286 0.477 0.019 0.032 0.110 112 L 0.005 0.004 0.074 0.424 0.334 0.028 0.017 0.113 113 H 0.004 0.003 0.148 0.242 0.399 0.031 0.031 0.141 114 V 0.022 0.005 0.063 0.202 0.194 0.066 0.047 0.401 115 D 0.460 0.014 0.040 0.074 0.059 0.051 0.116 0.185 116 L 0.076 0.006 0.013 0.020 0.029 0.116 0.040 0.700 117 A 0.023 0.002 0.012 0.008 0.018 0.082 0.024 0.830 118 G 0.127 0.007 0.012 0.019 0.029 0.101 0.074 0.632 119 P 0.062 0.003 0.013 0.022 0.026 0.118 0.041 0.714 120 Q 0.036 0.003 0.021 0.026 0.053 0.116 0.022 0.722 121 S 0.019 0.002 0.016 0.016 0.032 0.081 0.025 0.808 122 A 0.022 0.007 0.047 0.051 0.058 0.157 0.036 0.624 123 P 0.017 0.007 0.030 0.017 0.025 0.106 0.053 0.745 124 F 0.083 0.066 0.029 0.029 0.021 0.105 0.196 0.472 125 G 0.118 0.492 0.011 0.005 0.007 0.043 0.058 0.265 126 H 0.061 0.672 0.009 0.005 0.008 0.036 0.021 0.189 127 T 0.017 0.742 0.018 0.010 0.014 0.026 0.042 0.132 128 T 0.035 0.882 0.005 0.002 0.004 0.008 0.035 0.029 129 V 0.067 0.522 0.025 0.008 0.007 0.019 0.292 0.059 130 C 0.026 0.649 0.020 0.011 0.010 0.025 0.139 0.121 131 R 0.052 0.728 0.013 0.003 0.006 0.021 0.043 0.134 132 L 0.061 0.715 0.015 0.006 0.006 0.024 0.052 0.120 133 N 0.057 0.690 0.011 0.006 0.007 0.021 0.049 0.160 134 H 0.045 0.586 0.012 0.004 0.004 0.035 0.052 0.262 135 L 0.086 0.505 0.044 0.010 0.009 0.048 0.125 0.172 136 V 0.205 0.349 0.032 0.007 0.006 0.052 0.110 0.239 137 E 0.094 0.186 0.042 0.005 0.005 0.060 0.097 0.510 138 Q 0.133 0.172 0.024 0.004 0.004 0.060 0.059 0.544 139 Q 0.231 0.071 0.026 0.005 0.004 0.073 0.086 0.502 140 E 0.110 0.055 0.011 0.004 0.006 0.088 0.029 0.697 141 G 0.104 0.042 0.011 0.003 0.006 0.085 0.030 0.720 142 A 0.030 0.057 0.010 0.008 0.008 0.127 0.026 0.734 143 Q 0.031 0.110 0.024 0.007 0.009 0.090 0.029 0.701 144 A 0.213 0.406 0.011 0.007 0.006 0.053 0.040 0.264 145 P 0.210 0.229 0.076 0.012 0.011 0.058 0.123 0.282 146 Q 0.259 0.120 0.022 0.009 0.013 0.082 0.056 0.440 147 Y 0.230 0.036 0.032 0.008 0.011 0.070 0.145 0.469 148 M 0.032 0.040 0.014 0.011 0.020 0.140 0.063 0.680 149 G 0.027 0.018 0.030 0.011 0.029 0.070 0.049 0.766 150 R 0.144 0.029 0.022 0.064 0.067 0.104 0.047 0.523 151 T 0.068 0.006 0.046 0.033 0.044 0.080 0.068 0.654 152 I 0.020 0.005 0.045 0.073 0.123 0.156 0.029 0.550 153 K 0.009 0.002 0.035 0.020 0.046 0.081 0.026 0.781 154 L 0.049 0.007 0.034 0.072 0.043 0.121 0.049 0.625 155 P 0.093 0.022 0.041 0.027 0.040 0.096 0.082 0.598 156 A 0.080 0.025 0.028 0.026 0.042 0.112 0.063 0.623